Вибрион - Vibrio

Вибрион
Жгутиковый пятно V. cholerae
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Протеобактерии
Учебный класс:	Гаммапротеобактерии
Заказ:	Вибрионалес
Семья:	Vibrionaceae
Род:	Вибрион Пачини 1854 г.
Типовой вид
Холерный вибрион
Разновидность
V. adapatus V. aerogenes V. aestivus V. aestuarianus V. agarivorans V. albensis V. alfacsensis V. alginolyticus V. anguillarum V. areninigrae V. artabrorum V. atlanticus В. атипический В. лазурный V. brasiliensis V. bubulus V. calviensis В. Кэмпбеллий V. casei В. Чагасий V. cholerae В. cincinnatiensis В. coralliilyticus V. crassostreae V. cyclitrophicus V. diabolicus V. diazotrophicus V. ezurae V. fluvialis В. фортис В. фурниссии V. gallicus V. gazogenes V. gigantis V. halioticoli V. harveyi V. hepatarius В. гиппокампи V. hispanicus V. ichthyoenteri V. indicus V. kanaloae V. lentus V. litoralis В. логей V. mediterranei В. мечниковий V. mimicus В. мытили V. natriegens V. navarrensis V. neonatus V. neptunius V. nereis V. nigripulchritudo V. ordalii V. orientalis V. pacinii V. parahaemolyticus V. pectenicida V. penaeicida V. pomeroyi V. ponticus V. proteolyticus V. rotiferianus В. рубер V. Rumoiensis V. salmonicida V. scophthalmi V. splendidus V. superstes V. tapetis V. tasmaniensis V. tubiashii V. vulnificus В. воданис V. xuii Взолнованный: В. фишери к Aliivibrio fischeri V. hollisae к Grimontia hollisae

Вибрион это род из Грамотрицательные бактерии, имеющий форму изогнутого стержня (запятой),^[1][2][3] несколько видов, которые могут вызывать инфекция пищевого происхождения, как правило, связано с употреблением недоваренных морепродуктов. Обычно встречается в соленая вода, Вибрион виды факультативные анаэробы этот тест положительный для оксидаза и не образуют споры.^[4] Все представители рода подвижный и иметь полярные жгутики с ножнами. Вибрион виды обычно обладают двумя хромосомы, что необычно для бактерий.^[5][6] Каждая хромосома имеет отдельный и независимый источник репликации,^[7] и сохраняются вместе с течением времени в пределах рода.^[8] Недавние филогении были построены на основе набора генов (multilocus анализ последовательности ).^[1]

О. Ф. Мюллер (1773, 1786) описал восемь видов рода Вибрион (включен в Инфузория ), три из которых были спириловидными.^[9] Некоторые из других видов сегодня относят к таксонам эукариот, например, к эвгленоид Перанема или в диатомовый Бациллярии. Тем не мение, Вибрион Мюллер, 1773 стал считаться названием зоологического рода, а название рода бактерий стало Вибрион Пачини, 1854 г.^[10] Филиппо Пачини изолированные микроорганизмы, которые он назвал "вибрионы «от больных холерой в 1854 г. из-за их моторики.^[11]

Патогенные штаммы

TCBS агар тарелка Холерный вибрион (слева) и Вибрион парагемолитический (верно)

Несколько видов Вибрион находятся патогены.^[12] Большинство болезнетворных штаммов связаны с гастроэнтерит, но также может инфицировать открытые раны и вызывать сепсис.^[13] Они могут переноситься многочисленными морскими животными, такими как крабы или креветки, и, как известно, вызывают смертельные инфекции у людей во время воздействия. Риск клинического заболевания и смерти увеличивается при наличии определенных факторов, таких как неконтролируемый диабет, повышенный уровень железа (цирроз, серповидноклеточная анемия, гемохроматоз ), а также рак или другие состояния с ослабленным иммунитетом. Патогенный Вибрион виды включают V. cholerae (возбудитель холера ), V. parahaemolyticus, и V. vulnificus. V. cholerae обычно передается загрязненная вода.^[3] Патогенный Вибрион виды могут вызывать болезни пищевого происхождения (инфекцию), обычно связанные с употреблением в пищу недостаточно приготовленных морепродуктов. Патогенные особенности могут быть связаны с проверка кворума, где бактерии могут выражать свой фактор вирулентности через свои сигнальные молекулы.^[14]

V. vulnificus вспышки обычно происходят в теплом климате, а небольшие, обычно со смертельным исходом, вспышки происходят регулярно. Вспышка произошла в Новом Орлеане после ураган Катрина,^[15] и несколько летальных случаев чаще всего происходят во Флориде.^[16] По состоянию на 2013 год в США Вибрион инфекция в целом выросла на 43% по сравнению с показателями 2006–2008 гг. V. vulnificus, самая сильная деформация, не увеличилась. Пищевого происхождения Вибрион инфекции чаще всего связаны с употреблением сырого моллюски.^[17]

V. parahaemolyticus также связан с феноменом Канагава, в котором штаммы, выделенные из человеческих хозяева (клинические изоляты) гемолитический на чашки с кровяным агаром, в то время как изолированные из нечеловеческих источников не являются гемолитическими.^[18]

Много Вибрион виды также зоонозный. Они вызывают болезни у рыб и моллюсков и являются частой причиной смертности среди домашних морских обитателей.

Уход

Медицинская помощь зависит от клинической картины и наличия сопутствующих заболеваний.

Вибрион гастроэнтерит

Потому что Вибрион гастроэнтерит у большинства пациентов купируется самостоятельно, специальной медикаментозной терапии не требуется. Пациентам, которые не переносят восполнение ротовой полости, может потребоваться внутривенная инфузионная терапия.

Хотя большинство Вибрион виды чувствительны к антибиотикам, таким как доксициклин или хинолоны, антибиотикотерапия не сокращает течение болезни или продолжительность выведения патогенов. Однако, если пациент болен и у него высокая температура или сопутствующее заболевание, может быть начата пероральная антибиотикотерапия доксициклином или хинолоном.

Нехолера Вибрион инфекции

Пациенты с нехолерой Вибрион раневая инфекция или сепсис переносятся гораздо тяжелее и часто имеют другие заболевания. Лечебная терапия состоит из:

• Оперативное начало эффективной антибактериальной терапии (доксициклин или хинолон)
• Интенсивная медикаментозная терапия с агрессивным восполнением жидкости и вазопрессорами при гипотонии и септическом шоке для коррекции кислотно-щелочных и электролитных нарушений, которые могут быть связаны с тяжелым сепсисом
• Рано фасциотомия в течение 24 часов после развития клинических симптомов может спасти жизнь пациентам с некротический фасциит.
• Рано обработка раны инфицированной раны играет важную роль в успешном лечении и особенно показан во избежание ампутации пальцев рук, ног или конечностей.
• Необходима оперативная и серийная хирургическая оценка и вмешательство, поскольку состояние пациентов может быстро ухудшаться, особенно у пациентов с некротическим фасциитом или синдром компартмента.
• Реконструктивная хирургия, такая как пересадка кожи, используется на этапе восстановления.

Другие штаммы

V. harveyi является патогеном нескольких водных животных и известен как причина светящегося вибриоза у креветок (креветок).^[19] В. фишери (или же Aliivibrio fishceri ) известен своим мутуалистическим симбиозом с гавайскими бобтейл кальмар, который зависит от микробной люминесценции.^[20]

Жгутики

"Типичный", рано открытый Вибрион виды, такие как V. cholerae, иметь один полярный жгутик (одноцветные) с оболочкой. Некоторые виды, такие как V. parahaemolyticus и V. alginolyticus, имеют как один полярный жгутик с оболочкой и тонкими жгутиками, выступающими во всех направлениях (перитрихиальными), так и другие виды, такие как В. фишери, имеют пучки полярных жгутиков с влагалищем (лофотрих).^[21]

Естественная трансформация

Естественная трансформация это обычная бактериальная адаптация для переноса ДНК, в которой используются многочисленные продукты бактериальных генов.^[22][23] Чтобы бактерия-реципиент могла связывать, захватывать и рекомбинировать экзогенную ДНК в свою хромосому, она должна стать компетентный, то есть войти в особое физиологическое состояние. Процесс поглощения ДНК естественно компетентных V. cholerae включает в себя увеличенную компетенцию, индуцированную пилусом, и ДНК-связывающий белок, который действует как трещотка и втягивает ДНК в периплазму.^[24] Естественное преобразование также описано для V. fisheri,^[25] V. vulnificus^[26] и V. parahaemolyticus.^[27]

Малая РНК

V. cholerae был использован в открытиях многих бактериальные малые РНК. С использованием sRNA-Seq и нозерн-блоттинга кандидаты sRNA были идентифицированы и охарактеризованы как IGR -sRNA (внутригенная область), AS-sRNA (транскрибируется с антисмысловой цепи [[открытой рамки считывания (ORF) и происходит из ORF.^[28] Было показано, что один из кандидатов этого исследования, IGR7, участвует в углеродном метаболизме и позже переименован в РНК MtlS. Другие мРНК, идентифицированные в V. cholerae с помощью генетического скрининга и вычислительных методов включают Qrr РНК, Вибрио-регуляторная РНК OmpA, MicX мРНК, Активированные РНК Vibrio cholerae ToxT, tfoR РНК, и VqmR мРНК.

Смотрите также

• Холерный токсин

Рекомендации

1. Томпсон Флорида, Геверс Д., Томпсон С.С., Давиндт П., Насер С., Хост Б., Манн С.Б., Свинг Дж. (2005). «Филогения и молекулярная идентификация вибрионов на основе анализа мультилокусных последовательностей». Прикладная и экологическая микробиология. 71 (9): 5107–5115. Дои:10.1128 / AEM.71.9.5107-5115.2005. ЧВК  1214639. PMID  16151093.
2. Райан К.Дж.; Рэй CG, ред. (2004). Шеррис Медицинская микробиология (4-е изд.). Макгроу Хилл. ISBN  978-0-8385-8529-0.
3. Faruque SM; Наир ГБ, ред. (2008). Vibrio cholerae: геномика и молекулярная биология. Caister Academic Press. ISBN  978-1-904455-33-2.
4. Мэдиган, Майкл; Мартинко, Джон, ред. (2005). Биология микроорганизмов Брока (11-е изд.). Прентис Холл. ISBN  978-0-13-144329-7.
5. Траксис, Микеле; Михальски, Джейн; Дэн, Инь Кан; Капер, Джеймс Б. (1998-11-24). «Геном Vibrio cholerae содержит две уникальные кольцевые хромосомы». Труды Национальной академии наук. 95 (24): 14464–14469. Bibcode:1998PNAS ... 9514464T. Дои:10.1073 / пнас.95.24.14464. ISSN  0027-8424. ЧВК  24396. PMID  9826723.
6. Окада, Кадзухиса; Иида, Тэцуя; Кита-Цукамото, Кумико; Хонда, Такеши (2005-01-15). «У вибрионов обычно две хромосомы». Журнал бактериологии. 187 (2): 752–757. Дои:10.1128 / JB.187.2.752-757.2005. ISSN  0021-9193. ЧВК  543535. PMID  15629946.
7. Расмуссен, Вт; Дженсен, Расмус Бугге; Сковгаард, Оле (11.07.2007). «Две хромосомы холерного вибриона инициируются в разные моменты времени в клеточном цикле». Журнал EMBO. 26 (13): 3124–3131. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601747. ISSN  0261-4189. ЧВК  1914095. PMID  17557077.
8. Киркуп, Бенджамин С .; Чанг, ЛиАнн; Чанг, Сара; Геверс, Дирк; Польз, Мартин Ф. (01.01.2010). «Хромосомы вибрионов имеют общую историю». BMC Microbiology. 10: 137. Дои:10.1186/1471-2180-10-137. ISSN  1471-2180. ЧВК  2875227. PMID  20459749.
9. Пот Б., Гиллис М. и Де Лей Дж. Род Aquaspirillum. В: Balows, A., Trüper, H.G., Dworkin, M., Harder, W., Schleifer, K.-H. (Ред.). Прокариоты, 2-е изд., Т. 3. Springer-Verlag. Нью-Йорк. 1991 г.
10. Хью, Р. (1964). Предлагаемое сохранение родового названия Вибрион Pacini 1854 и обозначение неотипического штамма Холерный вибрион Пачини 1854. Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии, 14(2), 87-101, [1]^{[постоянная мертвая ссылка ]}.
11. http://www.whonamedit.com/doctor.cfm/2605.html
12. К. Майкл Хоган. 2010 г. Бактерии. Энциклопедия Земли. ред. Сидни Драгган и Си Джей Кливленд, Национальный совет по науке и окружающей среде, Вашингтон, округ Колумбия В архиве 11 мая 2011 г. Wayback Machine
13. Ли, Мишель Т .; Dinh, An Q .; Нгуен, Стефани; Крюке, Гас; Тран, Трук Т. (28 марта 2019 г.). «Поздняя септицемия Vibrio vulnificus без цирроза». Труды Медицинского центра Университета Бейлора. 0 (2): 286–288. Дои:10.1080/08998280.2019.1580661. ISSN  0899-8280. ЧВК  6541083. PMID  31191157.
14. Тан, Вэнь-Си; Мухамад Юнос, Нина Юсрина; Тан, Пуи-Ван; Мохамад, Нур Иззати; Адриан, Тан-Гуань-Шэн; Инь, Вай-Фонг; Чан, Кок-Ган (8 июля 2014 г.). «Характеристика морской бактерии Vibrio Brasiliensis T33, продуцирующей молекулы кворума N-ацил-гомосерина-лактона». Датчики. 14 (7): 12104–12113. Дои:10,3390 / с140712104. ЧВК  4168498. PMID  25006994.
15. Яблеки Дж., Нортон С.А., Келлер Г.Р., ДеГроу С., Ратард Р., Стрейф-Буржуа С., Холкомб Дж. М., Квилтер С., Байерс П., Макнил М., Шлоссберг Д., Дохони Д. П., Невилл Дж., Карло Дж., Бунер Д., Смит Б. Р., Уоллес К., Джерниган Д., Собел Дж., Рейнольдс М., Мур М, Кюнерт М., Мотт Дж., Джеймисон Д., Бернс-Грант Дж., Миссельбек Т., Круиз П., Лобуэ П., Хольц Т., Хаддад М., Кларк Т. А., Коэн А., Саненшайн Р., Джунг М., Вранкен П., Льюис Ф. М., Карпентер Л. Р. (2005). «Инфекционные заболевания и дерматологические состояния у эвакуированных и спасателей после урагана Катрина - несколько штатов, август – сентябрь 2005 г.». Еженедельный отчет о смертности и заболеваемости. 54: 1–4.
16. Бюро гигиены окружающей среды в сообществах, Отдел гигиены окружающей среды, Департамент здравоохранения Флориды (2005 г.). «Годовой отчет, Флорида». Эпиднадзор и расследование болезней пищевого и водного происхождения: 21.
17. «Инфекции от одних микробов пищевого происхождения увеличились, в то время как другие остались неизменными в 2012 году». Центры по контролю за заболеваниями. 18 апреля 2013 г.. Получено 19 апреля, 2013.
18. Джозеф С., Колвелл Р., Капер Дж. (1982). «Vibrio parahaemolyticus и родственные галофильные вибрионы». Crit Rev Microbiol. 10 (1): 77–124. Дои:10.3109/10408418209113506. PMID  6756788.
19. Остин Б., Чжан XH (2006). "Вибрио Харви: значительный патоген морских позвоночных и беспозвоночных ". Письма по прикладной микробиологии. 43 (2): 119–214. Дои:10.1111 / j.1472-765X.2006.01989.x. PMID  16869892.
20. "Aliivibrio fischeri", Википедия, 2020-04-26, получено 2020-04-26
21. Джордж М. Гаррити, изд. (2005). Руководство Берджи по систематической бактериологии. Vol. 2 Часть B (2-е изд.). Springer. С. 496–8. ISBN  978-0-387-24144-9.
22. Чен И., Дубнау Д. (2004). «Поглощение ДНК при бактериальной трансформации». Nat. Rev. Microbiol. 2 (3): 241–9. Дои:10.1038 / nrmicro844. PMID  15083159.
23. Бернштейн Х, Бернштейн С, Мишод Р. Э. (2018). Секс с микробными возбудителями. Инфекция, генетика и эволюция, том 57, страницы 8-25. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2017.10.024
24. Маттей Н, Блокеш М (2016). «Процесс захвата ДНК естественно компетентного холерного вибриона». Тенденции Microbiol. 24 (2): 98–110. Дои:10.1016 / j.tim.2015.10.008. PMID  26614677.
25. Поллак-Берти А., Волленберг М.С., Руби Е.Г. (2010). «Естественное преобразование Vibrio fischeri требует tfoX и tfoY». Environ. Микробиол. 12 (8): 2302–11. Дои:10.1111 / j.1462-2920.2010.02250.x. ЧВК  3034104. PMID  21966921.
26. Гулиг П.А., Такер М.С., Тиавилль ПК, Джозеф Дж. Л., Браун Р. Н. (2009). «Удобное для ПОЛЬЗОВАТЕЛЯ клонирование в сочетании с естественной трансформацией на основе хитина обеспечивает быстрый мутагенез Vibrio vulnificus». Appl. Environ. Микробиол. 75 (15): 4936–49. Дои:10.1128 / AEM.02564-08. ЧВК  2725515. PMID  19502446.
27. Чен Й, Дай Дж, Моррис Дж. Дж., Джонсон Дж. А. (2010). «Генетический анализ генов полисахарида капсулы (K-антиген) и экзополисахарида в пандемическом Vibrio parahaemolyticus O3: K6». BMC Microbiol. 10: 274. Дои:10.1186/1471-2180-10-274. ЧВК  2987987. PMID  21044320.
28. Лю, Джейн М .; Ливни, Джонатан; Лоуренс, Майкл С .; Kimball, Marc D .; Уолдор, Мэтью К .; Камилли, Эндрю (апрель 2009 г.). «Экспериментальное открытие мРНК в Vibrio cholerae путем прямого клонирования, истощения 5S / тРНК и параллельного секвенирования». Исследования нуклеиновых кислот. 37 (6): e46. Дои:10.1093 / nar / gkp080. ISSN  1362-4962. ЧВК  2665243. PMID  19223322.

внешняя ссылка

• Вибрион геномы и связанную информацию на ПАТРИК Ресурсный центр по биоинформатике, финансируемый НИАИД
• Бактериологическое аналитическое руководство онлайн