STX5 - STX5

STX5
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3EFO
Идентификаторы
Псевдонимы	STX5, SED5, STX5A, синтаксин 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 603189 MGI: 1928483 ГомолоГен: 2381 Генные карты: STX5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q12.3 Начните 62,806,860 бп[1] Конец 62,832,051 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 19 (мышь)[2] Группа 19 | 19 А Начните 8,741,413 бп[2] Конец 8,756,069 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание с N-концом белка • GO: 0001948 связывание с белками • Привязка SNARE • Активность рецептора SNAP • связывание кадгерина Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • везикул • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана • эндоплазматический ретикулум • ER к мембране транспортных пузырьков Гольджи • Комплекс SNARE • эндоплазматический ретикулум - мембрана промежуточного отсека Гольджи • аппарат Гольджи • цитозоль • Мембрана Гольджи • эндомембранная система Биологический процесс • положительная регуляция белкового катаболического процесса • слияние пузырьков с помощью аппарата Гольджи • ранняя эндосома к транспорту Гольджи • стыковка пузырьков • Покрытие везикул COPII • регулирование организации Гольджи • ретроградный транспорт, эндосома к Гольджи • Разборка Гольджи • слияние пузырьков • везикулярный транспорт • внутриклеточный транспорт белка • ER в пузырьки Гольджи-опосредованный транспорт Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	6811	56389
Ансамбль	ENSG00000162236	ENSMUSG00000010110
UniProt	Q13190	Q8K1E0
RefSeq (мРНК)	NM_001244666 NM_003164 NM_001330294	NM_001167799 NM_019829
RefSeq (белок)	NP_001231595 NP_001317223 NP_003155	NP_001161271 NP_062803
Расположение (UCSC)	Chr 11: 62,81 - 62,83 Мб	Chr 19: 8.74 - 8.76 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Синтаксин-5 это белок что у людей кодируется STX5 ген.^[5][6][7]

Взаимодействия

STX5 был показан взаимодействовать с участием:

• BET1L,^[8][9]
• GOSR1,^{[8][10][11][12]}
• GOSR2,^[8][10][11]
• НАПА,^[13][14] и
• USO1.^[8][15]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000162236 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000010110 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Равичандран V, Рош, Пенсильвания (апрель 1997 г.). «Клонирование и идентификация синтаксина 5 человека в качестве связывающего синаптобревин / ВАМП белка». Журнал молекулярной неврологии. 8 (2): 159–61. Дои:10.1007 / BF02736780. PMID  9188044. S2CID  8942580.
6. Парлати Ф., Варламов О., Паз К., МакНью Дж. А., Уртадо Д., Зёлльнер Т.Х., Ротман Дж. Э. (апрель 2002 г.). «Отличительные комплексы SNARE, опосредующие слияние мембран в транспорте Гольджи, основанное на комбинаторной специфичности». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (8): 5424–9. Дои:10.1073 / pnas.082100899. ЧВК  122785. PMID  11959998.
7. "Энтрез Ген: синтаксин 5 STX5".
8. Короче Дж., Борода М.Б., Земанн Дж., Дирак-Швейструп А.Б., Уоррен Дж. (Апрель 2002 г.). «Последовательное связывание Golgins и катализ сборки SNAREpin с помощью связывающего пузырьки белка p115». Журнал клеточной биологии. 157 (1): 45–62. Дои:10.1083 / jcb.200112127. ЧВК  2173270. PMID  11927603.
9. Сюй Ю., Мартин С., Джеймс Д.Э., Хонг В. (октябрь 2002 г.). «GS15 образует комплекс SNARE с синтаксином 5, GS28 и Ykt6 и участвует в движении в ранних цистернах аппарата Гольджи». Молекулярная биология клетки. 13 (10): 3493–507. Дои:10.1091 / mbc.E02-01-0004. ЧВК  129961. PMID  12388752.
10. Hay JC, Chao DS, Kuo CS, Scheller RH (апрель 1997 г.). «Белковые взаимодействия, регулирующие транспорт везикул между эндоплазматическим ретикулумом и аппаратом Гольджи в клетках млекопитающих». Ячейка. 89 (1): 149–58. Дои:10.1016 / s0092-8674 (00) 80191-9. PMID  9094723. S2CID  8682509.
11. Hay JC, Klumperman J, Oorschot V, Steegmaier M, Kuo CS, Scheller RH (июнь 1998 г.). «Локализация, динамика и белковые взаимодействия раскрывают различные роли ER и Гольджи SNARE». Журнал клеточной биологии. 141 (7): 1489–502. Дои:10.1083 / jcb.141.7.1489. ЧВК  2133002. PMID  9647643.
12. Субраманиам В.Н., Ло Э., Хонг В. (октябрь 1997 г.). «Чувствительный к N-этилмалеимиду фактор (NSF) и альфа-растворимые белки прикрепления NSF (SNAP) опосредуют диссоциацию комплекса GS28-синтаксин 5 рецепторов Гольджи SNAP (SNARE)». Журнал биологической химии. 272 (41): 25441–4. Дои:10.1074 / jbc.272.41.25441. PMID  9325254.
13. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
14. Рабуй К., Кондо Х., Ньюман Р., Хуэй Н., Фримонт П., Уоррен Г. (март 1998 г.). «Синтаксин 5 является общим компонентом опосредованных NSF и p97 путей повторной сборки цистерн Гольджи из митотических фрагментов Гольджи in vitro». Ячейка. 92 (5): 603–10. Дои:10.1016 / s0092-8674 (00) 81128-9. PMID  9506515. S2CID  17285800.
15. Аллан BB, Мойер Б.Д., Balch WE (июль 2000 г.). «Рекрутирование Rab1 p115 в комплекс cis-SNARE: программирование отпочковывающихся везикул COPII для слияния». Наука. 289 (5478): 444–8. Дои:10.1126 / science.289.5478.444. PMID  10903204.

дальнейшее чтение

• Николс Б.Дж., Пелхэм Х.Р. (август 1998 г.). «SNAREs и слияние мембран в аппарате Гольджи». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Исследование молекулярных клеток. 1404 (1–2): 9–31. Дои:10.1016 / S0167-4889 (98) 00044-5. PMID  9714710.
• Hay JC, Chao DS, Kuo CS, Scheller RH (апрель 1997 г.). «Белковые взаимодействия, регулирующие транспорт везикул между эндоплазматическим ретикулумом и аппаратом Гольджи в клетках млекопитающих». Ячейка. 89 (1): 149–58. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80191-9. PMID  9094723. S2CID  8682509.
• Paek I, Orci L, Ravazzola M, Erdjument-Bromage H, Amherdt M, Tempst P, Söllner TH, Rothman JE (июнь 1997 г.). «ERS-24, v-SNARE млекопитающих, участвующий в передаче пузырьков между ER и Golgi». Журнал клеточной биологии. 137 (5): 1017–28. Дои:10.1083 / jcb.137.5.1017. ЧВК  2136225. PMID  9166403.
• Рабуй К., Кондо Х., Ньюман Р., Хуэй Н., Фримонт П., Уоррен Г. (март 1998 г.). «Синтаксин 5 является общим компонентом опосредованных NSF и p97 путей повторной сборки цистерн Гольджи из митотических фрагментов Гольджи in vitro». Ячейка. 92 (5): 603–10. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81128-9. PMID  9506515. S2CID  17285800.
• Hay JC, Klumperman J, Oorschot V, Steegmaier M, Kuo CS, Scheller RH (июнь 1998 г.). «Локализация, динамика и белковые взаимодействия раскрывают различные роли ER и Гольджи SNARE». Журнал клеточной биологии. 141 (7): 1489–502. Дои:10.1083 / jcb.141.7.1489. ЧВК  2133002. PMID  9647643.
• Мартин-Мартин Б., Набокина С.М., Лазо П.А., Моллинедо Ф. (март 1999 г.). «Совместная экспрессия нескольких генов синтаксина человека в нейтрофилах и дифференцирующихся клетках HL-60: вариантные изоформы и обнаружение синтаксина 1». Журнал биологии лейкоцитов. 65 (3): 397–406. Дои:10.1002 / jlb.65.3.397. HDL:10261/59829. PMID  10080545. S2CID  18988377.
• Xu D, Joglekar AP, Williams AL, Hay JC (декабрь 2000 г.). "Субъединичная структура комплекса ER / Golgi SNARE млекопитающих". Журнал биологической химии. 275 (50): 39631–9. Дои:10.1074 / jbc.M007684200. PMID  11035026.
• Короче Дж., Борода М.Б., Земанн Дж., Дирак-Швейструп А.Б., Уоррен Дж. (Апрель 2002 г.). «Последовательное связывание Golgins и катализ сборки SNAREpin с помощью связывающего пузырьки белка p115». Журнал клеточной биологии. 157 (1): 45–62. Дои:10.1083 / jcb.200112127. ЧВК  2173270. PMID  11927603.
• Сюй Ю., Мартин С., Джеймс Д.Э., Хонг В. (октябрь 2002 г.). «GS15 образует комплекс SNARE с синтаксином 5, GS28 и Ykt6 и участвует в движении в ранних цистернах аппарата Гольджи». Молекулярная биология клетки. 13 (10): 3493–507. Дои:10.1091 / mbc.E02-01-0004. ЧВК  129961. PMID  12388752.
• Uchiyama K, Jokitalo E, Kano F, Murata M, Zhang X, Canas B, Newman R, Rabouille C, Pappin D, Freemont P, Kondo H (декабрь 2002 г.). «VCIP135, новый важный фактор для p97 / p47-опосредованного слияния мембран, необходим для сборки Гольджи и ER in vivo». Журнал клеточной биологии. 159 (5): 855–66. Дои:10.1083 / jcb.200208112. ЧВК  2173386. PMID  12473691.
• Дулубова И., Ямагути Т., Арак Д., Ли Х., Хурьева И., Мин С.В., Ризо Дж., Судхоф ТК (январь 2003 г.). «Конвергенция и расхождение в механизме связывания SNARE с помощью Sec1 / Munc18-подобных белков». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (1): 32–7. Дои:10.1073 / pnas.232701299. ЧВК  140874. PMID  12506202.
• Уильямс А.Л., Эм С., Джейкобсон, Северная Каролина, Сюй Д., Хэй Дж. К. (январь 2004 г.). «Связывание rsly1 с синтаксином 5 необходимо для транспорта эндоплазматического ретикулума к Гольджи, но не способствует доступности мотива SNARE». Молекулярная биология клетки. 15 (1): 162–75. Дои:10.1091 / mbc.E03-07-0535. ЧВК  307537. PMID  14565970.
• Хиросе Х, Арасаки К., Дохмае Н., Такио К., Хацудзава К., Нагахама М., Тани К., Ямамото А., Тохьяма М., Тагая М. (март 2004 г.). «Влияние ZW10 на мембранный перенос между эндоплазматическим ретикулумом и Гольджи». Журнал EMBO. 23 (6): 1267–78. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600135. ЧВК  381410. PMID  15029241.
• Шуга К., Томияма Т., Мори Х., Акагава К. (август 2004 г.). «Синтаксин 5 взаимодействует с голопротеинами пресенилина, но не с их N- или C-концевыми фрагментами, и влияет на продукцию бета-амилоидного пептида». Биохимический журнал. 381 (Пт 3): 619–28. Дои:10.1042 / BJ20040618. ЧВК  1133870. PMID  15109302.
• Тай Джи, Лу Л., Ван Т.Л., Тан Б.Л., Гоуд Б., Йоханнес Л., Хонг В. (сентябрь 2004 г.). «Участие комплекса синтаксин 5 / Ykt6 / GS28 / GS15 SNARE в транспортировке от ранней / рециркулирующей эндосомы к сети транс-Гольджи». Молекулярная биология клетки. 15 (9): 4011–22. Дои:10.1091 / mbc.E03-12-0876. ЧВК  515336. PMID  15215310.