Nebulette - Nebulette

NEBL
Доступные конструкции
PDBHuman UniProt search: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыNEBL, небулет, LASP2, LNEBL
Внешние идентификаторыOMIM: 605491 ГомолоГен: 31379 Генные карты: NEBL
Расположение гена (человек)
Хромосома 10 (человек)
Chr.Хромосома 10 (человек)[1]
Хромосома 10 (человек)
Геномное расположение NEBL
Геномное расположение NEBL
Группа10п12.31Начинать20,779,973 бп[1]
Конец21,174,187 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

10529

н / д

Ансамбль

ENSG00000078114

н / д

UniProt

O76041
Q5JUU7

н / д

RefSeq (мРНК)

NM_001173484
NM_006393
NM_016365
NM_213569

н / д

RefSeq (белок)

н / д

Расположение (UCSC)Chr 10: 20.78 - 21.17 Мбн / д
PubMed поиск[2]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Nebulette это сердечный -специфический изоформа принадлежащий к небулин семья белки. Он закодирован NEBL ген. Эта семья состоит из 5 членов: nebulette, небулин, N-RAP, LASP-1 и LASP-2. Nebulette локализуется на Z-диски из сердечная мышца и, кажется, регулирует длину актин тонкие нити.

Структура

Nebulette представляет собой белок 116,4 кДа, состоящий из 1014 аминокислот.[3][4] Как член семейства белков небулина, nebulette характеризуется 35 аминокислотными отрезками «небулиновых повторов», которые представляют собой актин-связывающие домены, содержащие консервативные SDxxYK мотив.[5] Как и небулин, небулет имеет кислую область с неизвестной структурой на ее N-конце и богатую серином область, прилегающую к SH3 домен на его C-конце.[6] Хотя небулет имеет общие структурные особенности с небулином, небулин преимущественно экспрессируется в скелетные мышцы и имеет огромные размеры (600-900 кДа), а небулет выражается в сердечная мышца в Z-диск регионов и значительно меньше (примерно 1/6 размера).[7] Nebulette взаимодействует с актин, тропомиозин, альфа-актинин.[8] Синь, и XIRP2.[9]

Функция

Небулетт был идентифицирован в 1995 году Монкманом и Ван с использованием первичных культур куриных эмбрионов. кардиомиоциты к иммунопреципитации с определенным анти-небулином моноклональные антитела.[10] Нормальное выражение небулетта необходимо для сборки и сократительная функция из миофибриллы.[11] В частности, nebulette, по-видимому, регулирует стабильность и длину тонких филаментов актина, а также частоту биений кардиомиоцитов; уменьшение полноразмерного белка небулетов в кардиомиоцитах привело к уменьшению длины тонких филаментов, снижению частоты биений и потере регуляторных белков тонких филаментов тропонин I и тропомиозин.[12][13]

Клиническое значение

Мутации в NEBL ген были связаны с дилатационная кардиомиопатия.[14] Исследования на трансгенных мышах подтвердили их причинную роль в эндокардиальном фиброэластозе и дилатационная кардиомиопатия.[15]

дальнейшее чтение

  • «Масс-спектрометрическая характеристика NEBL на COPaKB». Атлас кардиоорганических белков (COPaKB).[16]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000078114 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ "Небулет". Атлас кардиоорганических белков (COPaKB).
  4. ^ Zong, N.C .; Ли, Н; Ли, Н; Lam, M. P .; Jimenez, R.C .; Kim, C. S .; Deng, N; Kim, A. K .; Choi, J. H .; Селайя, я; Liem, D; Мейер, Д; Одеберг, Дж; Fang, C; Лу, Х. Дж .; Сюй, Т; Вайс, Дж; Дуань, Н; Улен, М; Йейтс-младший, 3-й; Apweiler, R; Ge, Дж; Hermjakob, H; Пинг, П. (2013). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины с помощью специализированной базы знаний». Циркуляционные исследования. 113 (9): 1043–53. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. ЧВК  4076475. PMID  23965338.
  5. ^ Лабейт С., Гибсон Т., Лейки А., Леонард К., Зевиани М., Найт П., Уордейл Дж., Триник Дж. (Май 1991 г.). «Доказательства того, что небулин - это белок-правитель в тонких мышечных волокнах». Письма FEBS. 282 (2): 313–6. Дои:10.1016 / 0014-5793 (91) 80503-у. PMID  2037050. S2CID  33047653.
  6. ^ Папас К.Т., Блисс К.Т., Зисенисс А., Грегорио С.К. (январь 2011 г.). «Семья Небулина: группа поддержки актина». Тенденции в клеточной биологии. 21 (1): 29–37. Дои:10.1016 / j.tcb.2010.09.005. ЧВК  3014390. PMID  20951588.
  7. ^ Монкман CL, Ван К. (1995). «Небулетт: небулиноподобный белок 107 кДа в сердечной мышце». Подвижность клеток и цитоскелет. 32 (3): 205–25. Дои:10.1002 / см. 970320305. PMID  8581976.
  8. ^ Монкман CL, Ван К. (1999). «Функциональное рассечение небулетов демонстрирует связывание с актином небулиноподобных повторов и нацеливание Z-линии на SH3 и линкерные домены». Подвижность клеток и цитоскелет. 44 (1): 1–22. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-0169 (199909) 44: 1 <1 :: AID-CM1> 3.0.CO; 2-8. PMID  10470015.
  9. ^ Eulitz, S; Sauer, F; Пелисье, М. С .; Boisguerin, P; Линька, S; Шульд, Дж; Орфанос, Z; Kley, R.A .; Volkmer, R; Wilmanns, M; Кирфель, G; Ван дер Вен, П. Ф .; Фюрст, Д. О. (2013). «Идентификация белков Xin-повторов в качестве новых лигандов SH3-доменов небулина и небулета и анализ их взаимодействия во время образования и ремоделирования миофибрилл». Молекулярная биология клетки. 24 (20): 3215–26. Дои:10.1091 / mbc.E13-04-0202. ЧВК  3810769. PMID  23985323.
  10. ^ Монкман CL, Ван К. (1995). «Небулет: небулиноподобный белок 107 кДа в сердечной мышце». Подвижность клеток и цитоскелет. 32 (3): 205–25. Дои:10.1002 / см. 970320305. PMID  8581976.
  11. ^ Moncman CL, Wang K (февраль 2002 г.). «Целенаправленное нарушение экспрессии белка небулетов изменяет сборку и функцию сердечных миофибрилл». Экспериментальные исследования клеток. 273 (2): 204–18. Дои:10.1006 / excr.2001.5423. PMID  11822876.
  12. ^ Бонзо Дж. Р., Норрис А. А., Эшам М., Монкман С. Л. (ноябрь 2008 г.). «Домен с повторяющимся небулетом необходим для правильного поддержания тропомиозина в сердечном саркомере». Экспериментальные исследования клеток. 314 (19): 3519–30. Дои:10.1016 / j.yexcr.2008.09.001. PMID  18823973.
  13. ^ Moncman CL, Wang K (февраль 2002 г.). «Направленное нарушение экспрессии белка небулетов изменяет сборку и функцию сердечных миофибрилл». Экспериментальные исследования клеток. 273 (2): 204–18. Дои:10.1006 / excr.2001.5423. PMID  11822876.
  14. ^ Аримура Т., Накамура Т., Хирои С., Сато М., Такахаши М., Охбути Н., Уэда К., Нучи Т., Ямагути Н., Акаи Дж., Мацумори А., Сасаяма С., Кимура А. (ноябрь 2000 г.). «Характеристика гена nebulette человека: полиморфизм актин-связывающего мотива связан с нефемейной идиопатической дилатационной кардиомиопатией». Генетика человека. 107 (5): 440–51. Дои:10.1007 / s004390000389. PMID  11140941. S2CID  4564490.
  15. ^ Пуревьяв Э., Варела Дж., Моргадо М., Кирни Д.Л., Ли Х., Тейлор, доктор медицины, Аримура Т., Монкман К.Л., Маккенна В., Мерфи Р.Т., Лабейт С., Ватта М., Боулз Н.Э., Кимура А., Бориек А.М., Таубин Д.А. (октябрь 2010 г. ). «Мутации Nebulette связаны с дилатационной кардиомиопатией и эндокардиальным фиброэластозом». Журнал Американского колледжа кардиологии. 56 (18): 1493–502. Дои:10.1016 / j.jacc.2010.05.045. ЧВК  2957670. PMID  20951326.
  16. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Дуан Х., Улен М., Йетс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины с помощью специализированной базы знаний». Циркуляционные исследования. 113 (9): 1043–1053. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. ЧВК  4076475. PMID  23965338.

внешняя ссылка