NLRC4 - NLRC4

NLRC4
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыNLRC4, CARD12, CLAN, CLAN1, CLANA, CLANB, CLANC, CLAND, CLR2.1, IPAF, AIFEC, FCAS4, семейство NLR, домен CARD, содержащий 4, домен CARD семейства NLR, содержащий 4
Внешние идентификаторыOMIM: 606831 MGI: 3036243 ГомолоГен: 10924 Генные карты: NLRC4
Расположение гена (человек)
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человек)[1]
Хромосома 2 (человек)
Геномное расположение NLRC4
Геномное расположение NLRC4
Группа2п22.3Начните32,224,453 бп[1]
Конец32,265,732 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001199138
NM_001199139
NM_001302504
NM_021209

NM_001033367

RefSeq (белок)

NP_001186067
NP_001186068
NP_001289433
NP_067032

NP_001028539

Расположение (UCSC)Chr 2: 32,22 - 32,27 МбChr 17: 74,43 - 74,46 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Белок 4, содержащий CARD домен семейства NLR это белок что у людей кодируется NLRC4 ген.[5][6]

Структура

Белок NLRC4 высоко консервативен у всех видов млекопитающих. Он гомологичен C. elegans Белок Ced4. Он содержит n-терминал КАРТА домен, центральный нуклеотид связывания /НАХТ домен, и c-концевой повтор, богатый лейцином (LRR ) домен. Он принадлежит к семейству белков NLR, которое включает коактиватор транскрипции. CIITA и канонический белок инфламмасом NLRP3. Усеченный мышиный NLRC4 был первым членом этого семейства, кристаллическая структура которого была решена.[7]

Функция

NLRC4 лучше всего ассоциируется с запуском формирования воспаление. В отличие от NLRP3, некоторые зависимые от инфламмасомы функции NLRC4 могут осуществляться независимо от каркаса инфламмасом. ASC. Гомологи Ced4 человека включают: APAF1, NOD1 (CARD4) и NOD2 (CARD15). Эти белки имеют не менее 1 N-концевой CARD-домен, за которым следует центрально расположенный нуклеотид-связывающий домен (NBD или NACHT) и C-терминал регуляторный домен, обнаруженный только у млекопитающих, который содержит либо WD40 повторяет или богатые лейцином повторы (LRR). CARD12 является членом семейства Ced4 и может вызывать апоптоз.[6]

Взаимодействия

NLRC4 был показан взаимодействовать с NAIP (есть один человеческий NAIP, но мыши экспрессируют по крайней мере 4 различных белка NAIP). Взаимодействие NAIP / NLRC4 может определять специфичность лиганда.[8] NLRC4-зависимая активность инфламмасом активирует CASP1.[9] При определенных обстоятельствах NLRC4 и NLRP3 могут занимать один и тот же комплекс инфламмасом.[10]

Клиническое значение

Люди, несущие активирующие мутации в NLRC4, могут развить аутовоспалительный синдром, характеризующийся острой лихорадкой, гепатитом, очень высоким уровнем ферритина в сыворотке и другими признаками, указывающими на Синдром активации макрофагов (MAS). У некоторых пациентов также развился потенциально опасный для жизни энтероколит, который прошел в раннем детстве.[11][12] У этих пациентов хроническое и необычайное повышение сывороточной Ил-18 обнаружено, в отличие от пациентов с мутациями NLRP3, у которых развиваются Криопирин-ассоциированные периодические синдромы.[11] В большой японской семье была гораздо более легкая болезнь, связанная с холодовой крапивницей, которая была вызвана доминантно наследуемой мутацией NLRC4.[13]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000091106 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039193 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Geddes BJ, Wang L, Huang WJ, Lavellee M, Manji GA, Brown M, Jurman M, Cao J, Morgenstern J, Merriam S, Glucksmann MA, DiStefano PS, Bertin J (июнь 2001 г.). «Human CARD12 является новым членом семейства CED4 / Apaf-1, который вызывает апоптоз». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 284 (1): 77–82. Дои:10.1006 / bbrc.2001.4928. PMID  11374873.
  6. ^ а б «Ген Entrez: семейство NLRC4 NLR, домен CARD, содержащий 4».
  7. ^ Ху З, Янь Ц., Лю П, Хуанг З, Ма Р, Чжан Ц., Ван Р, Чжан И, Мартинон Ф, Мяо Д., Дэн Х, Ван Дж, Чанг Дж, Чай Дж (июль 2013 г.). «Кристаллическая структура NLRC4 раскрывает его механизм автоингибирования». Наука. 341 (6142): 172–5. Дои:10.1126 / science.1236381. PMID  23765277. S2CID  12360722.
  8. ^ Кофоед Э.М., Вэнс Р. Э. (сентябрь 2011 г.). «Врожденное иммунное распознавание бактериальных лигандов NAIP определяет специфичность инфламмасом». Природа. 477 (7366): 592–5. Дои:10.1038 / природа10394. ЧВК  3184209. PMID  21874021.
  9. ^ Дамиано Дж. С., Оливейра В., Валлийский К., Рид Дж. С. (июль 2004 г.). «Гетеротипические взаимодействия между доменами NACHT: значение для регуляции врожденных иммунных ответов». Биохимический журнал. 381 (Пт 1): 213–9. Дои:10.1042 / BJ20031506. ЧВК  1133779. PMID  15107016.
  10. ^ Ман С.М., Хопкинс Л.Дж., Ньюджент Э., Кокс С., Глюк И.М., Турломусис П., Райт Дж. А., Цикута П., Мони Т.П., Брайант К.Э. (май 2014 г.). «Активация инфламмасом вызывает двойное привлечение NLRC4 и NLRP3 в один и тот же макромолекулярный комплекс» (PDF). Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 111 (20): 7403–8. Дои:10.1073 / pnas.1402911111. ЧВК  4034195. PMID  24803432.
  11. ^ а б Канна С.В., де Хесус А.А., Гуни С., Брукс С.Р., Марреро Б., Лю Й., ДиМаттия М.А., Заал К.Дж., Санчес Г.А., Ким Х., Шапель Д., Пласс Н., Хуанг И., Вилларино А.В., Бьянкотто А., Флейшер Т.А., Дункан Дж. А., О'Ши Дж. Дж., Бенселер С., Гром А., Дэн З., Лаксер Р. М., Гольдбах-Мански Р. (октябрь 2014 г.). «Активирующая мутация инфламмасомы NLRC4 вызывает аутовоспаление с синдромом рецидивирующей активации макрофагов». Природа Генетика. 46 (10): 1140–6. Дои:10.1038 / ng.3089. ЧВК  4177369. PMID  25217959.
  12. ^ Romberg N, Al Moussawi K, Nelson-Williams C, Stiegler AL, Loring E, Choi M, Overton J, Meffre E, Khokha MK, Huttner AJ, West B, Podoltsev NA, Boggon TJ, Kazmierczak BI, Lifton RP (октябрь 2014 г.) ). «Мутация NLRC4 вызывает синдром энтероколита и аутовоспаления». Природа Генетика. 46 (10): 1135–9. Дои:10,1038 / нг.3066. ЧВК  4177367. PMID  25217960.
  13. ^ Китамура А., Сасаки Ю., Абэ Т., Кано Х., Ясутомо К. (ноябрь 2014 г.). «Унаследованная мутация в NLRC4 вызывает ауто-воспаление у человека и мышей». Журнал экспериментальной медицины. 211 (12): 2385–96. Дои:10.1084 / jem.20141091. ЧВК  4235634. PMID  25385754.

дальнейшее чтение