PTK7 - PTK7

PTK7
Идентификаторы
Псевдонимы	PTK7, CCK-4, CCK4, протеинтирозинкиназа 7 (неактивная)
Внешние идентификаторы	OMIM: 601890 MGI: 1918711 ГомолоГен: 43672 Генные карты: PTK7
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6p21.1 Начинать 43,076,307 бп[1] Конец 43,161,719 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 | 17 С Начинать 46,564,471 бп[2] Конец 46,629,504 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность протеинкиназы • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание АТФ • корецепторная активность, участвующая в сигнальном пути Wnt, путь плоской клеточной полярности Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана • межклеточное соединение • очаговая адгезия • клеточная мембрана • соединение клеток • неотъемлемый компонент плазматической мембраны Биологический процесс • реорганизация актинового цитоскелета • клеточный ответ на ретиноевую кислоту • развитие межжелудочковой перегородки • конвергентное расширение • установление планарной полярности • лечение раны • Сигнальный путь Wnt • развитие коронарной сосудистой сети • путь плоской клеточной полярности, участвующий в закрытии нервной трубки • фосфорилирование белков • развитие сердца • установление апикальной / базальной полярности эпителиальных клеток • клеточная адгезия • закрытие нервной трубки • удлинение оси • морфогенез улитки • положительная регуляция развития проекции нейронов • канонический путь передачи сигналов Wnt • развитие мезенхимы, связанное с легкими • миграция клеток • преобразование сигнала • положительная регуляция канонического сигнального пути Wnt Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5754	71461
Ансамбль	ENSG00000112655	ENSMUSG00000023972
UniProt	Q13308	Q8BKG3
RefSeq (мРНК)	NM_001270398 NM_002821 NM_152880 NM_152881 NM_152882 NM_152883	NM_175168
RefSeq (белок)	NP_001257327 NP_002812 NP_690619 NP_690620 NP_690621	NP_780377
Расположение (UCSC)	Chr 6: 43.08 - 43.16 Мб	Chr 17: 46.56 - 46.63 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Тирозин-протеинкиназа-подобная 7 также известный как киназа карциномы толстой кишки 4 (CCK4) это рецепторная тирозинкиназа что у людей кодируется PTK7 ген.^[5][6]

Функция

Рецепторные протеинтирозинкиназы передают внеклеточные сигналы через клеточную мембрану. Подгруппа этих киназ лишена детектируемой каталитической тирозинкиназной активности, но сохраняет роль в передаче сигнала. Белок, кодируемый этим геном, представляет собой внутриклеточный домен с гомологией тирозинкиназы и может функционировать как клеточная адгезия молекула. Считается, что этот ген экспрессируется в карциномах толстой кишки, но не в нормальной толстой кишке, и, следовательно, может быть маркером или участвовать в прогрессировании опухоли. Для этого гена обнаружены четыре варианта транскрипта, кодирующие четыре разные изоформы.^[6]

PTK7 служит контекстно-зависимым сигнальным переключателем для Wnt пути (особенно в плоская полярность ячейки связанные функции, такие как конвергентное расширение и миграция клеток нервного гребня ) и, похоже, имеет аналогичные функции для плексин и Flt-1 пути.^[7] Было установлено, что PTK7 высоко экспрессируется при раке толстой кишки Saha et al. с помощью серийного анализа экспрессии генов (LongSAGE ).^[8] Pfizer нацеливает PTK7 на рак, генерируя конъюгат антитело-лекарственное средство против рецептора PTK7.

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000112655 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023972 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Мосси К., Джаллал Б., Алвес Ф., Sures I, Пахарь Г.Д., Ульрих А. (ноябрь 1995 г.). «Киназа-4 карциномы толстой кишки определяет новый подкласс семейства рецепторных тирозинкиназ». Онкоген. 11 (10): 2179–84. PMID  7478540.
6. «Ген Entrez: PTK7 PTK7 протеинтирозинкиназа 7».
7. Перадзирый Х., Толвински Н.С., Борхерс А (август 2012 г.). «Многочисленные роли PTK7: универсальный регулятор межклеточной связи». Архивы биохимии и биофизики. 524 (1): 71–6. Дои:10.1016 / j.abb.2011.12.019. PMID  22230326.
8. Saha, S., et al. (2002). «Использование транскриптома для аннотирования генома». Nat Biotechnol 20 (5): 508-512.

дальнейшее чтение

• Ли С.Т., Странк К.М., Spritz RA (декабрь 1993 г.). «Обзор мРНК протеинтирозинкиназы, экспрессируемых в нормальных меланоцитах человека». Онкоген. 8 (12): 3403–10. PMID  8247543.
• Park SK, Lee HS, Lee ST (февраль 1996 г.). «Характеристика полноразмерной кДНК PTK7 человека, кодирующей рецепторный белок тирозинкиназоподобной молекулы, тесно связанной с куриным KLG». Журнал биохимии. 119 (2): 235–9. Дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a021228. PMID  8882711.
• Банга СС, Озер Х.Л., Парк СК, Ли ST (1997). «Отнесение PTK7, кодирующего рецепторную протеин-тирозинкиназоподобную молекулу, к человеческой хромосоме 6p21.1 -> p12.2 посредством флуоресцентной гибридизации in situ». Цитогенетика и клеточная генетика. 76 (1–2): 43–4. Дои:10.1159/000134511. PMID  9154124.
• Jung JW, Ji AR, Lee J, Kim UJ, Lee ST (декабрь 2002 г.). «Организация человеческого гена PTK7, кодирующего молекулу, подобную тирозинкиназе рецепторного протеина, и альтернативный сплайсинг его мРНК». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1579 (2–3): 153–63. Дои:10.1016 / s0167-4781 (02) 00536-5. PMID  12427550.
• Чжан Х., Ли XJ, Мартин Д.Б., Эберсолд Р. (июнь 2003 г.). «Идентификация и количественное определение N-связанных гликопротеинов с использованием химии гидразидов, метки стабильных изотопов и масс-спектрометрии». Природа Биотехнологии. 21 (6): 660–6. Дои:10.1038 / nbt827. PMID  12754519. S2CID  581283.
• Кобус Ф.Дж., Флеминг К.Г. (февраль 2005 г.). «GxxxG-содержащий трансмембранный домен онкогена CCK4 не кодирует предпочтительных самовзаимодействий». Биохимия. 44 (5): 1464–70. Дои:10.1021 / bi048076l. PMID  15683231.
• Като М., Като М. (сентябрь 2007 г.). «Сравнительная интегромика на неканонических сигнальных молекулах WNT или планарной клеточной полярности: транскрипционный механизм PTK7 при колоректальном раке и механизм SEMA6A в недифференцированных ES-клетках». Международный журнал молекулярной медицины. 20 (3): 405–9. Дои:10.3892 / ijmm.20.3.405. PMID  17671748.