Эрик Лендер - Eric Lander

Эрик Лендер
Д-р Эрик Ландер, директор Института Броуда Массачусетского технологического института и Гарварда. Jpg
Эрик Ландер выступает на пресс-конференции по секвенированию генома мышей 4 декабря 2002 г.
Родившийся (1957-02-03) 3 февраля 1957 г. (63 года)
Бруклин, Нью-Йорк, НАС.
Альма-матерУниверситет Принстона (BS)
Оксфордский университет (Доктор философии)
Супруг (а)Лори Ландер
НаградыСтипендия Макартура (1987)
Премия Диксона (1997)
Премия Вудро Вильсона за государственную службу (1998)
Премия Гэрднера (2002)
Приз Харви (2012)
Премия за прорыв в науках о жизни (2013)
Премия Киллиана (2017)
Научная карьера
УчрежденияBroad Institute
Массачусетский Институт Технологий
ТезисТемы алгебраической теории кодирования  (1980)
ДокторантПитер Кэмерон
ДокторантыМанолис Келлис[1]
Эрез Либерман Эйден
Марк Дэйли
Интернет сайтwww.broadinstitute.org/ bios/ Эрик-С-Лендер

Эрик Стивен Лендер (родился 3 февраля 1957 г.), математик и генетик, профессор биологии Массачусетский Институт Технологий (MIT) и профессор системной биологии в Гарвардская медицинская школа, бывший член Институт Уайтхеда, и директор-основатель Broad Institute Массачусетского технологического института и Гарвард. Он был сопредседателем президента США. Барак Обама с Совет консультантов по науке и технологиям.[2][3] Он является 1987 MacArthur Fellow.

ранняя жизнь и образование

Лендер родился в Бруклине, Нью-Йорк,[4] и вырос в Еврейский семья,[5] сын Гарольда и Роды Ландер, которые оба были юристами. Он был капитаном математической команды в Stuyvesant High School, дневная и Международная математическая олимпиада Серебряный призер США, окончил среднюю школу в 1974 году. Он учился и позже преподавал в Летние занятия по математике в Хэмпширском колледже программа. В семнадцать лет он написал статью о квазиидеальные числа за что он выиграл Поиск талантов Westinghouse Science.[6]

Лендер присутствовал Университет Принстона, где он окончил в 1978 году прощальную речь. Он защитил кандидатскую диссертацию на тему «О структуре проективных модулей» под руководством Джон Коулман Мур.[7] Затем он посетил Оксфордский университет как Родосский ученый, и он написал свой Доктор Философии диссертация по алгебраической теория кодирования и симметричные блочные конструкции, под присмотром Питер Кэмерон.[8]

Карьера

Ранняя математическая карьера

Как математик, Ландер изучал комбинаторику и приложения теория представлений к теория кодирования. Ему нравилась математика, но он не хотел проводить свою жизнь в такой «монашеской» карьере.[9] Не зная, что делать дальше, он устроился преподавателем Управленческая экономика в Гарвардская школа бизнеса; Лендер также начал писать книгу о теория информации. По предложению брата, биолога-специалиста по развитию Артур Лендер, он начал изучать нейробиологию[10] «потому что в мозгу много информации». Чтобы понять математическую нейробиологию, он чувствовал, что должен изучить клеточную нейробиологию; в свою очередь, это привело к изучению микробиологии и, в конечном итоге, генетики. «Когда я наконец почувствую, что изучил генетику, мне следует вернуться к этим другим проблемам. Но я все еще пытаюсь понять генетику».

Позже он познакомился с Дэвид Ботштейн, генетик, работающий в Массачусетском технологическом институте. Ботштейн работал над тем, как понять, как тонкие различия в сложных генетических системах могут перерасти в такие расстройства, как рак, диабет, шизофрения и даже ожирение. Они вместе разработали компьютерный алгоритм для анализа карт генов.[9] Затем Лендер присоединился к Институт Уайтхеда в 1986 г .; в том же году он стал доцентом Массачусетского технологического института. Lander был удостоен престижной Стипендия Макартура в 1987 году. В 1990 году он основал Институт Уайтхеда / Центр исследования генома Массачусетского технологического института (WICGR). WICGR стал одним из ведущих мировых центров исследования генома, и под руководством Лендера он добился большого прогресса в разработке новых методов анализа геномов млекопитающих. Он также сделал важные прорывы в применении этой информации для изучения генетической изменчивости человека и лег в основу Broad Institute - преобразование, которое возглавил Лендер.

Вклад в геномику

Было две основные группы, пытавшиеся секвенировать геном человека: первая была Проект "Геном человека" (HGP), проект, финансируемый государством, с целью публиковать полученную информацию бесплатно и без ограничений. Многие исследовательские группы из разных стран мира были вовлечены в эту совместную работу. Вторая попытка была предпринята Celera Genomics, который предназначен для патент полученная информация и взимание платы за подписки за использование данных последовательности. (С тех пор Celera отказалась от этой политики и предоставила большое количество информации о последовательностях для бесплатного публичного использования.) Созданная первой, HGP медленно продвигалась на ранних этапах исследований в качестве роли Департамент энергетики было неясно, а технология секвенирования находилась в зачаточном состоянии. Когда Celera вступила в гонку за обнаружением генома, на HGP оказывалось давление, чтобы как можно быстрее установить как можно большую часть генома в общественное достояние. Это было изменением стратегии HGP, потому что многие ученые в то время хотели получить более полную копию генома. Вместе с другими членами HGP Лендер настаивал на более быстром открытии, чтобы гены не были открыты и запатентованы сначала Celera.

В 2001 году в журнале был опубликован проект генома человека. Природа. Институт биомедицинских исследований Уайтхеда, Центр исследований генома, был указан первым (порядок был в соответствии с общей внесенной геномной последовательностью). Лендер был первым названным автором.[11][12]

WICGR также внесла значительный вклад в секвенирование генома мыши.[13] Помимо академического интереса, это важный шаг к полному пониманию молекулярной биологии мышей, которые часто используются в качестве модельных организмов при изучении всего, от болезней человека до эмбрионального развития. Таким образом, более глубокое понимание мышей облегчит многие области исследований. WICGR также секвенировал геномы Ciona Savignyi (морской брызг),[14] то рыба фугу,[15] то нитчатый грибок Neurospora crassa,[16] и несколько родственников Saccharomyces cerevisiae,[17] один из самых изученных дрожжи. В Ciona Savignyi геном представляет собой хорошую систему для изучения эволюционного происхождения всех позвоночные. Геномы иглобрюхов меньше, чем у других позвоночных; в результате их геномы являются «мини-моделями» для позвоночных. Секвенирование дрожжей, относящихся к Saccharomyces cerevisiae упростит идентификацию ключевых регуляторных элементов генов, некоторые из которых могут быть общими для всех эукариоты (включая царство растений и животных).

Помимо геномики

Данные о последовательности - это всего лишь список оснований, обнаруженных в данном участке ДНК. Его ценность заключается в открытиях и новых технологиях, которые он позволяет. В случае с Лендером одно из таких приложений - изучение болезней. Он является основателем и директором Broad Institute - результат сотрудничества Массачусетского технологического института, Гарварда, института Уайтхеда и связанных с ним больниц. Его цель - «создать инструменты для геномной медицины и сделать их широко доступными для научного сообщества; применить эти инструменты для продвижения понимания и лечения болезней». С этой целью они изучают вариации в геноме человека и возглавили международную программу, которая собрала библиотеку из 2,1 миллиона человек. однонуклеотидные полиморфизмы (SNP). Они действуют как маркеры или указатели в геноме, позволяя идентифицировать гены восприимчивости к болезням. Они надеются построить карту генома человека с использованием блоков этих SNP, называемых неравновесием по сцеплению или LD. Эта карта будет большим подспорьем в медицинской генетике. Это позволит исследователям связать данное состояние с данным геном или набором генов, используя LD в качестве маркера. Это позволит улучшить диагностические процедуры. Ландер и его коллеги надеются, что карта LD позволит им проверить гипотезу Common Disease-Common Variant, которая гласит, что многие распространенные заболевания могут быть вызваны небольшим количеством общих аллелей, например, 50% дисперсии предрасположенности к болезни Альцгеймера. объясняется общим аллелем ApoE4. Группа Лендера недавно обнаружила важную ассоциацию, которая составляет большую часть риска развития диабета у взрослых.

Самая важная работа Лендера[18] может быть его разработка молекулярной таксономии рака.[19] Раковые опухоли группируются в соответствии с экспрессией генов, и для каждой группы собирается такая информация, как их реакция на химиотерапию. Разделение раковых заболеваний на гомогенные подгруппы позволит лучше понять молекулярное происхождение этих видов рака и поможет разработать более эффективные методы лечения. Они также идентифицировали новый тип лейкемии, названный MLL, и определили ген, который может служить мишенью для нового лекарства.

Обучение

В дополнение к своим исследованиям, он в течение нескольких лет совместно преподавал необходимый вводный курс биологии MIT (7.012) с Роберт Вайнберг. С 2013 года он также ведет 2 онлайн-курса под названием «Семинар по количественной биологии» и «7.00x Введение в биологию - секрет жизни» через EdX платформы, работая вместе с группой MITx Bio во главе с Мэри Эллен Уилтроут.[20]

Трансляционные предприятия

Ландер - советник-основатель Foundation Medicine, компании, которая стремится внедрить комплексный геномный анализ рака в повседневную клиническую практику.[21] Он также является соучредителем Verastem, биофармацевтической компании, занимающейся открытием и разработкой лекарств для лечения рака с помощью раковые стволовые клетки.[22]

Судебная медицина и уголовное правосудие

В 1989 году Ландер дал экспертные показания по уголовному делу: Люди против Кастро в Нью-Йорке. Он показал, что нынешний на тот момент метод интерпретации доказательств ДНК был ошибочным и мог давать ложноположительные совпадения, предполагая причастность невиновных обвиняемых.[23][24][25] Двое из защитников по этому делу, Питер Нойфельд и Барри Шек, основал Проект Невинности, организация, которая использует анализ ДНК для реабилитации ошибочно осужденных заключенных. Ландер является членом совета директоров.[26]

Появления в СМИ

Лендер был назван одним из Время журнал 100 самых влиятельных людей современности (2004 г.) за его работу над HGP. Lander также появлялся во многих PBS документальные фильмы о генетике. Он был указан на # 2 в рейтинге MIT150 список 150 лучших новаторов и идей от Массачусетский технологический институт.

Его также видели в легендарном видео MIT Gangnam Style.

Он рассказал фантастическую историю о том, почему он преподает на основе историй MOTH.

Признание и сервис

В 1999 году Лендер получил награду Golden Plate Award Американская академия достижений.[27]

В декабре 2008 года он был назван вместе с Гарольд Э. Вармус, один из сопредседателей Совет консультантов по науке и технологиям в Администрация Обамы. В 2012 г. награжден Приз Дэна Дэвида.

Lander также является членом Фестиваль науки и техники США Консультативный совет.[28]

В 2013 году Lander был удостоен награды Премия за прорыв в науках о жизни.[29][30]

В 2016 г. Семантический ученый Программа искусственного интеллекта поставила Lander на первое место в списке самых влиятельных исследователей в области биомедицины.[31]

6 февраля 2017 года Lander получил honoris causa докторская степень от Католический университет Лувена.[32]

В 2017 году он также получил Премия Уильяма Аллана от Американское общество генетики человека.[33]

25 мая 2020 г. Папа Франциск назначил его членом Папская академия наук.[34]

Избранные работы

  • После генетической революции, вопросы о ее значении, в The New York Times, 12 сентября 2000 г.[35]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Камвисселис, Манолис (2003). Вычислительная сравнительная геномика: гены, регуляция, эволюция. mit.edu (Кандидатская диссертация). Массачусетский технологический институт. HDL:1721.1/7999. OCLC  53277177. Бесплатно читать
  2. ^ Наир, П. (2011). "QnAs с Эриком С. Ландером". Труды Национальной академии наук. 108 (28): 11319. Дои:10.1073 / pnas.1106996108. ЧВК  3136317. PMID  21606349.
  3. ^ Ландер, Э.С. (2004). «Эрик С. Ландер». Обзоры природы Drug Discovery. 3 (9): 730. Дои:10.1038 / nrd1514. PMID  15368656.
  4. ^ "Основные моменты карьеры доктора философии Эрика С. Ландера". Медицинский институт Говарда Хьюза. 30 декабря 2010 г. Архивировано с оригинал 30 декабря 2010 г.. Получено 26 мая, 2020.
  5. ^ "Устная история | Джеймс Д. Уотсон | Личность и влияние | Эрик Ландер о духовности и науке". Library.cshl.edu. 2 июня 2003 г.. Получено 23 февраля, 2015.
  6. ^ Элмер-ДеВитт, Филип. "ВРЕМЯ 100 2004: Ученые и мыслители: Эрик Ландер". Время. Time Inc. Получено 25 февраля, 2019.
  7. ^ Лендер, Эрик. О структуре проективных модулей (Диплом бакалавра). Университет Принстона. Получено 21 февраля, 2018.
  8. ^ Лендер, Эрик (1980). Темы алгебраической теории кодирования (Докторская диссертация). Оксфордский университет. EThOS  uk.bl.ethos.276073.
  9. ^ а б «Сила в цифрах». Нью-Йорк Таймс. Получено 23 февраля, 2015.
  10. ^ "Эрик С. Ландер, доктор философии, биография и интервью". www.achievement.org. Американская академия достижений.
  11. ^ Ландер, Э.С.; Linton, M .; Birren, B .; Nusbaum, C .; Zody, C .; Болдуин, Дж .; Девон, К .; Dewar, K .; Дойл, М .; Fitzhugh, W .; Funke, R .; Gage, D .; Harris, K .; Heaford, A .; Howland, J .; Kann, L .; Lehoczky, J .; Levine, R .; McEwan, P .; McKernan, K .; Meldrim, J .; Месиров, Дж. П .; Миранда, С .; Моррис, В .; Naylor, J .; Raymond, C .; Rosetti, M .; Santos, R .; Шеридан, А .; и другие. (Февраль 2001 г.). "Начальная последовательность и анализ человеческого генома". Природа. 409 (6822): 860–921. Дои:10.1038/35057062. ISSN  0028-0836. PMID  11237011.
  12. ^ Ландер, Э. С. (2011). «Первоначальное влияние секвенирования генома человека» (PDF). Природа. 470 (7333): 187–197. Дои:10.1038 / природа09792. PMID  21307931.
  13. ^ Chinwalla, A. T .; Waterston, L.L .; Lindblad-Toh, K.D .; Birney, G.A .; Роджерс, Л. А .; Abril, R. S .; Agarwal, T. A .; Agarwala, L.W .; Ainscough, E. R .; Alexandersson, J. D .; An, T. L .; Antonarakis, W. E .; Attwood, J. O .; Baertsch, M.N .; Bailey, K. H .; Barlow, C. S .; Beck, T. C .; Берри, В .; Birren, J .; Bloom, E .; Bork, R.H .; Botcherby, M. C .; Bray, R.K .; Brent, S.P .; Brown, P .; Brown, E .; Bult, B .; Burton, T .; Батлер, Д. Г .; и другие. (2002). «Первоначальное секвенирование и сравнительный анализ генома мыши». Природа. 420 (6915): 520–562. Дои:10.1038 / природа01262. PMID  12466850.
  14. ^ "База данных Ciona savignyi". Broad.mit.edu. 10 сентября 2004 г.. Получено 23 февраля, 2015.
  15. ^ «База данных Tetraodon nigroviridis». Broad.mit.edu. 10 сентября 2004 г.. Получено 23 февраля, 2015.
  16. ^ «База данных Neurospora crassa». Broad.mit.edu. 9 апреля 2014 г. Архивировано с оригинал 5 сентября 2008 г.. Получено 23 февраля, 2015.
  17. ^ "База данных генома сахаромицетов". Yeastgenome.org. 18 февраля 2015 г.. Получено 23 февраля, 2015.
  18. ^ https://scholar.google.com/scholar?q=eric+lander Эрик Лендер в Google ученый
  19. ^ Голуб, Т. Р .; Слоним, Д .; Tamayo, P .; Huard, C .; Gaasenbeek, M .; Месиров, Дж .; Coller, H .; Loh, M .; Даунинг, Дж .; Калиджури, М. А .; Bloomfield, C.D .; Ландер, Э. С. (1999). «Молекулярная классификация рака: открытие класса и прогнозирование класса с помощью мониторинга экспрессии генов». Наука. 286 (5439): 531–537. CiteSeerX  10.1.1.115.7807. Дои:10.1126 / science.286.5439.531. PMID  10521349.
  20. ^ «MITx: 7.00x: Введение в биологию - секрет жизни (март 2013 г.)». edX. 3 марта 2013 г.. Получено 1 августа, 2013.
  21. ^ «Лидерство - Основы медицины». Foundationmedicine.com. Архивировано из оригинал 29 марта 2013 г.. Получено 23 февраля, 2015.
  22. ^ Гупта, Пиюш Б .; Ондер, Тамер Т .; Цзян, Гочжи; Тао, Кай; Купервассер, Шарлотта; Вайнберг, Роберт А .; Лендер, Эрик С. (16 ноября 2010 г.). «Пресс-релиз - Новые лекарства, направленные на раковые стволовые клетки». Клетка. 138 (4): 645–659. Дои:10.1016 / j.cell.2009.06.034. ЧВК  4892125. PMID  19682730. Архивировано из оригинал 7 января 2016 г.. Получено 1 августа, 2013.
  23. ^ Scheck, B (2013). «Проект невиновности в двадцать: интервью с Барри Шеком. Интервью Джейн Гитшер». PLoS Genet. 9 (8): e1003692. Дои:10.1371 / journal.pgen.1003692. ЧВК  3738447. PMID  23950733.
  24. ^ "Детективный рассказ ДНК". Экономист. 11 марта 2004 г.
  25. ^ Мнукин, Дженнифер Л. (2007). "Люди В. Кастро: вызов криминалистическому использованию доказательств ДНК". Журнал научных перспектив. 3 (1).
  26. ^ https://www.innocenceproject.org/eric-lander-calls-for-officials-to-uphold-best-forensic-practices/
  27. ^ "Золотые медали Американской академии достижений". www.achievement.org. Американская академия достижений.
  28. ^ "Фестиваль науки и техники США - Советники". Usasciencefestival.org. Архивировано из оригинал 21 апреля 2010 г.. Получено 23 февраля, 2015.
  29. ^ Сапир, Рэйчел Дж. (21 февраля 2013 г.). «Лендер получил 3 миллиона долларов». Гарвард Кримсон. Получено 26 мая, 2020.
  30. ^ Прощай, Деннис (20 февраля 2013 г.). «Новая премия в размере 3 миллионов долларов приносит ученым-медикам известность». Нью-Йорк Таймс. Получено 26 мая, 2020.
  31. ^ ЧавлаОкт. 17, Далмит Сингх; 2017; Вечерняя сессия, 16:20 (17 октября 2017 г.). «Кто самый влиятельный ученый-биомедик? Компьютерная программа, управляемая искусственным интеллектом, говорит, что знает». Наука | AAAS. Получено 22 сентября, 2020.CS1 maint: числовые имена: список авторов (связь)
  32. ^ Веб-сайт Католического университета Лувена В архиве 11 февраля 2017 г. Wayback Machine
  33. ^ "Премия Уильяма Аллана". ASHG. Получено 14 декабря, 2018.
  34. ^ «Отставки и уступки, 25.05.2020» (Пресс-релиз). Пресс-служба Святого Престола. 25 мая 2020. Получено 25 мая, 2020.
  35. ^ «CGS: после генетической революции, вопросы о ее значении». Geneticsandsociety.org. 12 сентября 2000 г.. Получено 23 февраля, 2015.

внешняя ссылка