Химерин 2 - Chimerin 2

CHN2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1XA6
Идентификаторы
Псевдонимы	CHN2, ARHGAP3, BCH, CHN2-3, RHOGAP3, химерин 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 602857 MGI: 1917243 ГомолоГен: 31213 Генные карты: CHN2
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[1] Группа 6 | 6 B3 Начните 54,039,554 бп[1] Конец 54,301,810 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Активность активатора GTPase Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • мембрана Биологический процесс • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала • регуляция передачи сигнала, опосредованного малой GTPase • преобразование сигнала • положительное регулирование передачи сигнала • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • GO: 0043087, GO: 0032313, GO: 0032319, GO: 0032314, GO: 0043088 регуляция активности GTPase Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	1124	69993
Ансамбль	ENSG00000106069	ENSMUSG00000004633
UniProt	P52757	Q80XD1
RefSeq (мРНК)	NM_001039936 NM_001293069 NM_001293070 NM_001293071 NM_001293072 NM_001293073 NM_001293075 NM_001293076 NM_001293077 NM_001293078 NM_001293079 NM_001293080 NM_001293081 NM_004067	NM_001163640 NM_023543 NM_001311133 NM_001311134
RefSeq (белок)	NP_001035025 NP_001279998 NP_001279999 NP_001280000 NP_001280001 NP_001280002 NP_001280004 NP_001280005 NP_001280006 NP_001280007 NP_001280008 NP_001280009 NP_001280010 NP_004058	NP_001157112 NP_001298062 NP_001298063 NP_076032
Расположение (UCSC)	н / д	Chr 6: 54.04 - 54,3 Мб
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Бета-химерин это белок что у людей кодируется CHN2 ген.^[4][5]

Этот ген является членом химерин семейство и кодирует белок с цинковым пальцем типа сложного форбола / DAG, доменом Rho-GAP и доменом SH2. Этот белок обладает активностью белка, активирующего ГТФазу, которая регулируется связыванием фосфолипидов, а связывание диацилглицерина (DAG) индуцирует транслокацию белка из цитозоля к мембране аппарата Гольджи. Белок играет роль в пролиферации и миграции гладкомышечных клеток. Сниженная экспрессия этого гена связана с глиомами высокой степени злокачественности и опухолями груди, а повышенная экспрессия этого гена связана с лимфомами. Мутации в этом гене были связаны с шизофренией у мужчин. Были охарактеризованы альтернативные варианты транскрипционного сплайсинга, кодирующие разные изоформы.^[5]

использованная литература

1. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000004633 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Леунг Т., Хау БЭ, Мансер Э, Лим Л. (июнь 1994 г.). «Бета 2-химерин мозжечка, белок, активирующий ГТФазу для p21 ras-родственного rac, специфически экспрессируется в гранулярных клетках и имеет уникальный N-концевой SH2-домен». J Biol Chem. 269 (17): 12888–92. PMID  8175705.
5. "Entrez Gene: CHN2 химерин (химерин) 2".

дальнейшее чтение

• Юань С., Миллер Д. В., Барнетт Г. Х. и др. (1995). «Идентификация и характеристика человеческого бета 2-химерина: ассоциация со злокачественной трансформацией астроцитомы». Рак Res. 55 (15): 3456–61. PMID  7614486.
• Калока М.Дж., Фернандес Н., Левин Н.Е. и др. (1997). «Бета2-химерин представляет собой рецептор с высоким сродством к промоторам опухоли сложного эфира форбола». J. Biol. Chem. 272 (42): 26488–96. Дои:10.1074 / jbc.272.42.26488. PMID  9334226.
• Калока М.Дж., Гарсия-Бермеджо М.Л., Блумберг П.М. и др. (1999). «Бета2-химерин является новой мишенью для диацилглицерина: связывающие свойства и изменения в субклеточной локализации, опосредованные связыванием лиганда с его доменом C1». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 96 (21): 11854–9. Bibcode:1999PNAS ... 9611854J. Дои:10.1073 / pnas.96.21.11854. ЧВК  18376. PMID  10518540.
• Калока М.Дж., Ван Х., Делемос А. и др. (2001). «Сложные эфиры форбола и родственные им аналоги регулируют внутриклеточную локализацию бета 2-химерина, рецептора сложного эфира форбола, не являющегося протеинкиназой C». J. Biol. Chem. 276 (21): 18303–12. Дои:10.1074 / jbc.M011368200. PMID  11278894.
• Ван Х, Казанец МГ (2002). «Химерины, новые рецепторы сложного эфира форбола, не относящиеся к протеинкиназе С, связываются с Tmp21-I (p23): доказательство нового механизма якорения, включающего домен С1 химерина». J. Biol. Chem. 277 (6): 4541–50. Дои:10.1074 / jbc.M107150200. PMID  11689559.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR и др. (2003). «Хромосома 7 человека: последовательность ДНК и биология». Наука. 300 (5620): 767–72. Bibcode:2003Наука ... 300..767С. Дои:10.1126 / science.1083423. ЧВК  2882961. PMID  12690205.
• Нишиу М., Янагава Р., Накацука С. и др. (2003). «Микроматричный анализ профилей экспрессии генов в диффузной большой B-клеточной лимфоме: идентификация генов, связанных с прогрессированием заболевания». Jpn. J. Cancer Res. 93 (8): 894–901. Дои:10.1111 / j.1349-7006.2002.tb01335.x. ЧВК  5927108. PMID  12716467.
• Хиллиер Л.В., Фултон Р.С., Фултон Л.А. и др. (2003). «Последовательность ДНК хромосомы 7 человека». Природа. 424 (6945): 157–64. Bibcode:2003Натура.424..157H. Дои:10.1038 / природа01782. PMID  12853948.
• Калока MJ, Ван Х, Казанец MG (2004). «Характеристика активности Rac-GAP (белок, активирующий Rac-GTPase) бета2-химерина, рецептора сложного эфира форбола, не являющегося протеинкиназой C». Biochem. J. 375 (Pt 2): 313–21. Дои:10.1042 / BJ20030727. ЧВК  1223697. PMID  12877655.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Канагараджа Б., Лесков Ф.К., Хо Дж.Й. и др. (2004). «Структурный механизм липидной активации Rac-специфического GAP, бета2-химерин». Ячейка. 119 (3): 407–18. Дои:10.1016 / j.cell.2004.10.012. PMID  15507211. S2CID  10076951.
• Хашимото Р., Йошида М., Кунуги Х. и др. (2005). «Миссенс-полиморфизм (H204R) белка, активирующего ГТФазу Rho, гена химерина 2, связан с шизофренией у мужчин». Исследование шизофрении. 73 (2–3): 383–5. Дои:10.1016 / j.schres.2004.01.017. PMID  15653288. S2CID  36432346.
• Барриос-Родилес М., Браун К.Р., Оздамар Б. и др. (2005). «Высокопроизводительное отображение динамической сигнальной сети в клетках млекопитающих». Наука. 307 (5715): 1621–5. Bibcode:2005Научный ... 307.1621B. Дои:10.1126 / science.1105776. PMID  15761153. S2CID  39457788.
• Ян Ц., Лю Й., Лесков Ф.К. и др. (2005). «Rac-GAP-зависимое ингибирование пролиферации клеток рака молочной железы бета-2-химерином». J. Biol. Chem. 280 (26): 24363–70. Дои:10.1074 / jbc.M411629200. PMID  15863513.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Силичео М., Гарсия-Берналь Д., Карраско С. и др. (2006). «Бета2-химерин обеспечивает диацилглицерин-зависимый механизм регуляции адгезии и хемотаксиса Т-клеток» (PDF). J. Cell Sci. 119 (Pt 1): 141–52. Дои:10.1242 / jcs.02722. PMID  16352660. S2CID  19107302.
• Ян Ц., Лю Й., Леммон М.А., Казанец М.Г. (2006). «Важная роль Rac в митогенной передаче сигналов бета1 херегулина: механизм, который включает рецептор эпидермального фактора роста и не зависит от ErbB4». Мол. Cell. Биол. 26 (3): 831–42. Дои:10.1128 / MCB.26.3.831-842.2006. ЧВК  1347034. PMID  16428439.