Малая РНК, специфичная для тельца Кахаля - Small Cajal body-specific RNA

РНК, специфичная для малых тельцов Кахаля 1
RF00553.png
Прогнозируемая вторичная структура РНК, специфичной для тельца Кахаля 1
Идентификаторы
СимволSCARNA1
РфамRF00553
Прочие данные
РНК типген, мяРНК, snoRNA, скаРНК;
Домен (ы)Позвоночные
PDB структурыPDBe

Малые РНК, специфичные для тельца Кахаля (scaRNAs) являются классом малые ядрышковые РНК (мяРНК), которые специфически локализуются в Тело Кахала, а ядерный органелла (клеточная суборганелла), участвующая в биогенезе малые ядерные рибонуклеопротеины (snRNPs или snurps). ScaRNA направляют модификацию (метилирование и псевдоуридилирование ) из РНК-полимераза II записано сплайсосомный РНК U1, U2, U4, U5 и U12.

Первой идентифицированной скаРНК была U85.[1] Он отличается от типичных snoRNAs тем, что представляет собой составные snoRNAs C / D box и H / ACA box и может направлять как псевдоуридилирование, так и 2'-O-метилирование. Не все scaRNA представляют собой составные snoRNA C / D и H / ACA-бокса, и большинство scaRNA структурно и функционально неотличимы от snoRNA, что определяет рибосомная РНК (рРНК) модификации в ядрышко.

Дрозофила scaRNAs

Несколько исследований идентифицировали scaRNAs в Дрозофила.[1][2][3][4][5] Одно из исследований показало, что несколько Дрозофила scaRNAs могут одинаково хорошо функционировать в нуклеоплазме мутантных мух, у которых отсутствуют тельца Кахаля.[4] Дальнейшие исследования показали, что scaRNA pugU6-40 нацелена на U6 snRNA, модификация которой происходит в ядрышке, а не в CB, и что pugU1-6 и pug U2-55 направляют 2 РНК: snRNA и 28s рРНК.[5]

Малые тельца Кахаля РНК 1

В молекулярная биология, Малые тельца Кахаля РНК 1 (также известная как SCARNA1 или ACA35) представляет собой небольшую ядрышковую РНК, обнаруженную в тельцах Кахаля и, как полагают, участвуют в псевдоуридилировании сплайсосомальной РНК U2 по остатку U89.

scaRNA1 представляет собой некодирующая РНК, которые являются функциональными продуктами гены нет переведено в белки. Такие молекулы РНК обычно содержат важные вторичная структура или лиганд-обязательные мотивы и участвуют во многих важных биологических процессах в клетке.[6]

scaRNA1 принадлежит к Коробка H / ACA класс snoRNAs, поскольку он имеет предсказанную структуру шпилька-шарнир-шпилька-хвост, консервативные мотивы H / ACA-бокса и, как обнаружено, связан с GAR1 белок.[7]

Рекомендации

  1. ^ а б Jády BE, Kiss T (февраль 2001 г.). «Малая ядрышковая направляющая РНК действует как в метилировании 2'-O-рибозы, так и в псевдоуридилировании сплайсосомной РНК U5». Журнал EMBO. 20 (3): 541–551. Дои:10.1093 / emboj / 20.3.541. ЧВК  133463. PMID  11157760.
  2. ^ Tortoriello G, Accardo MC, Scialò F, Angrisani A, Turano M, Furia M (май 2009 г.). «Новая антисмысловая scaRNA дрозофилы с предсказанной направляющей функцией». Ген. 436 (1–2): 56–65. Дои:10.1016 / j.gene.2009.02.005. PMID  19230845.
  3. ^ Tycowski KT, Shu MD, Kukoyi A, Steitz JA (апрель 2009 г.). «Консервативный белок WD40 связывает сигнал локализации тельца Кахаля частиц scaRNP». Молекулярная клетка. 34 (1): 47–57. Дои:10.1016 / j.molcel.2009.02.020. ЧВК  2700737. PMID  19285445.
  4. ^ а б Дерюшева С., Галл Ю.Г. (декабрь 2009 г.). «Малые специфические для тельца Кахаля РНК дрозофилы функционируют в отсутствие тельцов Кахаля». Молекулярная биология клетки. 20 (24): 5250–5259. Дои:10.1091 / mbc.E09-09-0777. ЧВК  2793299. PMID  19846657.
  5. ^ а б Дерюшева С., Галл Ю.Г. (декабрь 2013 г.). «Новые малые РНК, специфичные для тельца Кахаля, идентифицированные у Drosophila: зондирование функции РНК-направляющей». РНК. 19 (12): 1802–1814. Дои:10.1261 / rna.042028.113. ЧВК  3884663. PMID  24149844.
  6. ^ Darzacq X, Jády BE, Verheggen C, Kiss AM, Bertrand E, Kiss T (июнь 2002 г.). «Малые ядерные РНК, специфичные для тельца Кахаля: новый класс управляющих РНК 2'-O-метилирования и псевдоуридилирования». Журнал EMBO. 21 (11): 2746–2756. Дои:10.1093 / emboj / 21.11.2746. ЧВК  126017. PMID  12032087.
  7. ^ Kiss AM, Jády BE, Bertrand E, Kiss T (июль 2004 г.). «Human box H / ACA pseudouridylation guide RNA machinery». Молекулярная и клеточная биология. 24 (13): 5797–5807. Дои:10.1128 / MCB.24.13.5797-5807.2004. ЧВК  480876. PMID  15199136.

внешняя ссылка