HLA-DRB5 - HLA-DRB5

HLA-DRB5
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1FV1, 1П15, 1HQR, 1ZGL
Идентификаторы
Псевдонимы	HLA-DRB5, HLA-DRB, главный комплекс гистосовместимости, класс II, DR beta 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 604776 MGI: 95901 ГомолоГен: 101524 Генные карты: HLA-DRB5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6п21.32 Начинать 32,517,353 бп[1] Конец 32,530,287 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 B1 | 17 17,98 см Начинать 34,305,867 бп[2] Конец 34,316,674 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание пептида с антигеном Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана эндоцитарных везикул • мембрана эндоцитарных везикул, покрытая клатрином • эндосома • аппарат Гольджи • мембрана транс-сети Гольджи • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана • мембрана поздней эндосомы • Мембрана Гольджи • клеточная мембрана • мембрана транспортных везикул • Белковый комплекс MHC класса II • лизосомальная мембрана • эндоплазматический ретикулум • ER к мембране транспортных пузырьков Гольджи • лизосома • неотъемлемый компонент просветной стороны мембраны эндоплазматического ретикулума • эндосомная мембрана • внеклеточная экзосома Биологический процесс • процессинг и презентация антигена • процессинг антигена и презентация экзогенного пептидного антигена через MHC класса II • интерферон-гамма-опосредованный сигнальный путь • иммунная система • Костимуляция Т-клеток • процессинг антигена и презентация пептидного или полисахаридного антигена через MHC класса II • иммунная реакция • Путь передачи сигналов рецептора Т-клеток • адаптивный иммунный ответ Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	3127	14969
Ансамбль	ENSG00000198502	ENSMUSG00000060586
UniProt	Q30154	P04231 P04230 P18468 P18469 O78196 н / д
RefSeq (мРНК)	NM_002125	NM_010382
RefSeq (белок)	NP_002116	NP_034512
Расположение (UCSC)	Chr 6: 32,52 - 32,53 Мб	Chr 17: 34.31 - 34.32 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Антиген гистосовместимости HLA класса II, бета-цепь DRB5 это белок что у людей кодируется HLA-DRB5 ген.^[5]

Функция

В белок кодируемый этим геном принадлежит к HLA класса II бета-цепочка паралоги. Молекула класса II представляет собой гетеродимер, состоящий из альфа (DRA) и бета-цепи (DRB), которые закреплены в мембране. Он играет центральную роль в иммунная система путем представления пептидов, полученных из внеклеточных белков. Молекулы класса II выражаются в антигенпрезентирующие клетки (APC: B-лимфоциты, дендритные клетки, макрофаги).^[5]

Структура гена и полиморфизмы

Бета-цепь составляет приблизительно 26-28 кДа. Он кодируется 6 экзоны, экзон один кодирует лидерный пептид, экзоны 2 и 3 кодируют два внеклеточных домены, экзон 4 кодирует трансмембранный домен и экзон 5 кодирует цитоплазматический хвост. Внутри молекулы DR бета-цепь содержит все полиморфизмы определение специфичности связывания пептида. Сотни DRB1 аллели были описаны, и типирование этих полиморфизмов обычно проводится при трансплантации костного мозга и почек.^[5]

Экспрессия гена

DRB1 выражается на уровне, в пять раз превышающем его паралоги DRB3, DRB4 и DRB5. DRB1 присутствует у всех людей. Аллельные варианты DRB1 не связаны либо ни с одним из генов DRB3, DRB4 и DRB5, либо с одним из них. Наличие DRB5 связано с аллельными вариантами DRB1, в противном случае оно опускается. Есть 4 связанных псевдогена: DRB2, DRB6, DRB7, DRB8 и DRB9.^[5]

Смотрите также

• HLA-DR

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000198502 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000060586 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: главный комплекс гистосовместимости HLA-DRB5, класс II, DR beta 5».

дальнейшее чтение

• Лау М., Терасаки П.И., Парк М.С. (1995). «Международный сотовый обмен, 1994». Клинические трансплантаты: 467–88. PMID  7547576.
• Донг Р.П., Кимура А., Сасадзуки Т. (1992). «Анализ последовательности трех новых аллелей DRw14-DRB1». Иммуногенетика. 36 (2): 130–3. Дои:10.1007 / BF00215291. PMID  1612646. S2CID  32928324.
• Пьятье-Тонно Д., Гастинель Л.Н., Амблард Ф. и др. (1991). «Взаимодействие CD4 с антигенами HLA класса II и gp120 ВИЧ». Иммуногенетика. 34 (2): 121–8. Дои:10.1007 / BF00211424. PMID  1869305. S2CID  10116507.
• Нонг И, Кандил О., Тобин Э. Х. и др. (1991). «Коровой белок p24 ВИЧ ингибирует индуцированное гамма-интерфероном увеличение уровней мРНК тяжелой цепи HLA-DR и цитохрома b в линии человеческих моноцитоподобных клеток THP1». Клетка. Иммунол. 132 (1): 10–6. Дои:10.1016 / 0008-8749 (91) 90002-С. PMID  1905983.
• Rosenstein Y, Burakoff SJ, Herrmann SH (1990). «ВИЧ-gp120 может блокировать адгезию, опосредованную МНС CD4-класса II». J. Immunol. 144 (2): 526–31. PMID  1967269.
• Каллахан К.М., Форт М.М., Обах Е.А. и др. (1990). «Генетическая изменчивость gp120 ВИЧ-1 влияет на взаимодействие с молекулами HLA и рецептором Т-клеток». J. Immunol. 144 (9): 3341–6. PMID  1970352.
• Петерсдорф Э.В., Гриффит Р.Л., Эрлих Х.А. и др. (1990). «Уникальные последовательности для двух генов HLA-DRB1, экспрессируемых на разных гаплотипах DRw6». Иммуногенетика. 32 (2): 96–103. Дои:10.1007 / BF00210446. PMID  1975801. S2CID  28007432.
• Bowman MR, MacFerrin KD, Schreiber SL, Burakoff SJ (1991). «Идентификация и структурный анализ остатков в области V1 CD4, участвующих во взаимодействии с гликопротеином оболочки вируса иммунодефицита человека gp120 и молекулами главного комплекса гистосовместимости класса II». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 87 (22): 9052–6. Дои:10.1073 / pnas.87.22.9052. ЧВК  55099. PMID  1978941.
• Gyllensten UB, Sundvall M, Erlich HA (1991). «Аллельное разнообразие создается за счет обмена последовательностями внутри экзона в локусе DRB1 приматов». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 88 (9): 3686–90. Bibcode:1991PNAS ... 88.3686G. Дои:10.1073 / пнас.88.9.3686. ЧВК  51517. PMID  2023919.
• Ли К.В., Джонсон А.Х., Херли К.К. (1990). «Два расходящихся пути эволюции привели к гаплотипам DRw13». J. Immunol. 145 (9): 3119–25. PMID  2212675.
• Горский J (1989). «Полиморфизм бета-цепи HLA-DR. Полиморфизм второго домена отражает эволюционное родство аллелей и может объяснять общедоступные серологические эпитопы». J. Immunol. 143 (1): 329–33. PMID  2471740.
• Клейтон Л.К., Сие М., Благочестивый Д.А., Рейнхерц Е.Л. (1989). «Идентификация остатков CD4 человека, влияющих на MHC класса II по сравнению с связыванием gp120 ВИЧ-1». Природа. 339 (6225): 548–51. Bibcode:1989Натура. 339..548C. Дои:10.1038 / 339548a0. PMID  2543930. S2CID  4246781.
• Херли С.К., Грегерсен П.К., Горски Дж. И др. (1989). «Гаплотип DR3 (w18), DQw4 отличается от гаплотипов DR3 (w17), DQw2 по множеству локусов класса II». Гм. Иммунол. 25 (1): 37–50. Дои:10.1016/0198-8859(89)90068-2. PMID  2565895.
• Diamond DC, Sleckman BP, Gregory T и др. (1988). «Ингибирование функции CD4 + Т-клеток белком оболочки ВИЧ, gp120». J. Immunol. 141 (11): 3715–7. PMID  2846691.
• Фриман С.М., Сондерс Т.Л., Мэдден М. и др. (1987). «Сравнение аллелей DR beta 1 от диабетиков и здоровых людей». Гм. Иммунол. 19 (1): 1–6. Дои:10.1016/0198-8859(87)90033-4. PMID  2884201.
• Ли Б.С., Ржавчина Н.А., МакМайкл А.Дж., Макдевитт ХО (1987). «Подтипы HLA-DR2 образуют дополнительное супертипическое семейство аллелей бета DR». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 84 (13): 4591–5. Bibcode:1987PNAS ... 84.4591L. Дои:10.1073 / pnas.84.13.4591. ЧВК  305136. PMID  2885840.
• Овербах Д., Рич К., Танежа К. (1986). «Характеристика трех генов HLA-DR бета, выделенных у пациента с инсулинозависимым диабетом HLA-DR 3/4». Иммуногенетика. 24 (1): 41–6. Дои:10.1007 / BF00372296. PMID  3015788. S2CID  19599710.
• Ву С., Сондерс Т.Л., Бах Ф.Х. (1987). «Полиморфизм человеческих антигенов Ia, генерируемый реципрокным межгенным обменом между двумя локусами DR бета». Природа. 324 (6098): 676–9. Дои:10.1038 / 324676a0. PMID  3099214. S2CID  4365990.
• Лю CP, Бах FH, Ву SK (1988). «Молекулярные исследования редкого гаплотипа HLA класса II DR2 / LD-5a / DQw3. Множественные генетические механизмы в генерации полиморфных генов HLA класса II». J. Immunol. 140 (10): 3631–9. PMID  3129499.
• Steimle V, Hinkkanen A, Schlesier M, Epplen JT (1988). «Новая последовательность бета I HLA-DR из гаплотипа DRw11». Иммуногенетика. 28 (3): 208–10. Дои:10.1007 / BF00375861. PMID  3137159. S2CID  2712069.