GMP-синтаза - GMP synthase

GMP синтетаза (гидролизует глутамин)
GMP синтетаза, человек
Идентификаторы
Номер ЕС	6.3.5.2
Количество CAS	37318-71-1
Базы данных
IntEnz	Просмотр IntEnz
БРЕНДА	BRENDA запись
ExPASy	Просмотр NiceZyme
КЕГГ	Запись в KEGG
MetaCyc	метаболический путь
ПРИАМ	профиль
PDB структуры	RCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтология	AmiGO / QuickGO
Поиск ЧВК статьи PubMed статьи NCBI белки

Концевой домен С GMP-синтетазы
Escherichia coli gmp синтетаза в комплексе с amp и пирофосфатом.[1]
Идентификаторы
Символ	GMP_synt_C
Pfam	PF00958
ИнтерПро	IPR001674
PROSITE	PDOC00405
SCOP2	1 галлон в минуту / Объем / СУПФАМ
Доступные белковые структуры: Pfam   структуры / ECOD   PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum резюме структуры

GMPS
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2VPI, 2VXO
Идентификаторы
Псевдонимы	GMPS, GMP-синтаза, гуанинмонофосфат-синтаза, GATD7, GMP-синтаза
Внешние идентификаторы	OMIM: 600358 MGI: 2448526 ГомолоГен: 68367 Генные карты: GMPS
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[2] Группа 3q25.31 Начинать 155,870,650 бп[2] Конец 155,944,020 бп[2]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[3] Группа 3 | 3 E1 Начинать 63,976,106 бп[3] Конец 64,022,579 бп[3]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • активность лигазы • пирофосфатазная активность • Связывание АТФ • Активность GMP-синтазы (гидролизирующей глутамин) • GMP-синтазная активность Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль Биологический процесс • процесс биосинтеза пуриновых нуклеотидов • метаболический процесс глутамина • процесс биосинтеза пуринового азотистого основания • процесс биосинтеза пуринового рибонуклеозида монофосфата • GMP биосинтетический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8833	229363
Ансамбль	ENSG00000163655	ENSMUSG00000027823
UniProt	P49915	Q3THK7
RefSeq (мРНК)	NM_003875	NM_001033300
RefSeq (белок)	NP_003866	NP_001028472
Расположение (UCSC)	Chr 3: 155,87 - 155,94 Мб	Chr 3: 63.98 - 64.02 Мб
PubMed поиск	[4]	[5]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гуанозинмонофосфатсинтетаза, (EC 6.3.5.2), также известный как GMPS является фермент что обращает ксантозин монофосфат к монофосфат гуанозина.^[6]

В синтезе пуриновых нуклеотидов de novo IMP является метаболитом точки ветвления, в которой путь расходится до синтеза гуаниновых или адениновых нуклеотидов. В пути гуаниновых нуклеотидов есть 2 фермента, участвующих в преобразовании IMP в GMP, а именно IMP-дегидрогеназа (IMPD1), которая катализирует окисление IMP до XMP, и GMP-синтетаза, которая катализирует аминирование XMP в GMP.^[6]

Энзимология

В энзимология, а GMP-синтетаза (гидролиз глютамина) (EC 6.3.5.2 ) является фермент который катализирует то химическая реакция

АТФ + ксантозин 5'-фосфат + L-глютамин + H₂О ${\displaystyle \rightleftharpoons }$ AMP + дифосфат + GMP + L-глутамат

4 субстраты этого фермента АТФ, ксантозин 5'-фосфат, L-глютамин, и ЧАС₂О, а его 4 товары находятся AMP, дифосфат, GMP, и L-глутамат.

Этот фермент принадлежит к семейству лигазы, особенно те, которые образуют углерод-азотные связи углерод-азотные лигазы с глутамином в качестве амидо-N-донора. В систематическое название этого класса ферментов ксантозин-5'-фосфат:L-глутамин амидолигаза (AMP-образующая). Другие широко используемые имена включают GMP-синтетаза (гидролиз глютамина), гуанилатсинтетаза (гидролизующий глутамин), гуанозинмонофосфатсинтетаза (гидролизующий глутамин), ксантозин-5'-фосфатамидотрансфераза, и гуанозин-5'-монофосфатсинтетаза. Этот фермент участвует в метаболизм пуринов и метаболизм глутамата. По крайней мере одно соединение, Псикофуранин известно подавлять этот фермент.

Структурные исследования

На конец 2007 г. 5 структуры были решены для этого класса ферментов, с PDB коды доступа 1 галлон в минуту, 1WL8, 2А9В, 2D7J, и 2DPL.

Рекомендации

1. Тесмер Дж. Дж., Клем Т. Дж., Дерас М. Л., Дэвиссон В. Дж., Смит Дж. Л. (январь 1996 г.). «Кристаллическая структура синтетазы GMP раскрывает новую каталитическую триаду и является структурной парадигмой для двух семейств ферментов». Структурная биология природы. 3 (1): 74–86. Дои:10.1038 / nsb0196-74. PMID  8548458. S2CID  30864133.
2. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000163655 - Ансамбль, Май 2017
3. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027823 - Ансамбль, Май 2017
4. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
6. «Энтрез Ген: гуанинмонфосфатсинтетаза GMPS».

дальнейшее чтение

• Пейдж Т., Бакай Б., Нихан В.Л. (1984). «Синтетаза GMP человека». Международный журнал биохимии. 16 (1): 117–20. Дои:10.1016 / 0020-711X (84) 90061-2. PMID  6698284.
• Накамура Дж., Страуб К., Ву Дж., Лу Л. (октябрь 1995 г.). «Функция гидролиза глутамина человеческой GMP-синтетазы. Идентификация основного активного центра цистеина». Журнал биологической химии. 270 (40): 23450–5. Дои:10.1074 / jbc.270.40.23450. PMID  7559506.
• Накамура Дж., Лу Л. (март 1995 г.). «Биохимическая характеристика синтетазы GMP человека». Журнал биологической химии. 270 (13): 7347–53. Дои:10.1074 / jbc.270.13.7347. PMID  7706277.
• Херст М., Халидей Е., Накамура Дж., Лу Л. (сентябрь 1994 г.). «Синтетаза GMP человека. Очистка белков, клонирование и функциональная экспрессия кДНК». Журнал биологической химии. 269 (38): 23830–7. PMID  8089153.
• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Федорова Л., Кост-Алимова М., Гизатуллин Р.З., Алимов А., Забаровская В.И., Селеш А. и др. (1997). «Отнесение и упорядочение двадцати трех уникальных NotI-связывающих клонов, содержащих экспрессированные гены, включая ген гуанозин-5'-монофосфатсинтетазы, с хромосомой 3 человека». Европейский журнал генетики человека. 5 (2): 110–6. Дои:10.1159/000484744. PMID  9195163.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Pegram LD, Megonigal MD, Lange BJ, Nowell PC, Rowley JD, Rappaport EF, Felix CA (декабрь 2000 г.). «Транслокация t (3; 11) при остром миелоидном лейкозе, связанном с лечением, сливает MLL с геном GMPS (гуанозин-5'-монофосфат-синтетаза)». Кровь. 96 (13): 4360–2. Дои:10.1182 / кровь.V96.13.4360. PMID  11110714.
• Гуо Д., Хан Дж., Адам Б.Л., Колберн Н.Х., Ван М.Х., Донг З. и др. (Декабрь 2005 г.). «Протеомный анализ субстратов SUMO4 в клетках HEK293 в условиях стресса, вызванного сывороточным голоданием». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 337 (4): 1308–18. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.09.191. PMID  16236267.
• Абрамс Р., Бентли М. (1959). «Биосинтез пуринов нуклеиновых кислот. III. Образование гуанозин-5'-фосфата из ксантозин-5'-фосфата и L-глутамина». Arch. Biochem. Биофизы. 79: 91–110. Дои:10.1016/0003-9861(59)90383-2.
• Лагерквист У (июль 1958 г.). «Биосинтез гуанозин-5'-фосфата. II. Аминирование ксантозин-5'-фосфата очищенным ферментом из печени голубя». Журнал биологической химии. 233 (1): 143–9. PMID  13563458.

внешняя ссылка

• GMP + синтетаза в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для GMP-синтазы человека [глутамин-гидролизный]