SERAC1 - SERAC1
Белок 1, содержащий активный центр серина, или же Белок SERAC1 это белок у людей это кодируется SERAC1 ген.[5][6][7] Белок, кодируемый этим геном, представляет собой фосфатидилглицерин ремоделирующий белок, обнаруженный на границе раздела митохондрии и эндоплазматическая сеть, где он выступает посредником фосфолипид обмен. Кодируемый белок играет важную роль в митохондриальный функция и внутриклеточные холестерин торговля людьми. Дефекты в этом гене являются причиной 3-метилглутаконовая ацидурия с глухотой, энцефалопатия, и синдром Ли (MEGDEL). Два варианты расшифровки один кодирующий белок, а другой небелковый кодирующий были обнаружены для этого гена.[5]
Структура
В SERAC1 ген находится на q рука из хромосома 6 в положении 25.3 и охватывает 58 776 пар оснований.[5] В SERAC1 ген продуцирует белок 18,7 кДа, состоящий из 162 аминокислоты.[8][9] В структуре кодируемого белка содержится C-терминал серин -липаза /эстераза домен содержащий консенсус липаза мотив GxSxG и N-концевой сигнальная последовательность.[10]
Функция
В SERAC1 ген кодирует белок необходимо для фосфатидилглицерин ремоделирование. фосфатидилглицерин ремоделирование - это процесс изменения или ремоделирования определенного фосфолипид называется фосфатидилглицерин. Фосфатидилглицерин помогает сделать кардиолипин, важный ингредиент, окружающий Внутренняя митохондриальная мембрана. Кардиолипин отвечает за преобразование энергии, полученной из пищи, в пригодную для использования клетками форму и необходимую для правильной функции митохондрий. Потому что кардиолипин, процесс ремоделирования фосфатидилглицерин необходим для функции митохондрий и внутриклеточного транспорта холестерина.[11][6][7]
Кроме того, SERAC1 участвует в перемещении холестерин, которые представляют собой жировые восковые вещества внутри клеток. Холестерин является компонентом клеточной структуры и производит гормоны и пищеварительный кислоты. Белок также может участвовать в реакция трансацилирования-ацилирования производить фосфатидилглицерин -36: 1 и бис (моноацилглицерин ) путь биосинтеза фосфатов.[11][6][7]
Клиническое значение
Мутации в SERAC1 ген были связаны с нарушением как функции митохондрий, так и внутриклеточного холестерин торговля людьми.[10] Такие мутации в основном связаны с Синдром Ли и 3-метилглутаконовая ацидурия с глухотой, энцефалопатией и синдромом Ли, известный как синдром MEGDEL.[12]
Синдром MEGDEL
SERAC1 мутации в значительной степени связаны с синдромом MGDEL. Синдром MGDEL (3-метилглутаконовая ацидурия с глухотой, энцефалопатией и синдромом Ли) аутосомно-рецессивное заболевание характеризуется задержкой психомоторного развития или психомоторной регрессией в детстве, нейросенсорная глухота, спастичность или же дистония и повышенное выведение 3-метилглутаконовая кислота. Шоу изображений мозга мозговой и мозжечок атрофия а также поражения в базальный ганглий напоминает Синдром Ли. Лабораторные исследования показывают увеличение сыворотка лактат и аланин, митохондриальное окислительное фосфорилирование дефекты, ненормальные митохондрии, аномальный фосфатидилглицерин и кардиолипин профили в фибробласты, и аномальное накопление неэтерифицированных холестерин внутри клеток.[7][6]
В SERAC1 мутации гена, вызывающие это состояние, уменьшают количество продуцируемого белка SERAC1 или приводят к образованию белка с небольшой функцией или без нее. Как результат, фосфатидилглицерин ремоделирование нарушается, что, вероятно, изменяет состав кардиолипин. Исследователи предполагают, что аномальный кардиолипин влияет на функцию митохондрий, снижая выработку клеточной энергии и приводя к неврологическим и слуховым проблемам, характерным для синдрома MEGDEL. Неясно, как мутации гена SERAC1 приводят к аномальному высвобождению 3-метилглутаконовая кислота в моче.[11][5]
Мутация c.202C> T в этом гене была обнаружена у пациента, страдающего 3-метилглутаконовая ацидурия и сопутствующие симптомы.[13] Два пациента с гомозиготными трансверсиями G> C в SERAC1 ген обнаруживает симптомы синдрома MEGDEL с глухота, энцефалопатия, и синдром Ли.[10] Другой пациент с гомозиготным 4 базовая пара делеция (1167delTCAG) показала симптомы рецидивирующих инфекций, неспособность процветать, умственная отсталость, спастичность и экстрапирамидные симптомы.[14]
Синдром Ли
Синдром Ли является прогрессирующим с ранним началом нейродегенеративное расстройство характеризуется наличием очаговых, двусторонних поражения в одной или нескольких областях Центральная нервная система в том числе мозговой ствол, таламус, базальный ганглий, мозжечок и спинной мозг. Клинические особенности зависят от того, какие области центральной нервной системы поражены, и включают подострое начало психомоторная отсталость, гипотония, атаксия, мышечная слабость, потеря зрения, нарушения движения глаз, припадки, и дисфагия.[15]
Взаимодействия
SERAC1 показал, что Белковые взаимодействия со следующим.[16][6]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000122335 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015659 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ а б c d «Энтрез Ген: активный сайт серина, содержащий 1». Получено 2012-07-24.
Эта статья включает текст из этого источника, который находится в всеобщее достояние. - ^ а б c d е «Белок SERAC1». Получено 2018-08-27.
Эта статья включает текст доступно под CC BY 4.0 лицензия. - ^ а б c d «UniProt: универсальная база знаний о белках». Исследования нуклеиновых кислот. 45 (D1): D158 – D169. Январь 2017 г. Дои:10.1093 / нар / gkw1099. ЧВК 5210571. PMID 27899622.
- ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Дуан Х., Улен М., Йетс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины посредством специализированной базы знаний». Циркуляционные исследования. 113 (9): 1043–53. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. ЧВК 4076475. PMID 23965338.
- ^ «Белок SERAC1». Атлас кардиоорганических белков (COPaKB).
- ^ а б c Wortmann SB, Vaz FM, Gardeitchik T, Vissers LE, Renkema GH, Schuurs-Hoeijmakers JH, Kulik W, Lammens M, Christin C, Kluijtmans LA, Rodenburg RJ, Nijtmans LG, Grünewald A, Klein C, Gerhold JM, Kozicz T, van Hasselt PM, Harakalova M, Kloosterman W, Barić I, Pronicka E, Ucar SK, Naess K, Singhal KK, Krumina Z, Gilissen C, van Bokhoven H, Veltman JA, Smeitink JA, Lefeber DJ, Spelbrink JN, Wevers RA, Морава Э., де Брауэр А. П. (июнь 2012 г.). «Мутации в гене ремоделирования фосфолипидов SERAC1 нарушают функцию митохондрий и внутриклеточный трафик холестерина и вызывают дистонию и глухоту». Природа Генетика. 44 (7): 797–802. Дои:10,1038 / нг.2325. PMID 22683713. S2CID 2447771.
- ^ а б c "SERAC1". Домашний справочник по генетике. NCBI. Эта статья включает текст из этого источника, который находится в всеобщее достояние.
- ^ Lumish HS, Yang Y, Xia F, Wilson A, Chung WK (2014). «Расширяющийся фенотип MEGDEL: атрофия зрительного нерва, микроцефалия и миоклоническая эпилепсия у ребенка с мутациями SERAC1». Отчеты JIMD. 16: 75–9. Дои:10.1007/8904_2014_322. ISBN 978-3-662-44586-0. ЧВК 4221303. PMID 24997715.
- ^ Торт Ф, Гарсия-Сильва М.Т., Феррер-Кортес Х, Наварро-Састре А, Гарсия-Виллория Дж., Колл М.Дж., Видаль Э., Хименес-Альмазан Дж., Допазо Дж., Брионес П., Эльпелег О., Рибес А. (2013). «Секвенирование экзома идентифицирует новую мутацию в SERAC1 у пациента с 3-метилглутаконовой ацидурией». Молекулярная генетика и метаболизм. 110 (1–2): 73–7. Дои:10.1016 / j.ymgme.2013.04.021. PMID 23707711.
- ^ Wortmann S, Rodenburg RJ, Huizing M, Loupatty FJ, de Koning T, Kluijtmans LA, Engelke U, Wevers R, Smeitink JA, Morava E (май 2006 г.). «Связь 3-метилглутаконовой ацидурии с сенсоневральной глухотой, энцефалопатией и синдромом Ли (ассоциация MEGDEL) у четырех пациентов с нарушением окислительного фосфорилирования». Молекулярная генетика и метаболизм. 88 (1): 47–52. Дои:10.1016 / j.ymgme.2006.01.013. PMID 16527507.
- ^ «Синдром Ли». www.uniprot.org.
- ^ Mick DU, Dennerlein S, Wiese H, Reinhold R, Pacheu-Grau D, Lorenzi I, Sasarman F, Weraarpachai W., Shoubridge EA, Warscheid B, Rehling P (декабрь 2012 г.). «MITRAC связывает транслокацию митохондриальных белков со сборкой дыхательной цепи и регуляцией трансляции». Клетка. 151 (7): 1528–41. Дои:10.1016 / j.cell.2012.11.053. PMID 23260140.
Эта статья включает текст из этого источника, который находится в 
Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.