Birnaviridae - Birnaviridae

Birnaviridae
ODR.Birna.Fig1.v1.c.png
Вирус инфекционной бурсальной болезни частица
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Царство:Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:incertae sedis
Семья:Birnaviridae

Birnaviridae это семья двухцепочечные РНК-вирусы.[1] Лососевые рыбы, птицы и насекомые служат естественными хозяевами. В настоящее время в этом семействе 11 видов, разделенных на семь родов.[2] Заболевания, связанные с этой семьей, включают: инфекционный некроз поджелудочной железы в лососевых рыбах, что наносит значительный ущерб индустрии аквакультуры, с хронической инфекцией у взрослых лососевых рыб и острым вирусным заболеванием у молодых лососевых рыб.[2][3]

Структура

Вирусы в семье Birnaviridae находятся без оболочки, с икосаэдрической однооболочечной геометрией и симметрией T = 13. Диаметр около 70 нм.[2][3]

Геном

Геном вирус инфекционной бурсальной болезни семьи Birnaviridae

Геном состоит из линейной, двусегментированной, двухцепочечной РНК. Его длина составляет 5,9–6,9 т.п.н., и он кодирует от пяти до шести белков. Бирнавирусы кодируют следующие белки:

РНК-направленная РНК-полимераза (VP1), в котором отсутствует очень консервативный Последовательность Gly-Asp-Asp (GDD), компонент предлагаемого каталитический сайт этого семейства ферментов, который существует в консервированный мотив VI пальмового домена других РНК-направленных РНК-полимераз.[4]

Большой сегмент РНК, сегмент А, бирнавирусов коды для полипротеина (N-VP2-VP4-VP3-C) [5] который превращается в основные структурные белки вириона: VP2, VP3 (второстепенный структурный компонент вируса), и в предполагаемый протеаза VP4.[5] VP4 белок участвует в генерации VP2 и VP3.[5] рекомбинантный VP3 более иммуногенен, чем рекомбинантный VP2.[6]

Вирус инфекционного некроза поджелудочной железы (IPNV), бирнавирус, является важным возбудитель в рыбы фермы. Анализ вирусные белки показал, что VP2 является основным структурный и иммуногенный полипептид вируса.[7][8] Все нейтрализующие моноклональные антитела специфичны для VP2 и связывать к непрерывному или прерывистому эпитопы. Вариабельный домен VP2 и 20 смежных аминокислоты из консервированный С-концы, вероятно, наиболее важны в индукции иммунная реакция для защиты животные.[7]

Не структурный белок VP5 находится в сегменте РНК А.[нужна цитата ] Функция этого небольшого вирусного белка неизвестна. Считается, что он влияет на апоптоз, но результаты исследований не совсем совпадают. В вирионе белок не содержится.

Жизненный цикл

Репликация вируса происходит в цитоплазме. Проникновение в хозяйскую клетку осуществляется клеточным рецептором. эндоцитоз. Репликация следует модели репликации вируса с двухцепочечной РНК в цитоплазме. Транскрипция двухцепочечной РНК вируса - метод транскрипции в цитоплазме. Вирус высвобождается почкованием. Лососевые рыбы (Аквабирнавирус), молодняк неполовозрелых цыплят (Авибирнавирус), насекомые (Энтомобирнавирус), и пятнистая змееголовая рыба (Blosnavirus) как естественный хозяин. Маршруты передачи контактные.[2][3]

Таксономия

Филогенетическое дерево Birnaviridae

Выделяются следующие роды:

использованная литература

  1. ^ Дельмас, В; Attoui, H; Ghosh, S; Малик Ю.С. Mundt, E; Вахария, ВН; Отчет Ictv, Консорциум (январь 2019 г.). "Профиль таксономии вируса ICTV: Birnaviridae". Журнал общей вирусологии. 100 (1): 5–6. Дои:10.1099 / jgv.0.001185. PMID  30484762.
  2. ^ а б c d «Birnaviridae - Birnaviridae - вирусы дцРНК». Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Получено 16 октября 2019.
  3. ^ а б c «Вирусная зона». ExPASy. Получено 12 июн 2015.
  4. ^ Швед П.С., Добос П., Камерон Л.А., Вахария В.Н., Дункан Р. (май 2002 г.). «Белки VP1 бирнавируса образуют отдельную подгруппу РНК-зависимых РНК-полимераз, лишенных мотива GDD». Вирусология. 296 (2): 241–250. Дои:10.1006 / viro.2001.1334. PMID  12069523.
  5. ^ а б c Джагадиш М.Н., Статон В.Дж., Хадсон П.Дж., Азад А.А. (март 1988 г.). «Полипротеин-предшественник бирнавируса процессируется в Escherichia coli с помощью его собственного полипептида, кодируемого вирусом». Дж. Вирол. 62 (3): 1084–7. Дои:10.1128 / JVI.62.3.1084-1087.1988. ЧВК  253673. PMID  2828658.
  6. ^ Moon CH, Do JW, Cha SJ, Bang JD, Park MA, Yoo DJ, Lee JM, Kim HG, Chung DK, Park JW (октябрь 2004 г.). «Сравнение иммуногенности рекомбинантных VP2 и VP3 вируса инфекционного некроза поджелудочной железы и морского бирнавируса». Arch. Вирол. 149 (10): 2059–68. Дои:10.1007 / s00705-004-0339-2. PMID  15669113. S2CID  22958612.
  7. ^ а б Хеппелл Дж., Тарраб Э., Лекомте Дж., Бертьяум Л., Арелла М. (декабрь 1995 г.). «Штаммовая изменчивость и локализация важных эпитопов на главном структурном белке (VP2) вируса инфекционного некроза поджелудочной железы». Вирусология. 214 (1): 40–9. Дои:10.1006 / viro.1995.9956. PMID  8525637.
  8. ^ Нобирон I, Галлу М., Генри С., Торхи С., Будино П., Лежаль Н., Да Коста Б., Дельмас Б. (февраль 2008 г.). "Характеристика генома и полипептидов вируса Tellina 1 выявила пятый генетический кластер в Birnaviridae семья ". Вирусология. 371 (2): 350–61. Дои:10.1016 / j.virol.2007.09.022. PMID  17976679.

внешние ссылки