FKBP1A - FKBP1A

FKBP1A
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1A7X, 1B6C, 1BKF, 1BL4, 1D6O, 1D7H, 1D7I, 1D7J, 1ЭЙМ, 1F40, 1FAP, 1ФКБ, 1FKD, 1FKF, 1ФКГ, 1ФХ, 1FKI, 1FKJ, 1FKR, 1ФКС, 1ФКТ, 1J4H, 1J4I, 1J4R, 1NSG, 1QPF, 1QPL, 2DG3, 2DG4, 2DG9, 2FAP, 2FKE, 2ПН, 2PPO, 2ППП, 2RSE, 3FAP, 3H9R, 3MDY, 4DH0, 4FAP, 4IPX, 4N19, 4ODP, 4ODQ, 4ODR
Идентификаторы
Псевдонимы	FKBP1A, FKBP-12, FKBP-1A, FKBP1, FKBP12, PKC12, PKCI2, PPIASE, FK506-связывающий белок 1A, FKBP пролилизомераза 1A
Внешние идентификаторы	OMIM: 186945 MGI: 95541 ГомолоГен: 105139 Генные карты: FKBP1A
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20p13 Начинать 1,368,978 бп[1] Конец 1,393,172 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 G3 Начинать 151,542,483 бп[2] Конец 151,561,692 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность ингибитора кальциевых каналов • связывание активина • изомеразная активность • связывание макролидов • активность пептидил-пролил цис-транс-изомеразы • активность преобразователя сигнала • GO: 0001948 связывание с белками • Привязка SMAD • преобразование связывания бета-рецептора фактора роста • Обвязка FK506 • связывание лекарств • связывание ферментов • Связывание с белком Hsp70 • связывание бета-рецептора трансформирующего фактора роста I типа • активность гомодимеризации белков • связывание ионного канала Сотовый компонент • цитоплазма • терминальная цистерна • Z диск • внеклеточная экзосома • внешний компонент мембраны органелл • цитоплазматическая сторона мембраны • рианодиновый рецепторный комплекс • цитозоль • мембрана • саркоплазматический ретикулум • мембрана саркоплазматического ретикулума • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • конец аксона Биологический процесс • Сборка белкового комплекса SMAD • образование амилоидных фибрилл • регуляция сигнального пути рецептора активина • созревание белка путем сворачивания белка • регуляция катаболического процесса белка-предшественника амилоида • изомеризация пептидил-пролила белков • отрицательная регуляция активности рианодин-чувствительных каналов высвобождения кальция • регулирование локализации белка • трансмембранный транспорт ионов кальция • рефолдинг белка • регуляция иммунного ответа • положительная регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB • отрицательная регуляция высвобождения секвестрированного иона кальция в цитозоль • положительное регулирование связывания белков • положительная регуляция убиквитинирования белков • сворачивание белка de novo • трансформирующий сигнальный путь бета-рецептора фактора роста • Активация Т-клеток • шаперон-опосредованный сворачивание белка • супрамолекулярная организация волокон • отрицательная регуляция активности фосфопротеинфосфатазы • сворачивание белка • отрицательная регуляция фосфорилирования белков • морфогенез сердца • сокращение мышц • ответ на ион железа • цитокин-опосредованный сигнальный путь • ответ на кофеин • Пролиферация Т-клеток • высвобождение секвестрированного иона кальция в цитозоль • морфогенез ткани желудочков сердечной мышцы • регуляция активности рианодин-чувствительных каналов высвобождения кальция • образование трабекулы сердца Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	2280	14225
Ансамбль	ENSG00000088832	ENSMUSG00000032966
UniProt	P62942	P26883
RefSeq (мРНК)	NM_054014 NM_000801 NM_001199786	NM_001302077 NM_001302078 NM_001302079 NM_001302080 NM_008019 NM_001355077 NM_001355078
RefSeq (белок)	NP_000792 NP_001186715 NP_463460	NP_001289006 NP_001289007 NP_001289008 NP_001289009 NP_032045 NP_001342006 NP_001342007
Расположение (UCSC)	Chr 20: 1.37 - 1.39 Мб	Chr 2: 151,54 - 151,56 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Пептидил-пролил цис-транс-изомераза FKBP1A является фермент что у людей кодируется FKBP1A ген.^[5]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом иммунофилин семейство белков, которые играют роль в иммунорегуляции и основных клеточных процессах, включая сворачивание и транспортировку белков. Этот кодируемый белок представляет собой цис-транс-пролилизомеразу, которая связывает иммунодепрессанты. FK506 (такролимус) и рапамицин (сиролимус). Он взаимодействует с несколькими белками передачи внутриклеточного сигнала, включая рецептор TGF-бета I типа. Он также взаимодействует с множеством внутриклеточных каналов высвобождения кальция, включая тетрамерный рианодиновый рецептор скелетных мышц. У мышей делеция этого гомологичного гена вызывает врожденное заболевание сердца, известное как несуплотнение миокарда левого желудочка. Имеются данные о множестве альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов для этого гена, но полноразмерная природа некоторых вариантов не установлена.^[6]

Взаимодействия

FKBP1A был показан взаимодействовать с:

• GLMN,^[7][8]
• ITPR1^[9][10]
• KIAA1303,^[11][12]
• Млекопитающие-мишени рапамицина,^{[11][12][13][14][15][16]}
• RYR1,^[17][18][19] и
• Бета-рецептор TGF 1.^[20][21]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000088832 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032966 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. DiLella AG (сентябрь 1991 г.). «Хромосомная принадлежность гена иммунофилина человека FKBP-12». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 179 (3): 1427–33. Дои:10.1016 / 0006-291X (91) 91732-R. PMID  1930186.
6. «Ген Entrez: FKBP1A FK506 связывающий белок 1A, 12 кДа».
7. Chambraud B, Radanyi C, Camonis JH, Shazand K, Rajkowski K, Baulieu EE (декабрь 1996 г.). «FAP48, новый белок, который образует специфические комплексы как с иммунофилинами FKBP59, так и с FKBP12. Профилактика с помощью иммунодепрессантов FK506 и рапамицина». Журнал биологической химии. 271 (51): 32923–9. Дои:10.1074 / jbc.271.51.32923. PMID  8955134.
8. Neye H (март 2001 г.). «Мутация FKBP-ассоциированного белка 48 (FAP48) в пролине 219 нарушает взаимодействие с FKBP12 и FKBP52». Регуляторные пептиды. 97 (2–3): 147–52. Дои:10.1016 / s0167-0115 (00) 00206-8. PMID  11164950. S2CID  20617551.
9. Макмиллан Д., Карри С., Брэдли К.Н., Мьюир Т.С., Маккаррон Дж. Г. (декабрь 2005 г.). «В гладких мышцах FK506-связывающий белок модулирует вызванное рецептором IP3 высвобождение Ca2 + с помощью mTOR и кальциневрина». Журнал клеточной науки. 118 (Pt 23): 5443–51. Дои:10.1242 / jcs.02657. PMID  16278292.
10. Cameron AM, Nucifora FC, Fung ET, Livingston DJ, Aldape RA, Ross CA, Snyder SH (октябрь 1997 г.). «FKBP12 связывает инозитол-1,4,5-трифосфатный рецептор с лейцин-пролином (1400-1401) и прикрепляет кальциневрин к этому FK506-подобному домену». Журнал биологической химии. 272 (44): 27582–8. Дои:10.1074 / jbc.272.44.27582. PMID  9346894.
11. Хасинто Э., Лёвит Р., Шмидт А., Лин С., Рюегг М.А., Зал А, Зал Миннесота (ноябрь 2004 г.). «Комплекс TOR 2 млекопитающих контролирует актиновый цитоскелет и нечувствителен к рапамицину». Природа клеточной биологии. 6 (11): 1122–8. Дои:10.1038 / ncb1183. PMID  15467718. S2CID  13831153.
12. Сарбасов Д.Д., Али С.М., Ким Д.Х., Гертин Д.А., Латек Р.Р., Эрдджумент-Бромаж Х., Темпст П., Сабатини Д.М. (июль 2004 г.). «Rictor, новый связывающий партнер mTOR, определяет нечувствительный к рапамицину и независимый от хищников путь, регулирующий цитоскелет». Текущая биология. 14 (14): 1296–302. Дои:10.1016 / j.cub.2004.06.054. PMID  15268862. S2CID  4658268.
13. Чой Дж., Чен Дж., Шрайбер С.Л., Кларди Дж. (Июль 1996 г.). «Структура комплекса FKBP12-рапамицин, взаимодействующего со связывающим доменом FRAP человека». Наука. 273 (5272): 239–42. Дои:10.1126 / science.273.5272.239. PMID  8662507. S2CID  27706675.
14. Люкер К.Э., Смит М.К., Люкер Г.Д., Гаммон С.Т., Пивница-Вормс Х., Пивница-Вормс Д. (август 2004 г.). «Кинетика регулируемых белок-белковых взаимодействий, выявленная с помощью комплементационной визуализации люциферазы светлячков в клетках и живых животных». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (33): 12288–93. Дои:10.1073 / pnas.0404041101. ЧВК  514471. PMID  15284440.
15. Банашинский Л.А., Лю CW, Wandless TJ (апрель 2005 г.). «Характеристика тройного комплекса FKBP.rapamycin.FRB». Журнал Американского химического общества. 127 (13): 4715–21. Дои:10.1021 / ja043277y. PMID  15796538.
16. Sabers CJ, Martin MM, Brunn GJ, Williams JM, Dumont FJ, Wiederrecht G, Abraham RT (январь 1995 г.). «Выделение белка-мишени комплекса FKBP12-рапамицин в клетках млекопитающих». Журнал биологической химии. 270 (2): 815–22. Дои:10.1074 / jbc.270.2.815. PMID  7822316.
17. Авила Г., Ли Э. Х., Перес К. Ф., Аллен П. Д., Дирксен Р. Т. (июнь 2003 г.). «Связывание FKBP12 с RyR1 модулирует сцепление возбуждения и сокращения в скелетных мышечных трубках мышей». Журнал биологической химии. 278 (25): 22600–8. Дои:10.1074 / jbc.M205866200. PMID  12704193.
18. Bultynck G, De Smet P, Rossi D, Callewaert G, Missiaen L, Sorrentino V, De Smedt H, Parys JB (март 2001 г.). «Характеристика и картирование сайта связывания 12 кДа FK506-связывающего белка (FKBP12) на различных изоформах рецептора рианодина и рецептора инозитол-1,4,5-трифосфата». Биохимический журнал. 354 (Pt 2): 413–22. Дои:10.1042 / bj3540413. ЧВК  1221670. PMID  11171121.
19. Габурякова М., Габурякова Дж., Рейкен С., Хуанг Ф., Маркс С.О., Роземблит Н., Маркс А.Р. (май 2001 г.). «Связывание FKBP12 модулирует стробирование канала рианодинового рецептора». Журнал биологической химии. 276 (20): 16931–5. Дои:10.1074 / jbc.M100856200. PMID  11279144.
20. Ван Т., Донахью П.К., Зервос А.С. (июль 1994 г.). «Специфическое взаимодействие рецепторов типа I семейства TGF-бета с иммунофилином FKBP-12». Наука. 265 (5172): 674–6. Дои:10.1126 / science.7518616. PMID  7518616.
21. Лю Ф., Вентура Ф., Дуди Дж., Массагуэ Дж. (Июль 1995 г.). «Рецептор человеческого типа II для костных морфогенных белков (BMP): расширение модели двухкиназного рецептора на BMP». Молекулярная и клеточная биология. 15 (7): 3479–86. Дои:10.1128 / mcb.15.7.3479. ЧВК  230584. PMID  7791754.

дальнейшее чтение

• Schiene-Fischer C, Yu C. (апрель 2001 г.). «Вспомогательные ферменты-помощники складывания рецепторов: функциональная роль пептидилпролил цис / транс-изомераз». Письма FEBS. 495 (1–2): 1–6. Дои:10.1016 / S0014-5793 (01) 02326-2. PMID  11322937. S2CID  42263861.
• Дилелла А.Г., Хокинс А., Крейг Р.Дж., Шрайбер С.Л., Гриффин, Калифорния (декабрь 1992 г.). «Присвоение хромосомных полос генов, кодирующих человеческие FKBP12 и FKBP13». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 189 (2): 819–23. Дои:10.1016 / 0006-291X (92) 92276-4. PMID  1281998.
• Jayaraman T, Brillantes AM, Timerman AP, Fleischer S, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Marks AR (май 1992 г.). «Связывающий белок FK506, связанный с каналом высвобождения кальция (рецептор рианодина)». Журнал биологической химии. 267 (14): 9474–7. PMID  1374404.
• Лепре Калифорния, Томсон Дж. А., Мур Дж. М. (май 1992 г.). «Структура решения FK506, связанного с FKBP-12». Письма FEBS. 302 (1): 89–96. Дои:10.1016 / 0014-5793 (92) 80292-О. PMID  1375171. S2CID  41469360.
• Маки Н., Секигучи Ф., Нисимаки Дж., Мива К., Хаяно Т., Такахаши Н., Судзуки М. (июль 1990 г.). «Комплементарная ДНК, кодирующая человеческий Т-клеточный FK506-связывающий белок, пептидилпролил цис-транс-изомеразу, отличную от циклофилина». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 87 (14): 5440–3. Дои:10.1073 / pnas.87.14.5440. ЧВК  54340. PMID  1695378.
• Standaert RF, Galat A, Verdine GL, Schreiber SL (август 1990 г.). «Молекулярное клонирование и сверхэкспрессия человеческого FK506-связывающего белка FKBP». Природа. 346 (6285): 671–4. Дои:10.1038 / 346671a0. PMID  1696686. S2CID  4368221.
• Сикерка Дж., Видеррехт Дж., Грейлих Х, Боултон Д., Хунг С.Х., Крайан Дж., Ходжес П.Дж., Сигал Н.Х. (декабрь 1990 г.). «Цитозольный связывающий белок для иммунодепрессанта FK-506 представляет собой как повсеместную, так и высококонсервативную пептидил-пролил цис-транс-изомеразу». Журнал биологической химии. 265 (34): 21011–5. PMID  1701173.
• Michnick SW, Rosen MK, Wandless TJ, Karplus M, Schreiber SL (май 1991 г.). «Структура раствора FKBP, фермента ротамазы и рецептора для FK506 и рапамицина». Наука. 252 (5007): 836–9. Дои:10.1126 / science.1709301. PMID  1709301. S2CID  28289138.
• Van Duyne GD, Standaert RF, Karplus PA, Schreiber SL, Clardy J (май 1991 г.). «Атомная структура FKBP-FK506, иммунофилин-иммунодепрессантный комплекс». Наука. 252 (5007): 839–42. Дои:10.1126 / science.1709302. PMID  1709302. S2CID  32539611.
• Розен М.К., Михник С.В., Карплюс М., Шрайбер С.Л. (май 1991 г.). «Последовательное назначение протонов и азота и определение вторичной структуры человеческого FK506 и связывающего рапамицин белка». Биохимия. 30 (19): 4774–89. CiteSeerX  10.1.1.559.2890. Дои:10.1021 / bi00233a020. PMID  1709363.
• Джин Ю.Дж., Альберс М.В., Лейн В.С., Бирер Б.Э., Шрайбер С.Л., Буракофф С.Дж. (август 1991 г.). «Молекулярное клонирование ассоциированного с мембраной человеческого FK506 и рапамицин-связывающего белка, FKBP-13». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 88 (15): 6677–81. Дои:10.1073 / pnas.88.15.6677. ЧВК  52151. PMID  1713687.
• DiLella AG, Craig RJ (сентябрь 1991 г.). «Экзонная организация человеческого гена FKBP-12: корреляция со структурными и функциональными доменами белка». Биохимия. 30 (35): 8512–7. Дои:10.1021 / bi00099a002. PMID  1716149.
• Harding MW, Galat A, Uehling DE, Schreiber SL (октябрь 1989 г.). «Рецептором иммунодепрессанта FK506 является цис-транс-пептидил-пролилизомераза». Природа. 341 (6244): 758–60. Дои:10.1038 / 341758a0. PMID  2477715. S2CID  4349152.
• Ван Т., Донахью П.К., Зервос А.С. (июль 1994 г.). «Специфическое взаимодействие рецепторов типа I семейства TGF-бета с иммунофилином FKBP-12». Наука. 265 (5172): 674–6. Дои:10.1126 / science.7518616. PMID  7518616.
• Peattie DA, Hsiao K, Benasutti M, Lippke JA (декабрь 1994 г.). «Три различных матричных РНК могут кодировать человеческий иммунодепрессант-связывающий белок FKBP12». Ген. 150 (2): 251–7. Дои:10.1016/0378-1119(94)90434-0. PMID  7529739.
• Ян В.М., Иноуэ CJ, Сето Э. (июнь 1995 г.). «Циклофилин A и FKBP12 взаимодействуют с YY1 и изменяют его транскрипционную активность». Журнал биологической химии. 270 (25): 15187–93. Дои:10.1074 / jbc.270.25.15187. PMID  7541038.
• Кавамура А. Су М.С. (июнь 1995 г.). «Взаимодействие FKBP12-FK506 с кальциневрином A в домене связывания субъединицы B». Журнал биологической химии. 270 (26): 15463–6. Дои:10.1074 / jbc.270.26.15463. PMID  7541044.
• Гриффит Дж. П., Ким Дж. Л., Ким Е. Е., Синтчак, М. Д., Томсон, Дж. А., Фицгиббон, М. Дж., Флеминг, М. А., Карон, ПР, Сяо К., Navia MA (август 1995 г.). «Рентгеновская структура кальциневрина ингибируется комплексом иммунофилин-иммунодепрессант FKBP12-FK506». Клетка. 82 (3): 507–22. Дои:10.1016/0092-8674(95)90439-5. PMID  7543369. S2CID  15502270.
• Van Duyne GD, Standaert RF, Karplus PA, Schreiber SL, Clardy J (январь 1993 г.). «Атомные структуры комплексов человеческого иммунофилина FKBP-12 с FK506 и рапамицином». Журнал молекулярной биологии. 229 (1): 105–24. Дои:10.1006 / jmbi.1993.1012. PMID  7678431.