PSME2 - PSME2

PSME2
Идентификаторы
Псевдонимы	PSME2, PA28B, PA28beta, REGbeta, субъединица протеасомного активатора 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 602161 MGI: 1096365 ГомолоГен: 86889 Генные карты: PSME2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 14 (человек)[1] Группа 14q12 Начинать 24,143,362 бп[1] Конец 24,147,570 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 14 (мышь)[2] Группа 14 C3 | 14 28,19 см Начинать 55,587,441 бп[2] Конец 55,591,113 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность активатора эндопептидазы • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • мембрана • комплекс активатора протеасомы • нуклеоплазма • протеасомный комплекс • внеклеточная экзосома Биологический процесс • положительная регуляция активности эндопептидазы • регуляция катаболического процесса протеасомных белков • регуляция клеточного обмена аминокислот • процессинг антигена и презентация экзогенного пептидного антигена через MHC класса I, TAP-зависимый • регуляция стабильности мРНК • положительная регуляция канонического сигнального пути Wnt • полиубиквитинирование белков • стимулирующий сигнальный путь рецептора лектина С-типа • сигнальный путь, опосредованный фактором некроза опухоли • Каскад MAPK • Сигнальный путь рецептора Fc-эпсилон • регуляция G1 / S перехода митотического клеточного цикла • Сигнализация NIK / NF-kappaB • комплексно-зависимый катаболический процесс, стимулирующий анафазу • Путь передачи сигналов рецептора Т-клеток • отрицательная регуляция канонического сигнального пути Wnt • протеасомный убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • Путь передачи сигналов Wnt, путь планарной полярности клеток • отрицательная регуляция перехода G2 / M митотического клеточного цикла • деубиквитинирование белков • SCF-зависимый протеасомный убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • трансмембранный транспорт • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II в ответ на гипоксию • посттрансляционная модификация • сигнальный путь, опосредованный интерлейкином-12 • регуляция дифференцировки гемопоэтических стволовых клеток • сигнальный путь, опосредованный интерлейкином-1 • регуляция фазового перехода митотического клеточного цикла Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5721	19188
Ансамбль	ENSG00000100911 ENSG00000284889	ENSMUSG00000079197
UniProt	Q9UL46	P97372
RefSeq (мРНК)	NM_002818	NM_001029855 NM_011190
RefSeq (белок)	NP_002809	NP_001268401 NP_001025026 NP_035320
Расположение (UCSC)	Chr 14: 24.14 - 24.15 Мб	Chr 14: 55,59 - 55,59 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Субъединица 2 комплекса активатора протеасомы это белок что у людей кодируется PSME2 ген.^[5][6]

Функция

Протеасома 26S представляет собой мультикаталитический протеиназный комплекс с высокоупорядоченной структурой, состоящей из 2 комплексов, ядра 20S и регулятора 19S. Ядро 20S состоит из 4 колец по 28 неидентичных субъединиц; 2 кольца состоят из 7 альфа-субъединиц и 2 кольца состоят из 7 бета-субъединиц. Регулятор 19S состоит из основания, которое содержит 6 субъединиц АТФазы и 2 субъединицы не АТФазы, и крышки, которая содержит до 10 субъединиц не АТФазы. Протеасомы в высокой концентрации распределяются по эукариотическим клеткам и расщепляют пептиды в АТФ / убиквитин-зависимом процессе нелизосомного пути. Важной функцией модифицированной протеасомы, иммунопротеасомы, является процессинг пептидов MHC класса I. Иммунопротеасома содержит альтернативный регулятор, называемый регулятором 11S или PA28, который заменяет регулятор 19S. Идентифицированы три субъединицы (альфа, бета и гамма) регулятора 11S. Этот ген кодирует бета-субъединицу регулятора 11S, одну из двух субъединиц 11S, которая индуцируется гамма-интерфероном. Три бета и три альфа субъединицы объединяются, образуя гетерогексамерное кольцо. Шесть псевдогенов были идентифицированы на хромосомах 4, 5, 8, 10 и 13.^[6]

Взаимодействия

PSME2 был показан взаимодействовать с PSME1.^[7][8]

Рекомендации

1. ENSG00000284889 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000100911, ENSG00000284889 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000079197 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ан Дж.Й., Танахаши Н., Акияма К., Хисамацу Х., Нода К., Танака К., Чунг С.Х., Шибмара Н., Вилли П.Дж., Мотт Д.Д. (июль 1995 г.). «Первичные структуры двух гомологичных субъединиц PA28, гамма-интерферон-индуцируемого белкового активатора протеасомы 20S». FEBS Lett. 366 (1): 37–42. Дои:10.1016 / 0014-5793 (95) 00492-П. PMID  7789512.
6. «Ген Entrez: субъединица 2 активатора протеасомы PSME2 (просома, макропаин) (PA28 бета)».
7. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Милштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.
8. Ан К., Эрландер М., Летурк Д., Петерсон П.А., Фрю К., Ян Й. (июль 1996 г.). «Характеристика регулятора протеасомы РА28 in vivo». J. Biol. Chem. 271 (30): 18237–42. Дои:10.1074 / jbc.271.30.18237. PMID  8663520.

дальнейшее чтение

• Coux O, Tanaka K, Goldberg AL (1996). «Структура и функции протеасом 20S и 26S». Анну. Преподобный Biochem. 65: 801–47. Дои:10.1146 / annurev.bi.65.070196.004101. PMID  8811196.
• Sijts A, Sun Y, Janek K, Kral S, Paschen A, Schadendorf D, Kloetzel PM (2002). «Роль активатора протеасомы PA28 в процессинге антигена класса I MHC». Мол. Иммунол. 39 (3–4): 165–9. Дои:10.1016 / S0161-5890 (02) 00099-8. PMID  12200048.
• Гофф СП (2003). «Смерть от дезаминирования: новая система ограничения хозяина для ВИЧ-1». Клетка. 114 (3): 281–3. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00602-0. PMID  12914693.
• Dubiel W, Pratt G, Ferrell K, Rechsteiner M (1992). «Очистка 11 S регулятора мультикаталитической протеазы». J. Biol. Chem. 267 (31): 22369–77. PMID  1429590.
• Мотт Дж. Д., Праманик BC, Муми Ч. Р., Афендис С. Дж., ДеМартино Г. Н., Бойня Калифорния (1995). «PA28, активатор протеасомы 20 S, состоит из двух неидентичных, но гомологичных субъединиц». J. Biol. Chem. 269 (50): 31466–71. PMID  7989312.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Ан К., Эрландер М., Летурк Д., Петерсон П.А., Фрю К., Ян Й. (1996). «Характеристика регулятора протеасомы РА28 in vivo». J. Biol. Chem. 271 (30): 18237–42. Дои:10.1074 / jbc.271.30.18237. PMID  8663520.
• Сигер М., Феррелл К., Франк Р., Дубиль В. (1997). «ВИЧ-1 tat ингибирует 20 S протеасому и ее активацию, опосредованную 11 S». J. Biol. Chem. 272 (13): 8145–8. Дои:10.1074 / jbc.272.13.8145. PMID  9079628.
• Маккаскер Д., Джонс Т., Шир Д., Троусдейл Дж. (1998). «Генетические отношения генов, кодирующих бета-субъединицы протеасомы человека и протеасомный комплекс PA28». Геномика. 45 (2): 362–7. Дои:10.1006 / geno.1997.4948. PMID  9344661.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Хендил КБ, Хан С, Танака К. (1998). «Одновременное связывание активаторов PA28 и PA700 с 20 S протеасомами». Biochem. J. 332 (Pt 3) (Pt 3): 749–54. ЧВК  1219536. PMID  9620878.
• Мадани Н., Кабат Д. (1998). "Эндогенный ингибитор вируса иммунодефицита человека в лимфоцитах человека преодолевается вирусным белком Vif". Дж. Вирол. 72 (12): 10251–5. ЧВК  110608. PMID  9811770.
• Wójcik C, Tanaka K, Paweletz N, Naab U, Wilk S (1999). «Субъединицы активатора протеасомы (PA28), альфа, бета и гамма (антиген Ki) в клетках-предшественниках нейронов NT2 и клетках HeLa S3». Евро. J. Cell Biol. 77 (2): 151–60. Дои:10.1016 / s0171-9335 (98) 80083-6. PMID  9840465.
• Саймон Дж. Х., Гаддис NC, Фушье Р. А., Малим М. Х. (1998). «Доказательства недавно открытого клеточного фенотипа против ВИЧ-1». Nat. Med. 4 (12): 1397–400. Дои:10.1038/3987. PMID  9846577.
• Маккаскер Д., Уилсон М., Троусдейл Дж. (1999). «Организация генов, кодирующих активаторы протеасом человека PA28alpha и beta». Иммуногенетика. 49 (5): 438–45. Дои:10.1007 / s002510050517. PMID  10199920.
• Танахаши Н., Мураками Ю., Минами Ю., Шимбара Н., Хендил КБ, Танака К. (2000). «Гибридные протеасомы. Индукция интерфероном-гамма и вклад в АТФ-зависимый протеолиз». J. Biol. Chem. 275 (19): 14336–45. Дои:10.1074 / jbc.275.19.14336. PMID  10799514.
• Малдер LC, Muesing MA (2000). «Деградация интегразы ВИЧ-1 по пути правила N-конца». J. Biol. Chem. 275 (38): 29749–53. Дои:10.1074 / jbc.M004670200. PMID  10893419.
• Шихи AM, Гэддис NC, Чой JD, Малим MH (2002). «Выделение человеческого гена, который подавляет инфекцию ВИЧ-1 и подавляется вирусным белком Vif». Природа. 418 (6898): 646–50. Bibcode:2002Натура.418..646С. Дои:10.1038 / природа00939. PMID  12167863.