Ипомовирус - Ipomovirus
Ипомовирус | |
---|---|
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Область: | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Писувирикота |
Учебный класс: | Stelpaviricetes |
Заказ: | Пататавиралес |
Семья: | Potyviridae |
Род: | Ипомовирус |
Типовой вид | |
Вирус легкой крапчатости сладкого картофеля |
Ипомовирус это род вирусы, в семье Potyviridae. В настоящее время в этом роду семь видов, включая типовой вид. Вирус легкой крапчатости сладкого картофеля.[1][2] Они поражают растения и передаются белокрылками (Bemisia tabaci ). Название рода происходит от Ипомея - родовое название сладкого картофеля.
Таксономия
Группа: оцРНК (+)
Структура
Вирусы в Ipomovirus не имеют оболочки, имеют изгибную и нитевидную геометрию. Диаметр составляет около 12-15 нм и может иметь различную длину в зависимости от вида (200-300 нанометров (нм): 500-600 нм: 650-900 нм).[1] Капсид имеет спиральную симметрию с шагом 3,4 нм. Они вызывают характерные тельца включения (вертушки) в инфицированных растительных клетках.
Род | Структура | Симметрия | Капсид | Геномное расположение | Геномная сегментация |
---|---|---|---|---|---|
Ипомовирус | Нитчатый | Спиральный | Без оболочки | Линейный | Сегментированный |
Жизненный цикл
Репликация вируса происходит в цитоплазме. Попадание в хозяйскую клетку достигается за счет проникновения в хозяйскую клетку. Репликация следует модели репликации вируса с положительной цепью РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяина за счет движения вируса по канальцам. Растения служат естественным хозяином. Вирус передается через переносчика (белую муху). Пути передачи бывают векторные и механические.[1]
Род | Детали хоста | Тканевый тропизм | Детали входа | Детали выпуска | Сайт репликации | Сайт сборки | Передача инфекции |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Ипомовирус | Растения | Никто | Вирусное движение; механическая инокуляция | Вирусное движение | Цитоплазма | Цитоплазма | Механическая прививка: белая муха |
Геном
Геном представляет собой одноэлементный линейный одноцепочечный геном с РНК положительной полярности длиной около 10-11 килобаз. 3 ’конец имеет поли (A) тракт, а 5’ конец содержит белок, связанный с геномом (VPg).[1]
Он кодирует один полипептид с прогнозируемой молекулярной массой 390 кг.Дальтон (кДа), который раскалывается на ~ 10 белки. В порядке 5'-3 'эти белки
- P1 (а серин протеаза ): 83 кДа
- HC (протеаза): 51 кДа
- P3: 34 кДа
- 6K1: 5 кДа
- Cl (геликаза ): 71 кДа
- 6K2: 6 кДа
- VPg (5'-связывающий белок): 20 кДа
- NIa-Pro (протеаза): 27 кДа
- NIb (РНК-зависимая РНК-полимераза ): 57 кДа
- Капсидный белок: 34 кДа
Количество белков может варьироваться в зависимости от вида.
Рекомендации
- ^ а б c d «Вирусная зона». ExPASy. Получено 15 июн 2015.
- ^ а б ICTV. «Таксономия вирусов: выпуск 2014 г.». Получено 15 июн 2015.