Микобактерии абсцесс - Mycobacterium abscessus
Микобактерии абсцесс | |
---|---|
Штамм GD01 Mycobacterium abscessus, выделенный от пациента | |
Научная классификация | |
Домен: | Бактерии |
Тип: | Актинобактерии |
Учебный класс: | Актинобактерии |
Заказ: | Коринебактерии |
Семья: | Микобактерии |
Род: | Микобактерии |
Разновидность: | М. абсцесс |
Биномиальное имя | |
Микобактерии абсцесс (Мур и Фрерихс 1953 г.) Кусуноки и Эзаки 1992 г. |
Микобактерии абсцесс комплекс (MABSC) - это группа быстрорастущих, множественная лекарственная устойчивость, нетуберкулезные микобактерии (NTM) виды, которые являются обычными загрязнителями почвы и воды. Несмотря на то что М. абсцесс сложные наиболее частые причины хронический Легочная инфекция и инфекции кожи и мягких тканей (SSTI), комплекс также может вызывать инфекцию почти во всех органах человека, в основном у пациентов с подавленным иммунная система.[1] Среди видов NTM, ответственных за заболевание, инфекция, вызванная М. абсцесс сложнее лечить из-за противомикробный устойчивость к лекарству.[2]
Описание
Микобактерии абсцесс клетки Грамположительный, неподвижный, кислотоустойчивый стержни около 1,0–2,5 мкм в длину и 0,5 мкм в ширину. Они могут образовывать колонии на Среда Левенштейна – Йенсена которые кажутся гладкими или грубыми, белыми или сероватыми, и нефотохромогенный.
Физиология
М. абсцесс показывает рост при 28 и 37 ° C через 7 дней, но не при 43 ° C. Он может расти МакКонки агар при 28 ° C и даже 37 ° C. Он показывает толерантность к физиологическим средам (5% NaCl) и гидроксиламину 500 мг / л (яичная среда Огава) и 0,2% пикрату (агаризованная среда Саутона). Было показано, что штаммы этого вида разлагают антибиотик p-аминосалицилат. М. абсцесс также было показано, что они производят арилсульфатаза, но не нитратредуктазы и гидролазы Твин 80. Он показывает отрицательный результат теста на поглощение железа и отсутствие использования фруктоза, глюкоза, оксалат, или же цитрат как единственный источник углерода.
Дифференциальные характеристики
М. абсцесс и M. chelonae можно отличить от М. fortuitum или же М. peregrinum по их неспособности уменьшить нитрат и поглощать железо. Толерантность к 5% NaCl в среде Левенштейна-Йенсена, толерантность к 0,2% пикрату в агаре Саутона] и неиспользование цитрата в качестве единственного источника углерода являются отличительными характеристиками М. абсцесс из M. chelonae. М. абсцесс и M. chelonae sequevar У меня идентичная последовательность в области 54-510 16S рРНК, хотя оба вида можно различить по их hsp65, ЕГО или rpoB генные последовательности.
Генетика
Предварительная последовательность генома М. абсцесс subsp. Bolletii BDТ был завершен в 2012 году.[3] С тех пор большое количество напряжения от этого подвида были геномы упорядочены, приводя к уточнению границ подвидов. В 1992 г. М. абсцесс был впервые признан отдельным видом. В 2006 году эта группа была разделена на три подвида: М. а. абсцесс, М. а. Bolletii, и М. а. Massiliense. В 2011 году последние два были ненадолго объединены в один подвид, но впоследствии были снова разделены после большей доступности данных о последовательности генома, что показало, что три подвида образовали генетически разные группы.[4]
Эти отдельные группы также соответствуют важным биологическим различиям. Клинически важные различия включают различную чувствительность к антибиотикам. М. абсцесс subsp. абсцесс и Bolletii нести общий устойчивость к антибиотикам ген, придающий устойчивость к макролидам антибиотики, пока М. а. Massiliense считается, что у него нефункциональная копия, поэтому он более восприимчив к антибиотикам и его легче лечить.[4]
Патогенез
М. абсцесс может вызвать заболевание легких, кожные инфекции, Центральная нервная система инфекции, бактериемия, глазные инфекции и другие, менее распространенные заболевания.[4]
Хроническое заболевание легких чаще всего встречается у уязвимых хозяев с основным заболеванием легких, таким как кистозный фиброз, бронхоэктазия, и ранее туберкулез. Клинические симптомы легочной инфекции различаются по масштабу и интенсивности, но обычно включают хронический кашель, часто с гнойной мокротой. Кровохарканье также может присутствовать. Системные симптомы включают: недомогание, усталость, и потеря веса при запущенном заболевании.[5] Диагноз М. абсцесс легочная инфекция требует наличия симптомов, радиологических аномалий и микробиологические культуры.
М. абсцесс может вызывать кожные инфекции у пациентов с иммунодефицитом, пациентов, которые недавно перенесли операцию, татуировка, или же иглоукалывание, или после воздействия горячие источники или спа.[4] Это может быть связано с инфекциями среднего уха (средний отит ).[6]
Заболеваемость М. абсцесс со временем число инфекций увеличивается.[4][7] Вспышки М. абсцесс были зарегистрированы в больницах и клинических учреждениях по всему миру.[8] В то время как вспышки, вызывающие серьезную клиническую озабоченность, связаны с передачей (скорее всего, косвенной передачей) между уязвимыми пациентами, такими как те, кто получает трансплантацию легких или лечится от муковисцидоза, о вспышках также сообщалось в клиниках, предоставляющих косметические операции. липосакция, мезотерапия и внутривенное вливание клеточной терапии, хотя это больше связано с загрязненными дезинфицирующими средствами, физиологическим раствором и инструментами, чем с контактом между пациентами.[4]
Управление
Бактериофаговая терапия
Исследование 2019 года подтвердило возможность фаги в уничтожении устойчивых бактерий, не поддающихся лечению антибиотиками.[9] Исследовательские лаборатории объединились, чтобы найти эти фаги путем сбора, выделения и воздействия на них резистентных М. абсцесс который был изолирован от пациента в Лондоне.[9]
В пробирке
Бактериофаг, известный как Мадди, оказался эффективным в уничтожении отдельных М. абсцесс штамм (GD01), в то время как фаги, подобные ZoeJ и BPs, обладали пониженной способностью инфицировать GD01.[9] Однако смесь фагов, Muddy и модифицированных версий ZoeJ и BP полностью заразила и убила GD01.[9]
В естественных условиях
Коктейль из бактериофагов, Мадди, ZoeJ и БП эффективно убил штамм M. abscessus in vitro.[9] Потенциал, который это продемонстрировал, стимулировал начало лечения пациентов с инфекцией GD01.[9] Каждые 12 часов пациенту вводили коктейль с бактериофагами.[9]
Один день лечения показал высокий уровень бактериофагов в кровотоке.[9] Это предполагало, что их выпускали в кровоток и размножаются для заражения бактерий.[9] О значительных побочных эффектах не сообщалось.[9] У этого пациента были найдены нужные фаги, но другой штамм может быть чувствительным к разным фагам.[9]
Тип штамма
Типовой штамм М. абсцесс, чаще всего обозначаемый как ATCC19977, был выделен в 1953 году от инфекции коленного сустава человека с абсцессоподобными поражениями, в результате чего штамм был назван "абсцесс".[10] Однако этот штамм не был признан отдельным видом до 1992 года, когда Гибридизация ДНК работа идентифицировала его как генетически отличного от его родственника, M. chelonae.[11] Геном типового поезда был опубликован в 2009 году.[12]
ATCC 19977 = CCUG 20993 = CIP 104536 = DSM 44196 = JCM 13569 = NCTC 13031
Этимология
С латинского ab- («Прочь») + уступка («Идти») абсцесс назван в честь того, что жидкость покидает тело через гной. М. абсцесс был впервые выделен из ягодичных абсцессов у 62-летней пациентки, которая в детстве повредила колено и 48 лет спустя перенесла диссеминированную инфекцию. Виды М. bolletii, названный в честь покойного микробиолога и систематика Клод Болле, был описан в 2006 году.
Смотрите также
Рекомендации
Эта статья включает текст из общественного достояния из CDC, как процитировано
- ^ Сон, Джун Ён; Сон, Чан Ук; Чон, Хе Вон; Чеонг, Хи Джин; Ким, У Джу; Ким, Мин Джа (13 января 2006 г.). «Вспышка кожной инфекции после акупунктуры, вызванной Mycobacterium abscessus». BMC Инфекционные болезни. 6: 6. Дои:10.1186/1471-2334-6-6. ISSN 1471-2334. ЧВК 1361796. PMID 16412228.
- ^ Ли; и другие. (2015). «Микобактерии абсцессов сложных инфекций у человека». Emerg Infect Dis. 21 (9): 1638–1646. Дои:10.3201/2109.141634. ЧВК 4550155. PMID 26295364.
- ^ Choi, G.-E .; Cho, Y.-J .; Koh, W.-J .; Chun, J .; Чо, С.-Н .; Шин, С. Дж. (24 апреля 2012 г.). «Проект последовательности генома Mycobacterium abscessus subsp. Bolletii BDT». Журнал бактериологии. 194 (10): 2756–2757. Дои:10.1128 / JB.00354-12. ЧВК 3347169. PMID 22535937.
- ^ а б c d е ж Ли, Мэн-Руи; Шэн, Ван-Хуэй; Хунг, Цзянь-Цзин; Ю, Чонг-Джен; Ли, Ли-На; Сюэ, По-Рен (сентябрь 2015 г.). «Комплексные инфекции Mycobacterium abscessus у людей». Возникающие инфекционные заболевания. 21 (9): 1638–46. Дои:10.3201/2109.141634. ЧВК 4550155. PMID 26295364.
- ^ Джонсон; Оделл (2014). «Нетуберкулезные микобактериальные легочные инфекции». J Thorac Dis. 6 (3): 210–220. Дои:10.3978 / j.issn.2072-1439.2013.12.24. ЧВК 3949190. PMID 24624285.
- ^ Линманс Дж. Дж., Стокроос Р. Дж., Линссен К. Ф. (сентябрь 2008 г.). «Mycobacterium abscessus, нечастая причина хронического среднего отита: клинический случай и обзор литературы». Arch. Отоларингол. Хирургия головы и шеи. 134 (9): 1004–6. Дои:10.1001 / archotol.134.9.1004. PMID 18794448.[постоянная мертвая ссылка ]
- ^ Маррас, Теодор К .; Мендельсон, Дэвид; Маршан-Остин, Алекс; Мэй, Кевин; Джеймисон, Фрэнсис Б. (ноябрь 2013 г.). "Легочная нетуберкулезная микобактериальная болезнь, Онтарио, Канада, 1998–2010 гг.". Возникающие инфекционные заболевания. 19 (11): 1889–1891. Дои:10.3201 / eid1911.130737. ЧВК 3837646. PMID 24210012.
- ^ Брайант, Жозефина М .; Grogono, Dorothy M .; Родригес-Ринкон, Даниэла; Эвераль, Изобель; Браун, Карен П .; Морено, Пабло; Верма, Глубоководье; Хилл, Эмили; Драйконинген, Юдифь; Гиллиган, Питер; Эстер, Чарльз Р .; Нет, Пидар Дж .; Гиддингс, Оливия; Белл, Скотт С .; Томсон, Рэйчел; Уэйнрайт, Клэр Э .; Коултер, Крис; Пандей, Сушил; Вуд, Мишель Э .; Стоквелл, Ребекка Э .; Ramsay, Kay A .; Шеррард, Лора Дж .; Кидд, Тимоти Дж .; Джаббур, Насиб; Джонсон, Грэм Р .; Knibbs, Люк Д .; Моравска, Лидия; Хитрый, Питер Д .; Джонс, Эндрю; Билтон, Диана; Лоуренсон, Ян; Радди, Майкл; Бурк, Стивен; Bowler, Ian C.J.W .; Чепмен, Стивен Дж .; Клейтон, Эндрю; Каллен, Майри; Демпси, Оуэн; Дентон, Майлз; Десаи, Майя; Дрю, Ричард Дж .; Эденборо, Франк; Эванс, Джейсон; Фолб, Джонатан; Дэниелс, Томас; Хамфри, Хелен; Исальская, Барбара; Йенсен-Фангель, Сорен; Йёнссон, Бодил; Джонс, Эндрю М .; Katzenstein, Terese L .; Lillebaek, Troels; МакГрегор, Гордон; Мэйелл, Сара; Миллар, Майкл; Модха, Дебора; Нэш, Эдвард Ф .; О’Брайен, Кристофер; О’Брайен, Дейрдра; Охри, Чандра; Pao, Caroline S .; Пекхэм, Дэниел; Перрин, Фелисити; Перри, Одри; Пресслер, Таня; Пртак, Лаура; Qvist, Tavs; Робб, Али; Роджерс, Хелен; Шаффер, Кирстен; Шафи, Надя; ван Инген, Якко; Уолшоу, Мартин; Ватсон, Дэни; Уэст, Норин; Уайтхаус, Джоанна; Хаворт, Чарльз С .; Харрис, Саймон Р .; Ордуэй, Дайан; Паркхилл, Джулиан; Флото, Р. Андрес (10 ноября 2016 г.). «Возникновение и распространение нетуберкулезных микобактерий, передающихся человеку, с множественной лекарственной устойчивостью». Наука. 354 (6313): 751–757. Bibcode:2016Научный ... 354..751B. Дои:10.1126 / science.aaf8156. ЧВК 5142603. PMID 27846606.
- ^ а б c d е ж грамм час я j k «Созданные фаги лечат лекарственно-устойчивые инфекции». Национальные институты здоровья (NIH). 2019-05-20. Получено 2019-11-06.
- ^ Мур, Моррис; Фрерихс, Джон Б. (февраль 1953 г.). «Необычная кислотно-быстрая инфекция колена с подкожными абсцессоподобными поражениями ягодичной области». Журнал следственной дерматологии. 20 (2): 133–169. Дои:10.1038 / jid.1953.18. PMID 13035193.
- ^ Kusunoki, S .; Ezaki, T .; и другие. (1992). «Предложение Mycobacterium peregrinum sp. Nov., Nom. Rev. И повышение Mycobacterium chelonae subsp. Abscessus (Kubica et al.) До статуса вида: Mycobacterium abscessus comb. Nov». Int. J. Syst. Бактериол. 42 (2): 240–245. Дои:10.1099/00207713-42-2-240. PMID 1581184.
- ^ Риполь, Фабьен; Пасек, Софи; Шеновиц, Шанталь; Доссат, Кэрол; Барбе, Валери; Роттман, Мартин; Махерас, Эдуард; Хейм, Беате; Херрманн, Жан-Луи; Даффе, Мамаду; Брош, Роланд; Рислер, Жан-Лу; Гайяр, Жан-Луи; Ахмед, Нияз (19 июня 2009 г.). «Гены немикобактериальной вирулентности в геноме возникающего патогена Mycobacterium abscessus». PLOS ONE. 4 (6): e5660. Bibcode:2009PLoSO ... 4.5660R. Дои:10.1371 / journal.pone.0005660. ЧВК 2694998. PMID 19543527.
внешняя ссылка
- Типовой штамм Микобактерии абсцесс в BacНырять - База метаданных по бактериальному разнообразию
- Руководство для пациентов и врачей - AIT Therapeutics
- Мабеллини - аннотированный, смоделированный структурный протеом Микобактерии абсцесс
- https://www.hhmi.org/news/phage-therapy-treats-patient-with-drug-resistant-bacterial-infection