STX7 - STX7

STX7
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1GL2
Идентификаторы
Псевдонимы	STX7, синтаксин 7
Внешние идентификаторы	OMIM: 603217 MGI: 1858210 ГомолоГен: 37823 Генные карты: STX7
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6q23.2 Начинать 132,445,867 бп[1] Конец 132,513,198 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 | 10 A4 Начинать 24,149,302 бп[2] Конец 24,190,222 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Активность рецептора SNAP • GO: 0001948 связывание с белками • активность ингибитора хлоридных каналов • связывание синтаксина • Привязка SNARE Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • переработка эндосомы • везикул • эндосома • поздняя эндосома • мембрана ранней эндосомы • мембрана • третичная гранула • клеточная мембрана • эндоцитарный пузырек • лизосомальная мембрана • Комплекс SNARE • азурофильная гранула • ранняя эндосома • иммунологический синапс • перинуклеарная область цитоплазмы • лизосома • внеклеточная экзосома • синаптический пузырек • эндомембранная система Биологический процесс • положительная регуляция локализации рецептора в синапсе • локализация органелл • положительная регуляция цитотоксичности, опосредованной Т-клетками • стыковка пузырьков • сборка органелл • внутриклеточный транспорт белка • слияние пузырьков • везикулярный транспорт • регуляция локализации белка на плазматической мембране • регуляция молекулярной функции Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8417	53331
Ансамбль	ENSG00000079950	ENSMUSG00000019998
UniProt	O15400	O70439 Q8BH40
RefSeq (мРНК)	NM_003569 NM_001326578 NM_001326579 NM_001326580	NM_016797 NM_001358563
RefSeq (белок)	NP_001313507 NP_001313508 NP_001313509 NP_003560	NP_058077 NP_001345492
Расположение (UCSC)	Chr 6: 132,45 - 132,51 Мб	Chr 10: 24.15 - 24.19 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Синтаксин-7 это белок что у людей кодируется STX7 ген.^[5][6]

В меланоцитарных клетках экспрессия гена STX7 может регулироваться MITF.^[7]

Взаимодействия

STX7 был показан взаимодействовать с STX8,^[8] VPS18,^[9] Связанный с пузырьками мембранный белок 8^[8][10] и VPS11.^[9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000079950 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019998 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ван Х, Фрелин Л., Певснер Дж. (Октябрь 1997 г.). «Синтаксин человека 7: гомолог Pep12p / Vps6p, участвующий в доставке везикул в лизосомы». Ген. 199 (1–2): 39–48. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00343-0. PMID  9358037.
6. «Энтрез Ген: синтаксин 7 STX7».
7. Хук К.С., Шлегель Н.С., Эйххофф О.М., Видмер Д.С., Преториус К., Эйнарссон С.О., Валгейрсдоттир С., Бергстейнсдоттир К., Щепски А., Даммер Р., Штайнгримссон Е. (декабрь 2008 г.). «Новые мишени MITF идентифицированы с использованием двухэтапной стратегии ДНК-микрочипов». Исследования пигментных клеток и меланомы. 21 (6): 665–76. Дои:10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x. PMID  19067971. S2CID  24698373.
8. Антонин В., Холройд С., Фасшауэр Д., Пабст С., фон Моллард Г.Ф., Ян Р. (декабрь 2000 г.). «Комплекс SNARE, опосредующий слияние поздних эндосом, определяет консервативные свойства структуры и функции SNARE». Журнал EMBO. 19 (23): 6453–64. Дои:10.1093 / emboj / 19.23.6453. ЧВК  305878. PMID  11101518.
9. Ким Б., Кремер Х., Ямамото А., Коминами Е., Косака С., Акадзава С. (август 2001 г.). «Молекулярная характеристика гомологов млекопитающих белков Vps класса C, которые взаимодействуют с синтаксином-7». Журнал биологической химии. 276 (31): 29393–402. Дои:10.1074 / jbc.M101778200. PMID  11382755.
10. Уэйд Н., Брайант Н.Дж., Коннолли Л.М., Симпсон Р.Дж., Лузио Дж. П., Пайпер Р.С., Джеймс Д.Е. (июнь 2001 г.). «Комплексы синтаксина 7 с взаимодействующим с хвостом Vps10p мыши 1b, синтаксином 6, ассоциированным с пузырьками мембранным белком (VAMP) 8 и VAMP7 в клетках меланомы b16». Журнал биологической химии. 276 (23): 19820–7. Дои:10.1074 / jbc.M010838200. PMID  11278762.

дальнейшее чтение

• Вонг Ш., Сюй И, Чжан Т., Хун В. (январь 1998 г.). «Синтаксин 7, новый член синтаксина, связанный с ранним эндосомным компартментом». Журнал биологической химии. 273 (1): 375–80. Дои:10.1074 / jbc.273.1.375. PMID  9417091.
• Стигмайер М., Ян Б., Ю Дж. С., Хуанг Б., Шен М., Ю С., Ло И., Шеллер Р. Х. (декабрь 1998 г.). «Три новых белка семейства синтаксин / SNAP-25». Журнал биологической химии. 273 (51): 34171–9. Дои:10.1074 / jbc.273.51.34171. PMID  9852078.
• Прекерис Р., Ян Б., Оршот В., Клумперман Дж., Шеллер Р. Х. (ноябрь 1999 г.). «Различная роль синтаксина 7 и синтаксина 8 в эндосомном трафике». Молекулярная биология клетки. 10 (11): 3891–908. Дои:10.1091 / mbc.10.11.3891. ЧВК  25687. PMID  10564279.
• Накамура Н., Ямамото А., Вада Ю., Футаи М. (март 2000 г.). «Синтаксин 7 опосредует перенос эндоцитов в поздние эндосомы». Журнал биологической химии. 275 (9): 6523–9. Дои:10.1074 / jbc.275.9.6523. PMID  10692457.
• Scales SJ, Chen YA, Yoo BY, Patel SM, Doung YC, Scheller RH (май 2000 г.). «SNAREs вносят свой вклад в специфичность слияния мембран». Нейрон. 26 (2): 457–64. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 81177-0. PMID  10839363.
• Mullock BM, Smith CW, Ihrke G, Bright NA, Lindsay M, Parkinson EJ, Brooks DA, Parton RG, James DE, Luzio JP, Piper RC (сентябрь 2000 г.). «Синтаксин 7 локализован в компартментах поздних эндосом, связан с Vamp 8 и необходим для позднего слияния эндосомы и лизосомы». Молекулярная биология клетки. 11 (9): 3137–53. Дои:10.1091 / mbc.11.9.3137. ЧВК  14981. PMID  10982406.
• Антонин В., Холройд С., Фасшауэр Д., Пабст С., фон Моллард Г.Ф., Ян Р. (декабрь 2000 г.). «Комплекс SNARE, опосредующий слияние поздних эндосом, определяет консервативные свойства структуры и функции SNARE». Журнал EMBO. 19 (23): 6453–64. Дои:10.1093 / emboj / 19.23.6453. ЧВК  305878. PMID  11101518.
• Уэйд Н., Брайант Н.Дж., Коннолли Л.М., Симпсон Р.Дж., Лузио Дж. П., Пайпер Р.С., Джеймс Д.Е. (июнь 2001 г.). «Комплексы синтаксина 7 с взаимодействующим с хвостом Vps10p мыши 1b, синтаксином 6, ассоциированным с пузырьками мембранным белком (VAMP) 8 и VAMP7 в клетках меланомы b16». Журнал биологической химии. 276 (23): 19820–7. Дои:10.1074 / jbc.M010838200. PMID  11278762.
• Ким Б., Кремер Х., Ямамото А., Коминами Е., Косака С., Акадзава С. (август 2001 г.). «Молекулярная характеристика гомологов млекопитающих белков Vps класса C, которые взаимодействуют с синтаксином-7». Журнал биологической химии. 276 (31): 29393–402. Дои:10.1074 / jbc.M101778200. PMID  11382755.
• Ротем-Иегудар Р., Гальперин Э, Горовиц М. (август 2001 г.). «Ассоциация рецептора инсулиноподобного фактора роста 1 с EHD1 и SNAP29». Журнал биологической химии. 276 (35): 33054–60. Дои:10.1074 / jbc.M009913200. PMID  11423532.
• Сузуки Х, Фукуниси Й, Кагава И., Сайто Р., Ода Х, Эндо Т, Кондо С., Боно Х, Окадзаки Й, Хаяшизаки Й (октябрь 2001 г.). «Панель белок-белкового взаимодействия с использованием полноразмерных кДНК мыши». Геномные исследования. 11 (10): 1758–65. Дои:10.1101 / гр.180101. ЧВК  311163. PMID  11591653.
• Антонин В., Фасшауэр Д., Беккер С., Ян Р., Шнайдер Т.Р. (февраль 2002 г.). «Кристаллическая структура эндосомного комплекса SNARE раскрывает общие структурные принципы всех SNARE». Структурная биология природы. 9 (2): 107–11. Дои:10.1038 / nsb746. HDL:11858 / 00-001M-0000-0012-F459-F. PMID  11786915. S2CID  17724790.
• Антонин В., Дулубова И., Арак Д., Пабст С., Плитцнер Дж., Ризо Дж., Ян Р. (сентябрь 2002 г.). «N-концевые домены синтаксина 7 и vti1b образуют трехспиральные связки, которые различаются по своей способности регулировать сборку комплекса SNARE». Журнал биологической химии. 277 (39): 36449–56. Дои:10.1074 / jbc.M204369200. PMID  12114520.
• Богданович А., Беннетт Н., Киффер С., Луваги М., Морио Т., Гарин Дж., Сатре М., Брукерт Ф. (ноябрь 2002 г.). «Синтаксин 7, синтаксин 8, Vti1 и VAMP7 (ассоциированный с везикулами мембранный белок 7) образуют активный комплекс SNARE для раннего слияния макропиноцитарных компартментов в Dictyostelium discoideum». Биохимический журнал. 368 (Чт 1): 29–39. Дои:10.1042 / BJ20020845. ЧВК  1222979. PMID  12175335.
• Коллинз Р.Ф., Шрайбер А.Д., Гринштейн С., Trimble WS (сентябрь 2002 г.). «Синтаксины 13 и 7 функционируют на разных этапах фагоцитоза». Журнал иммунологии. 169 (6): 3250–6. Дои:10.4049 / jimmunol.169.6.3250. PMID  12218144.
• Адкинс Дж. Н., Варнум С. М., Обери К. Дж., Мур Р. Дж., Энджелл Н. Х., Смит Р. Д., Спрингер Д. Л., Паундс Дж. Г. (декабрь 2002 г.). «К протеому сыворотки крови человека: анализ методом многомерного разделения в сочетании с масс-спектрометрией». Молекулярная и клеточная протеомика. 1 (12): 947–55. Дои:10.1074 / mcp.M200066-MCP200. PMID  12543931.
• Геваерт К., Гетальс М., Мартенс Л., Ван Дамм Дж., Стаес А., Томас Г. Р., Вандекеркхове Дж. (Май 2003 г.). «Изучение протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Природа Биотехнологии. 21 (5): 566–9. Дои:10.1038 / nbt810. PMID  12665801. S2CID  23783563.
• Судзуки Дж., Охниши Х., Вада А., Хираяма Т., Оно Х., Уэда Н., Ясуда Х., Иири Т., Вада Й, Футаи М., Машима Х (июль 2003 г.). «Участие синтаксина 7 в вакуолизации эпителиальных клеток желудка человека, индуцированной цитотоксином VacA, продуцируемым Helicobacter pylori». Журнал биологической химии. 278 (28): 25585–90. Дои:10.1074 / jbc.M212445200. PMID  12730232.