SGTA - SGTA

О французской авиакомпании, действовавшей с 1919 по 1933 год, см. Société Générale des Transports Aériens.

SGTA
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2VYI, 4CPG, 4GOD, 4GOE, 4GOF
Идентификаторы
Псевдонимы	SGTA, SGT, alphaSGT, hSGT, малый богатый глутамином тетратрикопептидный повтор, содержащий альфа
Внешние идентификаторы	OMIM: 603419 MGI: 1098703 ГомолоГен: 31122 Генные карты: SGTA
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19p13.3 Начните 2,754,715 бп[1] Конец 2,783,282 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 C1 | 10 39,72 см Начните 81,044,075 бп[2] Конец 81,060,181 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание комплекса BAT3 • самоассоциация белков • идентичное связывание с белками • GO: 0032947 активность молекулярного адаптера Сотовый компонент • цитозоль • мембрана • ядро клетки • цитоплазма • пресинапс • внешний компонент мембраны синаптического пузырька • Комплекс TRC Биологический процесс • положительная регуляция ER-ассоциированного убиквитин-зависимого белкового катаболического процесса • GO: 0022415 вирусный процесс • убиквитин-зависимый путь ERAD • отрицательная регуляция ER-ассоциированного убиквитин-зависимого катаболического процесса белков • отрицательная регуляция убиквитинирования белков, участвующих в убиквитин-зависимом катаболическом процессе белков • вставка белка заякоренной мембраны в мембрану ER • шаперон-опосредованный сворачивание белка • Посттрансляционное нацеливание белка на мембрану эндоплазматического ретикулума • положительная регуляция опосредованного шаперонами сворачивания белков Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	6449	52551
Ансамбль	ENSG00000104969	ENSMUSG00000004937
UniProt	O43765	Q8BJU0
RefSeq (мРНК)	NM_003021	NM_024499 NM_001358549 NM_001358550
RefSeq (белок)	NP_003012	NP_078775 NP_001345478 NP_001345479
Расположение (UCSC)	Chr 19: 2,75 - 2,78 Мб	Chr 10: 81.04 - 81.06 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Малый богатый глутамином тетратрикопептидный повторяющийся белок альфа это белок что у людей кодируется SGTA ген.^[5][6][7] SGTA ортологи ^[8] также были выявлены в нескольких млекопитающие для которого доступны полные данные о геноме.

Функция

Этот ген кодирует белок, который способен взаимодействовать с основным неструктурным белком парвовируса H-1 и родственным белком теплового шока 70 кДа; однако его функция неизвестна. Поскольку этот транскрипт повсеместно экспрессируется в различных тканях, этот белок может выполнять служебную функцию.^[7]

Взаимодействия

SGTA был показан взаимодействовать с участием Рецептор гормона роста.^[6]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000104969 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000004937 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Кордес Е., Савельева Л., Шваб М., Роммелер Дж., Яунио Дж. К., Цеплух С. (август 1998 г.). «Выделение и характеристика SGT человека и идентификация гомологов в Saccharomyces cerevisiae и Caenorhabditis elegans». Геномика. 52 (1): 90–94. Дои:10.1006 / geno.1998.5385. PMID  9740675.
6. Шантл Дж. А., Роза М., Де Йонг А. П., Строус Дж. Дж. (Август 2003 г.). «Небольшой белок, содержащий тетратрикопептидный повтор, богатый глутамином (SGT), взаимодействует с мотивом убиквитин-зависимого эндоцитоза (UbE) рецептора гормона роста». Биохимический журнал. 373 (Pt 3): 855–863. Дои:10.1042 / BJ20021591. ЧВК  1223544. PMID  12735788.
7. «Ген Entrez: SGTA, содержащий малый богатый глутамином тетратрикопептидный повтор (TPR), альфа».
8. «Филогенетический маркер OrthoMaM: кодирующая последовательность SGTA».

дальнейшее чтение

• Робертс Дж. Д., Тапалия А., Мартинес-Лумбрерас С., Крыштофинская Е. М., Исааксон Р. Л. (декабрь 2015 г.). «Структурные и функциональные исследования небольшого, богатого глутамином, тетратрикопептидного повторяющегося белка альфа». Границы молекулярных биологических наук. 2: 71. Дои:10.3389 / fmolb.2015.00071. ЧВК  4683186. PMID  26734616.
• Хевнер Г.А., Аудья Т., Гольдштейн Г. (февраль 1990 г.). «Пептидные аналоги тимопентина различают специфические особенности рецептора тимопоэтина на двух линиях Т-клеток человека». Регуляторные пептиды. 27 (2): 257–262. Дои:10.1016 / 0167-0115 (90) 90044-В. PMID  2158125. S2CID  12562672.Герати Р.Дж., Талбот К.Дж., Каллахан М., Харпер В., Панганибан А.Т. (1994). «Зависимость от типа ячейки для функции Vpu». Журнал медицинской приматологии. 23 (2–3): 146–150. Дои:10.1111 / j.1600-0684.1994.tb00115.x. PMID  7966229. S2CID  20674152.
• Cziepluch C, Kordes E, Poirey R, Grewenig A, Rommelaere J, Jauniaux JC (май 1998 г.). «Идентификация нового клеточного TPR-содержащего белка, SGT, который взаимодействует с неструктурным белком NS1 парвовируса H-1». Журнал вирусологии. 72 (5): 4149–4156. Дои:10.1128 / JVI.72.5.4149-4156.1998. ЧВК  109644. PMID  9557704.
• Каллахан М.А., Хэндли М.А., Ли Й.Х., Талбот К.Дж., Харпер Д.В., Панганибан А.Т. (июнь 1998 г.). «Функциональное взаимодействие Vpu и Gag вируса иммунодефицита человека типа 1 с новым членом семейства белков с тетратрикопептидными повторами». Журнал вирусологии. 72 (6): 5189–5197. Дои:10.1128 / JVI.72.6.5189-5197.1998. ЧВК  110095. PMID  9573291.
• Каллахан М.А., Хэндли М.А., Ли Й.Х., Талбот К.Дж., Харпер Д.В., Панганибан А.Т. (октябрь 1998 г.). «Функциональное взаимодействие Vpu и Gag вируса иммунодефицита человека типа 1 с новым членом семейства белков с тетратрикопептидными повторами». Журнал вирусологии. 72 (10): 8461. Дои:10.1128 / JVI.72.10.8460c-8460c.1998. ЧВК  110251. PMID  9766974.
• Лю Ф.Х., Ву С.Дж., Ху С.М., Сяо С.Д., Ван С. (ноябрь 1999 г.). «Специфическое взаимодействие родственного белка теплового шока 70 кДа с тетратрикопептидными повторами». Журнал биологической химии. 274 (48): 34425–34432. Дои:10.1074 / jbc.274.48.34425. PMID  10567422.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Геномные исследования. 10 (11): 1788–1795. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (март 2001 г.). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геномные исследования. 11 (3): 422–435. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Симпсон Дж. С., Велленройтер Р., Поустка А., Пепперкок Р., Виманн С. (сентябрь 2000 г.). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». Отчеты EMBO. 1 (3): 287–292. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Хэндли М.А., Паддок С., Далл А., Панганибан А.Т. (декабрь 2001 г.). «Ассоциация Vpu-связывающего белка с микротрубочками и Vpu-зависимое перераспределение белка Gag ВИЧ-1». Вирусология. 291 (2): 198–207. Дои:10.1006 / viro.2001.1166. PMID  11878889.
• Анджелетти П.С., Уокер Д., Панганибан А.Т. (июль 2002 г.). «Малый богатый глютамином белок / U-связывающий белок вирусного белка представляет собой новый коаперон, который влияет на активность белка теплового шока 70». Клеточный стресс и шапероны. 7 (3): 258–268. Дои:10.1379 / 1466-1268 (2002) 007 <0258: SGRPVP> 2.0.CO; 2. ЧВК  514826. PMID  12482202.
• Пай М.Т., Ян К.С., Цзэн С.Р., Ван С., Ченг Дж.В. (август 2003 г.). «1H, 15N и 13C резонансные отнесения домена тетратрикопептидного повтора (TPR) hSGT». Журнал биомолекулярного ЯМР. 26 (4): 381–382. Дои:10.1023 / А: 1024029117511. PMID  12815268. S2CID  19544209.
• Ван Х, Чжан Ц., Чжу Д. (ноябрь 2003 г.). «hSGT взаимодействует с N-концевой областью миостатина». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 311 (4): 877–883. Дои:10.1016 / j.bbrc.2003.10.080. PMID  14623262.
• Ленер Б., Семпл Д.И., Браун С.Е., Советник Д., Кэмпбелл Р.Д., Сандерсон К.М. (январь 2004 г.). «Анализ высокопроизводительной двугибридной дрожжевой системы и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области III класса MHC человека». Геномика. 83 (1): 153–167. Дои:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. PMID  14667819.
• Winnefeld M, Rommelaere J, Cziepluch C (февраль 2004 г.). «Человеческий небольшой белок, богатый глутамином, содержащий TPR, необходим для прогресса клеточного деления». Экспериментальные исследования клеток. 293 (1): 43–57. Дои:10.1016 / j.yexcr.2003.09.028. PMID  14729056.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кантли Л.С., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (33): 12130–12135. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.