АДАР - ADAR
Двухцепочечная РНК-специфическая аденозиндезаминаза является фермент что у людей кодируется АДАР ген (что означает аденозиндезаминаза, действующая на РНК).[5][6]
Аденозиндезаминазы, действующие на РНК (ADAR) - это ферменты, ответственные за связывание с двухцепочечной РНК (дцРНК) и преобразование аденозин (А) к инозин (I) по дезаминирование.[7] Белок ADAR представляет собой РНК-связывающий белок, который участвует в редактировании РНК посредством посттранскрипционной модификации транскриптов мРНК путем изменения содержания нуклеотидов в РНК.[8] Преобразование из A в I в РНК нарушает нормальное спаривание A: U, что делает РНК нестабильной. Инозин структурно похож на гуанин (G) что приводит к I к цитозин (C) привязка. Инозин во время трансляции обычно имитирует гуанозин.[9] Изменения кодонов могут возникнуть в результате редактирования, которое может привести к изменению кодирующих последовательностей белков и их функций.[10] Большинство сайтов редактирования находятся в некодирующих областях РНК, таких как непереведенные регионы (UTR), Элементы Alu, и длинный вкрапленный ядерный элемент (ЛИНИИ).[11] Мутации в этом гене были связаны с симметричный наследственный дисхроматоз, а также синдром Айкарди – Гутьера.[12] Были охарактеризованы альтернативные варианты транскрипционного сплайсинга, кодирующие разные изоформы.[8] ADAR также влияет на транскриптом независимыми от редактирования способами, вероятно, путем вмешательства в другие РНК-связывающие белки.[13]
Открытие
Аденозиндезаминаза, действующая на РНК (ADAR) и ее ген были впервые обнаружены случайно в 1987 году в результате исследований Бренды Басс и Гарольда Вайнтрауба.[14] Эти исследователи использовали антисмысловая РНК ингибирование, чтобы определить, какие гены играют ключевую роль в развитии Xenopus laevis эмбрионы. Предыдущее исследование Ксенопус ооциты был успешным. Однако, когда Басс и Вайнтрауб применили идентичные протоколы к Ксенопус эмбрионы, они не могли определить гены развития эмбриона. В попытке понять, почему метод оказался неудачным, они начали сравнивать дуплексную РНК как в ооцитах, так и в эмбрионах. Это привело их к открытию того, что регулируемая в процессе развития активность денатурирует гибриды РНК: РНК в эмбрионах.
В 1988 году Рихард Вагнер и др. дополнительно изучил активность, происходящую на Ксенопус эмбрионы.[15] Они определили, что белок отвечает за раскручивание РНК из-за отсутствия активности после протеиназа лечение. Также было показано, что этот белок специфичен для двухцепочечной РНК, или дцРНК, и не требует АТФ. Кроме того, стало очевидно, что активность белка в отношении дцРНК изменяет его за пределами точки регибридизации, но не полностью денатурирует его. Наконец, исследователи определили, что это раскручивание связано с дезаминированием аденозин остатки инозин. Эта модификация приводит к несоответствию пар оснований между инозином и уридин, что приводит к дестабилизации и раскручиванию дцРНК.
Функция и происхождение
ADAR, действующие на РНК, являются одной из наиболее распространенных форм редактирования РНК и обладают как селективной, так и неизбирательной активностью.[16] ADAR способен как изменять, так и регулировать выработку генного продукта, поскольку инозин интерпретируется ячейка быть гуанозин. Было также установлено, что ADAR изменяет функциональность малых молекул РНК. Недавно были обнаружены ADAR в качестве регулятора сплайсинга с их способностью редактировать или функцией связывания РНК.[17][18] Считается, что ADAR произошел от ADAT (аденозиндезаминаза, действующая на тРНК), критического белка, присутствующего во всех эукариоты, в начале многоклеточный период за счет добавления дцРНК связывающий домен. Вероятно, это произошло в линии, ведущей к кроне Metazoa, когда дублированный ген ADAT был соединен с геном, кодирующим по крайней мере одно связывание двухцепочечной РНК. Семейство генов ADAR в значительной степени сохранилось за всю историю своего существования. Это, наряду с его присутствием в большинстве современных тип, указывает на то, что редактирование РНК является важным регуляторным геном для организмов многоклеточных. ADAR не был обнаружен у различных эукариот неметазоа, таких как растения, грибы и хоанофлагелляты.
Типы
У млекопитающих есть три типа ADAR: ADAR (ADAR1), ADARB1 (ADAR2) и ADARB2 (ADAR3).[19] ADAR и ADARB1 обнаруживаются во многих тканях тела, в то время как ADARB2 находится только в головном мозге.[10] Известно, что ADAR и ADARB1 каталитически активны, в то время как ADARB2 считается неактивным.[10] У ADAR есть две известные изоформы, известные как ADAR1p150 и ADAR1p110. ADAR1p110 обычно обнаруживается только в ядре, тогда как ADAR1p150 перемещается между ядром и цитоплазмой и в основном присутствует в цитоплазме.[19] Хотя ADAR и ADARB1 имеют много общих функциональных доменов, а также общности с точки зрения паттерна экспрессии, структуры белка и требований к субстратам, имеющим структуры двухцепочечной РНК, они различаются по своей активности редактирования.[20]
Каталитическая активность
Биохимическая реакция
ADAR катализируют реакцию от A до I путем гидролиза. дезаминирование.[7] Это достигается за счет использования активированной молекулы воды для нейтрофильной атаки. Это достигается добавлением воды к углероду 6 и удалением аммиака с помощью гидратированного промежуточного продукта.
схема превращения аденозина в инозин через ADAR
Активный сайт
У человека активный сайт фермента имеет 2-3 амино-концевых домена связывания дцРНК (dsRBD) и один карбоксиконцевой каталитический домен дезаминазы.[19] В домене dsRBD присутствует консервативная конфигурация α-β-β-β-α.[10] ADAR1 содержит две области для связывания Z-ДНК известные как Zα и Zβ. ADAR2 и ADAR3 содержат богатый аргинином одноцепочечный Связывающий домен РНК (оцРНК). Решена кристаллическая структура ADAR2.[19] В активном центре фермента есть глютаминовая кислота остаток (E396), который связывается водородом с водой. Существует гистидин (H394) и два цистеин повторные исследования (C451 и C516), которые координируют цинк ион. Цинк активирует молекулу воды для нуцелофильного гидролитического дезаминирования. Внутри каталитического ядра есть гексакисфосфат инозита (IP6), который стабилизирует аргинин и лизин остатки.
Димеризация
У млекопитающих было обнаружено, что преобразование из A в I требует гомодимеризация ADAR1 и ADAR2, но не ADAR3.[10] Исследования in vivo пока не дали окончательных результатов, требуется ли связывание РНК для димеризации. Исследование с мутантами ADAR1 и 2, которые не могли связываться с дцРНК, все еще были способны димеризоваться, что показало, что они могут связываться на основе белок-белковых взаимодействий.[10][21]
Модельные организмы
Модельные организмы использовались при изучении функции ADAR. Линия условного нокаута, названная Adartm1a (EUCOMM) Wtsi[22][23] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект мутагенеза с высокой пропускной способностью для создания и распространения животных моделей болезней среди заинтересованных ученых.[24][25][26] Самцы и самки животных прошли стандартизированный фенотипический скрининг для определения эффектов делеции.[27][28] Было проведено двадцать пять тестов на мутантных мышах, и были обнаружены два значительных отклонения от нормы. [6] Во время беременности было идентифицировано несколько гомозиготных мутантных эмбрионов, и ни один из них не выжил до отъема. Остальные тесты проводились на гетерозиготных мутантных взрослых мышах, и у этих животных не наблюдалось никаких отклонений от нормы.[27]
Роль в болезни
Синдром Айкарди – Гутьера и двусторонний стриарный некроз / дистония
ADAR1 - один из нескольких генов, которые могут способствовать Синдром Айкарди – Гутьера при мутации.[12] Это генетическое воспалительное заболевание, в первую очередь поражающее кожу и мозг, и оно характеризуется высоким уровнем IFN-α в спинномозговой жидкости.[29] Воспаление вызвано неправильной активацией генов, индуцируемых интерфероном, например, тех, которые активированы для борьбы с вирусными инфекциями. Мутация и потеря функции ADAR1 предотвращает дестабилизацию двухцепочечной РНК (дцРНК). Это накопление дцРНК стимулирует выработку IFN без вирусной инфекции, вызывая воспалительную реакцию и аутоиммунный ответ.[30] Фенотип у мышей с нокаутом Adar спасает форма p150 ADAR1, содержащая Zα-домен, который специфически связывается с левосторонней двухцепочечной конформацией, обнаруженной в Z-ДНК и Z-РНК, но не изоформой p110, в которой отсутствует этот домен.[31] У человека мутация P193A в домене Zα является причиной Синдром Айкарди – Гутьера [12] и для более тяжелого фенотипа, обнаруженного при двустороннем стриарном некрозе / дистонии.[32] Полученные данные устанавливают биологическую роль левой конформации Z-ДНК.[33]
ВИЧ
Исследования показали, что ADAR1 может быть как полезным, так и препятствием для способности клеток сопротивляться. ВИЧ инфекция. Показано, что уровни экспрессии белка ADAR1 повышаются во время ВИЧ-инфекции, и было высказано предположение, что он отвечает за мутации от A до G в геноме ВИЧ, ингибируя репликацию.[34] Авторы этого исследования также предполагают, что мутация генома ВИЧ с помощью ADAR1 может в некоторых случаях приводить к полезным вирусным мутациям, которые могут способствовать устойчивости к лекарствам.
Гепатоцеллюлярная карцинома
Исследования образцов от пациентов с гепатоцеллюлярная карцинома (HCC) показали, что ADAR1 часто активируется, а ADAR2 часто подавляется при болезни. Было высказано предположение, что это отвечает за нарушенный паттерн редактирования от A до I, наблюдаемый при HCC, и что ADAR1 действует как онкоген в этом контексте, в то время как ADAR2 обладает активностью супрессора опухолей.[35] Дисбаланс экспрессии ADAR может изменять частоту переходов от A к I в кодирующей белок области генов, что приводит к появлению мутировавших белков, которые вызывают заболевание. Нарушение регуляции ADAR1 и ADAR2 можно использовать как возможный плохой прогностический маркер.
Меланома
В отличие от гепатоцеллюлярной карциномы, несколько исследований показали, что потеря ADAR1 способствует росту меланомы и метастазированию. Известно, что ADAR может действовать на микроРНК и влиять на ее биогенез, стабильность и / или цель связывания.[36] Было высказано предположение, что ADAR1 подавляется белком, связывающим элемент cAMP-ответа (CREB), что ограничивает его способность действовать на miRNA.[37] Одним из таких примеров является miR-455-5p, редактируемая ADAR1. Когда CREB подавляет ADAR, неотредактированная miR-455-5p подавляет белок-супрессор опухоли, называемый CPEB1, способствуя прогрессированию меланомы в модели in vivo.[37]
Симметричный наследственный дисхроматоз (DSH1)
Мутация Gly1007Arg в ADAR1, а также другие усеченные версии были вовлечены как причина в некоторых случаях DSH1.[38] Это заболевание, характеризующееся гиперпигментацией рук и ног, встречается в японских и китайских семьях.
Вирусная активность
Противовирусное средство
ADAR1 - это интерферон ( IFN ) -индуцибельный белок (высвобождаемый клеткой в ответ на патоген или вирус), поэтому было бы разумно, что он будет способствовать иммунному пути клетки. Похоже, это верно для ВГС репликон, лимфоцитарный хориоменингит LCMV, и полиомавирус[39]
Провиральный
Известно, что ADAR1 провирусен и при других обстоятельствах. Редактирование ADAR1 от A до I было обнаружено во многих вирусах, включая вирус кори,[40][41] вирус гриппа,[42] вирус лимфоцитарного хориоменингита,[43] полиомавирус,[44] вирус гепатита дельта,[45] и вирус гепатита С.[46] Хотя ADAR1 был замечен в других вирусах, он был тщательно изучен только в некоторых; один из них - вирус кори (МВ). Исследования, проведенные на MV, показали, что ADAR1 усиливает репликацию вируса. Это осуществляется с помощью двух различных механизмов: редактирования РНК и ингибирования активируемой дцРНК протеинкиназы (PKR ).[39] В частности, считается, что вирусы используют ADAR1 в качестве положительного фактора репликации, избирательно подавляя зависимые от дцРНК и противовирусные пути.[47]
Смотрите также
использованная литература
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000160710 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027951 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Ким У, Ван И, Сэнфорд Т., Цзэн И, Нишикура К. (ноябрь 1994 г.). «Молекулярное клонирование кДНК для двухцепочечной аденозиндезаминазы РНК, фермента-кандидата для редактирования ядерной РНК». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 91 (24): 11457–61. Дои:10.1073 / пнас.91.24.11457. ЧВК 45250. PMID 7972084.
- ^ «Энтрез Ген: Аденозиндезаминаза ADAR, действующая на РНК».
- ^ а б Самуэль CE (2012). Аденозиндезаминазы, действующие на РНК (ADAR), и редактирование A-to-I. Гейдельберг: Springer. ISBN 978-3-642-22800-1.
- ^ а б «АДАР». NCBI. Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Licht K, Hartl M, Amman F, Anrather D, Janisiw MP, Jantsch MF (ноябрь 2018 г.). «Инозин вызывает контекстно-зависимое перекодирование и остановку перевода». Исследования нуклеиновых кислот. 47 (1): 3–14. Дои:10.1093 / нар / gky1163. ЧВК 6326813. PMID 30462291.
- ^ а б c d е ж Нисикура К. (7 июня 2010 г.). «Функции и регуляция редактирования РНК дезаминазами ADAR». Ежегодный обзор биохимии. 79 (1): 321–49. Дои:10.1146 / annurev-biochem-060208-105251. ЧВК 2953425. PMID 20192758.
- ^ Таджаддод М., Янч М.Ф., Лихт К. (март 2016 г.). «Динамический эпитранскриптом: редактирование от A до I модулирует генетическую информацию». Хромосома. 125 (1): 51–63. Дои:10.1007 / s00412-015-0526-9. ЧВК 4761006. PMID 26148686.
- ^ а б c Райс Г.И., Кашер П.Р., Форте Г.М., Маннион Н.М., Гринвуд С.М., Шинкевич М. и др. (Ноябрь 2012 г.). «Мутации в ADAR1 вызывают синдром Айкарди-Гутьера, связанный с сигнатурой интерферона I типа». Природа Генетика. 44 (11): 1243–8. Дои:10,1038 / нг. 2414. ЧВК 4154508. PMID 23001123.
- ^ Лихт К., Янч М.Ф. (ноябрь 2017 г.). "Другое лицо редактора: функции ADAR1 независимыми от редактирования способами". BioEssays. 39 (11): 1700129. Дои:10.1002 / bies.201700129. PMID 28960389.
- ^ Самуэль CE (март 2011 г.). «Аденозиндезаминазы, действующие на РНК (ADAR), являются как противовирусными, так и провирусными». Вирусология. 411 (2): 180–93. Дои:10.1016 / j.virol.2010.12.004. ЧВК 3057271. PMID 21211811.
- ^ Вагнер Р. В., Смит Дж. Э., Куперман Б. С., Нишикура К. (1989). «Активность по раскручиванию двухцепочечной РНК привносит структурные изменения посредством превращений аденозина в инозин в клетках млекопитающих и яйцах Xenopus». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 86 (8): 2647–51. Дои:10.1073 / pnas.86.8.2647. ЧВК 286974. PMID 2704740.
- ^ Грайс Л.Ф., Дегнан Б.М. (29 января 2015 г.). «Происхождение семейства генов ADAR и редактирование РНК животных». BMC Эволюционная биология. 15 (1): 4. Дои:10.1186 / s12862-015-0279-3. ЧВК 4323055. PMID 25630791.
- ^ Тан С.Дж., Шен Х., Ан О и др. (07.02.2020). «Цис- и транс-регуляция сплайсинга пре-мРНК ферментами редактирования РНК влияет на развитие рака». Nat Commun. 11: 799. Дои:10.1038 / s41467-020-14621-5. ЧВК 7005744. PMID 32034135.
- ^ Hsiao YE, Bahn JH, Yang Y и др. (2018). «Редактирование РНК в формирующейся РНК влияет на сплайсинг пре-мРНК». Genome Res. 28 (6): 812–823. Дои:10.1101 / гр.231209.117. ЧВК 5991522. PMID 29724793.
- ^ а б c d Савва Ю.А., Ридер Л.Е., Ринан Р.А. (2012). «Семейство белков ADAR». Геномная биология. 13 (12): 252. Дои:10.1186 / gb-2012-13-12-252. ЧВК 3580408. PMID 23273215.
- ^ Хигучи М., Маас С., Сингл Ф.Н., Хартнер Дж., Розов А., Бурнашев Н., Фельдмейер Д., Шпренгель Р., Зеебург PH (июль 2000 г.). «Точечная мутация в гене рецептора AMPA снижает летальность у мышей с дефицитом фермента редактирования РНК ADAR2». Природа. 406 (6791): 78–81. Дои:10.1038/35017558. PMID 10894545.
- ^ Чо Д.С., Ян В., Ли Дж. Т., Шихаттар Р., Мюррей Дж. М., Нишикура К. (май 2003 г.). «Требование димеризации для активности редактирования РНК аденозиндезаминаз, действующих на РНК». Журнал биологической химии. 278 (19): 17093–102. Дои:10.1074 / jbc.M213127200. PMID 12618436.
- ^ «Международный консорциум нокаут-мышей».
- ^ "Информатика генома мыши".
- ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт А.Ф., Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК 3572410. PMID 21677750.
- ^ Долгин Е. (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.
- ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Ячейка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247.
- ^ а б ГЕРДИН А.К. (сентябрь 2010 г.). «Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica. 88: 0. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x.
- ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геномная биология. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК 3218837. PMID 21722353.
- ^ Ян А., Дэн П., Чжу Дж., Ван Г, Чжан Л., Чен А.Ф., Ван Т., Саркар С.Н., Биллиар Т.Р., Ван Ц. (октябрь 2014 г.). «Аденозиндезаминаза, действующая на РНК1, ограничивает обнаружение РНК RIG-I и подавляет продукцию IFN в ответ на вирусные и эндогенные РНК». Журнал иммунологии. 193 (7): 3436–3445. Дои:10.4049 / jimmunol.1401136. ЧВК 4169998. PMID 25172485.
- ^ Liddicoat BJ, Piskol R, Chalk AM, Ramaswami G, Higuchi M, Hartner JC, Li JB, Seeburg PH, Walkley CR (сентябрь 2015 г.). «Редактирование РНК с помощью ADAR1 не позволяет MDA5 воспринимать эндогенную дцРНК как чужую». Наука. 349 (6252): 1115–20. Дои:10.1126 / science.aac7049. ЧВК 5444807. PMID 26275108.
- ^ Ward SV, George CX, Welcha MJ, Lioua LY, Hahma B, Lewickia H, Torrea JC, Samuel CE, Oldstone MB (январь 2011 г.). «Фермент редактирования РНК аденозиндезаминаза является фактором ограничения для контроля репликации вируса кори, который также необходим для эмбриогенеза». PNAS. 108 (1): 331–336. Дои:10.1073 / pnas.1017241108. ЧВК 3017198. PMID 21173229.
- ^ Ливингстон Дж. Х., Лин Дж. П., Дейл Р. К., Гилл Д., Броган П., Мюнхен А. и др. (Февраль 2014 года). «Сигнатура интерферона типа I идентифицирует двусторонний стриарный некроз из-за мутаций в ADAR1». Журнал медицинской генетики. 51 (2): 76–82. Дои:10.1136 / jmedgenet-2013-102038. PMID 24262145.
- ^ Герберт А. (июль 2019 г.). «Менделирующая болезнь, вызванная вариантами, влияющими на распознавание Z-ДНК и Z-РНК Zα-доменом фермента редактирования двухцепочечной РНК ADAR». Европейский журнал генетики человека. 8: 114–117. Дои:10.1038 / s41431-019-0458-6. ЧВК 6906422. PMID 31320745.
- ^ Weiden MD, Hoshino S, Levy DN, Li Y, Kumar R, Burke SA, Dawson R, Hioe CE, Borkowsky W, Rom WN, Hoshino Y (2014). «Аденозиндезаминаза, действующая на РНК-1 (ADAR1), ингибирует репликацию ВИЧ-1 в альвеолярных макрофагах человека». PLOS ONE. 9 (10): e108476. Дои:10.1371 / journal.pone.0108476. ЧВК 4182706. PMID 25272020.
- ^ Chan TH, Lin CH, Qi L, Fei J, Li Y, Yong KJ, Liu M, Song Y, Chow RK, Ng VH, Yuan YF, Tenen DG, Guan XY, Chen L (май 2014 г.). «Нарушение баланса редактирования РНК, опосредованное ADAR (аденозиндеаминазами, которые действуют на РНК) в гепатоцеллюлярной карциноме человека». Кишечник. 63 (5): 832–43. Дои:10.1136 / gutjnl-2012-304037. ЧВК 3995272. PMID 23766440.
- ^ Хил Б.С., Киган Л.П., МакГерк Л., Михлевски Г., Бриндл Дж., Стэнтон С.М., Касерес Дж.Ф., О'Коннелл М.А. (октябрь 2009 г.). «Редактирование независимых эффектов ADAR на пути miRNA / siRNA». Журнал EMBO. 28 (20): 3145–56. Дои:10.1038 / emboj.2009.244. ЧВК 2735678. PMID 19713932.
- ^ а б Шошан Э, Мобли А.К., Брауэр Р.Р., Камия Т., Хуанг Л., Васкес М.Э., Саламех А., Ли Х.Дж., Ким С.Дж., Иван С., Веласкес-Торрес Дж., Нип К.М., Чжу К., Брукс Д., Джонс С.Дж., Бирол И., Москеда М., Вен Й.Й., Этерович А.К., Суд А.К., Хву П., Гершенвальд Дж.Э., Робертсон А.Г., Калин Г.А., Маркель Г., Фидлер И.Дж., Бар-Эли М. (март 2015 г.). «Сниженное преобразование аденозина в инозин miR-455-5p способствует росту меланомы и метастазированию». Природа клеточной биологии. 17 (3): 311–21. Дои:10.1038 / ncb3110. ЧВК 4344852. PMID 25686251.
- ^ Тодзё К., Секидзима Ю., Сузуки Т., Сузуки Н., Томита Ю., Йошида К., Хашимото Т., Икеда С. (сентябрь 2006 г.). «Дистония, умственное ухудшение и наследственный симметричный дисхроматоз в семье с мутацией ADAR1». Двигательные расстройства. 21 (9): 1510–3. Дои:10.1002 / mds.21011. PMID 16817193.
- ^ а б Gélinas JF, Clerzius G, Shaw E, Gatignol A (сентябрь 2011 г.). «Повышение репликации РНК-вирусов с помощью ADAR1 посредством редактирования РНК и ингибирования РНК-активированной протеинкиназы». Журнал вирусологии. 85 (17): 8460–6. Дои:10.1128 / JVI.00240-11. ЧВК 3165853. PMID 21490091.
- ^ Baczko K, Lampe J, Liebert UG, Brinckmann U, ter Meulen V, Pardowitz I, Budka H, Cosby SL, Isserte S, Rima BK (ноябрь 1993 г.). «Клональная экспансия гипермутированного вируса кори в мозге SSPE». Вирусология. 197 (1): 188–95. Дои:10.1006 / viro.1993.1579. PMID 8212553.
- ^ Каттанео (21 октября 1988 г.). «Предвзятая гипермутация и другие генетические изменения дефектных вирусов кори при инфекциях головного мозга человека». Ячейка. 55 (2): 255–65. Дои:10.1016/0092-8674(88)90048-7. ЧВК 7126660. PMID 3167982.
- ^ Tenoever BR, Ng SL, Chua MA, McWhirter SM, García-Sastre A, Maniatis T (март 2007 г.). «Множественные функции IKK-родственной киназы IKKepsilon в опосредованном интерфероном противовирусном иммунитете». Наука. 315 (5816): 1274–8. Дои:10.1126 / science.1136567. PMID 17332413.
- ^ Zahn RC, Schelp I, Utermöhlen O, von Laer D (январь 2007 г.). «Гипермутация A-G в геноме вируса лимфоцитарного хориоменингита». Журнал вирусологии. 81 (2): 457–64. Дои:10.1128 / jvi.00067-06. ЧВК 1797460. PMID 17020943.
- ^ Кумар (15 апреля 1997 г.). «Ядерная антисмысловая РНК индуцирует обширные модификации аденозина и ядерное удержание транскриптов-мишеней». Proc Natl Acad Sci USA. 94 (8): 3542–7. Дои:10.1073 / пнас.94.8.3542. ЧВК 20475. PMID 9108012.
- ^ Луо Г.X, Чао М., Се С.Ю., Сюро С., Нишикура К., Тейлор Дж. (1990). «Конкретный переход оснований происходит при репликации РНК вируса гепатита дельта». Журнал вирусологии. 64 (3): 1021–7. ЧВК 249212. PMID 2304136.
- ^ Тейлор Д.Р., Пуч М., Дарнелл М.Э., Михалик К., Фейнстон С.М. (2005). «Новый противовирусный путь, который опосредует чувствительность репликона к интерферону вируса гепатита С через ADAR1». Журнал вирусологии. 79 (10): 6291–8. Дои:10.1128 / JVI.79.10.6291-6298.2005. ЧВК 1091666. PMID 15858013.
- ^ Toth AM, Li Z, Cattaneo R, Samuel CE (октябрь 2009 г.). «РНК-специфическая аденозиндезаминаза ADAR1 подавляет апоптоз, вызванный вирусом кори, и активацию протеинкиназы PKR». Журнал биологической химии. 284 (43): 29350–6. Дои:10.1074 / jbc.M109.045146. ЧВК 2785566. PMID 19710021.
дальнейшее чтение
- Валенсуэла А., Бланко Дж., Каллебаут С., Жакото Е., Луис С., Ованесян А.Г., Франко Р. (1997). Gp120 оболочки ВИЧ-1 и вирусные частицы блокируют связывание аденозиндезаминазы с CD26 человека. Достижения экспериментальной медицины и биологии. 421. С. 185–92. Дои:10.1007/978-1-4757-9613-1_24. ISBN 978-1-4757-9615-5. PMID 9330696.
- Wathelet MG, Szpirer J, Nols CB, Clauss IM, De Wit L, Islam MQ, Levan G, Horisberger MA, Content J, Szpirer C (сентябрь 1988 г.). «Клонирование и хромосомная локализация человеческих генов, индуцируемых интерфероном I типа». Соматическая клетка и молекулярная генетика. 14 (5): 415–26. Дои:10.1007 / BF01534709. PMID 3175763.
- Ван Й, Цзэн Й, Мюррей Дж. М., Нишикура К. (ноябрь 1995 г.). "Геномная организация и хромосомное расположение гена аденозиндезаминазы человека дцРНК: фермент для редактирования РНК глутамат-активированного ионного канала". Журнал молекулярной биологии. 254 (2): 184–95. Дои:10.1006 / jmbi.1995.0610. PMID 7490742.
- Паттерсон Дж. Б., Сэмюэл К. Э. (октябрь 1995 г.). «Экспрессия и регуляция интерфероном двухцепочечной РНК-специфической аденозиндезаминазы из клеток человека: данные о двух формах дезаминазы». Молекулярная и клеточная биология. 15 (10): 5376–88. Дои:10.1128 / mcb.15.10.5376. ЧВК 230787. PMID 7565688.
- Паттерсон Дж. Б., Томис, округ Колумбия, Ханс С. Л., Сэмюэл К. Э. (июль 1995 г.). «Механизм действия интерферона: двухцепочечная РНК-специфическая аденозиндезаминаза из клеток человека индуцируется альфа- и гамма-интерферонами». Вирусология. 210 (2): 508–11. Дои:10.1006 / viro.1995.1370. PMID 7618288.
- О'Коннелл М.А., Краузе С., Хигучи М., Сюань Дж.Дж., Тотти Н.Ф., Дженни А., Келлер В. (март 1995 г.). «Клонирование кДНК, кодирующих двухцепочечную РНК-специфичную аденозиндезаминазу млекопитающих». Молекулярная и клеточная биология. 15 (3): 1389–97. Дои:10.1128 / mcb.15.3.1389. ЧВК 230363. PMID 7862132.
- Weier HU, Джордж CX, Грейлих К.М., Самуэль CE (ноябрь 1995 г.). «Интерферон-индуцируемый ген двухцепочечной РНК-специфической аденозиндезаминазы (DSRAD) отображается на хромосоме человека 1q21.1-21.2». Геномика. 30 (2): 372–5. Дои:10.1006 / geno.1995.0034. PMID 8586444.
- Лю Й., Джордж CX, Паттерсон Дж. Б., Сэмюэл С.Э. (февраль 1997 г.). «Функционально отличные двухцепочечные РНК-связывающие домены, связанные с альтернативными вариантами сайтов сплайсинга интерферон-индуцируемой двухцепочечной РНК-специфической аденозиндезаминазы». Журнал биологической химии. 272 (7): 4419–28. Дои:10.1074 / jbc.272.7.4419. PMID 9020165.
- Валенсуэла А., Бланко Дж., Каллебаут С., Жакото Е., Луис С., Ованесян А.Г., Франко Р. (апрель 1997 г.). «Связывание аденозиндезаминазы с человеческим CD26 ингибируется гликопротеином оболочки ВИЧ-1 gp120 и вирусными частицами». Журнал иммунологии. 158 (8): 3721–9. PMID 9103436.
- Герберт А., Альфкен Дж., Ким Ю. Г., Миан И. С., Нисикура К., Рич А. (август 1997 г.). «Связывающий домен Z-ДНК, присутствующий в человеческом редактирующем ферменте, двухцепочечной РНК-аденозиндезаминазе». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 94 (16): 8421–6. Дои:10.1073 / пнас.94.16.8421. ЧВК 22942. PMID 9237992.
- Лю Ю., Герберт А., Рич А., Сэмюэл К.Э. (июль 1998 г.). «Двухцепочечная РНК-специфическая аденозиндезаминаза: свойства связывания нуклеиновых кислот». Методы. 15 (3): 199–205. Дои:10.1006 / мет.1998.0624. PMID 9735305.
- Джордж CX, Самуэль CE (апрель 1999 г.). «Транскрипты аденозиндезаминазы человека ADAR1 обладают альтернативными структурами экзона 1, которые инициируются разными промоторами, один из которых является конститутивно активным, а другой - индуцируемым интерфероном». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (8): 4621–6. Дои:10.1073 / пнас.96.8.4621. ЧВК 16382. PMID 10200312.
- Шварц Т., Рульд М.А., Ловенхаупт К., Герберт А., Рич А. (июнь 1999 г.). «Кристаллическая структура домена Zalpha редактирующего фермента человека ADAR1, связанного с левой Z-ДНК». Наука. 284 (5421): 1841–5. Дои:10.1126 / science.284.5421.1841. PMID 10364558.
- Schade M, Turner CJ, Kühne R, Schmieder P, Lowenhaupt K, Herbert A, Rich A, Oschkinat H (октябрь 1999 г.). «Структура раствора Zalpha-домена фермента редактирования РНК человека ADAR1 показывает предполагаемую поверхность связывания для Z-ДНК». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (22): 12465–70. Дои:10.1073 / пнас.96.22.12465. ЧВК 22950. PMID 10535945.
- Бланко Дж., Валенсуэла А., Эррера С., Луис С., Ованесиан А.Г., Франко Р. (июль 2000 г.). «Gp120 ВИЧ-1 ингибирует связывание аденозиндезаминазы с CD26 посредством механизма, модулируемого экспрессией CD4 и CXCR4». Письма FEBS. 477 (1–2): 123–8. Дои:10.1016 / S0014-5793 (00) 01751-8. PMID 10899322.
- Эррера С., Моримото С., Бланко Дж., Маллол Дж., Арензана Ф., Луис С., Франко Р. (июнь 2001 г.). «Комодуляция CXCR4 и CD26 в лимфоцитах человека». Журнал биологической химии. 276 (22): 19532–9. Дои:10.1074 / jbc.M004586200. PMID 11278278.
- Вонг С.К., Сато С., Лазинский Д.В. (июнь 2001 г.). «Распознавание субстрата ADAR1 и ADAR2». РНК. 7 (6): 846–58. Дои:10.1017 / S135583820101007X. ЧВК 1370134. PMID 11421361.
- Eckmann CR, Neunteufl A, Pfaffstetter L, Jantsch MF (июль 2001 г.). «У человека, а не у Xenopus, редактирующего РНК фермента ADAR1, есть атипичный сигнал ядерной локализации, и он демонстрирует характеристики челночного белка». Молекулярная биология клетки. 12 (7): 1911–24. Дои:10.1091 / mbc.12.7.1911. ЧВК 55639. PMID 11451992.
- Ян А., Дэн П., Чжу Дж., Ван Г, Чжан Л., Чен А.Ф., Ван Т., Саркар С.Н., Биллиар Т.Р., Ван Ц. (октябрь 2014 г.). «Аденозиндезаминаза, действующая на РНК1, ограничивает обнаружение РНК RIG-I и подавляет продукцию IFN в ответ на вирусные и эндогенные РНК». Журнал иммунологии. 193 (7): 3436–3445. Дои:10.4049 / jimmunol.1401136. ЧВК 4169998. PMID 25172485.
внешние ссылки
- Записи OMIM о дисхроматозе Symmetrica Hereditaria 1
- АДАР расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
- АДАР детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.