Субгеномная мРНК - Subgenomic mRNA

Субгеномный мРНК 's - существенно меньшие части оригинального транскрибированного шаблон прядь.

От 3 'до 5' ДНК или РНК

В течение транскрипция, исходная цепочка шаблона обычно считывается из 3' к 5' конец от начала до конца. Субгеномные мРНК создаются, когда транскрипция начинается с 3 'конца цепи матрицы (или 5' вновь синтезируемой матрицы) и начинает копироваться к 5 'концу цепи матрицы, прежде чем "прыгнуть" до конца. шаблона и копирование последних нуклеотидов 5 'конца шаблона (завершение 3' хвоста для вновь созданной цепи).

В результате, переведенная нить будет иметь 5'-конец в разной степени с исходным шаблоном (в зависимости от того, через какую часть шаблона перепрыгнула транскрипция) и аналогичный 3'-конец шаблона.^[1]

5 'на 3' (положительный смысл) вирусной РНК

Положительно-смысловая (от 5 'до 3') вирусная РНК, которая может быть непосредственно транслирована в желаемые вирусные белки, подвергается процессу, аналогичному описанному в пунктах 3-5 '. Части вирусной РНК могут быть пропущены во время трансляции.

Результат

В результате много разных белки могут быть созданы из одной и той же цепи мРНК со сходными 5'-концами (в разной степени) и одинаковыми 3'-концами. Или различные белки могут быть созданы с помощью вирусной РНК с положительным смыслом.

Участок 5 'на вновь созданной нити совпадает с участком эталонной нити, и этот участок эталонной нити называется «вложенным набором».^[2]

3 '5' GCCGCCCCGTATCGATCGTAGCGCACGTTATATACGTTATTTCTGCGCGGAAAAAAAAA - Исходная цепочка шаблона 5 '3' GCCGCCCCGTATCGATCGTAGCGCACGTTATATATAC --------------- AAAAAAA --------------- AAAAAA | GCCGCCCCGTATCGATCGTAGCGCAC -------------------------- AAAAAAAAA | = Субгеномная мРНК. GCCGCCCCGTAT ---------------------------------------- AAAAAAAAA | GCCGCCCCGTAT = Nested Set - указывает прыжки.

Примеры

Этот сложный метод транскрипции обычно ограничивается вирусы, особенно одноцепочечные, с положительным смыслом РНК или вирусы класса IV, использующие Балтиморская система классификации, например вирусы порядка Нидовиралес.

Он в основном используется для уплотнения более генетический информацию в меньший объем генетического материала.^[3]

Литература

^ Ву Б., Уайт К.А. (декабрь 2007 г.). «Отключение репликации РНК вируса от транскрипции через полимеразу: функциональные и эволюционные идеи». Журнал EMBO. 26 (24): 5120–30. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601931. ЧВК 2140117. PMID 18034156.
^ Ле, ТМ; Вонг, HH; Тай, ФП; Клык, S; Keng, CT; Tan, YJ; Лю, Д.X. (август 2007 г.). «Экспрессия, посттрансляционная модификация и биохимическая характеристика белков, кодируемых субгеномной мРНК8 коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома». FEBS J. 274 (16): 4211–22. Дои:10.1111 / j.1742-4658.2007.05947.x. PMID 17645546.
^ Сюй В., Белый К.А. (февраль 2008 г.). «Субгеномная транскрипция мРНК в aureusvirus: подавление транскрипции и эволюция регуляторных элементов РНК». Вирусология. 371 (2): 430–8. Дои:10.1016 / j.virol.2007.09.035. PMID 17988704.

[pmid18034156-1] Ву Б., Уайт К.А. (декабрь 2007 г.). «Отключение репликации РНК вируса от транскрипции через полимеразу: функциональные и эволюционные идеи». Журнал EMBO. 26 (24): 5120–30. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601931. ЧВК 2140117. PMID 18034156.

[2] Ле, ТМ; Вонг, HH; Тай, ФП; Клык, S; Keng, CT; Tan, YJ; Лю, Д.X. (август 2007 г.). «Экспрессия, посттрансляционная модификация и биохимическая характеристика белков, кодируемых субгеномной мРНК8 коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома». FEBS J. 274 (16): 4211–22. Дои:10.1111 / j.1742-4658.2007.05947.x. PMID 17645546.

[pmid17988704-3] Сюй В., Белый К.А. (февраль 2008 г.). «Субгеномная транскрипция мРНК в aureusvirus: подавление транскрипции и эволюция регуляторных элементов РНК». Вирусология. 371 (2): 430–8. Дои:10.1016 / j.virol.2007.09.035. PMID 17988704.

[1]

[2]

[3]