ЦПАН6 - TSPAN6

ЦПАН6
Идентификаторы
Псевдонимы	ЦПАН6, T245, TM4SF6, TSPAN-6, тетраспанин 6
Внешние идентификаторы	OMIM: 300191 MGI: 1926264 ГомолоГен: 20700 Генные карты: ЦПАН6
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xq22.1 Начинать 100,627,108 бп[1] Конец 100,639,991 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа X | X E3 Начинать 133,891,068 бп[2] Конец 133,898,429 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • активность преобразователя сигнала Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • внеклеточная экзосома • мембрана Биологический процесс • положительная регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB • отрицательная регуляция передачи сигналов NIK / NF-kappaB • сигнальный путь рецептора клеточной поверхности • отрицательная регуляция индуцированного вирусами сигнального пути рецептора распознавания цитоплазматических образов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	7105	56496
Ансамбль	ENSG00000000003	ENSMUSG00000067377
UniProt	O43657	O70401
RefSeq (мРНК)	NM_001278740 NM_001278741 NM_001278742 NM_001278743 NM_003270	NM_019656
RefSeq (белок)	NP_001265669 NP_001265670 NP_001265671 NP_001265672 NP_003261	н / д
Расположение (UCSC)	Chr X: 100.63 - 100.64 Мб	Chr X: 133,89 - 133,9 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Тетраспанин-6 это белок что у людей кодируется ЦПАН6 ген.^[5][6]

Белок, кодируемый этим геном, является членом трансмембранное 4 суперсемейство, также известный как тетраспанин семья. Большинство этих членов представляют собой белки клеточной поверхности, характеризующиеся наличием четырех гидрофобный домены. Белки опосредуют события передачи сигнала, которые играют роль в регуляции развития клеток, активация, рост и подвижность. Этот кодируемый белок представляет собой клеточную поверхность. гликопротеин и очень похож по последовательности на трансмембранный 4 член суперсемейства 2. Использование альтернативных полиаденилирование сайты были найдены для этого гена.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000000003 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000067377 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Маэда К., Мацухаши С., Хори К., Синь З., Мукаи Т., Табучи К., Эгашира М., Ниикава Н. (декабрь 1998 г.). «Клонирование и характеристика нового человеческого гена TM4SF6, кодирующего белок, принадлежащий трансмембранному суперсемейству 4, и картированный на Xq22». Геномика. 52 (2): 240–2. Дои:10.1006 / geno.1998.5415. PMID  9782095.
6. "Энтрез Ген: TSPAN6 тетраспанин 6".

дальнейшее чтение

• Бердичевский Ф (2002). «Комплексы тетраспанинов с интегринами: больше, чем кажется на первый взгляд». J. Cell Sci. 114 (Pt 23): 4143–51. PMID  11739647.
• Тодд С.К., Доктор В.С., Леви С. (1998). «Последовательности и экспрессия шести новых членов семейства тетраспанинов / TM4SF». Биохим. Биофиз. Acta. 1399 (1): 101–4. Дои:10.1016 / s0167-4781 (98) 00087-6. PMID  9714763.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Мацуда А, Сузуки У, Хонда Дж и др. (2003). «Крупномасштабная идентификация и характеристика человеческих генов, активирующих сигнальные пути NF-kappaB и MAPK». Онкоген. 22 (21): 3307–18. Дои:10.1038 / sj.onc.1206406. PMID  12761501.
• Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретных белков (SPDI), крупномасштабная попытка выявления новых секретируемых и трансмембранных белков человека: биоинформатическая оценка». Genome Res. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Росс М.Т., Графхэм Д.В., Коффи А.Дж. и др. (2005). «Последовательность ДНК Х-хромосомы человека». Природа. 434 (7031): 325–37. Дои:10.1038 / природа03440. ЧВК  2665286. PMID  15772651.
• Оцуки Т., Ота Т., Нисикава Т. и др. (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевого слова in silico для отбора полноразмерных человеческих кДНК, кодирующих секрецию или мембранные белки из библиотек олигокапированных кДНК». ДНК Res. 12 (2): 117–26. Дои:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID  16303743.