Порядок ветвления бактериальных типов (Гупта, 2001) - Branching order of bacterial phyla (Gupta, 2001)

Есть несколько моделей Порядок ветвления бактериальных типов, один из них был предложен в 2001 году Гуптой на основе консервативных инделей или белков, называемых «белковые сигнатуры», альтернативного подхода к молекулярной филогении.^[1] В этих сохранившихся инделах присутствуют некоторые проблемные исключения и конфликты, однако они согласуются с несколькими группировками классов и типов.^[1] Одной из особенностей кладограммы, полученной с помощью этого метода, является кластеризация морфологии клеточной стенки (за некоторыми исключениями) от монодерм до переходных дидерм и традиционных дидерм.^[2]

На кладограмме ниже желтый = псевдопептидогликановые монодермы (грамм-переменная), красный = толстые пептидогликановые монодермы (грамположительные), синий = тонкие пептидогликановые дидермы (грамотрицательные), зеленый = атипичные, см. Примечание в скобках).

Археи

Фирмикуты

Актинобактерии

Термотоги (тога)

Фузобактерии

Группа Deinococcus-Thermus (толстый пепт. Diderms)

Хлорофлекси (тонкие пепт. Монодермы)

Цианобактерии

Спирохеты

Группа FCB

Фибробактерии

	Хлороби

	Bacteroidetes

Группа ПВХ

Планктомицеты (нуклеоид, заключенный в пиреллусомы)

	Веррукомикробия (компартментализация)

	Хламидии

Водные

Протеобактерии

Дельтапротеобактерии

Эпсилонпротеобактерии

Alphaproteobacteria

	Гаммапротеобактерии

	Бетапротеобактерии

Смотрите также

Рекомендации

^ ^а ^б Гупта, Р. (2001). «Порядок ветвления и филогенетическое размещение видов из завершенных бактериальных геномов на основе консервативных инделей, обнаруженных в различных белках». Международная микробиология. 4 (4): 187–202. Дои:10.1007 / s10123-001-0037-9. PMID 12051562. S2CID 14017883.
^ Гупта, Р. С. (2011). «Происхождение дидерм (грамотрицательных) бактерий: давление отбора антибиотиков, а не эндосимбиоз, вероятно, привело к эволюции бактериальных клеток с двумя мембранами». Антони ван Левенгук. 100 (2): 171–182. Дои:10.1007 / s10482-011-9616-8. ЧВК 3133647. PMID 21717204.

[Gupta-1] а ^б Гупта, Р. (2001). «Порядок ветвления и филогенетическое размещение видов из завершенных бактериальных геномов на основе консервативных инделей, обнаруженных в различных белках». Международная микробиология. 4 (4): 187–202. Дои:10.1007 / s10123-001-0037-9. PMID 12051562. S2CID 14017883.

[2] Гупта, Р. С. (2011). «Происхождение дидерм (грамотрицательных) бактерий: давление отбора антибиотиков, а не эндосимбиоз, вероятно, привело к эволюции бактериальных клеток с двумя мембранами». Антони ван Левенгук. 100 (2): 171–182. Дои:10.1007 / s10482-011-9616-8. ЧВК 3133647. PMID 21717204.

[1]

[2]