STX17 - STX17

STX17
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4WY4, %% s4WY4
Идентификаторы
Псевдонимы	STX17, синтаксин 17
Внешние идентификаторы	OMIM: 604204 MGI: 1914977 ГомолоГен: 9917 Генные карты: STX17
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9q31.1 Начинать 99,906,654 бп[1] Конец 99,974,534 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 B1 Начинать 48,124,915 бп[2] Конец 48,186,507 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • Активность рецептора SNAP • GO: 0001948 связывание с белками • связывание протеинфосфатазы • связывание протеинкиназы • Привязка SNARE Сотовый компонент • ХОПС комплекс • цитоплазма • неотъемлемый компонент мембраны • цитозоль • Сайт контакта мембраны ER-митохондрии • шероховатой эндоплазматической сети • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана • лизосомальная мембрана • мембрана аутофагосомы • Комплекс SNARE • гладкая мембрана эндоплазматического ретикулума • эндоплазматический ретикулум • митохондрия • ER к мембране транспортных пузырьков Гольджи • ER, покрытый COPII, в транспортную везикулу Гольджи • эндоплазматический ретикулум - мембрана промежуточного отсека Гольджи • цитоплазматический пузырек • эндоплазматический ретикулум-промежуточный компартмент Гольджи • аутофагосома • клеточная мембрана • эндомембранная система Биологический процесс • организация промежуточного компартмента эндоплазматического ретикулума-Гольджи • Организация Гольджи • локализация белка в преаутофагосомной структуре • аутофагия • ER в пузырьки Гольджи-опосредованный транспорт • стыковка пузырьков • GO: 0000046 Созревание аутофагосомы • внутриклеточный транспорт белка • слияние пузырьков • везикулярный транспорт • стыковка мембраны аутофагосомы • экзоцитоз Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	55014	67727
Ансамбль	ENSG00000136874	ENSMUSG00000061455
UniProt	P56962	Q9D0I4
RefSeq (мРНК)	NM_017919	NM_026343
RefSeq (белок)	NP_060389	NP_080619
Расположение (UCSC)	Chr 9: 99.91 - 99.97 Мб	Chr 4: 48.12 - 48.19 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Синтаксин 17 это белок что у людей кодируется STX17 ген.^[5] У лошадей дупликация интрона 6 вызывает прогрессирующее поседение.^[6]

Смотрите также

• Синтаксин

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000136874 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000061455 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Энтрез Ген: Синтаксин 17».
6. "Калифорнийский университет Дэвис Грей".

дальнейшее чтение

• Итакура Э, Киши-Итакура Ч, Мидзусима Н (2012). «Синтаксин 17 SNARE, закрепленный на хвосте шпильки, нацелен на аутофагосомы для слияния с эндосомами / лизосомами». Клетка. 151 (6): 1256–69. Дои:10.1016 / j.cell.2012.11.001. PMID  23217709.
• Петухова Л., Дувич М., Хординский М., Норрис Д., Прайс В., Шимомура Ю., Ким Х, Сингх П., Ли А., Чен В. В., Мейер К. К., Паус Р., Джахода К. А., Амос К. И., Грегерсен П. К., Кристиано А. М. (2010) . «Полногеномное исследование ассоциации при очаговой алопеции затрагивает как врожденный, так и адаптивный иммунитет». Природа. 466 (7302): 113–7. Дои:10.1038 / природа09114. ЧВК  2921172. PMID  20596022.
• Муппирала М., Гупта В., Сваруп Г. (2011). «Синтаксин 17 циклически перемещается между ER и ERGIC и необходим для поддержки архитектуры ERGIC и Golgi». Биол. Клетка. 103 (7): 333–50. Дои:10.1042 / BC20110006. PMID  21545355. S2CID  41507139.
• Чжао З.З., Даффи Д.Л., Томас С.А., Мартин Н.Г., Хейворд Н.К., Монтгомери Г.В. (2009). «Полиморфизмы в гене синтаксина 17 не связаны со злокачественной меланомой кожи человека». Меланома Рес. 19 (2): 80–6. Дои:10.1097 / CMR.0b013e328322fc45. ЧВК  3665505. PMID  19209086.
• Стигмайер М., Ян Б., Ю Дж. С., Хуанг Б., Шен М., Ю. С., Ло И., Шеллер Р. Х. (1998). «Три новых белка семейства синтаксин / SNAP-25». J. Biol. Chem. 273 (51): 34171–9. Дои:10.1074 / jbc.273.51.34171. PMID  9852078.
• Хэй Дж. К., Чао Д. С., Куо С. С., Шеллер Р. Х. (1997). «Белковые взаимодействия, регулирующие транспорт везикул между эндоплазматическим ретикулумом и аппаратом Гольджи в клетках млекопитающих». Клетка. 89 (1): 149–58. Дои:10.1016 / s0092-8674 (00) 80191-9. PMID  9094723. S2CID  8682509.
• Steegmaier M, Oorschot V, Klumperman J, Scheller RH (2000). «Синтаксин 17 в изобилии присутствует в стероидогенных клетках и участвует в динамике мембран гладкого эндоплазматического ретикулума». Мол. Биол. Клетка. 11 (8): 2719–31. Дои:10.1091 / mbc.11.8.2719. ЧВК  14951. PMID  10930465.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P56962 (Человеческий синтаксин-17 (STX17)) в PDBe-KB.