FKBP5 - FKBP5

FKBP5
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1KT0, 3O5D, 3O5E, 3O5F, 3O5G, 3O5I, 3O5J, 3O5K, 3O5L, 3O5M, 3O5O, 3O5P, 3O5Q, 3O5R, 4DRH, 4DRI, 4DRK, 4DRM, 4DRN, 4DRO, 4DRP, 4DRQ, 4JFI, 4JFJ, 4JFK, 4JFL, 4JFM, 4R0X, 4TW6, 4TW7, 4TX0, 4W9O, 4W9P, 4W9Q, 5DIT, 5DIU, 5BXJ, 5DIV
Идентификаторы
Псевдонимы	FKBP5, AIG6, FKBP51, FKBP54, P54, PPIase, Ptg-10, связывающий белок FK506 5, пролилизомераза FKBP 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 602623 MGI: 104670 ГомолоГен: 3038 Генные карты: FKBP5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6п21.31 Начните 35,573,585 бп[1] Конец 35,728,583 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 A3.3 | 17 14,66 см Начните 28,399,094 бп[2] Конец 28,517,527 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • изомеразная активность • GO: 0001948 связывание с белками • связывание с белками теплового шока • активность пептидил-пролил цис-транс-изомеразы • Обвязка FK506 Сотовый компонент • внеклеточная экзосома • мембрана • ядро клетки • нуклеоплазма • цитоплазма • цитозоль Биологический процесс • изомеризация пептидил-пролила белков • шаперон-опосредованный сворачивание белка • сворачивание белка • реакция на бактерии Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	2289	14229
Ансамбль	ENSG00000096060	ENSMUSG00000024222
UniProt	Q13451	Q64378
RefSeq (мРНК)	NM_004117 NM_001145775 NM_001145776 NM_001145777	NM_010220
RefSeq (белок)	NP_001139247 NP_001139248 NP_001139249 NP_004108	NP_034350
Расположение (UCSC)	Chr 6: 35,57 - 35,73 Мб	Chr 17: 28,4 - 28,52 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Связывающий белок 5 FK506, также известен как FKBP5, это белок который у человека кодируется FKBP5 ген.^[5]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейство белков иммунофилинов, которые играют роль в иммунорегуляции и основных клеточных процессах, включая сворачивание и транспортировку белков. Этот кодируемый белок представляет собой цис-транс-пролилизомеразу, которая связывается с иммунодепрессантами FK506 и рапамицином. Считается, что он опосредует ингибирование кальциневрина. Он также функционально взаимодействует с гетерокомплексами зрелых кортикоидных рецепторов (т.е. прогестерон, глюкокортикоид, минералокортикоид-рецептор комплексов) вместе с 90 кДа белок теплового шока и белок Р23.

Клиническое значение

Было обнаружено, что ген FKBP5 имеет несколько полиаденилирование места^[5] и статистически связан с более высокой частотой депрессивных расстройств.^[6]

Взаимодействия

FKBP5 был показан взаимодействовать с участием Белок теплового шока 90 кДа альфа (цитозольный), член A1.^[7]

Смотрите также

• FKBP52 - функциональный антагонист FKBP51 на кортикоидных рецепторах

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000096060 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024222 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: FKBP5 FK506 связывающий белок 5».
6. Биндер Э. Б., Салякина Д., Лихтнер П., Вочник Г. М., Изинг М., Пютц Б., Папиол С., Симан С., Лука С., Кохли М. А., Никель Т, Кюнцель Х. Э., Фукс Б., Майер М., Пфенниг А., Керн Н., Бруннер Дж. , Modell S, Baghai T, Deiml T, Zill P, Bondy B, Rupprecht R, Messer T, Köhnlein O, Dabitz H, Brückl T, Müller N, Pfister H, Lieb R, Mueller JC, Lõhmussaar E, Strom TM, Bettecken Т., Мейтингер Т., Ур М., Рейн Т., Хольсбоер Ф., Мюллер-Мисок Б. (декабрь 2004 г.). «Полиморфизм в FKBP5 связан с увеличением рецидивов депрессивных эпизодов и быстрым ответом на лечение антидепрессантами». Nat. Genet. 36 (12): 1319–25. Дои:10,1038 / ng1479. PMID  15565110. S2CID  21914515.
7. Наир С.К., Римерман Р.А., Торан Э.Дж., Чен С., Прапапанич В., Баттс Р.Н., Смит Д.Ф. (февраль 1997 г.). «Молекулярное клонирование человеческого FKBP51 и сравнение иммунофилиновых взаимодействий с Hsp90 и рецептором прогестерона». Мол. Cell. Биол. 17 (2): 594–603. Дои:10.1128 / MCB.17.2.594. ЧВК  231784. PMID  9001212.

дальнейшее чтение

• Скиене-Фишер Ц., Ю. Ц. (2001). «Вспомогательные ферменты-помощники складывания рецепторов: функциональная роль пептидилпролил цис / транс-изомераз». FEBS Lett. 495 (1–2): 1–6. Дои:10.1016 / S0014-5793 (01) 02326-2. PMID  11322937. S2CID  42263861.
• Baughman G, Wiederrecht GJ, Кэмпбелл Н.Ф., Мартин М.М., Буржуа S (1995). «FKBP51, новый Т-клеточно-специфический иммунофилин, способный ингибировать кальциневрин». Мол. Cell. Биол. 15 (8): 4395–402. Дои:10.1128 / mcb.15.8.4395. ЧВК  230679. PMID  7542743.
• Смит Д.Ф., Баггенстосс Б.А., Марион Т.Н., Римерман Р.А. (1993). «Два белка, родственных FKBP, связаны с комплексами рецепторов прогестерона». J. Biol. Chem. 268 (24): 18365–71. PMID  7688746.
• Смит Д.Ф., Альберс М.В., Шрайбер С.Л., Лич К.Л., Дейбель М.Р. (1993). «FKBP54, новый связывающий FK506 белок в комплексах рецепторов прогестерона птиц и экстрактах HeLa». J. Biol. Chem. 268 (32): 24270–3. PMID  7693698.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Джонсон Дж, Корбизье Р., Стенсгард Б., Тофт Д. (1996). «Участие p23, hsp90 и иммунофилинов в сборке комплексов рецепторов прогестерона». J. Steroid Biochem. Мол. Биол. 56 (1–6 Номер спецификации): 31–7. Дои:10.1016/0960-0760(95)00221-9. PMID  8603045. S2CID  24410864.
• Наир С.К., Римерман Р.А., Торан Э.Дж., Чен С., Прапапанич В., Баттс Р.Н., Смит Д.Ф. (1997). «Молекулярное клонирование человеческого FKBP51 и сравнение иммунофилиновых взаимодействий с Hsp90 и рецептором прогестерона». Мол. Cell. Биол. 17 (2): 594–603. Дои:10.1128 / MCB.17.2.594. ЧВК  231784. PMID  9001212.
• Baughman G, Wiederrecht GJ, Чанг Ф., Мартин М.М., Буржуа S (1997). «Тканевое распределение и количество человеческого FKBP51 и FK506-связывающего белка, который может опосредовать ингибирование кальциневрина». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 232 (2): 437–43. Дои:10.1006 / bbrc.1997.6307. PMID  9125197.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Янг JC, Оберманн WM, Хартл Ф.У. (1998). «Специфическое связывание белков тетратрикопептидных повторов с C-концевым доменом 12 кДа hsp90». J. Biol. Chem. 273 (29): 18007–10. Дои:10.1074 / jbc.273.29.18007. PMID  9660753.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2000). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Пиркл Ф, Бюхнер Дж (2001). «Функциональный анализ Hsp90-ассоциированных пептидилпролилцис / транс-изомераз человека FKBP51, FKBP52 и Cyp40». J. Mol. Биол. 308 (4): 795–806. Дои:10.1006 / jmbi.2001.4595. PMID  11350175.
• Дэвис TH, Нинг YM, Sánchez ER (2002). «Новый первый шаг в активации стероидных рецепторов: гормональное переключение иммунофилинов FKBP51 и FKBP52». J. Biol. Chem. 277 (7): 4597–600. Дои:10.1074 / jbc.C100531200. PMID  11751894.
• Giraudier S, Chagraoui H, Komura E, Barnache S, Blanchet B, LeCouedic JP, Smith DF, Larbret F, Taksin AL, Moreau-Gachelin F, Casadevall N, Tulliez M, Hulin A, Debili N, Vainchenker W (2002). «Сверхэкспрессия FKBP51 при идиопатическом миелофиброзе регулирует независимость от фактора роста предшественников мегакариоцитов». Кровь. 100 (8): 2932–40. Дои:10.1182 / кровь-2002-02-0485. PMID  12351405.
• Sinars CR, Cheung-Flynn J, Rimerman RA, Scammell JG, Smith DF, Clardy J (2003). «Структура большого FK506-связывающего белка FKBP51, Hsp90-связывающего белка и компонента комплексов стероидных рецепторов». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (3): 868–73. Bibcode:2003ПНАС..100..868С. Дои:10.1073 / pnas.0231020100. ЧВК  298693. PMID  12538866.
• Хаблер Т.Р., Денни В.Б., Валентайн Д.Л., Чунг-Флинн Дж., Смит Д.Ф., Скаммелл Дж. Г. (2003). «Связывающий FK506 иммунофилин FKBP51 транскрипционно регулируется прогестином и снижает чувствительность к прогестину». Эндокринология. 144 (6): 2380–7. Дои:10.1210 / en.2003-0092. PMID  12746298.
• Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Ghidelli S, Hopf C, Huhse B, Mangano R, Michon AM, Schirle M, Schlegl J, Schwab M , Штейн М.А., Бауэр А., Касари Дж., Дрюс Дж., Гэвин А.С., Джексон Д. Б., Джоберти Дж., Нойбауэр Дж., Рик Дж., Кустер Б., Суперти-Фурга Г. (2004). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Nat. Cell Biol. 6 (2): 97–105. Дои:10.1038 / ncb1086. PMID  14743216. S2CID  11683986.