PSMD8 - PSMD8

PSMD8
Идентификаторы
Псевдонимы	PSMD8, HEL-S-91n, HIP6, HYPF, Nin1p, Rpn12, S14, p31, субъединица 26S протеасомы, не-АТФаза 8
Внешние идентификаторы	OMIM: 617844 MGI: 1888669 ГомолоГен: 37686 Генные карты: PSMD8
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.2 Начните 38,374,536 бп[1] Конец 38,383,824 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 B1 Начните 29,174,188 бп[2] Конец 29,180,701 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • нуклеоплазма • ядро клетки • регуляторная частица протеасомы, подкомплекс крышки • регуляторная частица протеасомы • протеасомный акцессорный комплекс • внеклеточная экзосома • цитозоль • протеасомный комплекс Биологический процесс • Сигнализация NIK / NF-kappaB • протеолиз • Каскад MAPK • сборка протеасомы • регуляция стабильности мРНК • полиубиквитинирование белков • Сигнальный путь рецептора Fc-эпсилон • регуляция клеточного обмена аминокислот • процессинг антигена и презентация экзогенного пептидного антигена через MHC класса I, TAP-зависимый • сигнальный путь, опосредованный фактором некроза опухоли • регулирование стабильности белка • стимулирующий сигнальный путь рецептора лектина С-типа • комплексно-зависимый катаболический процесс, стимулирующий анафазу • положительное регулирование доставки белка в митохондрии • отрицательная регуляция канонического сигнального пути Wnt • Путь передачи сигналов рецептора Т-клеток • положительная регуляция канонического сигнального пути Wnt • протеасомный убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • Путь передачи сигналов Wnt, путь планарной полярности клеток • отрицательная регуляция перехода G2 / M митотического клеточного цикла • деубиквитинирование белков • SCF-зависимый протеасомный убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • трансмембранный транспорт • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II в ответ на гипоксию • посттрансляционная модификация • регуляция дифференцировки гемопоэтических стволовых клеток • сигнальный путь, опосредованный интерлейкином-1 • регуляция фазового перехода митотического клеточного цикла Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	5714	57296
Ансамбль	ENSG00000099341	ENSMUSG00000030591
UniProt	P48556	Q9CX56
RefSeq (мРНК)	NM_002812	NM_026545
RefSeq (белок)	NP_002803	NP_080821
Расположение (UCSC)	Chr 19: 38.37 - 38.38 Мб	Chr 7: 29.17 - 29.18 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

26S протеасома, не регулирующая АТФаза субъединица 8 является фермент что у людей кодируется PSMD8 ген.^[5][6]

Функция

Протеасома 26S представляет собой мультикаталитический протеиназный комплекс с высокоупорядоченной структурой, состоящей из 2 комплексов, ядра 20S и регулятора 19S. Ядро 20S состоит из 4 колец по 28 неидентичных субъединиц; 2 кольца состоят из 7 альфа-субъединиц и 2 кольца состоят из 7 бета-субъединиц. Регулятор 19S состоит из основания, которое содержит 6 субъединиц АТФазы и 2 субъединицы не АТФазы, и крышки, которая содержит до 10 субъединиц не АТФазы. Протеасомы в высокой концентрации распределяются по эукариотическим клеткам и расщепляют пептиды в АТФ / убиквитин-зависимом процессе нелизосомного пути. Важной функцией модифицированной протеасомы, иммунопротеасомы, является процессинг пептидов MHC класса I. Этот ген кодирует не АТФазную субъединицу регулятора 19S. Псевдоген был идентифицирован на хромосоме 1.^[6]

Клиническое значение

Протеасома и ее субъединицы имеют клиническое значение по крайней мере по двум причинам: (1) нарушенная комплексная сборка или дисфункциональная протеасома может быть связана с патофизиологией конкретных заболеваний, и (2) они могут использоваться в качестве мишеней для лекарств для терапевтических вмешательства. Совсем недавно были предприняты дополнительные усилия по рассмотрению протеасомы для разработки новых диагностических маркеров и стратегий. Улучшенное и всестороннее понимание патофизиологии протеасомы должно привести к клиническому применению в будущем.

Протеасомы образуют ключевой компонент для убиквитин-протеасомная система (UPS) ^[7] и соответствующий контроль качества клеточного белка (PQC). Протеин убиквитинирование и последующие протеолиз и деградация протеасомами являются важными механизмами в регуляции клеточный цикл, рост клеток и дифференцировка, транскрипция генов, сигнальная трансдукция и апоптоз.^[8] Впоследствии нарушение сборки и функции протеасомного комплекса ведет к снижению протеолитической активности и накоплению поврежденных или неправильно свернутых белков. Такое накопление белка может способствовать патогенезу и фенотипическим характеристикам нейродегенеративных заболеваний,^[9][10] сердечно-сосудистые заболевания,^[11][12][13] воспалительные реакции и аутоиммунные заболевания,^[14] и системные реакции на повреждение ДНК, приводящие к злокачественные новообразования.^[15]

Несколько экспериментальных и клинических исследований показали, что аберрации и нарушение регуляции UPS вносят вклад в патогенез нескольких нейродегенеративных и миодегенеративных заболеваний, включая Болезнь Альцгеймера,^[16] болезнь Паркинсона^[17] и Болезнь Пика,^[18] Боковой амиотрофический склероз (ALS),^[18] болезнь Хантингтона,^[17] Болезнь Крейтцфельдта-Якоба,^[19] болезни мотонейронов, полиглутаминовые (PolyQ) заболевания, Мышечные дистрофии^[20] и несколько редких форм нейродегенеративных заболеваний, связанных с слабоумие.^[21] В рамках убиквитин-протеасомная система (UPS) протеасома поддерживает гомеостаз сердечного белка и, таким образом, играет важную роль в сердечной ишемический травма, повреждение,^[22] гипертрофия желудочков^[23] и Сердечная недостаточность.^[24] Кроме того, накапливаются доказательства того, что UPS играет важную роль в злокачественной трансформации. Протеолиз UPS играет важную роль в ответах раковых клеток на стимулирующие сигналы, которые имеют решающее значение для развития рака. Соответственно, экспрессия гена за счет деградации факторы транскрипции, такие как p53, с-июн, c-Fos, NF-κB, c-Myc, HIF-1α, MATα2, STAT3, стерол-регулируемые связывающие элементы белки и рецепторы андрогенов Все они контролируются ИБП и, таким образом, участвуют в развитии различных злокачественных новообразований.^[25] Кроме того, UPS регулирует деградацию продуктов гена-супрессора опухолей, таких как аденоматозный полипоз кишечной палочки (APC ) при колоректальном раке, ретинобластома (Rb). и опухолевый супрессор фон Хиппеля – Линдау (ВХЛ), а также ряд протоонкогены (Раф, Мой с, Myb, Rel, Src, Мос, ABL ). ИБП также участвует в регуляции воспалительных реакций. Эта активность обычно объясняется ролью протеасом в активации NF-κB, который дополнительно регулирует экспрессию провоспалительных цитокины такие как TNF-α, ИЛ-β, Ил-8, молекулы адгезии (ICAM-1, VCAM-1, Р-селектин ) и простагландины и оксид азота (НЕТ).^[14] Кроме того, UPS также играет роль в воспалительных реакциях в качестве регуляторов пролиферации лейкоцитов, в основном за счет протеолиза циклинов и деградации CDK ингибиторы.^[26] Наконец, аутоиммунное заболевание пациенты с SLE, Синдром Шегрена и ревматоидный артрит (RA) преимущественно демонстрируют циркулирующие протеасомы, которые можно использовать в качестве клинических биомаркеров.^[27]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000099341 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030591 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Коминами К., ДеМартино Г. Н., Мумау С. Р., Слотер Калифорния, Симбара Н., Фудзимуро М., Йокосава Н., Хисамацу Н., Танахаши Н., Симидзу Ю. (июль 1995 г.). «Nin1p, регуляторная субъединица протеасомы 26S, необходим для активации киназы Cdc28p Saccharomyces cerevisiae». Журнал EMBO. 14 (13): 3105–15. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07313.x. ЧВК  394372. PMID  7621825.
6. «Ген Entrez: протеасома PSMD8 (просома, макропаин), 26S субъединица, не-АТФаза, 8».
7. Клейгер Г., мэр Т. (июнь 2014 г.). «Опасное путешествие: экскурсия по убиквитин-протеасомной системе». Тенденции в клеточной биологии. 24 (6): 352–9. Дои:10.1016 / j.tcb.2013.12.003. ЧВК  4037451. PMID  24457024.
8. Гольдберг А. Л., Стейн Р., Адамс Дж. (Август 1995 г.). «Новое понимание функции протеасом: от архебактерий до разработки лекарств». Химия и биология. 2 (8): 503–8. Дои:10.1016/1074-5521(95)90182-5. PMID  9383453.
9. Сулистио Ю.А., Хиз К. (январь 2015 г.). «Убиквитин-протеасомная система и дерегуляция молекулярных шаперонов при болезни Альцгеймера». Молекулярная нейробиология. 53 (2): 905–31. Дои:10.1007 / s12035-014-9063-4. PMID  25561438. S2CID  14103185.
10. Ортега З, Лукас Дж.Дж. (2014). «Участие убиквитин-протеасомной системы в болезни Хантингтона». Границы молекулярной неврологии. 7: 77. Дои:10.3389 / fnmol.2014.00077. ЧВК  4179678. PMID  25324717.
11. Сандри М., Роббинс Дж. (Июнь 2014 г.). «Протеотоксичность: недооцененная патология при сердечных заболеваниях». Журнал молекулярной и клеточной кардиологии. 71: 3–10. Дои:10.1016 / j.yjmcc.2013.12.015. ЧВК  4011959. PMID  24380730.
12. Дрюс О., Тэгтмайер Х (декабрь 2014 г.). «Нацеливание на убиквитин-протеасомную систему при сердечных заболеваниях: основа для новых терапевтических стратегий». Антиоксиданты и редокс-сигналы. 21 (17): 2322–43. Дои:10.1089 / ars.2013.5823. ЧВК  4241867. PMID  25133688.
13. Ван З.В., Хилл Д.А. (февраль 2015 г.). «Контроль качества протеина и метаболизм: двунаправленный контроль в сердце». Клеточный метаболизм. 21 (2): 215–26. Дои:10.1016 / j.cmet.2015.01.016. ЧВК  4317573. PMID  25651176.
14. Карин М., Дельхас М. (февраль 2000 г.). «Киназа I каппа B (IKK) и NF-каппа B: ключевые элементы провоспалительной передачи сигналов». Семинары по иммунологии. 12 (1): 85–98. Дои:10.1006 / smim.2000.0210. PMID  10723801.
15. Ермолаева М.А., Даховник А., Шумахер Б. (сентябрь 2015 г.). «Механизмы контроля качества в ответах на клеточные и системные повреждения ДНК». Обзоры исследований старения. 23 (Pt A): 3–11. Дои:10.1016 / j.arr.2014.12.009. ЧВК  4886828. PMID  25560147.
16. Checler F, da Costa CA, Ancolio K, Chevallier N, Lopez-Perez E., Marambaud P (июль 2000 г.). «Роль протеасомы в болезни Альцгеймера». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярная основа болезни. 1502 (1): 133–8. Дои:10.1016 / s0925-4439 (00) 00039-9. PMID  10899438.
17. Чунг К.К., Доусон В.Л., Доусон TM (ноябрь 2001 г.). «Роль убиквитин-протеасомного пути в болезни Паркинсона и других нейродегенеративных расстройствах». Тенденции в неврологии. 24 (11 Прил.): S7–14. Дои:10.1016 / s0166-2236 (00) 01998-6. PMID  11881748. S2CID  2211658.
18. Икеда К., Акияма Х., Араи Т., Уэно Х., Цучия К., Косака К. (июль 2002 г.). «Морфометрическая переоценка системы двигательных нейронов болезни Пика и бокового амиотрофического склероза с деменцией». Acta Neuropathologica. 104 (1): 21–8. Дои:10.1007 / s00401-001-0513-5. PMID  12070660. S2CID  22396490.
19. Манака Х, Като Т, Курита К., Катагири Т, Шикама Й, Кудзираи К., Каванами Т, Судзуки И, Нихей К., Сасаки Х (май 1992 г.). «Заметное увеличение убиквитина в спинномозговой жидкости при болезни Крейтцфельдта – Якоба». Письма о неврологии. 139 (1): 47–9. Дои:10.1016 / 0304-3940 (92) 90854-з. PMID  1328965. S2CID  28190967.
20. Мэтьюз К.Д., Мур С.А. (январь 2003 г.). «Конечностно-поясная мышечная дистрофия». Текущие отчеты по неврологии и неврологии. 3 (1): 78–85. Дои:10.1007 / s11910-003-0042-9. PMID  12507416. S2CID  5780576.
21. Майер Р.Дж. (март 2003 г.). «От нейродегенерации к нейрогомеостазу: роль убиквитина». Новости и перспективы наркотиков. 16 (2): 103–8. Дои:10.1358 / dnp.2003.16.2.829327. PMID  12792671.
22. Кализа Дж., Пауэлл С.Р. (февраль 2013 г.). «Убиквитиновая протеасомная система и ишемия миокарда». Американский журнал физиологии. Сердце и физиология кровообращения. 304 (3): H337–49. Дои:10.1152 / ajpheart.00604.2012. ЧВК  3774499. PMID  23220331.
23. Предмор Дж. М., Ван П., Дэвис Ф., Бартолон С., Вестфол М. В., Дайк Д. Б., Пагани Ф., Пауэлл С. Р., Дэй С.М. (март 2010 г.). «Дисфункция убиквитиновых протеасом при гипертрофических и дилатационных кардиомиопатиях». Тираж. 121 (8): 997–1004. Дои:10.1161 / CIRCULATIONAHA.109.904557. ЧВК  2857348. PMID  20159828.
24. Пауэлл SR (июль 2006 г.). «Убиквитин-протеасомная система в физиологии и патологии сердца». Американский журнал физиологии. Сердце и физиология кровообращения. 291 (1): H1 – H19. Дои:10.1152 / ajpheart.00062.2006. PMID  16501026.
25. Адамс Дж (апрель 2003 г.). «Возможности ингибирования протеасомы при лечении рака». Открытие наркотиков сегодня. 8 (7): 307–15. Дои:10.1016 / с 1359-6446 (03) 02647-3. PMID  12654543.
26. Бен-Нерия Y (январь 2002 г.). «Регуляторные функции убиквитинирования в иммунной системе». Иммунология природы. 3 (1): 20–6. Дои:10.1038 / ni0102-20. PMID  11753406. S2CID  26973319.
27. Egerer K, Kuckelkorn U, Rudolph PE, Rückert JC, Dörner T., Burmester GR, Kloetzel PM, Feist E (октябрь 2002 г.). «Циркулирующие протеасомы являются маркерами повреждения клеток и иммунологической активности при аутоиммунных заболеваниях». Журнал ревматологии. 29 (10): 2045–52. PMID  12375310.

дальнейшее чтение

• Coux O, Tanaka K, Goldberg AL (1996). «Структура и функции протеасом 20S и 26S». Ежегодный обзор биохимии. 65: 801–47. Дои:10.1146 / annurev.bi.65.070196.004101. PMID  8811196.
• Goff SP (август 2003 г.). «Смерть от дезаминирования: новая система ограничения хозяина для ВИЧ-1». Ячейка. 114 (3): 281–3. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00602-0. PMID  12914693. S2CID  16340355.
• Сигер М., Феррелл К., Франк Р., Дубиль В. (март 1997 г.). «ВИЧ-1 tat ингибирует 20 S протеасому и ее активацию, опосредованную 11 S». Журнал биологической химии. 272 (13): 8145–8. Дои:10.1074 / jbc.272.13.8145. PMID  9079628.
• Мадани Н., Кабат Д. (декабрь 1998 г.). «Эндогенный ингибитор вируса иммунодефицита человека в лимфоцитах человека преодолевается вирусным белком Vif». Журнал вирусологии. 72 (12): 10251–5. Дои:10.1128 / JVI.72.12.10251-10255.1998. ЧВК  110608. PMID  9811770.
• Саймон Дж. Х., Гаддис, Северная Каролина, Фушье Р. А., Малим М. Х. (декабрь 1998 г.). «Доказательства недавно открытого клеточного фенотипа против ВИЧ-1». Природа Медицина. 4 (12): 1397–400. Дои:10.1038/3987. PMID  9846577. S2CID  25235070.
• Малдер LC, Muesing MA (сентябрь 2000 г.). «Деградация интегразы ВИЧ-1 по пути правила N-конца». Журнал биологической химии. 275 (38): 29749–53. Дои:10.1074 / jbc.M004670200. PMID  10893419.
• Ли Т., Дуан В., Ян Х., Ли М.К., Бте Мустафа Ф., Ли Б.Х., Тео Т.С. (январь 2001 г.). «Идентификация двух белков, S14 и UIP1, которые взаимодействуют с UCH37». Письма FEBS. 488 (3): 201–5. Дои:10.1016 / S0014-5793 (00) 02436-4. HDL:10536 / DRO / DU: 30009147. PMID  11163772. S2CID  40717095.
• Шихи AM, Гэддис NC, Чой JD, Malim MH (август 2002 г.). «Выделение человеческого гена, который подавляет инфекцию ВИЧ-1 и подавляется вирусным белком Vif». Природа. 418 (6898): 646–50. Bibcode:2002Натура.418..646С. Дои:10.1038 / природа00939. PMID  12167863. S2CID  4403228.
• Хуанг X, Зайферт У., Зальцманн У., Хенкляйн П., Прейсснер Р., Хенке В., Сийтс А.Дж., Клётцель П.М., Дубиль В. (ноябрь 2002 г.). «Сайт RTP, общий для белка Tat ВИЧ-1 и субъединицы регулятора 11S альфа, имеет решающее значение для их эффектов на функцию протеасом, включая процессинг антигена». Журнал молекулярной биологии. 323 (4): 771–82. Дои:10.1016 / S0022-2836 (02) 00998-1. PMID  12419264.
• Гаддис NC, Чертова Э., Шихи AM, Хендерсон LE, Малим MH (май 2003 г.). «Комплексное исследование молекулярного дефекта в vif-дефицитных вирионах вируса иммунодефицита человека 1 типа». Журнал вирусологии. 77 (10): 5810–20. Дои:10.1128 / JVI.77.10.5810-5820.2003. ЧВК  154025. PMID  12719574.
• Lecossier D, Bouchonnet F, Clavel F, Hance AJ (май 2003 г.). «Гипермутация ДНК ВИЧ-1 в отсутствие белка Vif». Наука. 300 (5622): 1112. Дои:10.1126 / science.1083338. PMID  12750511. S2CID  20591673.
• Чжан Х., Ян Б., Померанц Р. Дж., Чжан С., Аруначалам СК, Гао Л. (июль 2003 г.). «Цитидиндезаминаза CEM15 индуцирует гипермутацию во вновь синтезированной ДНК ВИЧ-1». Природа. 424 (6944): 94–8. Bibcode:2003Натура.424 ... 94Z. Дои:10.1038 / природа01707. ЧВК  1350966. PMID  12808465.
• Мангеат Б., Турелли П., Карон Г., Фридли М., Перрин Л., Троно Д. (июль 2003 г.). «Широкая антиретровирусная защита человеческого APOBEC3G посредством летального редактирования возникающих обратных транскриптов». Природа. 424 (6944): 99–103. Bibcode:2003Натура 424 ... 99М. Дои:10.1038 / природа01709. PMID  12808466. S2CID  4347374.
• Харрис Р.С., Бишоп К.Н., Шихи А.М., Крейг Х.М., Петерсен-Март С.К., Ватт И.Н., Нойбергер М.С., Малим М.Х. (июнь 2003 г.). «Дезаминирование ДНК опосредует врожденный иммунитет к ретровирусной инфекции». Ячейка. 113 (6): 803–9. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00423-9. PMID  12809610. S2CID  544971.
• Харрис Р.С., Шихи А.М., Крейг М.М., Малим М.Х., Нойбергер М.С. (июль 2003 г.). «Дезаминирование ДНК: не только спусковой крючок для диверсификации антител, но и механизм защиты от ретровирусов». Иммунология природы. 4 (7): 641–3. Дои:10.1038 / ni0703-641. PMID  12830140. S2CID  5549252.
• Гу И, Сандквист, Висконсин (июль 2003 г.). «Доброго времени суток». Природа. 424 (6944): 21–2. Bibcode:2003Натура.424 ... 21Г. Дои:10.1038 / 424021a. PMID  12840737. S2CID  4430569.
• Мариани Р., Чен Д., Шрёфельбауэр Б., Наварро Ф., Кёниг Р., Боллман Б., Мюнк С., Нимарк-МакМахон Н., Ландау Н. Р. (июль 2003 г.). «Видоспецифическое исключение APOBEC3G из вирионов ВИЧ-1 с помощью Vif». Ячейка. 114 (1): 21–31. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00515-4. PMID  12859895. S2CID  1789911.

внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: P48556 (26S протеасомная не-АТФаза регуляторная субъединица 8) на PDBe-KB.