HDAC10 - HDAC10

HDAC10
Идентификаторы
Псевдонимы	HDAC10, HD10, гистондеацетилаза 10
Внешние идентификаторы	OMIM: 608544 MGI: 2158340 ГомолоГен: 23749 Генные карты: HDAC10
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 22 (человек)[1] Группа 22q13.33 Начинать 50,245,183 бп[1] Конец 50,251,405 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 | 15 E3 Начинать 89,123,307 бп[2] Конец 89,128,700 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • НАД-зависимая активность гистондеацетилазы (специфическая для H3-K14) • активность протеиндеацетилазы • связывание гистондеацетилазы • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ферментов • гидролазная активность • активность гистондеацетилазы • связывание ионов цинка • деацетилазная активность • активность ацетилпутресциндеацетилазы • активность ацетилспермидиндеацетилазы • связывание ионов металлов Сотовый компонент • цитоплазма • гистондеацетилазный комплекс • нуклеоплазма • ядро клетки Биологический процесс • деацетилирование гистона H3 • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • деацетилирование белков • развитие олигодендроцитов • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • деацетилирование гистонов • организация хроматина • макроавтофагия • положительное регулирование устранения несоответствия • деацетилирование пептидил-лизина • гомологичная рекомбинация • деацетилирование полиаминов • деацетилирование спермидина • Ремонт ДНК • Рекомбинация ДНК • аутофагия • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	83933	170787
Ансамбль	ENSG00000100429	ENSMUSG00000062906
UniProt	Q969S8 Q08AP5	Q6P3E7
RefSeq (мРНК)	NM_032019 NM_001159286	NM_199198
RefSeq (белок)	NP_001152758 NP_114408	NP_954668
Расположение (UCSC)	Chr 22: 50.25 - 50.25 Мб	Chr 15: 89.12 - 89.13 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гистоновая деацетилаза 10 является фермент что у людей кодируется HDAC10 ген.^[5][6][7]

Ацетилирование ядер гистоновых частиц модулирует структуру хроматина и экспрессию генов. Противоположная ферментативная активность гистоновых ацетилтрансфераз и гистоновых деацетилаз, таких как HDAC10, определяет статус ацетилирования гистоновых хвостов (Kao et al., 2002) [предоставлено OMIM]^[7]

Взаимодействия

HDAC10 показал себя взаимодействовать с Гистоновая деацетилаза 2^[8] и Корепрессор ядерного рецептора 2.^[8]

Смотрите также

• Гистоновая деацетилаза

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000100429 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000062906 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Као Х.Й., Ли СН, Комаров А, Хан СС, Эванс Р.М. (январь 2002 г.). «Выделение и характеристика HDAC10 млекопитающих, новой гистоновой деацетилазы». J Biol Chem. 277 (1): 187–93. Дои:10.1074 / jbc.M108931200. PMID  11677242.
6. Гвардиола А.Р., Яо Т.П. (январь 2002 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика новой гистондеацетилазы HDAC10». J Biol Chem. 277 (5): 3350–6. Дои:10.1074 / jbc.M109861200. PMID  11726666.
7. "Энтрез Ген: гистондеацетилаза 10 HDAC10".
8. Фишер, Дениз Д; Кай Ричард; Бхатия Умеш; Ассельбергс Фред А. М.; Сун Чуаньчжэн; Терри Роберт; Трогани Нэнси; Видмер Роланд; Атаджа Петр; Коэн Далия (февраль 2002 г.). «Выделение и характеристика новой гистондеацетилазы класса II, HDAC10». J. Biol. Chem. Соединенные Штаты. 277 (8): 6656–66. Дои:10.1074 / jbc.M108055200. ISSN  0021-9258. PMID  11739383.

дальнейшее чтение

• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Данэм И., Шимицу Н., Роу Б.А. и др. (1999). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека». Природа. 402 (6761): 489–95. Bibcode:1999Натура.402..489D. Дои:10.1038/990031. PMID  10591208.
• Фишер Д.Д., Кай Р., Бхатия У. и др. (2002). «Выделение и характеристика новой гистондеацетилазы класса II, HDAC10». J. Biol. Chem. 277 (8): 6656–66. Дои:10.1074 / jbc.M108055200. PMID  11739383.
• Тонг Дж.Дж., Лю Дж., Бертос Н.Р., Ян XJ (2002). «Идентификация HDAC10, новой гистондеацетилазы человека класса II, содержащей домен, богатый лейцином». Нуклеиновые кислоты Res. 30 (5): 1114–23. Дои:10.1093 / nar / 30.5.1114. ЧВК  101247. PMID  11861901.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Родригес М., Ю Икс, Чен Дж, Сунъян Зи (2004). «Специфичность связывания фосфопептида COOH-концевых (BRCT) доменов BRCA1». J. Biol. Chem. 278 (52): 52914–8. Дои:10.1074 / jbc.C300407200. PMID  14578343.
• Hillman RT, Green RE, Brenner SE (2005). «Недооцененная роль надзора за РНК». Геном Биол. 5 (2): R8. Дои:10.1186 / gb-2004-5-2-r8. ЧВК  395752. PMID  14759258.
• Osada H, Tatematsu Y, Saito H и др. (2004). «Пониженная экспрессия генов гистондеацетилазы II класса связана с плохим прогнозом у пациентов с раком легких». Int. J. Рак. 112 (1): 26–32. Дои:10.1002 / ijc.20395. PMID  15305372.
• Коллинз Дж. Э., Райт К. Л., Эдвардс К. А. и др. (2005). «Основанный на аннотации генома подход к клонированию ORFeome человека». Геном Биол. 5 (10): R84. Дои:10.1186 / gb-2004-5-10-r84. ЧВК  545604. PMID  15461802.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.

внешняя ссылка

• HDAC10 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.