Порядок ветвления бактериальных типов (Woese, 1987) - Branching order of bacterial phyla (Woese, 1987)

Для того же дерева с недавно обнаруженными типами см. Порядок ветвления бактериальных типов (Rappe, Giovanoni, 2003).

Основная статья: Бактериальный тип

Есть несколько моделей Порядок ветвления бактериальных типов, один из них был предложен в статье 1987 г. Карл Вёзе.[1]

Порядок ветвления, предложенный Карлом Вёзе, был основан на молекулярная филогения, что было сочтено революционным, поскольку все предыдущие модели основывались на обсуждениях морфологии. (v. Monera ).[2] С тех пор было предложено несколько моделей, и в настоящее время нет единого мнения относительно порядка ветвления основных бактериальных линий.[3]

Используемый ген был 16S рибосомная ДНК.

Дерево

Имена были изменены, чтобы отразить более современную номенклатуру, используемую молекулярными филогенистами.

 

Археи + эукариот

 
Бактерии
 

Термотоги

 
 
 

Хлорофлекси

 
 
 

Deinococcus-Thermus

 
 
 
 

Протеобактерии

 
 
 

Цианобактерии

 
 
 

Фирмикуты

 
 

Актинобактерии

 
 
 
 
 
 
 

Планктомицеты

 
 

Хламидии

 
 
 
 

Спирохеты

 
 
 

Bacteroidetes

 
 

Хлороби

 
 
 
 
 
 
 
 

Примечание к именам

Смотрите также: Бактериальная систематика

Несмотря на влияние документа на классификацию бактерий, это не было предложением об изменении таксономии. Следовательно, многие клады получили официальные названия. Только впоследствии это произошло: например, «пурпурные бактерии и родственники» были переименованы. Протеобактерии.[4]

Обсуждение

Этот раздел включен из Бактериальный тип. (редактировать | история )


Последний универсальный общий предок

Основная статья: Последний универсальный общий предок

Корень дерева, т.е. узел последний универсальный общий предок, находится между доменом Бактерии (или королевство Эубактерии как это тогда было известно) и клады образованный доменами Археи (ранее королевство Архебактерии) и Эукариоты. Это согласуется со всеми последующими исследованиями, за исключением исследования Томас Кавалье-Смит в 2002 и 2004 годах, что не было основано на молекулярной филогении.[5]

Эукариоты представляют собой мозаику разных родословных:

Следовательно, в Woese (1987) группа упоминается как уркариот.

Кладу, состоящую из архей и ядерного генома эукариот, Т. Кавалье-Смит назвал Neomura.[5]

Смотрите также

Сноски

Рекомендации

  1. ^ Woese, CR (1987). «Бактериальная эволюция». Микробиологические обзоры. 51 (2): 221–71. Дои:10.1128 / MMBR.51.2.221-271.1987. ЧВК  373105. PMID  2439888.
  2. ^ Olsen GJ, Woese CR, Overbeek R (1994). «Ветры (эволюционных) изменений: вдохновение новой жизни в микробиологию». Журнал бактериологии. 176 (1): 1–6. Дои:10.2172/205047. ЧВК  205007. PMID  8282683.
  3. ^ Пейс, Н. Р. (2009). «Картирование Древа Жизни: прогресс и перспективы». Обзоры микробиологии и молекулярной биологии. 73 (4): 565–576. Дои:10.1128 / MMBR.00033-09. ЧВК  2786576. PMID  19946133.
  4. ^ Stackebrandt; и другие. (1988). «Proteobacteria classis nov.», Название филогенетического таксона, включающего «пурпурные бактерии и их родственники»."". Int. J. Syst. Бактериол. 38 (3): 321–325. Дои:10.1099/00207713-38-3-321.
  5. ^ а б Кавальер-Смит, Т. (2002). «Неомуранское происхождение архебактерий, негибактериальный корень универсального дерева и бактериальная мегаклассификация». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 52 (Чт 1): 7–76. Дои:10.1099/00207713-52-1-7. PMID  11837318.