Док2 - Dock2

DOCK2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2RQR, 2 ИНЬ, 3A98, 3B13
Идентификаторы
Псевдонимы	DOCK2, IMD40, Dock2, выделитель цитокинеза 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 603122 MGI: 2149010 ГомолоГен: 37984 Генные карты: DOCK2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q35.1 Начните 169,637,268 бп[1] Конец 170,083,382 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 A4 Начните 34,226,815 бп[2] Конец 34,783,892 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов Rac • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Активность активатора GTPase • активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание с рецептором Т-клеток Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • мембрана • внеклеточная экзосома • цитоскелет • эндомембранная система • внеклеточная область • специфический просвет гранулы Биологический процесс • положительная регуляция фагоцитоза • передача сигнала, опосредованная малой GTPase • активация альфа-бета Т-клеток • регулирование защитной реакции вируса на вирус • поляризация мембранного рафта • отрицательный отбор Т-лимфоцитов тимуса • Пролиферация Т-клеток • хемотаксис • пролиферация альфа-бета Т-клеток • макропиноцитоз • организация цитоскелета • активация миелоидных дендритных клеток, участвующих в иммунном ответе • положительный отбор Т-лимфоцитов тимуса • установление полярности Т-клеток • формирование иммунологического синапса • организация актинового цитоскелета • Активация Т-клеток • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • дегрануляция нейтрофилов • регуляция молекулярной функции Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	1794	94176
Ансамбль	ENSG00000134516	ENSMUSG00000020143
UniProt	Q92608	Q8C3J5
RefSeq (мРНК)	NM_004946	NM_033374
RefSeq (белок)	NP_004937	NP_203538
Расположение (UCSC)	Chr 5: 169.64 - 170.08 Мб	Chr 11: 34,23 - 34,78 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Док2 (Dнаставник ож cytokинезис 2), также известный как DOCK2, является большим (~ 180 кДа) белок участвует в внутриклеточный сети сигнализации.^[5] Это член подсемейства DOCK-A ДОК семья факторы обмена гуаниновых нуклеотидов (ГЭФ), которые функционируют как активаторы малых G белки. Dock2 специфически активирует изоформы малого белка G Rac.

Открытие

Dock2 был впервые охарактеризован как один из ряда белков, которые имеют высокий сходство последовательностей с ранее описанным белком Док180, архетипический член семьи ДОКОВ. В то время как Dock180 выражение почти повсеместно встречается у млекопитающих, Dock2, по-видимому, экспрессируется специфически в лейкоциты и считается основным членом семейства DOCK в этих ячейках.^[6]

Структура и функции

Dock2 является частью большого класса белков (GEF), которые участвуют в событиях передачи сигналов в клетке, активируя небольшие G-белки. В состоянии покоя G белки связаны с Гуанозин дифосфат (GDP) и их активация требует диссоциации GDP и связывания гуанозинтрифосфат (GTP). GEF активируют G-белки, способствуя этому обмену нуклеотидов.

Dock2 и другие белки семейства DOCK отличаются от других GEF тем, что они не обладают канонической структурой тандемных DH -PH домены, которые, как известно, вызывают обмен нуклеотидов. Вместо этого они обладают DHR2 домен который опосредует активацию Rac, стабилизируя его в безнуклеотидном состоянии.^[7] Они также содержат DHR1 домен что связывает фосфолипиды и требуется для взаимодействия между Dock2 и плазматическая мембрана.^[8] Как и другие члены подсемейств DOCK-A и DOCK-B, Dock2 содержит N-концевой SH3 домен который участвует в привязке к ELMO белки (см. ниже).^[9] Dock180 содержит C-терминал пролин богатая область, которая опосредует связывание с Crk однако в Dock2 эта функция отсутствует^[6] несмотря на то, что он способен связывать Crk-подобный белок CrkL.^[10]

Регулирование активности Dock2

Известно, что эффективная активность GEF Dock180 в клеточном контексте требует формирования сложный между Dock180 и его родственником адаптерные белки, которые способствуют его перемещению к плазматической мембране и связыванию с Rac.^[11][12] Аналогичным образом, Dock2, как было показано, образует комплекс с хорошо описанным DOCK-связывающим белком. ELMO1 и это взаимодействие необходимо для Dock2-опосредованной активации Rac в лимфоцит Сотовые линии.^[9] Белки ELMO содержат С-концевой участок, богатый пролином, который связывается с N-концевым доменом SH3 белков DOCK и опосредует их привлечение к участкам с высокой доступностью Rac (прежде всего, к плазматической мембране).^[12] Белки ELMO также содержат Домен PH что, кажется, вызывает конформационные изменения в DOCK и тем самым разрешить привязку к Rac.^[13]

Сигнализация ниже по потоку от Dock2

Как и другие белки подсемейства DOCK-A и DOCK-B, Dock2 активность GEF специфична для Rac. Лейкоциты экспрессируют оба Rac1 и Rac2 и Dock2, как было показано, связывает и способствует обмену нуклеотидов на обоих из этих изоформы.^[6] Изоформы Rac регулируют множество процессов в лейкоцитах, и исследования пока показали, что Dock2-зависимая активация Rac регулирует нейтрофил НАДФН оксидаза^[8] а также важно для хемотаксис в нейтрофилах,^[8][14] лимфоциты^[15] и плазмацитоидные дендритные клетки.^[16] Сообщалось о Dock2-зависимой активации НАДФН-оксидазы в ответ на растворимый агонист fMLP, который действует через G-белковые рецепторы в нейтрофилах.^[8] Сообщалось о Dock2-зависимом хемотаксисе в ответ на хемокины CXCL12 / SDF-1 в Т-лимфоциты, CXCL13 / BLC в В-лимфоциты и CCL19 / ELC в тимоциты (незрелые лимфоциты), эмигрирующие из вилочковая железа^[15] а также CCL21 / SLC в ex vivo плазмацитоидные дендритные клетки.^[16] При хемотаксисе нейтрофилов Dock2 передает сигналы ниже C5a и CXCL8 / IL-8 рецепторы.^[8][14] Дополнительные рецепторы, которые передают сигнал через Dock2, включают Т-клеточный рецептор / TCR^[17] и EDG1, а сфингозин-1-фосфат (S1P) рецептор.^[18] В ВИЧ-1 белок Неф способен конститутивно активировать Dock2 в Т-лимфоцитах, что нарушает хемотаксис и иммунологический синапс образование, тем самым подавляя противовирусный иммунная реакция.^[19]

Взаимодействия

Dock2 был показан взаимодействовать с CRKL.^[20]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000134516 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020143 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. "Entrez Gene: DOCK2, выделяющий цитокинез 2".
6. Нишихара Х., Кобаяси С., Хашимото Й. и др. (Ноябрь 1999 г.). «Неприлипающая клеточно-специфическая экспрессия DOCK2, члена человеческого семейства белков CDM». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Исследование молекулярных клеток. 1452 (2): 179–87. Дои:10.1016 / S0167-4889 (99) 00133-0. PMID  10559471.
7. Côté JF, Vuori K (декабрь 2002 г.). «Идентификация эволюционно консервативного суперсемейства DOCK180-родственных белков с активностью обмена гуаниновых нуклеотидов». Журнал клеточной науки. 115 (Пт 24): 4901–13. Дои:10.1242 / jcs.00219. PMID  12432077.
8. Кунисаки Ю., Нишикими А., Танака Ю. и др. (Август 2006 г.). «DOCK2 - активатор Rac, регулирующий подвижность и полярность во время хемотаксиса нейтрофилов». Журнал клеточной биологии. 174 (5): 647–52. Дои:10.1083 / jcb.200602142. ЧВК  2064308. PMID  16943182.
9. Сануи Т., Инаёши А., Нода М. и др. (Октябрь 2003 г.). «DOCK2 регулирует активацию Rac и реорганизацию цитоскелета посредством взаимодействия с ELMO1». Кровь. 102 (8): 2948–50. Дои:10.1182 / кровь-2003-01-0173. PMID  12829596.
10. Нишихара Х., Маеда М., Ода А. и др. (Декабрь 2002 г.). «DOCK2 связывается с CrkL и регулирует Rac1 в клеточных линиях лейкемии человека». Кровь. 100 (12): 3968–74. Дои:10.1182 / кровь-2001-11-0032. PMID  12393632.
11. Хасегава Х., Киёкава Э., Танака С. и др. (Апрель 1996 г.). «DOCK180, основной белок, связывающий CRK, изменяет морфологию клеток при транслокации к клеточной мембране». Молекулярная и клеточная биология. 16 (4): 1770–76. Дои:10.1128 / mcb.16.4.1770. ЧВК  231163. PMID  8657152.
12. Като Х., Негиси М. (июль 2003 г.). «RhoG активирует Rac1 путем прямого взаимодействия с Dock180-связывающим белком Elmo». Природа. 424 (6947): 461–64. Дои:10.1038 / природа01817. PMID  12879077. S2CID  4411133.
13. Лу М., Кинчен Дж. М., Россман К. Л. и др. (2004). "Домен PH функций ELMO в транс для регулирования активации Rac через Dock180 ". Структурная и молекулярная биология природы. 11 (8): 756–62. Дои:10.1038 / nsmb800. PMID  15247908. S2CID  125990.
14. Сай Дж., Раман Д., Лю И и др. (Июль 2008 г.). «Параллельные PI3K-зависимые и Src-зависимые пути приводят к CXCL8-опосредованной активации Rac2 и хемотаксису». Журнал биологической химии. 283 (39): 26538–47. Дои:10.1074 / jbc.M805611200. ЧВК  2546539. PMID  18662984.
15. Фукуи Ю., Хашимото О, Сануи Т. и др. (Август 2001 г.). «Специфический для гематопоэтических клеток белок семейства CDM DOCK2 необходим для миграции лимфоцитов». Природа. 412 (6849): 826–31. Дои:10.1038/35090591. PMID  11518968. S2CID  19123083.
16. Гото К., Танака Ю., Нишикими А. и др. (Март 2008 г.). «Дифференциальная потребность в DOCK2 в миграции плазматических дендритных клеток по сравнению с миелоидными дендритными клетками». Кровь. 111 (6): 2973–76. Дои:10.1182 / кровь-2007-09-112169. PMID  18198348.
17. Нишихара Х., Маэда М., Цуда М. и др. (Август 2002 г.). «DOCK2 опосредует индуцированную Т-клеточным рецептором активацию транскрипции Rac2 и IL-2». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 296 (3): 716–20. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 00931-2. PMID  12176041.
18. Номбела-Арриета С., Мемпель Т.Р., Сориано С.Ф. и др. (Март 2007 г.). «Центральная роль DOCK2 во время подвижности интерстициальных лимфоцитов и опосредованного сфингозин-1-фосфатом выхода» (PDF). Журнал экспериментальной медицины. 204 (3): 497–510. Дои:10.1084 / jem.20061780. ЧВК  2137902. PMID  17325199.
19. Джанардхан А., Свигут Т., Хилл Б. и др. (Январь 2004 г.). «ВИЧ-1 Nef связывает комплекс DOCK2-ELMO1 для активации rac и ингибирования хемотаксиса лимфоцитов». PLOS Биология. 2 (1): e6. Дои:10.1371 / journal.pbio.0020006. ЧВК  314466. PMID  14737186.
20. Нишихара Х, Маэда М, Ода А, Цуда М, Сава Х, Нагашима К., Танака С. (2002). «DOCK2 связывается с CrkL и регулирует Rac1 в клеточных линиях лейкемии человека». Кровь. 100 (12): 3968–74. Дои:10.1182 / кровь-2001-11-0032. PMID  12393632.

дальнейшее чтение

• Рейф К., Цистер Дж. (2003). «Белок CDM DOCK2 в миграции лимфоцитов». Тенденции в клеточной биологии. 12 (8): 368–73. Дои:10.1016 / S0962-8924 (02) 02330-9. PMID  12191913.
• Бругнера Э., Хейни Л., Гримсли С. и др. (2002). «Нетрадиционная активность Rac-GEF опосредована комплексом Dock180-ELMO». Природа клеточной биологии. 4 (8): 574–82. Дои:10.1038 / ncb824. PMID  12134158. S2CID  36363774.
• Лу М., Кинчен Дж. М., Россман К. Л. и др. (2005). «Модель стерического ингибирования для регуляции обмена нуклеотидов через семейство Dock180 GEF». Текущая биология. 15 (4): 371–7. Дои:10.1016 / j.cub.2005.01.050. PMID  15723800. S2CID  14267018.
• Гарсия-Берналь Д., Сотильо-Малло Е., Номбела-Арриета С. и др. (2007). «DOCK2 необходим для адгезии человеческих Т-лимфоцитов, стимулированной хемокинами, при напряжении сдвига, опосредованном интегрином альфа4бета1». Журнал иммунологии. 177 (8): 5215–25. Дои:10.4049 / jimmunol.177.8.5215. PMID  17015707.
• Меллер Н., Мерло С., Гуда С. (ноябрь 2005 г.). «Белки CZH: новое семейство Rho-GEF». Журнал клеточной науки. 118 (Пт 21): 4937–46. Дои:10.1242 / jcs.02671. PMID  16254241.
• Коте Дж. Ф., Вуори К. (2007). «GEF что? Dock180 и родственные белки помогают Rac поляризовать клетки по-новому». Тенденции в клеточной биологии. 17 (8): 383–93. Дои:10.1016 / j.tcb.2007.05.001. ЧВК  2887429. PMID  17765544.
• Лу М., Равичандран К.С. (2006). «Сотрудничество Dock180-ELMO в активации Rac». Методы в энзимологии. 406: 388–402. Дои:10.1016 / S0076-6879 (06) 06028-9. ISBN  9780121828110. PMID  16472672.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q92608 (Выявляющий белок цитокинеза 2) на PDBe-KB.