TAP1 - TAP1

TAP1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1JJ7
Идентификаторы
Псевдонимы	TAP1, ABC17, ABCB2, APT1, D6S114E, PSF-1, PSF1, RING4, TAP1 * 0102N, TAP1N, транспортер 1, АТФ-связывающая кассета, подсемейство B (MDR / TAP), транспортер 1, член подсемейства B АТФ-связывающей кассеты
Внешние идентификаторы	OMIM: 170260 MGI: 98483 ГомолоГен: 495 Генные карты: TAP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6п21.32 Начинать 32,845,209 бп[1] Конец 32,853,978 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 B1 | 17 17,98 см Начинать 34,187,553 бп[2] Конец 34,197,225 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание с белками MHC • связывание нуклеотидов • активность гомодимеризации белков • Активность трансмембранного переносчика пептидов, связанных с АТФазой • Привязка TAP2 • Связывание с белками MHC класса Ib • АТФазная активность • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание с белками MHC класса I • Привязка TAP1 • Связывание АТФ • связывание пептида с антигеном • Связывание ADP • Активность АТФазы, связанная с трансмембранным перемещением веществ • пептидная антиген-транспортная активность АТФазы • активность трансмембранного переносчика пептидов Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана • Комплекс ТАП • неотъемлемый компонент мембраны эндоплазматического ретикулума • митохондрия • эндоплазматический ретикулум • центр организации микротрубочек • мембрана фагоцитарных везикул • эндоплазматический ретикулум-мембрана промежуточного отсека Гольджи • Комплекс загрузки пептидов MHC класса I Биологический процесс • ответ защиты • адаптивный иммунный ответ • иммунная система • процессинг антигена и презентация пептидного антигена через MHC класса I • процессинг антигена и презентация эндогенного пептидного антигена через MHC класса I • транспорт белка • пептидный транспорт • GO: 0022415 вирусный процесс • цитозоль к транспорту ER • процессинг антигена и презентация экзогенного пептидного антигена через MHC класса I, TAP-зависимый • слияние везикул с мембраной эндоплазматического ретикулума и промежуточного компартмента Гольджи (ERGIC) • трансмембранный транспорт • транспорт Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6890	21354
Ансамбль	ENSG00000226173 ENSG00000168394 ENSG00000224212 ENSG00000230705 ENSG00000206297 ENSG00000227816 ENSG00000224748 ENSG00000232367	ENSMUSG00000037321
UniProt	Q03518	P21958
RefSeq (мРНК)	NM_001292022 NM_000593	NM_001161730 NM_013683
RefSeq (белок)	NP_000584 NP_001278951	NP_001155202 NP_038711
Расположение (UCSC)	Chr 6: 32,85 - 32,85 Мб	Chr 17: 34.19 - 34,2 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Транспортер, связанный с процессингом антигена 1 это белок что у людей кодируется TAP1 ген.^[5][6]

Функция

Ассоциированный с мембраной белок, кодируемый этим геном, является членом суперсемейства переносчиков АТФ-связывающей кассеты (ABC). Белки ABC транспортируют различные молекулы через внеклеточные и внутриклеточные мембраны. Гены ABC делятся на семь отдельных подсемейств (ABC1, MDR / TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, White). Этот белок является членом подсемейства MDR / TAP. Члены подсемейства MDR / TAP вовлечены в множественную лекарственную устойчивость. Белок, кодируемый этим геном, участвует в перекачивании деградированных цитозольных пептидов через эндоплазматический ретикулум в мембраносвязанный компартмент, где собираются молекулы класса I. Мутации в этом гене могут быть связаны с анкилозирующим спондилитом, инсулинозависимым сахарным диабетом и глютеновой болезнью.^[7]

Смотрите также

• АТФ-связывающий кассетный транспортер

Взаимодействия

TAP1 был показан взаимодействовать с:

• HLA-A,^[8] и
• Тапасин.^[8][9]

Рекомендации

1. ENSG00000168394, ENSG00000224212, ENSG00000230705, ENSG00000206297, ENSG00000227816, ENSG00000224748, ENSG00000232367 GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000226173, ENSG00000168394, ENSG00000224212, ENSG00000230705, ENSG00000206297, ENSG00000227816, ENSG00000224748, ENSG00000232367 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037321 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Бодмер Дж. Г., Марш С. Г., Альберт Э. Д., Бодмер В. Ф., Дюпон Б., Эрлих Г. А., Мах Б., Майр В. Р., Пархэм П., Сасазуки Т. (октябрь 1992 г.). «Номенклатура факторов системы HLA, 1991. Номенклатурный комитет ВОЗ для факторов системы HLA». Тканевые антигены. 39 (4): 161–173. Дои:10.1111 / j.1399-0039.1992.tb01932.x. PMID  1529427.
6. Бахрам С., Арнольд Д., Бреснахан М., Строминджер Дж. Л., Шпионы Т. (декабрь 1991 г.). «Две предполагаемые субъединицы пептидного насоса, кодируемые в области класса II главного комплекса гистосовместимости человека». Proc Natl Acad Sci U S A. 88 (22): 10094–10098. Bibcode:1991ПНАС ... 8810094Б. Дои:10.1073 / пнас.88.22.10094. ЧВК  52874. PMID  1946428.
7. «Ген Entrez: транспортер 1 TAP1, АТФ-связывающая кассета, подсемейство B (MDR / TAP)».
8. Полссон К.М., Клеймер М.Дж., Гриффит Дж., Джевон М., Чен С., Андерсон П.О., Сьогрен Х.О., Ли С., Ван П. (май 2002 г.). «Ассоциация тапазина и COPI обеспечивает механизм ретроградного транспорта молекул класса I главного комплекса гистосовместимости (MHC) из комплекса Гольджи в эндоплазматический ретикулум». J. Biol. Chem. 277 (21): 18266–18271. Дои:10.1074 / jbc.M201388200. PMID  11884415.
9. Рагураман Г., Лапинский П.Е., Рагхаван М. (ноябрь 2002 г.). «Тапазин взаимодействует с мембранными доменами обеих субъединиц TAP и увеличивает структурную стабильность комплексов TAP1 x TAP2». J. Biol. Chem. 277 (44): 41786–41794. Дои:10.1074 / jbc.M207128200. PMID  12213826.

дальнейшее чтение

• Таунсенд А., Троусдейл Дж. (1993). «Транспортеры, связанные с презентацией антигена». Семин. Cell Biol. 4 (1): 53–61. Дои:10.1006 / scel.1993.1007. PMID  8453065.
• Шёльц К., Тампе Р. (2006). «Внутриклеточный транспортный механизм антигена TAP в механизмах адаптивного иммунитета и ускользания от вирусов». J. Bioenerg. Биомер. 37 (6): 509–515. Дои:10.1007 / s10863-005-9500-1. PMID  16691491. S2CID  28129678.
• Бек С., Келли А., Рэдли Э, Хуршид Ф., Олдертон Р.П., Троусдейл Дж. (1992). «Анализ последовательности ДНК 66 т.п.н. области человеческого МНС класса II, кодирующей кластер генов процессинга антигена». J. Mol. Биол. 228 (2): 433–441. Дои:10.1016/0022-2836(92)90832-5. PMID  1453454.
• Colonna M, Bresnahan M, Bahram S, Strominger JL, Spies T (1992). «Аллельные варианты предполагаемого переносчика пептидов человека, участвующие в процессинге антигена». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 89 (9): 3932–3936. Bibcode:1992PNAS ... 89.3932C. Дои:10.1073 / пнас.89.9.3932. ЧВК  525605. PMID  1570316.
• Троусдейл Дж., Хэнсон И., Мокридж И., Бек С., Таунсенд А., Келли А. (1991). «Последовательности, закодированные в области класса II MHC, относящейся к суперсемейству переносчиков« ABC »». Природа. 348 (6303): 741–744. Дои:10.1038 / 348741a0. PMID  2259383. S2CID  4279033.
• Шпионы Т., Бреснахан М., Бахрам С., Арнольд Д., Бланк Г., Меллинс Э., Благочестивый Д., Демарс Р. (1991). «Ген в области класса II главного комплекса гистосовместимости человека, контролирующий путь презентации антигена класса I». Природа. 348 (6303): 744–747. Дои:10.1038 / 348744a0. PMID  2259384. S2CID  31875999.
• Церундоло V, Александр Дж., Андерсон К., Лэмб С., Крессвелл П., МакМайкл А., Готч Ф, Таунсенд А. (1990). «Представление вирусного антигена, контролируемого геном в главном комплексе гистосовместимости». Природа. 345 (6274): 449–452. Bibcode:1990 Натур.345..449C. Дои:10.1038 / 345449a0. PMID  2342577. S2CID  20178053.
• Szafer F, Oksenberg JR, Steinman L (1994). «Новые аллельные полиморфизмы в генах ТАП». Иммуногенетика. 39 (5): 374. Дои:10.1007 / BF00189240. PMID  8168860. S2CID  23485390.
• Джексон Д. Г., Капра Д. Д. (1994). «Аллели TAP1 при инсулинозависимом сахарном диабете: недавно определенная центромерная граница восприимчивости к болезни». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 90 (23): 11079–11083. Дои:10.1073 / пнас.90.23.11079. ЧВК  47925. PMID  8248212.
• Глинн Р., Керр Л.А., Мокридж И., Бек С., Келли А., Троусдейл Дж. (1993). «Главный протеасомный компонент, кодируемый комплексом гистосовместимости, LMP7: альтернативные первые экзоны и посттрансляционный процессинг». Евро. J. Immunol. 23 (4): 860–866. Дои:10.1002 / eji.1830230414. PMID  8458375.
• Бек С., Абдулла С., Олдертон Р.П., Глинн Р.Дж., Гут И.Г., Хоскинг Л.К., Джексон А., Келли А., Ньюэлл В. Р., Сансо П., Рэдли Е., Торп К. Л., Троусдейл Дж. (1996). «Эволюционная динамика некодирующих последовательностей в области класса II человеческого MHC». J. Mol. Биол. 255 (1): 1–13. Дои:10.1006 / jmbi.1996.0001. PMID  8568858.
• Чен Х.Л., Габрилович Д., Тампе Р., Гиргис К.Р., Надаф С., Карбоне Д.П. (1996). «Функционально дефектный аллель TAP1 приводит к потере презентации антигена MHC класса I при раке легких человека». Nat. Genet. 13 (2): 210–213. Дои:10.1038 / ng0696-210. PMID  8640228. S2CID  20367760.
• Ан К., Мейер Т.Х., Убель С., Семпе П., Джабаллах Х., Ян Й., Петерсон П.А., Фрю К., Тампе Р. (1996). «Молекулярный механизм и видовая специфичность ингибирования ТАР вирусом простого герпеса ICP47». EMBO J. 15 (13): 3247–3255. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00689.x. ЧВК  451885. PMID  8670825.
• Льюис Дж. У., Нейзиг А., Нифджес Дж., Эллиот Т. (1997). «Точечные мутации в альфа-2-домене HLA-A2.1 определяют функционально релевантное взаимодействие с TAP». Curr. Биол. 6 (7): 873–883. Дои:10.1016 / S0960-9822 (02) 00611-5. PMID  8805302.
• Nijenhuis M, Hämmerling GJ (1997). «Множественные области транспортера, связанные с процессингом антигена (TAP), вносят вклад в его сайт связывания пептида». J. Immunol. 157 (12): 5467–5477. PMID  8955196.
• Гобин С.Дж., Уилсон Л., Кейзерс В., Ван ден Элсен П.Дж. (1997). «Процессинг и презентация антигена клеточными линиями, происходящими из трофобласта человека». J. Immunol. 158 (8): 3587–3592. PMID  9103419.
• Ан К., Грюлер А., Галоча Б., Джонс Т.Р., Вирц Э.Дж., Плоег Х.Л., Петерсон П.А., Янг Й., Фрю К. (1997). «ER-просветный домен гликопротеина US6 HCMV ингибирует транслокацию пептидов с помощью TAP». Иммунитет. 6 (5): 613–621. Дои:10.1016 / S1074-7613 (00) 80349-0. PMID  9175839.

внешняя ссылка

• TAP1 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.