Трансмембранный домен транспортеров ABC - Transmembrane domain of ABC transporters
| Трансмембранная область транспортера ABC | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | ABC_membrane | ||||||||
| Pfam | PF00664 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR011527 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00364 | ||||||||
| SCOP2 | 1pf4 / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| TCDB | 3.A.1 | ||||||||
| OPM суперсемейство | 17 | ||||||||
| Белок OPM | 2hyd | ||||||||
| |||||||||
Трансмембранный домен транспортера ABC является главной трансмембранной структурное подразделение из АТФ-связывающий кассетный транспортер белки, состоящие из шести альфа-спирали которые проходят через плазматическую мембрану. Многие представители семейства транспортеров ABC (Pfam PF00005 ) есть два таких региона.[1][2][3][4][5][6]
Это семейство соответствует ABC1 по классификации TCDB.
Подсемейства
- Сульфатный переносчик ABC белка пермеазы 2 ИнтерПро: IPR005667
- Система транспорта фосфата пермеаза белок 2 ИнтерПро: IPR005672
- Переносчик захвата фосфонатов ИнтерПро: IPR005769
- Нитрат-транспортная пермеаза ИнтерПро: IPR005889
- NifC-подобный носильщик типа ABC ИнтерПро: IPR006469
- Переносчик фосфата ABC, белок пермеазы PstC ИнтерПро: IPR011864
- Молибдатный переносчик ABC, белок пермеазы ИнтерПро: IPR011867
- Никелевый транспортер ABC, субъединица пермеазы NikB ИнтерПро: IPR014156
- Никелевый транспортер ABC, субъединица пермеазы NikC ИнтерПро: IPR014157
- Транспортер ABC эктоина / гидроксиэктоина, белок пермеазы EhuD ИнтерПро: IPR014341
- Транспортер ABC эктоина / гидроксиэктоина, белок пермеазы EhuC ИнтерПро: IPR014342
Белки человека, содержащие этот домен
ABCB1; ABCB10; ABCB11; ABCB4; ABCB5; ABCB6; ABCB7; ABCB8;ABCB9; ABCC1; ABCC10; ABCC11; ABCC12; ABCC13; ABCC2; ABCC3;ABCC4; ABCC5; ABCC6; ABCC8; ABCC9; CFTR; TAP1; TAP2; ТАПЛ;
Рекомендации
- ^ Керр ID (2002). «Структура и ассоциация АТФ-связывающих кассетных переносчиков нуклеотид-связывающих доменов». Биохим. Биофиз. Acta. 1561 (1): 47–64. Дои:10.1016 / s0304-4157 (01) 00008-9. PMID 11988180.
- ^ Хант Дж. Ф., Юань Ю. Р., Марцинкевич О., Миллен Л., Томас П. Дж., Карпович Н., Дай П. Л., МакВей К. (2001). «Кристаллические структуры АТФ-связывающей кассеты MJ1267 демонстрируют эффект индуцированной подгонки в активном центре АТФазы ABC-транспортера». Структура. 9 (7): 571–86. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00617-7. PMID 11470432.
- ^ Хант Дж. Ф., Юань Ю. Р., Блекер С., Марцинкевич О., Миллен Л., Томас П. Дж. (2001). «Кристаллическая структура кассеты, связывающей MJ0796ATP. Значение для структурных последствий гидролиза АТФ в активном центре ABC-транспортера». J. Biol. Chem. 276 (34): 32313–21. Дои:10.1074 / jbc.M100758200. PMID 11402022.
- ^ Ким С.Х., Хунг Л.В., Ван IX, Никайдо К., Лю П.К., Эймс Г.Ф. (1998). «Кристаллическая структура АТФ-связывающей субъединицы ABC транспортера». Природа. 396 (6712): 703–707. Bibcode:1998Натура.396..703H. Дои:10.1038/25393. PMID 9872322. S2CID 204996524.
- ^ Велте В., Порода Дж., Боос В., Дидерикс К., Фонрейн С., Мюллер С., Диц Дж., Греллер Г., Шнелл С. (2000). «Кристаллическая структура MalK, субъединицы АТФазы ABC-транспортера трегалозы / мальтозы архей Thermococcus litoralis». EMBO J. 19 (22): 5951–61. Дои:10.1093 / emboj / 19.22.5951. ЧВК 305842. PMID 11080142.
- ^ Wiley DC, Gaudet R (2001). «Структура домена ABC АТФазы человеческого TAP1, транспортера, связанного с процессингом антигена». EMBO J. 20 (17): 4964–72. Дои:10.1093 / emboj / 20.17.4964. ЧВК 125601. PMID 11532960.
 | Этот мембранный белок –Связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |