SMC5 - SMC5

Структурное содержание хромосомного белка 5 это белок закодировано SMC5 ген в человеке.^[1][2]

Структурное поддержание сложных механизмов, лежащих в основе хромосом, вовлеченных в динамику динамики хроматина, неизвестно, и новые открытия проливают свет на различные функции.^[3] В SMC комплекс опосредует взаимодействия на расстоянии, которые делают возможным сворачивание хроматина более высокого порядка в интерфазе. Комплекс SMC имеет АТФаза активность, консервативный клейзин, а также регуляторные субъединицы.^[3] Белковые комплексы SMC вовлечены в репарацию ДНК, пути транскрипции, регуляцию сегрегации хромосом и иммунитет у Арабидопсис. У эукариот хромосомы структурной поддержки состоят из когезин (SMC1 И SMC3), конденсин (SMC2 и SMC4) и комплексы SMC5 / 6.

Структура

Комплекс Smc5 / 6 был обнаружен у делящихся дрожжей. RAD18 (SMC6), ген повреждения ДНК у делящихся дрожжей, также кодирует SMC-подобный белок и образует гетеродимерный комплекс с белком Spr18 (SMC5).^[4][5] У дрожжей комплекс SMC5 / 6 имеет субъединицы, которые состоят из SMC5, SMC6 и шести белков неструктурного поддержания хромосом (NSE). Субъединицы Nse1-Nse3-Nse4 соединяют головку Smc5 Smc6 и позволяют связываться с ДНК.

SMC5
Идентификаторы
Псевдонимы	SMC5, SMC5L1, структурное поддержание хромосом 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 609386 MGI: 2385088 ГомолоГен: 41009 Генные карты: SMC5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[6] Группа 9q21.12 Начинать 70,258,978 бп[6] Конец 70,354,873 бп[6]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 19 (мышь)[7] Группа 19 | 19 млрд Начинать 23,206,451 бп[7] Конец 23,273,897 бп[7]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание АТФ Сотовый компонент • место двухцепочечного разрыва • Тело PML • Smc5-Smc6 комплекс • хромосома • хромосома, теломерная область • соединение клеток • межхроматиновая гранула • ядро клетки • нуклеоплазма • ядерное пятнышко • половая хромосома Биологический процесс • Рекомбинация ДНК • положительная регуляция поддержания сплоченности митотических сестринских хроматид • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • деление клеток • поддержание теломер посредством рекомбинации • клеточное старение • положительное регулирование сегрегации хромосом • репарация двухцепочечных разрывов посредством гомологичной рекомбинации • клеточный цикл • восстановление двухниточного разрыва за счет негомологичного соединения концов • Ремонт ДНК • сцепление сестринских хроматид Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	23137	226026
Ансамбль	ENSG00000198887	ENSMUSG00000024943
UniProt	Q8IY18	Q8CG46
RefSeq (мРНК)	NM_015110	NM_001252684 NM_001252685 NM_153808
RefSeq (белок)	NP_055925	NP_001239613 NP_001239614 NP_722503
Расположение (UCSC)	Chr 9: 70.26 - 70.35 Мб	Chr 19: 23.21 - 23.27 Мб
PubMed поиск	[8]	[9]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Он участвует в Альтернативное удлинение теломер механизм рака.^[10]

Роль в рекомбинации и мейозе

Smc5 и Smc6 белки образуют гетеродимерную кольцевую структуру и вместе с другими элементами, не относящимися к SMC, образуют комплекс SMC-5/6. В черве Caenorhabditis elegans этот комплекс взаимодействует с Геликаза HIM-6 (BLM) продвигать мейотическая рекомбинация промежуточная обработка и хромосома созревание.^[11] Комплекс SMC-5/6 в мыши ооциты необходим для образования сегрегационных бивалентов во время мейоз.^[12] У человека синдром обрыва хромосомы характеризующийся тяжелым заболеванием легких в раннем детстве, связан с мутация в составе комплекса СМЦ-5/6.^[13] Отображение клеток пациента хромосомные перестройки, микроядра, чувствительность к Повреждение ДНК и дефектный гомологичная рекомбинация.

Рекомендации

1. Нагасе Т., Исикава К., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О. (февраль 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. IX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК исследования. 5 (1): 31–9. Дои:10.1093 / днарес / 5.1.31. PMID  9628581.
2. «Ген Entrez: структурное поддержание SMC5 хромосом 5».
3. Jeppsson K, Kanno T, Shirahige K, Sjögren C (сентябрь 2014 г.). «Поддержание структуры хромосом: позиционирование и функционирование комплексов SMC». Обзоры природы. Молекулярная клеточная биология. 15 (9): 601–14. Дои:10.1038 / nrm3857. PMID  25145851. S2CID  23908801.
4. Фустери М.И., Леманн А.Р. (апрель 2000 г.). «Новый белковый комплекс SMC в Schizosaccharomyces pombe содержит белок репарации ДНК Rad18». Журнал EMBO. 19 (7): 1691–702. Дои:10.1093 / emboj / 19.7.1691. ЧВК  310237. PMID  10747036.
5. Lehmann AR, Walicka M, Griffiths DJ, Murray JM, Watts FZ, McCready S, Carr AM (декабрь 1995 г.). «Ген rad18 Schizosaccharomyces pombe определяет новую подгруппу суперсемейства SMC, участвующих в репарации ДНК». Молекулярная и клеточная биология. 15 (12): 7067–80. Дои:10.1128 / mcb.15.12.7067. ЧВК  230962. PMID  8524274.
6. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000198887 - Ансамбль, Май 2017
7. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024943 - Ансамбль, Май 2017
8. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
9. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
10. Potts PR, Yu H (июль 2007 г.). «Комплекс SMC5 / 6 поддерживает длину теломер в раковых клетках ALT за счет SUMOylation теломер-связывающих белков». Структурная и молекулярная биология природы. 14 (7): 581–90. Дои:10.1038 / nsmb1259. PMID  17589526. S2CID  7915836.
11. Хонг И, Сонневиль Р., Агостиньо А., Мейер Б., Ван Б., Блоу Дж. Дж., Gartner A (март 2016 г.). «Комплекс SMC-5/6 и геликаза HIM-6 (BLM) синергетически способствуют промежуточному процессингу мейотической рекомбинации и созреванию хромосом во время мейоза Caenorhabditis elegans». PLOS Genetics. 12 (3): e1005872. Дои:10.1371 / journal.pgen.1005872. ЧВК  4807058. PMID  27010650.
12. Хван Г., Сун Ф., О'Брайен М., Эппиг Дж. Дж., Гендель М. А., Джордан П. У. (май 2017 г.). «SMC5 / 6 необходим для образования сегрегационных двухвалентных хромосом во время мейоза I в ооцитах мышей». Разработка. 144 (9): 1648–1660. Дои:10.1242 / dev.145607. ЧВК  5450844. PMID  28302748.
13. ван дер Краббен С.Н., Хеннус М.П., ​​МакГрегор Г.А., Риттер Д.И., Нагамани С.К., Уэллс О.С. и др. (Август 2016 г.). «Дестабилизированный комплекс SMC5 / 6 приводит к синдрому разрыва хромосом с тяжелым заболеванием легких». Журнал клинических исследований. 126 (8): 2881–92. Дои:10.1172 / JCI82890. ЧВК  4966312. PMID  27427983.

дальнейшее чтение

• Накадзима Д., Окадзаки Н., Ямакава Х., Кикуно Р., Охара О., Нагасе Т. (июнь 2002 г.). «Конструирование готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное культивирование 330 клонов кДНК KIAA». ДНК исследования. 9 (3): 99–106. CiteSeerX  10.1.1.500.923. Дои:10.1093 / днарес / 9.3.99. PMID  12168954.
• Тейлор Э.М., Мограби Дж. С., Лис Дж. Х., Смит Б., Моэн П. Б., Леманн А. Р. (июнь 2001 г.). «Характеристика нового гетеродимера SMC человека, гомологичного комплексу Schizosaccharomyces pombe Rad18 / Spr18». Молекулярная биология клетки. 12 (6): 1583–94. Дои:10.1091 / mbc.12.6.1583. ЧВК  37326. PMID  11408570.
• Potts PR, Yu H (август 2005 г.). «Человеческий MMS21 / NSE2 - это лигаза SUMO, необходимая для репарации ДНК». Молекулярная и клеточная биология. 25 (16): 7021–32. Дои:10.1128 / MCB.25.16.7021-7032.2005. ЧВК  1190242. PMID  16055714.
• Potts PR, Porteus MH, YuH (июль 2006 г.). «Человеческий комплекс SMC5 / 6 способствует гомологичной рекомбинации сестринских хроматид, привлекая когезиновый комплекс SMC1 / 3 к двухцепочечным разрывам». Журнал EMBO. 25 (14): 3377–88. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601218. ЧВК  1523187. PMID  16810316.