Анаэрококк - Anaerococcus

Анаэрококк
Научная классификация
Домен:
Бактерии
Тип:
Фирмикуты
Учебный класс:
Clostridia
Заказ:
Clostridiales
Род:
Анаэрококк

Анаэрококк - это род бактерий. Типовой вид: Anaerococcus prevotii.[1] Эти бактерии грамположительны и строго анаэробны.[2][3][4] Род Anaerococcus был предложен в 2001 году.[2][4] Его геном был секвенирован в августе 2009 года. Род Anaerococcus - один из шести родов, отнесенных к группе GPAC (грамположительные анаэробные кокки).[5] Эти шесть родов (Пептострептококк, Пептонифил, Парвимонас, Finegoldia, Anaerococcus и Murdochiella) обнаруживаются в организме человека как часть комменсальной микробиоты человека.[6][7][5]

Он может вызвать инфекцию и является нормальной частью микробиома человека.[8] Большинство видов этого рода можно найти как часть нормальной флоры кожи, человеческого влагалища, полости носа, ротовой полости и фекалий.[2] Это патоген людей, обнаруженный в яичник абсцессы, хронические раны и выделения из влагалища.[9] Более того, некоторые виды могут быть изолированы от язвы стопы и колено артритис.[2] Он может присутствовать в инфекция мочеиспускательного канала, хронические язвы, эмпиема плевры, инфекции крови и мягкие ткани инфекции. Он участвует в полимикробных инфекциях.[10] Более того, штаммы Anaerococcus были обнаружены в микробиоте подмышек, что позволяет предположить, что некоторые виды этого рода могут играть роль в возникновении запаха подмышек.[10][11]

Физиология

Род Anaerococcus - неподвижные бактерии, которые не могут образовывать споры и.[4][12][2] В зависимости от породы расположение может быть разным. Чаще всего в этом роде встречаются пары, тетрады, короткие цепи и неправильные образования.[10][4] Размер их ячеек может варьироваться от 0,6 мкм до 0,9 мкм.[10] Однако, когда они выращиваются с использованием обогащенного кровяного агара, их размер может составлять от 0,5 мкм до 2 мкм.[10] В этом роду существует более одной основных клеточных жирных кислот: C18: 1, C16: 1, C18 и C16.[12] Большинство видов этого рода индол-отрицательные и коагуазо-отрицательные.[10] Как правило, виды Anaerococcus чувствительны к пенициллинам, но устойчивы к ним. тетрациклин, эритромицин и клиндамицин.[9]

Метаболизм

Род Anaerococcus классифицируется как сахаролитический бактерии.[2][13] Его разновидности могут быть от слабосахаролитических (напр. A. prevotii, A. lactolyticus) до сильно сахаролитических (напр. A. Hydrogenalis).[13] Этот род слабо сбраживает углеводы.[6] Основными источниками энергии, используемой в метаболизме анаэрококков, являются пептоны и аминокислоты.[4][10] Три основных сахара, ферментируемых в пределах этого рода, - это глюкоза, манноза, фруктоза и сахароза.[12][4] После ферментации сахаров анаэрококк производит слабые кислоты в качестве конечного продукта метаболизма.[13] В составе этих конечных продуктов метаболизма этот вид может производить масляную кислоту, молочную кислоту и некоторое количество пропионовой и янтарной кислот.[12] Тем не менее, основным метаболитом, продуцируемым Anaerococcus, является бутират.[13][10][2]

Разновидность

До недавнего времени у рода Anaerococcus было 14 известных видов.[14][9] Шесть видов изначально были отнесены к роду Peptostreptococcus, но затем на основании их характеристик были переклассифицированы в новый род Anaerococcus: A. Hydrogenalis, A. lactolyticus, А. октавиус, A. prevotii, A. tetradius, и A. vaginalis.[5][2] На протяжении многих лет представители этого рода чаще встречались на теле. A. prevotii.[9]

Anaerococcus Hydrogenalis

A. Hydrogenalis он присутствует при выделениях из влагалища и абсцессах яичника.[4] Присутствие Anaerococcus Hydrogenalis в метаболизме кишечника, и потребление ими колина было связано с сердечно-сосудистыми заболеваниями.[15] В отличие от большинства видов этого рода, Anaerococcus Hydrogenalis индол-положительный.[4] Кроме того, некоторые штаммы этого вида могут давать уреаза.[4]

Лактолитический анаэрококк

Лактолитический анаэрококк[10] является одним из двух видов рода Anaerococcus, которые были обнаружены из диабетическая стопа.[9] Более того, A. lactolyticus можно извлечь из пролежни.[9]

Анаэрококк октавий

В отличие от большинства видов этого рода, Анаэрококк октавий не был связан с человеческими инфекциями.[9] Тем не менее, недавно выявлен новый случай. А. октавиус может вызвать бактериемия.[9] Хотя это редко, Анаэрококк октавий может быть причиной заражения человека.[9] Другие исследования обнаружили А. октавиус В составе полости носа, кожи и влагалища нормальная флора.[9][4] Эти бактерии могут сбраживать рибозу, глюкозу и маннозу.[4]

Anaerococcus prevotii

A. prevotii обычно обнаруживается в выделениях из влагалища, плазме крови человека и некоторых типах абсцессов, таких как абсцессы яичников, брюшно-крестцового отдела и / или легкие.[9][6] Даже больше, Anaerococcus prevotii является частью нормальной флоры кожи, полости рта и кишечника.[6] Исследования показали Anaerococcus prevotii представляет сопротивление Цефтазидим, Клиндамицин, Левофлоксацин.[9] В отличие от других видов, A. prevotii не может сбраживать глюкозу.[16]

Анаэрококк тетрадиус

A. tetradius впервые был выделен из выделений из влагалища и абсцессов яичников.[4] Эти бактерии могут брожение глюкоза и манноза.[4]

Анаэрококк вагинальный

A. vaginalis впервые был извлечен из выделений из влагалища и абсцессов яичников, хотя эти бактерии также можно обнаружить при пролежнях и диабетической стопе.[4][9] Некоторые штаммы этого вида могут быть индол-положительными.[4]

Анаэрококк мурдохийский

A. Murdochii представляет устойчивость к антибиотикам клиндамицин и канамицин.[9] Кроме того, исследования показали, что этот вид имеет временную устойчивость к пенциллины.[9]

Анаэрококк degenerii

A. degenerii

Анаэрококк провансенсис

A. Провансенсис был выделен из абсцесса шейки матки.[17] Этот вид может сбраживать лактозу, в отличие от A. tetradius, A. prevotii, и А. октавиус.[17] Первый анализ, сделанный на Анаэрококк провансенсис показал, что это восприимчиво к пенициллин G, имипенем, амоксиллин, метронидазол, цефотетан и ванкомицин.[17]

Анаэрококк сенегальский

A. senegalensis является одним из немногих видов Anerococcus, чей геном был секвенирован.[2] Геном имеет размер 1790835 бп.[2] Проведенный анализ не показал присутствия плазмиды.[2] Первоначально, Анаэрококк сенегальский был обнаружен в фекальной флоре здорового человека.[2]

Анаэрококк рубиинфантис

А. Rubiinfantis был обнаружен в образце стула, взятом у младенца с тяжелой острой недостаточностью питания в Сенегале.[18] На основе геномного анализа, Анаэрококк рубиинфантис имеет высокую чувствительность к антибиотикам.[18] По этой причине эти бактерии можно лечить обычными пероральными антибиотиками.[18] А. Rubiinfantis обладают активностью каталазы, которая не характерна для анаэробных бактерий.[18]

Anaerococcus marasmi

А. марасми был впервые обнаружен в 2016 году в образце стула у ребенка с маразм.[14] Как A. rubiinfantis, Anaerococcus marasmi катализатор положительный.[14] А. марасми может расти в диапазоне pH от 6,5 до 8.[14] Более того, А. марасми имеет высокое сходство последовательностей (97,6%) с A. prevotii на основе их 16S рРНК.[14]

Анаэрококк уриномассиленсис

А. urinomassiliensis был выделен из образца мочи подростка мужского пола с мембранопролиферативный гломерулонефрит и аутоинмунный гепатит.[19] Чтобы увидеть рост этих бактерий, потребовалось 10 дней анаэробной инкубации.[19]Анаэрококк urinomassiliensis не обладает ни оксидазной, ни каталитической активностью.[19]

Anaerococcus nagyae

A. nagyae был впервые обнаружен в посеве крови пациента с ишемия и грипп.[5] Ячейки Anaerococcus nagyae расположены попарно.[5] Хотя они могут слабо сбраживать маннозу, исследования показали, что эти анаэробные бактерии не могут сбраживать глюкозу и раффинозу.[5] A. nagyae устойчив к колистин, но он чувствителен к ванкомицину и канамицину.[5]

Рекомендации

  1. ^ Parte, A.C. «Анаэрококк». Получено 27 марта 2017.
  2. ^ а б c d е ж грамм час я j k л Lagier JC, El Karkouri K, Nguyen TT, Armougom F, Raoult D, Fournier PE (март 2012 г.). «Несмежная законченная последовательность генома и описание Anaerococcus senegalensis sp. Nov». Стандарты геномных наук. 6 (1): 116–25. Дои:10.4056 / sigs.2415480. ЧВК  3359877. PMID  22675604.
  3. ^ Версалович Дж., Кэрролл К.С., Функе Дж., Йоргенсен Дж. Х., Ландри М.Л., Уорнок Д.В., ред. (01.01.2011). «Пептострептококк, Finegoldia, Anaerococcus, Peptoniphilus, Veillonella и другие анаэробные кокки». Руководство по клинической микробиологии (10-е изд.). Американское общество микробиологов. С. 803–816. Дои:10.1128 / 9781555816728.ch48. ISBN  978-1-55581-463-2. Получено 2020-08-02.
  4. ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о Ezaki T, Kawamura Y, Li N, Li ZY, Zhao L, Shu S. (июль 2001 г.). «Предложение родов Anaerococcus gen. Nov., Peptoniphilus gen. Nov. И Gallicola gen. Nov. Для представителей рода Peptostreptococcus». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 51 (Pt 4): 1521–1528. Дои:10.1099/00207713-51-4-1521. PMID  11491354.
  5. ^ а б c d е ж грамм Veloo AC, de Vries ED, Jean-Pierre H, van Winkelhoff AJ (апрель 2016 г.). «Anaerococcus nagyae sp. Nov., Выделенный из клинических образцов человека». Анаэроб. 38: 111–115. Дои:10.1016 / j.anaerobe.2015.11.009. PMID  26639871.
  6. ^ а б c d Лабутти К., Пукал Р., Стинблок К., Главина Дель Рио Т, ​​Тайс Х, Коупленд А. и др. (Сентябрь 2009 г.). «Полная последовательность генома штамма типа Anaerococcus prevotii (PC1)». Стандарты геномных наук. 1 (2): 159–65. Дои:10.4056 / sigs.24194. ЧВК  3035230. PMID  21304652.
  7. ^ Veloo AC, Elgersma PE, van Winkelhoff AJ (июнь 2015 г.). «Anaerococcus degenerii sp. Nov., Выделенный из клинических образцов человека». Анаэроб. 33: 71–5. Дои:10.1016 / j.anaerobe.2015.02.002. PMID  25680238.
  8. ^ "BacMap". Получено 27 марта 2017.
  9. ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о Cobo F, Navarro-Marí JM (февраль 2020 г.). «Первое описание Anaerococcus octavius ​​как причины бактериемии». Анаэроб. 61: 102130. Дои:10.1016 / j.anaerobe.2019.102130. PMID  31765706.
  10. ^ а б c d е ж грамм час я Мерфи Э. К., Фрик И. М. (июль 2013 г.). «Грамположительные анаэробные кокки - комменсалы и условно-патогенные микроорганизмы». Обзор микробиологии FEMS. 37 (4): 520–53. Дои:10.1111/1574-6976.12005. PMID  23030831.
  11. ^ Фудзии, Такаяоши; Шинозаки, Дзюнко; Кадзиура, Такаяки; Ивасаки, Кейджи; Фудо, Рёсукэ (июль 2014 г.). «Недавно обнаруженный штамм Anaerococcus, ответственный за запах из подмышек, и новый ингибитор запаха из подмышечных впадин, пентагаллоил глюкоза». FEMS Microbiology Ecology. 89 (1): 198–207. Дои:10.1111/1574-6941.12347. PMID  24784923.
  12. ^ а б c d Эзаки, Такаюки; Окусу, Киёфуми (2015), «Анаэрококк», Руководство Берджи по систематике архей и бактерий, Американское онкологическое общество, стр. 1–5, Дои:10.1002 / 9781118960608.gbm00712, ISBN  978-1-118-96060-8
  13. ^ а б c d Эзаки, Такаюки; Ли, На; Кавамура, Йошиаки (2006), Дворкин, Мартин; Фалькоу, Стэнли; Розенберг, Юджин; Шлейфер, Карл-Хайнц (ред.), «Анаэробные грамположительные кокки», Прокариоты: Том 4: Бактерии: Firmicutes, Cyanobacteria, Нью-Йорк, Нью-Йорк: Springer US, стр. 795–808, Дои:10.1007/0-387-30744-3_26, ISBN  978-0-387-30744-2
  14. ^ а б c d е Tall ML, Pham TP, Bellali S, Ngom II, Delerce J, Lo C.I и др. (Май 2020 г.). «marasmi sp. nov., новая бактерия, выделенная из микробиоты кишечника человека». Новые микробы и новые инфекции. 35: 100655. Дои:10.1016 / j.nmni.2020.100655. ЧВК  7082211. PMID  32211195.
  15. ^ Ядав М., Верма М.К., Чаухан Н.С. (март 2018 г.). «Обзор метаболического потенциала микробиома кишечника человека в питании человека». Архив микробиологии. 200 (2): 203–217. Дои:10.1007 / s00203-017-1459-х. PMID  29188341. S2CID  3464103.
  16. ^ Песня Y, Лю Ц., Finegold SM (июнь 2007 г.). «Peptoniphilus gorbachii sp. Nov., Peptoniphilus olsenii sp. Nov. И Anaerococcus murdochii sp. Nov., Выделенные из клинических образцов человеческого происхождения». Журнал клинической микробиологии. 45 (6): 1746–52. Дои:10.1128 / JCM.00213-07. ЧВК  1933094. PMID  17428937.
  17. ^ а б c Pagnier I, Croce O, Robert C, Raoult D, La Scola B (июнь 2014 г.). «Несмежная законченная последовательность генома и описание Anaerococcus provenciensis sp. Nov». Стандарты геномных наук. 9 (3): 1198–210. Дои:10.4056 / sigs.5501035. ЧВК  4149013. PMID  25197492.
  18. ^ а б c d Тиджани Алоу М., Хелаифия С., Мишель С., Андрие С., Армстронг Н., Биттар Ф. и др. (Август 2016 г.). «Anaerococcus rubiinfantis sp. Nov., Выделенный из микробиоты кишечника сенегальского младенца с тяжелой острой недостаточностью питания». Анаэроб. 40: 85–94. Дои:10.1016 / j.anaerobe.2016.06.007. PMID  27328611.
  19. ^ а б c Моран А, Корню Ф, Цимаратос М, Лагье Дж. К., Кадорет Ф, Фурнье П. Е., Рауль Д. (сентябрь 2016 г.). «Anaerococcus urinomassiliensis sp. Nov., Выделенный из образца мочи 17-летнего мальчика, страдающего аутоиммунным гепатитом и мембранопролиферативным гломерулонефритом». Новые микробы и новые инфекции. 13: 56–8. Дои:10.1016 / j.nmni.2016.06.001. ЧВК  4933030. PMID  27408746.