Галоацетатдегалогеназа - Haloacetate dehalogenase

Галоацетатдегалогеназа
Rhodopseudomonas palustris Haloacetate dehalogenase.png
Rhodopseudomonas palustris галоацетатдегалогеназа
Идентификаторы
Номер ЕС3.8.1.3
Количество CAS37289-40-0
Базы данных
IntEnzПросмотр IntEnz
БРЕНДАBRENDA запись
ExPASyПросмотр NiceZyme
КЕГГЗапись в KEGG
MetaCycметаболический путь
ПРИАМпрофиль
PDB структурыRCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтологияAmiGO / QuickGO

В энзимология, а галоацетатдегалогеназа (EC 3.8.1.3 ) является фермент который катализирует то химическая реакция

галоацетат + H2О гликолят + галогенид

Таким образом, два субстраты этого фермента галоацетат и ЧАС2О, а его два товары находятся гликолят и галогенид. Например, в случае фторацетат в будет производить гликолят и фторид.

Этот фермент принадлежит к семейству гидролазы, одно из крупнейших известных семейств ферментов, включающее примерно 1% генов в человеческий геном, существует как гомодимер, и действует специфически галогенидными связями в соединениях галогенида углерода. В систематическое название этого класса ферментов галоацетат галидогидролаза. Этот фермент еще называют моногалогенацетатдегалогеназа и фторацетатдегалогеназа. Этот фермент участвует в разложение гамма-гексахлорциклогексана и Разложение 1,2-дихлорэтана.

Реакции

является уникальным, поскольку катализирует разрыв исключительно стабильной связи углерод-фтор в фторированное алифатическое соединение. В реакции L-2-галогенкислотдегалогеназы и фторацетатдегалогеназы карбоксилатная группа выполняет нуклеофильная атака на альфа-углерод атом, перемещающий атом галогена. Это действие характерно для галогеналкандегалогеназы и 4-хлорбензоил-КоА-дегалогеназы. DL-2-галогенкислотдегалогеназа уникальна тем, что молекула воды непосредственно атакует основание, вытесняя галоген атом.

Значимость

В качестве фторацетат ядовит и присутствует в растениях, эндемичных для Австралии, Африки и Центральной Америки, домашний скот часто погибает от отравления фторацетатом. Фторацетат смертоносен для овец и крупного рогатого скота в дозах от 0,25 до 0,5 мг / кг массы тела и представляет собой проблему в животноводстве. Фторацетатдегалогеназа ген из почвенной бактерии Moraxella видовой штамм B был перенесен в рубец бактерия Butyrivibrio fibrisolvens и выразил in vitro на достаточно высоких уровнях для детоксикации фторацетата из окружающей среды. Ученые и фермеры хотят определить способ получения Б. фибрисолвенс в животных или в растения.

Структурные исследования

По состоянию на конец 2007 г. только один структура было решено для этого класса ферментов, с PDB код присоединения 1Y37.

Рекомендации

  • ГОЛДМАН П. (1965). «Ферментативное расщепление связи углерод-фтор во фторацетате». J. Biol. Chem. 240: 3434–8. PMID  14321384.
  • Гольдман П., Милн Г. В. (1966). «Разрыв связи углерод-фтор. II. Исследования механизма дефторирования фторацетата». J. Biol. Chem. 241 (23): 5557–9. PMID  5928195.
  • Форум японских химических журналов и Wiley Periodicals, Inc., 2008 г.
  • Маккензи, Д. Проблемы на ветру из-за измененных соевых бобов. Новый ученый. Том 148 (2006), стр. 2 декабря 1995 г.
  • 1995 Soy Stats. Домашняя страница Американской соевой ассоциации.
  • Биотехнологии растений появятся на экране радаров сельскохозяйственного сектора в 1996 году. Биобизнес. 8 декабря 1995 г.
  • Журнал Тацуо Курихара по биохимии. Vol. 131, стр. 671–677 (2002), Regular paper; 2002