Диметилаллилтрансфераза - Dimethylallyltranstransferase

FDPS
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1YQ7, 1YV5, 1ZW5, 2Ф7М, 2F89, 2F8C, 2F8Z, 2F92, 2F94, 2Ф9К, 2OPM, 2OPN, 2QIS, 2RAH, 2VF6, 3B7L, 3CP6, 3Н1В, 3N1W, 3N3L, 3N45, 3N46, 3N49, 3N5H, 3N5J, 3Н6К, 3RYE, 3S4J, 4DEM, 4GA3, 4H5C, 4H5D, 4H5E, 4JVJ, 4KFA, 4KPD, 4KPJ, 4KQ5, 4KQS, 4KQU, 4L2X, 4LFV, 4LPG, 4 л / ч, 4N1Z, 4Н9У, 4NFI, 4NFJ, 4НФК, 4NG6, 4NKE, 4НКФ, 4NUA, 4OGU, 4P0V, 4P0W, 4P0X, 4PVX, 4PVY, 4 квартал 23, 4QPF, 4QXS, 4RXA, 4XQR, 5CG5, 5DIQ, 5CG6, 5DJR, 5DJP, 4XQS, 5DJV, 5DGN, 4XQT, 5ДГМ, 5ДГС
Идентификаторы
Псевдонимы	FDPS, FPPS, FPS, POROK9, фарнезилдифосфатсинтаза
Внешние идентификаторы	OMIM: 134629 MGI: 104888 ГомолоГен: 1519 Генные карты: FDPS
Номер ЕС	2.5.1.1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q22 Начните 155,308,748 бп[1] Конец 155,320,666 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 F1 | 3 39,01 см Начните 89,093,588 бп[2] Конец 89,101,959 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • связывание ионов металлов • активность геранилтрантрансферазы • диметилаллилтрансферазная активность • Связывание РНК Сотовый компонент • нуклеоплазма • цитоплазма • цитозоль • митохондрия Биологический процесс • процесс биосинтеза холестерина • стероидный метаболический процесс • GO: 0022415 вирусный процесс • метаболический процесс холестерина • процесс биосинтеза геранилдифосфата • процесс биосинтеза стерола • изопреноидный биосинтетический процесс • липидный обмен • процесс биосинтеза стероидов • процесс биосинтеза фарнезилдифосфата • регуляция процесса биосинтеза холестерина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	2224	110196
Ансамбль	ENSG00000160752	ENSMUSG00000059743
UniProt	P14324	Q920E5
RefSeq (мРНК)	NM_001135821 NM_001135822 NM_001242824 NM_001242825 NM_002004	NM_001253751 NM_134469
RefSeq (белок)	NP_001129293 NP_001129294 NP_001229753 NP_001229754 NP_001995 NP_001365353 NP_001365354	NP_001240680 NP_608219
Расположение (UCSC)	Chr 1: 155.31 - 155.32 Мб	Chr 3: 89.09 - 89.1 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Диметилаллилтрансфераза
Идентификаторы
Номер ЕС	2.5.1.1
Количество CAS	9032-79-5
Базы данных
IntEnz	Просмотр IntEnz
БРЕНДА	BRENDA запись
ExPASy	Просмотр NiceZyme
КЕГГ	Запись в KEGG
MetaCyc	метаболический путь
ПРИАМ	профиль
PDB структуры	RCSB PDB PDBe PDBsum
Поиск ЧВК статьи PubMed статьи NCBI белки

Фарнезилдифосфатсинтаза (фарнезилпирофосфатсинтетаза, диметилаллилтрансфераза, геранилтрантрансфераза)
Идентификаторы
Символ	FDPS
Ген NCBI	2224
HGNC	3631
OMIM	134629
RefSeq	NM_002004
UniProt	P14324
Прочие данные
Номер ЕС	2.5.1.1
Locus	Chr. 1 q22
Искать Структуры Швейцарская модель Домены ИнтерПро

Диметилаллилтрансфераза (DMATT), также известный как фарнезилпирофосфатсинтаза (FPPS) или как фарнезилдифосфатсинтаза (FDPS), является фермент что у человека кодируется геном FDPS и катализирует то трансформация из диметилаллилпирофосфат (DMAPP) и изопентенилпирофосфат (IPP) в фарнезилпирофосфат (FPP).^[5][6]

Пирофосфат также участвует, поскольку реагент и товар. Геранилпирофосфат создается на промежуточном этапе.

Смотрите также

• Геранилтрантрансфераза

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000160752 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000059743 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Бэнторп Д.В., Бакнелл Г.А., Дунан Х.Дж., Дунан С., Роуэн М.Г. (1976). «Биосинтез гераниола и нерола в бесклеточных экстрактах Tanacetum vulgare". Фитохимия. 15: 91–100. Дои:10.1016 / s0031-9422 (00) 89061-5.
6. Сагами Х., Огура К., Сето С., Курокава Т. (ноябрь 1978 г.). «Новая пренилтрансфераза из Micrococcus lysodeikticus». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 85 (2): 572–8. Дои:10.1016 / 0006-291X (78) 91201-9. PMID  736921.

внешняя ссылка

• Диметилаллилтрансфераза в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P14324 (Фарнезилпирофосфатсинтаза человека C) в PDBe-KB.