SEC23A - SEC23A

SEC23A
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2NUP, 2ГАЙКА, 2YRC, 2YRD, 3EFO, 3EG9, 3EGD, 3EGX
Идентификаторы
Псевдонимы	SEC23A, CLSD, гомолог A Sec23, компонент комплекса оболочки II, hSec23A, гомолог A Sec23, компонент комплекса оболочки COPII
Внешние идентификаторы	OMIM: 610511 MGI: 1349635 ГомолоГен: 4642 Генные карты: SEC23A
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 14 (человек)[1] Группа 14q21.1 Начните 39,031,919 бп[1] Конец 39,109,646 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 12 (мышь)[2] Группа 12 | 12 C1 Начните 58,958,383 бп[2] Конец 59,012,017 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов цинка • связывание ионов металлов • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Активность активатора GTPase Сотовый компонент • мембрана • Мембрана Гольджи • перинуклеарная область цитоплазмы • ER, покрытый COPII, в транспортную везикулу Гольджи • эндоплазматический ретикулум • внешний компонент мембраны • Покрытие везикул COPII • место выхода эндоплазматического ретикулума • цитоплазма • мембрана эндоплазматического ретикулума • цитозоль • ER к мембране транспортных пузырьков Гольджи • цитоплазматический пузырек Биологический процесс • процессинг антигена и презентация экзогенного пептидного антигена через MHC класса II • процессинг антигена и презентация пептидного антигена через MHC класса I • ER в пузырьки Гольджи-опосредованный транспорт • Покрытие везикул COPII • транспорт белка • внутриклеточный транспорт белка • везикулярный транспорт • загрузка груза в везикулу, покрытую COPII • Почкование пузырьков, покрытых COPII • регуляция покрытия везикул COPII • Организация Гольджи • регулировка формы клеток • макроавтофагия • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • локализация белка на плазматической мембране Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10484	20334
Ансамбль	ENSG00000100934	ENSMUSG00000020986
UniProt	Q15436	Q01405
RefSeq (мРНК)	NM_006364	NM_009147 NM_001361956
RefSeq (белок)	NP_006355	NP_033173 NP_001348885
Расположение (UCSC)	Chr 14: 39.03 - 39.11 Мб	Chr 12: 58.96 - 59.01 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гомолог А Sec23 (S. cerevisiae), также известный как SEC23A, это белок который у человека кодируется SEC23A ген.^[5]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом подсемейства SEC23 семейства SEC23 / SEC24. Он содержит гельсолин домен.^[6] Он является частью белкового комплекса и содержится в рибосома -бесплатно переходная грань эндоплазматический ретикулум (ER) и связанные везикулы. Этот белок имеет сходство с дрожжевым компонентом Sec23p COPII. COPII - это комплекс белков оболочки, ответственный за везикул почкование от ER. Предполагается, что кодируемый белок играет роль в ER-Гольджи торговля белками.^[5]

SEC23 взаимодействует с обоими SEC16A и SEC16B.^{[нужна цитата ]}

Взаимодействия

SEC23A был показан взаимодействовать с SEC24C,^[7] Sec16A / p250 и iPLA₁β / p125.^[8]

Sec23 также показал взаимодействовать с TRAPPⅠ, Grh1p, также известный как GRASP65 и Dynactin. Поскольку они участвуют в антероградном транспорте пузырьков от ER к Golgi, Sec23 участвует в транспорте пузырьков.^[9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000100934 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020986 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. "Ген Entrez: SEC23A Sec23 гомолог A (S. cerevisiae)".
6. Ghoshdastider, U; Попп, Д; Burtnick, L.D .; Робинсон, Р. С. (2013). «Расширяющееся суперсемейство белков домена гомологии гельсолина». Цитоскелет. 70 (11): 775–95. Дои:10.1002 / см 21149. PMID  24155256.
7. Pagano A, Letourneur F, Garcia-Estefania D, Carpentier JL, Orci L, Paccaud JP (март 1999 г.). «Белки Sec24 и сортировка в эндоплазматическом ретикулуме». J. Biol. Chem. 274 (12): 7833–40. Дои:10.1074 / jbc.274.12.7833. PMID  10075675.
8. p125 локализуется в местах выхода эндоплазматического ретикулума и участвует в их организации.
9. Координация переноса везикул COPII с помощью Sec23.

дальнейшее чтение

• Пакко Дж. П., Райт В., Карпентье Дж. Л., Раваццола М., Амхердт М., Шекман Р., Орчи Л. (1996). «Клонирование и функциональная характеристика гомологов млекопитающих компонента COPII Sec23». Мол. Биол. Клетка. 7 (10): 1535–46. Дои:10.1091 / mbc.7.10.1535. ЧВК  276004. PMID  8898360.
• Пагано А, Летурнер Ф, Гарсия-Эстефания Д., Карпентье Дж. Л., Орчи Л., Пакко Дж. П. (1999). «Белки Sec24 и сортировка в эндоплазматическом ретикулуме». J. Biol. Chem. 274 (12): 7833–40. Дои:10.1074 / jbc.274.12.7833. PMID  10075675.
• Тан Б.Л., Каушалья Дж., Низкий Д.Й., Лок М.Л., Хонг В. (1999). «Семейство белков млекопитающих, гомологичных дрожжевому Sec24p». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 258 (3): 679–84. Дои:10.1006 / bbrc.1999.0574. PMID  10329445.
• Бояджиев С.А., Джастис К.М., Эйайд В., МакКусик В.А., Лахман Р.С., Чоудри А.Б., Джабак М., Цваан Дж., Уилсон А.Ф., Джабс Е.В. (2003). «Новый дисморфический синдром с открытыми швами свода черепа и шовной катарактой отображается на хромосоме 14q13-q21». Гм. Genet. 113 (1): 1–9. Дои:10.1007 / s00439-003-0932-6. PMID  12677423.
• Дудоньон П., Медер-Гаравалья К., Карпентье Дж. Л., Пакко Дж. П. (2004). «Регулирование компонента COPII путем цитозольного O-гликозилирования во время митоза». FEBS Lett. 561 (1–3): 44–50. Дои:10.1016 / S0014-5793 (04) 00109-7. PMID  15013749.
• Уотсон П., Форстер Р., Палмер К. Дж., Пепперкок Р., Стивенс Д. Д. (2005). «Присоединение выхода ER к микротрубочкам посредством прямого взаимодействия COPII с динактином». Nat. Cell Biol. 7 (1): 48–55. Дои:10.1038 / ncb1206. ЧВК  1592520. PMID  15580264.
• Палмер KJ, Konkel JE, Стивенс DJ (2005). «Протеинкиназы PCTAIRE взаимодействуют напрямую с комплексом COPII и модулируют транспорт секреторных грузов». J. Cell Sci. 118 (Пт 17): 3839–47. Дои:10.1242 / jcs.02496. PMID  16091426.
• Бояджиев С.А., Фромм Дж. К., Бен Дж., Чонг С. С., Наута С., Хур Д. Д., Чжан Дж., Хамамото С., Шекман Р., Раваццола М., Орчи Л., Эяйд В. (2006). «Кранио-лентикуло-шовная дисплазия вызвана мутацией SEC23A, ведущей к ненормальному перемещению эндоплазматического ретикулума в Гольджи». Nat. Genet. 38 (10): 1192–7. Дои:10,1038 / ng1876. PMID  16980979.
• Ту ЛК, Ян X, Худ Л., Линь Б. (2007). «Протеомический анализ взаимодействия гена 1, регулируемого нижестоящим N-myc, и его взаимодействия с программой андрогенного ответа в клетках рака простаты». Мол. Клетка. Протеомика. 6 (4): 575–88. Дои:10.1074 / mcp.M600249-MCP200. PMID  17220478.

внешняя ссылка

• PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для белка транспортного белка человека Sec23A