Галоацетатдегалогеназа - Haloacetate dehalogenase
Галоацетатдегалогеназа | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Rhodopseudomonas palustris галоацетатдегалогеназа | |||||||||
Идентификаторы | |||||||||
Номер ЕС | 3.8.1.3 | ||||||||
Количество CAS | 37289-40-0 | ||||||||
Базы данных | |||||||||
IntEnz | Просмотр IntEnz | ||||||||
БРЕНДА | BRENDA запись | ||||||||
ExPASy | Просмотр NiceZyme | ||||||||
КЕГГ | Запись в KEGG | ||||||||
MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
ПРИАМ | профиль | ||||||||
PDB структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
Генная онтология | AmiGO / QuickGO | ||||||||
|
В энзимология, а галоацетатдегалогеназа (EC 3.8.1.3 ) является фермент который катализирует то химическая реакция
- галоацетат + H2О гликолят + галогенид
Таким образом, два субстраты этого фермента галоацетат и ЧАС2О, а его два товары находятся гликолят и галогенид. Например, в случае фторацетат в будет производить гликолят и фторид.
Этот фермент принадлежит к семейству гидролазы, одно из крупнейших известных семейств ферментов, включающее примерно 1% генов в человеческий геном, существует как гомодимер, и действует специфически галогенидными связями в соединениях галогенида углерода. В систематическое название этого класса ферментов галоацетат галидогидролаза. Этот фермент еще называют моногалогенацетатдегалогеназа и фторацетатдегалогеназа. Этот фермент участвует в разложение гамма-гексахлорциклогексана и Разложение 1,2-дихлорэтана.
Реакции
является уникальным, поскольку катализирует разрыв исключительно стабильной связи углерод-фтор в фторированное алифатическое соединение. В реакции L-2-галогенкислотдегалогеназы и фторацетатдегалогеназы карбоксилатная группа выполняет нуклеофильная атака на альфа-углерод атом, перемещающий атом галогена. Это действие характерно для галогеналкандегалогеназы и 4-хлорбензоил-КоА-дегалогеназы. DL-2-галогенкислотдегалогеназа уникальна тем, что молекула воды непосредственно атакует основание, вытесняя галоген атом.
Значимость
В качестве фторацетат ядовит и присутствует в растениях, эндемичных для Австралии, Африки и Центральной Америки, домашний скот часто погибает от отравления фторацетатом. Фторацетат смертоносен для овец и крупного рогатого скота в дозах от 0,25 до 0,5 мг / кг массы тела и представляет собой проблему в животноводстве. Фторацетатдегалогеназа ген из почвенной бактерии Moraxella видовой штамм B был перенесен в рубец бактерия Butyrivibrio fibrisolvens и выразил in vitro на достаточно высоких уровнях для детоксикации фторацетата из окружающей среды. Ученые и фермеры хотят определить способ получения Б. фибрисолвенс в животных или в растения.
Структурные исследования
По состоянию на конец 2007 г. только один структура было решено для этого класса ферментов, с PDB код присоединения 1Y37.
Рекомендации
- ГОЛДМАН П. (1965). «Ферментативное расщепление связи углерод-фтор во фторацетате». J. Biol. Chem. 240: 3434–8. PMID 14321384.
- Гольдман П., Милн Г. В. (1966). «Разрыв связи углерод-фтор. II. Исследования механизма дефторирования фторацетата». J. Biol. Chem. 241 (23): 5557–9. PMID 5928195.
- Форум японских химических журналов и Wiley Periodicals, Inc., 2008 г.
- Маккензи, Д. Проблемы на ветру из-за измененных соевых бобов. Новый ученый. Том 148 (2006), стр. 2 декабря 1995 г.
- 1995 Soy Stats. Домашняя страница Американской соевой ассоциации.
- Биотехнологии растений появятся на экране радаров сельскохозяйственного сектора в 1996 году. Биобизнес. 8 декабря 1995 г.
- Журнал Тацуо Курихара по биохимии. Vol. 131, стр. 671–677 (2002), Regular paper; 2002
Этот гидролаза статья - это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |