NLRP2 - NLRP2

NLRP2
Идентификаторы
Псевдонимы	NLRP2, CLR19.9, NALP2, NBS1, PAN1, PYPAF2, семейство NLR, домен пирина, содержащий 2, домен пирина семейства NLR, содержащий 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 609364 MGI: 3041206 ГомолоГен: 56789 Генные карты: NLRP2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.42 Начните 54,953,130 бп[1] Конец 55,001,142 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 A1 Начните 5,298,547 бп[2] Конец 5,351,035 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание с доменом пирина • связывание нуклеотидов • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание АТФ Сотовый компонент • цитоплазма • аппарат Гольджи • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • ядерная хромосома, теломерная область • цитозоль Биологический процесс • положительная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе • воспалительная реакция • врожденная иммунная система • иммунная система • апоптотический процесс • отрицательная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	55655	232827
Ансамбль	ENSG00000278789 ENSG00000275796 ENSG00000277060 ENSG00000275843 ENSG00000275399 ENSG00000022556 ENSG00000275082 ENSG00000278682 ENSG00000274638 ENSG00000273992	ENSMUSG00000035177
UniProt	Q9NX02	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_017852 NM_001174081 NM_001174082 NM_001174083 NM_001348003	NM_177690
RefSeq (белок)	NP_001167552 NP_001167553 NP_001167554 NP_060322 NP_001334932	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 19: 54.95 - 55 Мб	Chr 7: 5,3 - 5,35 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок 2, содержащий домены NACHT, LRR и PYD это белок что у людей кодируется NLRP2 ген.^[5][6][7]

Белки NALP, такие как NALP2, характеризуются N-концевым Pyrin домен (PYD) и участвуют в активации каспазы-1 (CASP1; MIM 147678) Toll-подобными рецепторами (см. TLR4). Они также могут быть вовлечены в белковые комплексы, которые активируют провоспалительные каспазы (Tschopp et al., 2003) [предоставлено OMIM]^[7][8]

Функция

Ген NLRP2 является одним из членов семейства нуклеотид-связывающих и лейцин -Рецептор богатых повторов (NLR). Информация из многих литературных источников указывает на то, что N-концевой эффекторный домен пирина (PYD) является одним из компонентов гена NLRP2. Другие компоненты включают центрально расположенный нуклеотид -связывающий и олигомеризационный домен (NACHT) и С-концевые лейцин-богатые повторы (LRR).^[9] Известно, что продукты гена NLRP2 взаимодействуют с компонентами комплекса киназы IkB (IKK). Он также может регулировать активность как каспазы-1, так и ядерного фактора, энхансера легкой каппа-цепи активированных В-клеток (NF-kB). Пириновый домен необходим и достаточен для подавления активности NF-kB (Минкевич, де Риверо Ваккари и Кин 1113). Известно, что аллельный вариант (rs147585490) блокирует транскрипционную активность NF-kB. Ген NLRP2 является одним из семейства NLR; считается, что он способствует регуляции иммунных ответов (Минкевич, де Риверо Ваккари и Кин 1121). Хотя это не совсем понятно, ген NLRP2 отвечает за поддержание фертильности у женщин и способствует нормальным родам. Ген NPRP2 кодирует белок человека, известный как «белок 2, содержащий домены NACHT, LRR и PYD».^[10] NALP2, который является одним из белков NALP, имеет N-концевую характеристику пирина, также кодируемую как MIM 608107 и домен PYD.^[11] Белок NALP2 играет роль в процессе активации каспазы-1, которая кодируется как CASP1; MIM 147678. Процесс активации происходит через Toll-подобные рецепторы. NALP2 также может принимать участие в белковых комплексах, которые инициируют активацию провоспалительных каспаз.^[12] Семейство NLR регулирует функционирование иммунная система, что технически ставит под угрозу нормальные функции организма, включая репродуктивную функцию.

Открытие

Семейство генов NLR, к которому принадлежит ген NLRP2, было впервые выделено из рыбок данио, которые являются обычным образцом для изучения иммунной системы. Считается, что ген NLRP2 произошел от семейства генов NLR через мутация.^[13] Мутация была инициирована необходимостью приспособления организмов к динамической среде и диверсификации на этапах эволюции.^[14] Кроме того, мутация белков семейства генов NLR была также связана со способностью патогенов разрушать защитный механизм хозяина.^[15] Поэтому организмы были вынуждены изобретать новые способы обнаружения и противодействия воздействию резистентных патогены.^[16] Эволюция белков NLR определяет происхождение гена NLRP2. Ген NLRP2 теперь является датчиком врожденного иммунитета для патогенов и сигнала стерильного стресса (SSS) в многоклеточных организмах.

Мутация и бесплодие

Дефицит гена NLRP2 приводит к подавлению активации ооцитов.^[17] Ген NLRP2 экспрессируется исключительно в ооцитах. Следовательно, он регулирует качество ооцитов, что объясняет его связь с бесплодием у женщин.^[18]

Рекомендации

1. ENSG00000275796, ENSG00000277060, ENSG00000275843, ENSG00000275399, ENSG00000022556, ENSG00000275082, ENSG00000278682, ENSG00000274638, ENSG00000273992 GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000278789, ENSG00000275796, ENSG00000277060, ENSG00000275843, ENSG00000275399, ENSG00000022556, ENSG00000275082, ENSG00000278682, ENSG00000274638, ENSG00000273992 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000035177 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Tschopp J, Martinon F, Burns K (февраль 2003 г.). «NALP: новое семейство белков, участвующих в воспалении». Обзоры природы. Молекулярная клеточная биология. 4 (2): 95–104. Дои:10.1038 / nrm1019. PMID  12563287. S2CID  31417018.
6. Бертин Дж, ДиСтефано П.С. (декабрь 2000 г.). «Домен PYRIN: новый мотив, обнаруженный в белках апоптоза и воспаления». Гибель клеток и дифференциация. 7 (12): 1273–4. Дои:10.1038 / sj.cdd.4400774. PMID  11270363.
7. «Ген Entrez: семейство NLRP2 NLR, пириновый домен, содержащий 2».
8. "NLRP2 Пириновый домен семейства NLR, содержащий 2 [Homo sapiens (человек)]". NCBI.
9. Минкевич Дж., Де Риверо Ваккари Дж. П., Кин Р. В. (июль 2013 г.). «Человеческие астроциты экспрессируют новую инфламмасому NLRP2». Глия. 61 (7): 1113–21. Дои:10.1002 / glia.22499. PMID  23625868. S2CID  24606692.
10. Ачарья С., Саха С., Прадхан П. (декабрь 2018 г.). «Новые основанные на симметрии меры различия генов-генов с использованием онтологии генов: применение в кластеризации генов». Ген. 679: 341–351. Дои:10.1016 / j.gene.2018.08.062. PMID  30184472.
11. Пэн Х, Лю Х, Лю Ф, Гао Й, Чен Дж, Хо Дж, Хан Дж, Сяо Т., Чжан В. (сентябрь 2017 г.). «Дефицит NLRP2 и FAF1 блокирует ранний эмбриогенез у мышей». Размножение. 154 (3): 245–251. Дои:10.1530 / REP-16-0629. PMID  28630100.
12. Визлин-Ходзич Д., Жай К., Илес С., Сёдерстен К., Труве К., Пэррис Т.З. и др. (Январь 2017 г.). «Раннее начало воспаления в онтогенезе биполярного расстройства: ген инфламмасомы NLRP2 четко различает пациентов и здоровых людей в контрольной группе при переходе между стадиями iPS-клеток и нервных стволовых клеток». Трансляционная психиатрия. 7 (1): e1010. Дои:10.1038 / tp.2016.284. ЧВК  5545741. PMID  28117838.
13. Ачарья С., Саха С., Прадхан П. (декабрь 2018 г.). «Новые методы измерения несходства генов на основе симметрии с использованием генной онтологии: применение в кластеризации генов». Ген. 679: 341–351. Дои:10.1016 / j.gene.2018.08.062. PMID  30184472.
14. Ян И, Ланг Х, Сун С., Гао Ц, Ху Дж, Дин С., Ли Дж, Ли И, Ван Ф, Гонг Т. (ноябрь 2018 г.). «NLRP2 отрицательно регулирует противовирусный иммунитет, взаимодействуя с TBK1». Европейский журнал иммунологии. 48 (11): 1817–1825. Дои:10.1002 / eji.201847589. PMID  30183071.
15. Минкевич Дж., Де Риверо Ваккари Дж. П., Кин Р. В. (июль 2013 г.). «Человеческие астроциты экспрессируют новую инфламмасому NLRP2». Глия. 61 (7): 1113–21. Дои:10.1002 / glia.22499. PMID  23625868. S2CID  24606692.
16. Махадеван С., Сатхаппан В., Утама Б., Лоренцо И., Каскар К., Ван ден Вейвер И.Б. (апрель 2017 г.). «Ошибка: материнский экспрессируемый NLRP2 связывает подкорковый материнский комплекс (SCMC) с фертильностью, эмбриогенезом и эпигенетическим репрограммированием». Научные отчеты. 7: 46434. Дои:10.1038 / srep46434. ЧВК  5395947. PMID  28422141.
17. Минкевич Дж., Де Риверо Ваккари Дж. П., Кин Р. В. (июль 2013 г.). «Человеческие астроциты экспрессируют новую инфламмасому NLRP2». Глия. 61 (7): 1113–21. Дои:10.1002 / glia.22499. PMID  23625868. S2CID  24606692.
18. Ачарья С., Саха С., Прадхан П. (декабрь 2018 г.). «Новые основанные на симметрии меры различия генов-генов с использованием онтологии генов: применение в кластеризации генов». Ген. 679: 341–351. Дои:10.1016 / j.gene.2018.08.062. PMID  30184472.

дальнейшее чтение

• Teng SC, Wu KJ, Tseng SF, Wong CW, Kao L (сентябрь 2006 г.). «Импортин KPNA2, NBS1, репарация ДНК и онкогенез». Журнал молекулярной гистологии. 37 (5–7): 293–9. Дои:10.1007 / s10735-006-9032-y. PMID  16752129. S2CID  7281949.
• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Мартинон Ф., Хофманн К., Чопп Дж. (Февраль 2001 г.). «Пириновый домен: возможный член семейства складчатых доменов смерти, вовлеченный в апоптоз и воспаление». Текущая биология. 11 (4): R118-20. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00056-2. PMID  11250163. S2CID  18564343.
• Ван Л., Манджи Г. А., Гренье Дж. М., Аль-Гарави А., Мерриам С., Лора Дж. М., Геддес Б. Дж., Брискин М., ДиСтефано П. С., Бертин Дж. (Август 2002 г.). «PYPAF7, новый PYRIN-содержащий Apaf1-подобный белок, который регулирует активацию NF-каппа B и процессинг цитокинов, зависимый от каспазы-1». Журнал биологической химии. 277 (33): 29874–80. Дои:10.1074 / jbc.M203915200. PMID  12019269.
• Гренье Дж. М., Ван Л., Манджи Г. А., Хуанг В. Дж., Аль-Гарави А., Келли Р., Карлсон А., Мерриам С., Лора Дж. М., Брискин М., ДиСтефано П. С., Бертин Дж. (Октябрь 2002 г.). «Функциональный скрининг пяти членов семейства PYPAF идентифицирует PYPAF5 как новый регулятор NF-kappaB и каспазы-1». Письма FEBS. 530 (1–3): 73–8. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03416-6. PMID  12387869. S2CID  25023390.
• Агостини Л., Мартинон Ф., Бернс К., Макдермотт М.Ф., Хокинс П.Н., Чопп Дж. (Март 2004 г.). «NALP3 формирует инфламмасому, обрабатывающую IL-1beta, с повышенной активностью при аутовоспалительном заболевании Muckle-Wells». Иммунитет. 20 (3): 319–25. Дои:10.1016 / S1074-7613 (04) 00046-9. PMID  15030775.
• Bruey JM, Bruey-Sedano N, Newman R, Chandler S, Stehlik C, Reed JC (декабрь 2004 г.). «PAN1 / NALP2 / PYPAF2, индуцибельный медиатор воспаления, который регулирует активацию NF-kappaB и каспазы-1 в макрофагах». Журнал биологической химии. 279 (50): 51897–907. Дои:10.1074 / jbc.M406741200. PMID  15456791.
• Киношита Т., Ван И, Хасегава М., Имамура Р., Суда Т. (июнь 2005 г.). «PYPAF3, PYRIN-содержащий APAF-1-подобный белок, является регулятором обратной связи каспазо-1-зависимой секреции интерлейкина-1бета». Журнал биологической химии. 280 (23): 21720–5. Дои:10.1074 / jbc.M410057200. PMID  15817483.
• Rink L, Slupianek A, Stoklosa T, Nieborowska-Skorska M, Urbanska K, Seferynska I, Reiss K, Skorski T. (июль 2007 г.). «Усиленное фосфорилирование Nbs1, члена комплекса репарации ДНК / контрольной точки Mre11-RAD50-Nbs1, может быть нацелено на повышение эффективности мезилата иматиниба против BCR / ABL-положительных лейкозных клеток». Кровь. 110 (2): 651–60. Дои:10.1182 / кровь-2006-08-042630. ЧВК  1924483. PMID  17431132.