Coilin - Coilin

Катушка
Идентификаторы
Псевдонимы	Катушка, Катушка, C79982, Cln80, p80, p80-coilin, coilin
Внешние идентификаторы	OMIM: 600272 MGI: 104842 ГомолоГен: 3413 Генные карты: Катушка
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q22 Начинать 56,938,199 бп[1] Конец 56,961,050 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 C | 11 54,34 см Начинать 88,970,252 бп[2] Конец 88,991,613 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками • связывание с С-концом белка • Связывание мяРНК U1 • Связывание U2 мяРНК Сотовый компонент • Тело Кахала • ядрышко • мембрана • ядро клетки • нуклеоплазма • фибриллярный центр • ядерное тело Биологический процесс • сплайсосомная сборка snRNP Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8161	12812
Ансамбль	ENSG00000121058	ENSMUSG00000033983
UniProt	P38432	Q5SU73
RefSeq (мРНК)	NM_004645	NM_016706
RefSeq (белок)	NP_004636	NP_057915
Расположение (UCSC)	Chr 17: 56.94 - 56.96 Мб	Chr 11: 88.97 - 88.99 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Coilin это белок что у людей кодируется Катушка ген.^[5][6] Coilin получил свое название от спиральной формы Тела Кахала в котором он находится. Впервые он был идентифицирован с использованием аутоиммунной сыворотки человека.

Функция

Белок Coilin является одним из основных молекулярных компонентов тельцов Кахаля. Тельца Кахаля не связаны с мембраной ядерные тела различного количества и состава, которые участвуют в посттранскрипционная модификация малых ядерных и малые ядрышковые РНК. В дополнение к своей структурной роли, coilin действует как клей для соединения CB с ядрышко. В N-конец белка коилина направляет его самоолигомеризацию, в то время как C-конец влияет на количество ядерных тел, собранных на клетку. Дифференциальный метилирование и фосфорилирование of coilin, вероятно, влияет на его локализацию среди ядерных тел, а также на состав и сборку тел Кахаля. Этот ген имеет псевдогены на хромосоме 4 и хромосоме 14.^[6]

Для изучения CB коулин можно комбинировать с GFP (Зеленый флуоресцентный белок ) для формирования Coilin-GFP гибридный белок. Затем гибридный белок можно использовать для определения местонахождения CB под микроскопом, обычно около ядрышка клетки. Другие белки, входящие в состав CB, включают: snRNPs и ядрышко snoRNPs.

Coilin было показано взаимодействовать с атаксин 1,^[7][8] ядрышковый фосфопротеин p130,^[9] SMN,^[10][11] и SNRPB.^[11]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000121058 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033983 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Чан EK, Takano S, Andrade LE, Hamel JC, Matera AG (декабрь 1994 г.). «Структура, экспрессия и хромосомная локализация гена p80-коилина человека». Нуклеиновые кислоты Res. 22 (21): 4462–9. Дои:10.1093 / nar / 22.21.4462. ЧВК  308480. PMID  7971277.
6. "Entrez Gene: COIL coilin".
7. Хонг С., Ка С., Ким С., Пак И, Кан С. (май 2003 г.). «p80 коилин, специфический белок в форме спирального тела, взаимодействует с атаксином-1, продуктом гена SCA1». Биохим. Биофиз. Acta. 1638 (1): 35–42. Дои:10.1016 / s0925-4439 (03) 00038-3. PMID  12757932.
8. Хун С., Ли С., Чо С., Кан С. (июнь 2008 г.). «UbcH6 взаимодействует и убиквитинирует продукт гена SCA1 - атаксин-1». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 371 (2): 256–60. Дои:10.1016 / j.bbrc.2008.04.066. PMID  18439907.
9. Исаак К., Ян Й., Мейер UT (июль 1998 г.). «Nopp140 функционирует как молекулярное звено между ядрышком и спиральными телами». J. Cell Biol. 142 (2): 319–29. Дои:10.1083 / jcb.142.2.319. ЧВК  2133063. PMID  9679133.
10. Hebert MD, Shpargel KB, Ospina JK, Tucker KE, Matera AG (сентябрь 2002 г.). «Метилирование коилина регулирует формирование ядерного тела». Dev. Клетка. 3 (3): 329–37. Дои:10.1016 / с1534-5807 (02) 00222-8. PMID  12361597.
11. Hebert MD, Szymczyk PW, Shpargel KB, Matera AG (октябрь 2001 г.). «Коилин образует мост между тельцами Кахаля и SMN, белком спинальной мышечной атрофии». Genes Dev. 15 (20): 2720–9. Дои:10.1101 / gad.908401. ЧВК  312817. PMID  11641277.

дальнейшее чтение

• Огг С.К., Ламонд А.И. (14 октября 2002 г.). «Тела Кахаля и койлин - движение к функции». J. Cell Biol. 159 (1): 17–21. Дои:10.1083 / jcb.200206111. ЧВК  2173504. PMID  12379800.
• Андраде Л.Е., Чан Э.К., Раска И., Пиблз К.Л., Роос Г., Тан Э.М. «Человеческое аутоантитело к новому белку ядерного свернутого тела: иммунологическая характеристика и клонирование кДНК p80-коилина». J. Exp. Med. 173 (6): 1407–19. Дои:10.1084 / jem.173.6.1407. ЧВК  2190846. PMID  2033369.
• Боманн К., Феррейра Дж.А., Ламонд А.И. (1996). «Мутационный анализ коилина p80 указывает на функциональное взаимодействие между спиральными тельцами и ядрышком». J. Cell Biol. 131 (4): 817–31. Дои:10.1083 / jcb.131.4.817. ЧВК  2200013. PMID  7490287.
• Кармо-Фонсека М., Феррейра Дж., Ламонд А.И. (1993). «Сборка snRNP-содержащих спиральных тел регулируется в интерфазе и митозе - свидетельство того, что спиралевидное тело представляет собой кинетическую ядерную структуру». J. Cell Biol. 120 (4): 841–52. Дои:10.1083 / jcb.120.4.841. ЧВК  2200076. PMID  7679389.
• Робертсон Н.Г., Хетарпал У., Гутьеррес-Эспелета Г.А., Бибер Ф.Р., Мортон С.К. (1995). «Выделение новых и известных генов из библиотеки кДНК улитки человеческого плода с использованием субтрактивной гибридизации и дифференциального скрининга». Геномика. 23 (1): 42–50. Дои:10.1006 / geno.1994.1457. PMID  7829101.
• Кусуда Дж., Танума Р., Гото Э., Тойода А., Хашимото К. (1995). «Отнесение аутоиммунного антигена человека, гена p80-коилина к хромосоме 17q21-q23 и его возможного псевдогена к хромосоме 14». Гм. Genet. 95 (2): 233–4. Дои:10.1007 / BF00209411. PMID  7860074. S2CID  20006429.
• Lyon CE, Bohmann K, Sleeman J, Lamond AI (1997). «Ингибирование дефосфорилирования белка приводит к накоплению сплайсинговых мяРНП и спиральных тел внутри ядрышка». Exp. Cell Res. 230 (1): 84–93. Дои:10.1006 / excr.1996.3380. PMID  9013710.
• Парфенов В.Н., Дэвис Д.С., Почукалина Г.Н., Костючек Д., Мурти К.Г. (1998). «Динамика распределения компонентов сплайсинга относительно транскрипционного состояния ооцитов человека из антральных фолликулов». J. Cell. Биохим. 69 (1): 72–80. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19980401) 69: 1 <72 :: AID-JCB8> 3.0.CO; 2-S. PMID  9513048.
• Почукалина Г.Н., Дэвис Д.С., Костючек Д.Ф., Мурти К.Г., Парфенов В.Н. (1998). «[Факторы сплайсинга в ядрах ооцитов антральных фолликулов человека]». Цитология. 40 (4): 239–47. PMID  9644758.
• Исаак К., Ян Й, Мейер UT (1998). «Nopp140 функционирует как молекулярное звено между ядрышком и спиральными телами». J. Cell Biol. 142 (2): 319–29. Дои:10.1083 / jcb.142.2.319. ЧВК  2133063. PMID  9679133.
• Лю Дж., Хеберт, доктор медицины, Йе Й, Темплтон, ди-джей, Кунг Х, Матера АГ (2000). «Зависимая от клеточного цикла локализация комплекса CDK2-циклин E в тельцах Кахаля (спиральные)». J. Cell Sci. 113 (9): 1543–52. PMID  10751146.
• Hebert MD, Matera AG (2001). «Самоассоциация коилинов раскрывает общую тему локализации ядерного тела». Мол. Биол. Клетка. 11 (12): 4159–71. Дои:10.1091 / mbc.11.12.4159. ЧВК  15064. PMID  11102515.
• Янг П.Дж., Ле Т.Т., Данкли М., Нгуен Т.М., Бургес А.Х., Моррис Г.Э. (2001). «Ядерные камни и тела Кахаля (свернутые в спираль) в тканях плода: ядрышковое распределение белка спинальной мышечной атрофии, SMN». Exp. Cell Res. 265 (2): 252–61. Дои:10.1006 / excr.2001.5186. PMID  11302690.
• Hebert MD, Szymczyk PW, Shpargel KB, Matera AG (2001). «Коилин образует мост между тельцами Кахаля и SMN, белком спинальной мышечной атрофии». Genes Dev. 15 (20): 2720–9. Дои:10.1101 / gad.908401. ЧВК  312817. PMID  11641277.
• Андерсен Дж. С., Лион CE, Фокс А. Х., Люнг А. К., Лам Ю. В., Стин Х, Манн М., Ламонд А. И. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Curr. Биол. 12 (1): 1–11. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID  11790298. S2CID  14132033.
• Слиман Дж. Э., Аджух П., Ламонд А. И. (2002). «Экспрессия белка snRNP усиливает образование тельцов Кахаля, содержащих p80-коилин и SMN». J. Cell Sci. 114 (Pt 24): 4407–19. PMID  11792806.
• Hebert MD, Shpargel KB, Ospina JK, Tucker KE, Matera AG (2002). «Метилирование коилина регулирует формирование ядерного тела». Dev. Клетка. 3 (3): 329–37. Дои:10.1016 / S1534-5807 (02) 00222-8. PMID  12361597.
• Шпаргель КБ, Оспина Дж.К., Такер К.Э., Матера АГ, Хеберт Мэриленд (2003). «Контроль числа тельцов Кахаля опосредован С-концом коилина». J. Cell Sci. 116 (Pt 2): 303–12. Дои:10.1242 / jcs.00211. PMID  12482916.
• Слиман Дж. Э., Тринкл-Малкахи Л., Прескотт А. Р., Огг С. К., Ламонд А. И. (2004). «Белки тельца Кахаля SMN и Coilin демонстрируют дифференциальное динамическое поведение in vivo». J. Cell Sci. 116 (Pt 10): 2039–50. Дои:10.1242 / jcs.00400. PMID  12679382.
• Херст С.М., Гилдер А.С., Неги С.С., Дэвис М.Д., Джордж Е.М., Уиттом А.А., Toyota CG, Хуседзинович А., Грусс О.Дж., Хеберт М.Д. (2009). «Образование тельцов Кахаля коррелирует с дифференциальным фосфорилированием коилинов в первичных и трансформированных клеточных линиях». J. Cell Sci. 122 (Pt 11): 1872–81. Дои:10.1242 / jcs.044040. ЧВК  2684838. PMID  19435804.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.