UBE2C - UBE2C

UBE2C
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1I7K, 4YII, 5A31
Идентификаторы
Псевдонимы	UBE2C, UBCH10, dJ447F3.2, убиквитин-конъюгированный фермент E2 C
Внешние идентификаторы	OMIM: 605574 MGI: 1915862 ГомолоГен: 5096 Генные карты: UBE2C
Номер ЕС	2.3.2.24
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20q13.12 Начинать 45,812,576 бп[1] Конец 45,816,957 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 H3 | 2 85,27 см Начинать 164,769,898 бп[2] Конец 164,778,822 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • связывание нуклеотидов • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы • активность убиквитин-протеинтрансферазы • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание АТФ • активность фермента, конъюгированного с убиквитином • связывание убиквитин-протеин-лигазы • связывание убиквитин-подобной протеинлигазы Сотовый компонент • цитоплазма • нуклеоплазма • комплекс, способствующий анафазе • цитозоль • клеточная мембрана • убиквитинлигазный комплекс • ядро клетки Биологический процесс • полимеризация цепи свободного убиквитина • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • выход из митоза • положительная регуляция выхода из митоза • убиквитинирование, связанное с белком K11 • деление клеток • убиквитинирование, связанное с белком K48 • регуляция митотического перехода метафаза / анафаза • клеточный цикл • комплексно-зависимый катаболический процесс, стимулирующий анафазу • GO: 0090623, GO: 1903835, GO: 0007092, GO: 0051488 положительная регуляция активности убиквитин протеинлигазы • убиквитинирование белков • регуляция фазового перехода митотического клеточного цикла Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	11065	68612
Ансамбль	ENSG00000175063	ENSMUSG00000001403
UniProt	O00762 Q5TZN3	Q9D1C1
RefSeq (мРНК)	NM_001281741 NM_001281742 NM_007019 NM_181799 NM_181800 NM_181801 NM_181802 NM_181803	NM_026785
RefSeq (белок)	NP_001268670 NP_001268671 NP_008950 NP_861515 NP_861516 NP_861517 NP_008950.1	NP_081061
Расположение (UCSC)	Chr 20: 45,81 - 45,82 Мб	Chr 2: 164,77 - 164,78 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Убиквитин-конъюгированный фермент E2 C это белок что у людей кодируется UBE2C ген.^[5][6]

Модификация белков с помощью убиквитин является важным клеточным механизмом для нацеливания на аномальные или короткоживущие белки для деградации. Убиквитинирование включает как минимум три класса ферменты: убиквитин-активирующие ферменты, или E1s, убиквитин-конъюгирующие ферменты, или E2s, и убиквитин-протеиновые лигазы, или E3s. Этот ген кодирует член семейства E2-убиквитин-конъюгированных ферментов. Этот фермент необходим для разрушения митотического циклины и для прогрессирование клеточного цикла. Несколько альтернативно сращенный варианты транскриптов были найдены для этого гена, но полноразмерная природа некоторых вариантов не была определена.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000175063 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001403 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Таунсли FM, Аристархов А., Бек С., Хершко А., Рудерман СП (апрель 1997 г.). «Доминантно-отрицательный циклин-селективный белок-носитель убиквитина E2-C / UbcH10 блокирует клетки в метафазе». Proc Natl Acad Sci U S A. 94 (6): 2362–7. Дои:10.1073 / пнас.94.6.2362. ЧВК  20093. PMID  9122200.
6. «Ген Entrez: UBE2C убиквитин-конъюгированный фермент E2C».

дальнейшее чтение

• Fossey SC, Mychaleckyj JC, Pendleton JK, et al. (2001). «6,0-мегабазная транскрипционная карта с высоким разрешением области восприимчивости к диабету 2 типа на хромосоме 20 человека». Геномика. 76 (1–3): 45–57. Дои:10.1006 / geno.2001.6584. PMID  11549316.
• Тан З., Ли Б., Бхарадвадж Р. и др. (2002). «Белок APC2 Cullin и белок APC11 RING составляют минимальный убиквитинлигазный модуль комплекса, стимулирующего анафазу». Мол. Биол. Клетка. 12 (12): 3839–51. Дои:10.1091 / mbc.12.12.3839. ЧВК  60759. PMID  11739784.
• Делукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. И др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 20 человека». Природа. 414 (6866): 865–71. Дои:10.1038 / 414865a. PMID  11780052.
• Линь И, Хван В.С., Басаваппа Р. (2002). «Структурный и функциональный анализ человеческого митотического специфического убиквитин-конъюгированного фермента, UbcH10». J. Biol. Chem. 277 (24): 21913–21. Дои:10.1074 / jbc.M109398200. PMID  11927573.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Окамото Ю., Одзаки Т., Миядзаки К. и др. (2003). «UbcH10 представляет собой связанный с раком фермент, конъюгированный с убиквитином Е2». Рак Res. 63 (14): 4167–73. PMID  12874022.
• Чуанг TH, Улевич RJ (2004). «Triad3A, убиквитин-протеинлигаза E3, регулирующая Toll-подобные рецепторы». Nat. Иммунол. 5 (5): 495–502. Дои:10.1038 / ni1066. PMID  15107846. S2CID  39773935.
• Вагнер К.В., Сапиносо Л.М., Эль-Рифаи В. и др. (2004). «Сверхэкспрессия, геномная амплификация и терапевтический потенциал ингибирования конъюгазы убиквитина UbcH10 в карциномах человека различного анатомического происхождения». Онкоген. 23 (39): 6621–9. Дои:10.1038 / sj.onc.1207861. PMID  15208666.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Le XF, Lammayot A, Gold D и др. (2005). «Гены, влияющие на клеточный цикл, рост, поддержание и чувствительность к лекарствам, предпочтительно регулируются антителом против HER2 через передачу сигналов фосфатидилинозитол-3-киназы-AKT». J. Biol. Chem. 280 (3): 2092–104. Дои:10.1074 / jbc.M403080200. PMID  15504738.
• Палланте П., Берлингьери М.Т., Тронконе Дж. И др. (2005). «Сверхэкспрессия UbcH10 может представлять собой маркер анапластической карциномы щитовидной железы». Br. J. Рак. 93 (4): 464–71. Дои:10.1038 / sj.bjc.6602721. ЧВК  2361574. PMID  16106252.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Такахаши Ю., Исии Ю., Нишида Ю. и др. (2006). «Обнаружение аберраций гена убиквитин-конъюгированного фермента E2C (UBE2C) при распространенном раке толстой кишки с метастазами в печени с помощью ДНК-микрочипа и двухцветной FISH». Рак Генет. Цитогенет. 168 (1): 30–5. Дои:10.1016 / j.cancergencyto.2005.12.011. PMID  16772118.
• Лин Дж., Рауф Д.А., Ван З. и др. (2007). «Экспрессия и эффект ингибирования убиквитин-конъюгированного фермента E2C на аденокарциному пищевода». Неоплазия. 8 (12): 1062–71. Дои:10.1593 / neo.05832. ЧВК  1783715. PMID  17217624.
• Иета К., Одзима Э., Танака Ф. и др. (2007). «Идентификация сверхэкспрессированных генов при гепатоцеллюлярной карциноме, с особым упором на экспрессию гена убиквитин-конъюгированного фермента E2C». Int. J. Рак. 121 (1): 33–8. Дои:10.1002 / ijc.22605. PMID  17354233. S2CID  12277353.