DNAJC5 - DNAJC5

DNAJC5
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2N05, 2N04
Идентификаторы
Псевдонимы	DNAJC5, CLN4, CLN4B, CSP, DNAJC5A, NCL, mir-941-2, mir-941-3, mir-941-4, mir-941-5, член C5 семейства белков теплового шока DnaJ (Hsp40)
Внешние идентификаторы	OMIM: 611203 MGI: 892995 ГомолоГен: 9631 Генные карты: DNAJC5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20q13.33 Начните 63,895,126 бп[1] Конец 63,936,031 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 H4 | 2103,63 см Начните 181,520,485 бп[2] Конец 181,555,133 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание с АТФ-зависимым белком • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • меланосома • лизосомальная мембрана • терминальный бутон • клеточная мембрана • клатриновая мембрана транспортных везикул гамма-аминомасляной кислоты • внеклеточная экзосома • митохондрия • синаптический пузырек • мембрана • мембрана азурофильных гранул • специфическая гранулированная мембрана • нервномышечное соединение • пресинапс • закрепленный компонент мембраны синаптического пузырька Биологический процесс • отрицательная регуляция апоптотического процесса нейронов • регулируемый экзоцитоз • GO: 0010554 секреция нейротрансмиттера • экзоцитоз синаптических пузырьков • экзоцитоз • дегрануляция нейтрофилов • шаперон-опосредованный сворачивание белка • регуляция цикла синаптических везикул Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	80331	13002
Ансамбль	ENSG00000101152	ENSMUSG00000000826
UniProt	Q9H3Z4	P60904
RefSeq (мРНК)	NM_025219	NM_001271584 NM_001271585 NM_016775
RefSeq (белок)	NP_079495	NP_001258513 NP_001258514 NP_058055
Расположение (UCSC)	Chr 20: 63.9 - 63.94 Мб	Chr 2: 181,52 - 181,56 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

DnaJ гомолог подсемейства C член 5, также известный как белок цепочки цистеина или CSP это белок, что у людей кодируется DNAJC5 ген.^[5] Впервые он был описан в 1990 году.^[6]

Ген

У человека ген расположен на длинной руке хромосома 20 (20q13.33) на Ватсоне (положительная цепь). Ген имеет длину 40 867 оснований и кодируется белок имеет 198 аминокислоты с прогнозируемой молекулярной массой 22,149 кгДальтон (кДа). Вес зрелого белка составляет 34 кДа.

Этот ген является высококонсервативным и обнаруживается как в беспозвоночные и позвоночные. У человека псевдоген этого гена находится на коротком плече хромосома 8.

Структура

Организация белка следующая:^[7]

• ан N-конец фосфорилирование сайт для протеинкиназа А
• а J домен (~ 70 аминокислот)
• область линкера
• а цистеин мотив, состоящий из 13-15 цистеинов на участке из 25 аминокислот. Это сильно пальмитоилированный в мотиве цепочки цистеина.
• менее консервативный C-терминал домен

Распределение тканей

Этот белок в изобилии присутствует в нервной ткани и имеет характерную локализацию в синаптических и клатрин покрытые оболочкой везикулы. Он также обнаруживается на секреторных пузырьках эндокринных, нейроэндокринных и экзокринных клеток. Этот белок составляет ~ 1% от содержания белка в синаптические везикулы.^[8] DNAJC5, по-видимому, играет роль в стимулировании экзоцитоз.^[9]

Функция

Кодируемый белок является членом семейства белков J. Эти белки действуют во многих клеточных процессах, регулируя АТФаза активность 70 кДа белки теплового шока (Hsp70 ). DNAJC5 - это фактор обмена гуаниновых нуклеотидов за грамм_α белки.^[10] CSPα играет роль в мембране торговля людьми и сворачивание белка, и было показано, что он имеет анти-нейродегенеративный характеристики. Известно, что он играет роль в кистозный фиброз и болезнь Хантингтона.^[5]

Этот белок был предложен в качестве ключевого элемента синаптического молекулярного аппарата, предназначенного для восстановления синаптических белков, которые были развернуты в результате стресса, зависимого от активности.^[11][12] Синтаксин 1A, плазматическая мембрана SNARE (растворимый рецептор белка прикрепления фактора, чувствительного к N-этилмалеимиду), критический для нейротрансмиссии, образует комплекс с CSPα, a G протеин и Кальциевый канал N-типа. Хантингтин может вытеснить синтаксин 1A и CSPα из каналов N-типа.^[13] CSP взаимодействует с белком сенсора кальция синаптотагмин 9 через свой линкерный домен.^[14]

Хантингтин-взаимодействующий белок 14, а пальмитоилтрансфераза, необходим для экзоцитоза и доставки CSP к синаптическим пузырькам. Остатки пальмитоила переносятся на остатки цистеина. Если эти участки являются мутированными, нацеливание на мембрану снижается или теряется.^[15] CSP крысы образует комплекс с Sgt (SGTA ) и Hsc70 (HSPA8 ) расположен на синаптический пузырек поверхность. Этот комплекс функционирует как АТФ-зависимый сопровождающий который повторно активирует денатурированные субстраты. Кроме того, комплекс Csp / Sgt / Hsc70, по-видимому, важен для поддержания нормального синапсы.^[7]

Его выражение может быть увеличено с помощью литий.^[16] Кверцетин способствует образованию стабильных димеров CSPα-CSPα.^[17]

Цистеиновый белок повышает чувствительность к кальцию экзоцитоза нейромедиаторов.^[18]

Взаимодействия

Было показано, что DNAJC5 взаимодействовать с регулятор трансмембранной проводимости при муковисцидозе.^[19]

Клиническое значение

Мутации в этом гене могут вызывать нейрональный цероид липофусциноз.^[20]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000101152 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000000826 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: ДНКJC5, гомолог DnaJ (Hsp40), подсемейство C, член 5».
6. Zinsmaier KE, Hofbauer A, Heimbeck G, Pflugfelder GO, Buchner S, Buchner E (ноябрь 1990 г.). «Белок цистеиновой цепи экспрессируется в сетчатке и мозге дрозофилы». J. Neurogenet. 7 (1): 15–29. Дои:10.3109/01677069009084150. PMID  2129171.
7. Tobaben S, Thakur P, Fernández-Chacón R, Südhof TC, Rettig J, Stahl B (сентябрь 2001 г.). «Тримерный белковый комплекс функционирует как синаптический шаперон». Нейрон. 31 (6): 987–99. Дои:10.1016 / S0896-6273 (01) 00427-5. HDL:11858 / 00-001M-0000-0012-F746-0. PMID  11580898. S2CID  12386691.
8. Бенитес Б.А., Альварадо Д., Кай Й., Майо К., Чакраверти С., Нортон Дж., Моррис Дж. К., Сэндс М.С., Козел А, Кручага С. (2011). «Секвенирование экзома подтверждает мутации DNAJC5 как причину нейронального цероид-липофусциноза». PLOS ONE. 6 (11): e26741. Дои:10.1371 / journal.pone.0026741. ЧВК  3208569. PMID  22073189.
9. Ранджан Р., Бронк П., Зинсмайер К.Э. (февраль 1998 г.). «Белок цепочки цистеина необходим для связывания секреции кальция с вызванной нейротрансмиссией у дрозофилы, но не для рециклинга везикул». J. Neurosci. 18 (3): 956–64. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.18-03-00956.1998. ЧВК  6792780. PMID  9437017.
10. Бай Л., Суэйн Л.А., Браун Д.Е. (январь 2007 г.). «Белковый комплекс CSPalpha / G в клетках PC12». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 352 (1): 123–9. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.10.178. PMID  17113038.
11. Фернандес-Чакон Р., Вельфель М., Нисимуне Х., Табарес Л., Шмитц Ф., Кастеллано-Муньос М., Розенмунд С., Монтесинос М.Л., Санес-младший, Шнеггенбургер Р., Зюдхоф ТЦ (апрель 2004 г.). «Белок синаптических пузырьков CSP альфа предотвращает пресинаптическую дегенерацию». Нейрон. 42 (2): 237–51. Дои:10.1016 / S0896-6273 (04) 00190-4. PMID  15091340. S2CID  15604376.
12. Чандра С., Галлардо Дж., Фернандес-Чакон Р., Шлютер О.М., Зюдхоф ТЦ (ноябрь 2005 г.). «Альфа-синуклеин взаимодействует с CSPalpha в предотвращении нейродегенерации». Клетка. 123 (3): 383–96. Дои:10.1016 / j.cell.2005.09.028. PMID  16269331. S2CID  18173864.
13. Суэйн Л.А., Бек К.Э., Браун Д.Е. (сентябрь 2006 г.). «Мультимерный комплекс белков цепочки цистеина». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 348 (1): 83–91. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.07.033. PMID  16875662.
14. Boal F, Laguerre M, Milochau A, Lang J, Scotti PA (январь 2011 г.). «Заряженный выступ в линкерном домене белка цистеиновой цепи Cspα опосредует его регулируемое взаимодействие с синаптотагмином 9, сенсором кальция, во время экзоцитоза». FASEB J. 25 (1): 132–43. Дои:10.1096 / fj.09-152033. PMID  20847230. S2CID  7494452.
15. Чемберлен Л. Х., Бургойн Р. Д. (октябрь 1998 г.). «Цистеиновый домен цепочки цистеинового белка секреторных везикул необходим для нацеливания на мембрану». Biochem. J. 335 (2): 205–9. Дои:10.1042 / bj3350205. ЧВК  1219770. PMID  9761715.
16. Cordeiro ML, Umbach JA, Gundersen CB (июнь 2000 г.). «Ионы лития усиливают экспрессию гена белка цепочки цистеина in vivo и in vitro». J. Neurochem. 74 (6): 2365–72. Дои:10.1046 / j.1471-4159.2000.0742365.x. PMID  10820197. S2CID  19687617.
17. Сюй Ф., Профт Дж., Гиббс С., Винкфейн Б., Джонсон Дж., Сайед Н., Браун Дж. Э. (2010). «Кверцетин нацелен на белок цистеиновой цепи (CSPalpha) и ухудшает синаптическую передачу». PLOS ONE. 5 (6): e11045. Дои:10.1371 / journal.pone.0011045. ЧВК  2883571. PMID  20548785.
18. Доусон-Скалли К., Бронк П., Этвуд Х. Л., Зинсмайер К. Э. (август 2000 г.). «Цистеиновый белок увеличивает кальциевую чувствительность экзоцитоза нейромедиаторов у дрозофилы». J. Neurosci. 20 (16): 6039–47. Дои:10.1523 / jneurosci.20-16-06039.2000. ЧВК  6772598. PMID  10934253.
19. Чжан Х., Питерс К.В., Сан Ф., Марино С.Р., Ланг Дж., Бургойн Р.Д., Фриззелл Р.А. (август 2002 г.). «Белок цепочки цистеина взаимодействует с регулятором трансмембранной проводимости при муковисцидозе и модулирует его созревание». J. Biol. Chem. 277 (32): 28948–58. Дои:10.1074 / jbc.M111706200. PMID  12039948.
20. Nosková L, Stránecký V, Hartmannová H, Přistoupilová A, Barešová V, Ivánek R, Hůlková H, Jahnová H, van der Zee J, Staropoli JF, Sims KB, Tyynelä J, Van Broeckhoven C, Nijssen Eder Mölder, PC , Kmoch S (август 2011). «Мутации в DNAJC5, кодирующем альфа-белок цистеиновой цепи, вызывают аутосомно-доминантный нейрональный цероид липофусциноз у взрослых». Американский журнал генетики человека. 89 (2): 241–52. Дои:10.1016 / j.ajhg.2011.07.003. ЧВК  3155175. PMID  21820099.

дальнейшее чтение

• Чемберлен LH, Burgoyne RD (2000). «Цистеиновый белок цепочки: шаперон в синапсе». J. Neurochem. 74 (5): 1781–1789. Дои:10.1046 / j.1471-4159.2000.0741781.x. PMID  10800920. S2CID  7667658.
• Мастрогиакомо А, Парсонс С.М., Зампиги Г.А., Дженден Д.Д., Умбах Дж. А., Гундерсен CB (1994). «Цистеиновые цепочки белков: потенциальная связь между синаптическими везикулами и пресинаптическими Са2 + каналами». Наука. 263 (5149): 981–82. Дои:10.1126 / science.7906056. PMID  7906056.
• Гундерсен CB, Mastrogiacomo A, Faull K, Umbach JA (1994). «Обширное липидирование белка цепочки цистеина Torpedo». Журнал биологической химии. 269 (30): 19197–19199. PMID  8034679.
• Мастрогиакомо А, Гундерсен CB (1995). «Нуклеотидная и выведенная аминокислотная последовательность белка цепи цистеина крысы». Молекулярные исследования мозга. 28 (1): 12–18. Дои:10.1016 / 0169-328х (94) 00172-б. PMID  7535880.
• Коппола Т., Гундерсен С. (1996). «Широко распространенная экспрессия белков цепочки цистеина человека». FEBS Lett. 391 (3): 269–72. Дои:10.1016/0014-5793(96)00750-8. PMID  8764987. S2CID  10410573.
• Чжан Х., Келли В.Л., Чемберлен Л.Х. и др. (1999). «Мутационный анализ функции цистеиновых белков в экзоцитозе инсулина». J. Cell Sci. 112 (9): 1345–51. PMID  10194413.
• Хаттори А., Окумура К., Нагасе Т. и др. (2001). «Характеристика длинных клонов кДНК из селезенки взрослого человека». ДНК Res. 7 (6): 357–66. Дои:10.1093 / dnares / 7.6.357. PMID  11214971.
• Evans GJ, Wilkinson MC, Graham ME, et al. (2002). «Фосфорилирование белка цистеиновой цепи протеинкиназой А. Влияние на модуляцию экзоцитоза». J. Biol. Chem. 276 (51): 47877–85. Дои:10.1074 / jbc.M108186200. PMID  11604405.
• Делукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. И др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 20 человека». Природа. 414 (6866): 865–71. Дои:10.1038 / 414865a. PMID  11780052.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Миллер Л.С., Суэйн Л.А., Чен Л. и др. (2004). «Ингибирование белком цистеиновой цепи (CSP) кальциевых каналов N-типа блокируется мутантным гентингтином». J. Biol. Chem. 278 (52): 53072–81. Дои:10.1074 / jbc.M306230200. PMID  14570907.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Джорджанни Ф, Беранова-Джорджанни С, Desiderio DM (2004). «Идентификация и характеристика фосфорилированных белков в гипофизе человека». Протеомика. 4 (3): 587–98. Дои:10.1002 / pmic.200300584. PMID  14997482.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Боал Ф., Чжан Х., Тесье С. и др. (2005). «Вариабельный С-конец белков цепочки цистеина модулирует экзоцитоз и белок-белковые взаимодействия». Биохимия. 43 (51): 16212–23. Дои:10.1021 / bi048612 +. PMID  15610015.
• Наточин М., Кэмпбелл Т.Н., Баррен Б. и др. (2005). «Характеристика белка цепи цистеина, регулятора G альфа (s)». J. Biol. Chem. 280 (34): 30236–41. Дои:10.1074 / jbc.M500722200. PMID  15972823.
• Чжан Х., Шмидт Б.З., Сунь Ф. и др. (2006). «Белок цистеиновой цепочки контролирует поздние стадии биогенеза регулятора трансмембранной проводимости при муковисцидозе». J. Biol. Chem. 281 (16): 11312–21. Дои:10.1074 / jbc.M512013200. PMID  16469739.
• Chi A, Valencia JC, Hu ZZ и др. (2007). «Протеомная и биоинформатическая характеристика биогенеза и функции меланосом». J. Proteome Res. 5 (11): 3135–44. Дои:10.1021 / pr060363j. PMID  17081065.

внешняя ссылка

• GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о нейрональном цероид-липофусцинозе