HLA-DRA - HLA-DRA

HLA-DRA
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1A6A, 1AQD, 1BX2, 1Д5М, 1D5X, 1D5Z, 1D6E, 1DLH, 1FV1, 1FYT, 1П15, 1HXY, 1J8H, 1JWM, 1JWS, 1JWU, 1 кг0, 1КЛГ, 1KLU, 1ЛО5, 1PYW, 1R5I, 1 SEB, 1SJE, 1SJH, 1T5W, 1T5X, 1ГММ, 1ZGL, 2FSE, 2G9H, 2IAM, 2ЯН, 2ICW, 2IPK, 2OJE, 2Q6W, 2WBJ, 2XN9, 3C5J, 3L6F, 3O6F, 3PDO, 3ПГК, 3ПГД, 3QXA, 3QXD, 3S4S, 3С5Л, 3T0E, 4AEN, 4AH2, 4E41, 4FQX, 4 ГБ, 4H1L, 4C56, 4H25, 4H26, 4I5B, 4IS6, 4MCY, 4MCZ, 4MD0, 4MD4, 4MD5, 4MDI, 4MDJ, 4OV5, 4Y19, 4Y1A, 4X5X, 4X5 Вт
Идентификаторы
Псевдонимы	HLA-DRA, HLA-DRA1, MLRW, главный комплекс гистосовместимости, класс II, DR альфа
Внешние идентификаторы	OMIM: 142860 MGI: 95900 ГомолоГен: 7751 Генные карты: HLA-DRA
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6п21.32 Начинать 32,439,878 бп[1] Конец 32,445,046 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 B1 | 17 17,98 см Начинать 34,341,959 бп[2] Конец 34,344,645 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание пептида с антигеном • Активность рецептора MHC класса II • Связывание с белковым комплексом MHC класса II • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана эндоцитарных везикул • мембрана эндоцитарных везикул, покрытая клатрином • эндосома • аппарат Гольджи • мембрана транс-сети Гольджи • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана • мембрана поздней эндосомы • Мембрана Гольджи • клеточная мембрана • мембрана транспортных везикул • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • поверхность клетки • лизосомальная мембрана • эндоплазматический ретикулум • ER к мембране транспортных пузырьков Гольджи • лизосома • неотъемлемый компонент просветной стороны мембраны эндоплазматического ретикулума • эндосомная мембрана • внеклеточная экзосома • Белковый комплекс MHC класса II Биологический процесс • процессинг и представление антигена • процессинг антигена и презентация экзогенного пептидного антигена через MHC класса II • познание • интерферон-гамма-опосредованный сигнальный путь • иммунная система • Костимуляция Т-клеток • процессинг антигена и презентация пептидного или полисахаридного антигена через MHC класса II • иммунная реакция • сборка пептидного антигена с белковым комплексом MHC класса II • GO: 0022415 вирусный процесс • Путь передачи сигналов рецептора Т-клеток • адаптивный иммунный ответ Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	3122	100504404
Ансамбль	ENSG00000206308 ENSG00000228987 ENSG00000230726 ENSG00000204287 ENSG00000227993 ENSG00000226260 ENSG00000234794	ENSMUSG00000036322
UniProt	P01903	P04224 P01904
RefSeq (мРНК)	NM_019111	NM_010381
RefSeq (белок)	NP_061984	NP_034511
Расположение (UCSC)	Chr 6: 32,44 - 32,45 Мб	Chr 17: 34.34 - 34.34 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Антиген гистосовместимости HLA класса II, альфа-цепь DR это белок что у человека кодируется HLA-DRA ген.^[5] HLA-DRA кодирует альфа-субъединицу HLA-DR. В отличие от альфа-цепей других молекул человеческого МНС класса II, альфа-субъединица практически не меняется. Однако у любого человека он может сочетаться с бета-цепью из 3 разных бета-локусов DR, DRB1, и два любых DRB3, DRB4, или же DRB5 аллели. Таким образом, существует вероятность того, что любой конкретный человек может образовывать 4 различных изоформы HLA-DR (2 аллеля DRB1 и два аллеля DRB3, DRB4 или DRB5).

Функция

В полипептид подразделение кодируемый этим геном принадлежит к HLA класса II альфа-цепь паралоги. Белок класса II представляет собой гетеродимер, состоящий из альфа (DRα) и бета-цепи (DRβ), которые закреплены в мембране. Он играет центральную роль в иммунная система путем представления пептидов, полученных из внеклеточных белков. Молекулы класса II выражаются в антигенпрезентирующие клетки (APC: B-лимфоциты, дендритные клетки, макрофаги).^[5]

Структура гена и полиморфизмы

Альфа-цепь составляет приблизительно 33-35 кДа, а ее ген содержит 5 экзоны. Экзон 1 кодирует лидерный пептид, экзоны 2 и 3 кодируют два внеклеточных домены, а экзон 4 кодирует трансмембранный домен и цитоплазматический хвост. DRA не имеет полиморфизмов в пептидной связывающей части и действует как единственная альфа-цепь для DRB1, DRB3, DRB4 и DRB5.^[5]

Аллели

В человеческой популяции есть две разные цепи HLA-DRA, кодируемые тремя разными аллелями DRA:

ДРА * 01: 01 ДРА * 01: 02: 01 ДРА * 01: 02: 02

Смотрите также

• HLA-DR

Рекомендации

1. ENSG00000228987, ENSG00000230726, ENSG00000204287, ENSG00000227993, ENSG00000226260, ENSG00000234794 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000206308, ENSG00000228987, ENSG3202000, ENSG42400 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036322 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: главный комплекс гистосовместимости HLA-DRA, класс II, DR альфа».

дальнейшее чтение

• Бенишу С., Бенмера А. (2003). «[Nef ВИЧ и белки K3 / K5 вируса Капоши-саркомы:« паразиты »пути эндоцитоза]». Med Sci (Париж). 19 (1): 100–6. Дои:10.1051 / medsci / 2003191100. PMID  12836198.
• Толструп М., Остергаард Л., Лаурсен А.Л. и др. (2004). «Ускользание от иммунного надзора за ВИЧ / ВИП: внимание на Неф». Curr. ВИЧ Res. 2 (2): 141–51. Дои:10.2174/1570162043484924. PMID  15078178.
• Андерсон Дж. Л., Надежда Т. Дж. (2005). «Вспомогательные белки ВИЧ и выживание в клетке-хозяине». Текущие отчеты о ВИЧ / СПИДе. 1 (1): 47–53. Дои:10.1007 / с11904-004-0007-х. PMID  16091223. S2CID  34731265.
• Ли Л., Ли Х.С., Пауза ЦД и др. (2006). «Роль вспомогательных белков ВИЧ-1 в вирусном патогенезе и взаимодействиях хозяин-патоген». Cell Res. 15 (11–12): 923–34. Дои:10.1038 / sj.cr.7290370. PMID  16354571.
• Плита V, Верхассельт B (2006). «Моделирование эффектов тимуса ВИЧ-1 Nef». Curr. ВИЧ Res. 4 (1): 57–64. Дои:10.2174/157016206775197583. PMID  16454711.
• Мацусима Г.К., Ито-Линдстрем Ю., Тинг Дж. П. (1992). «Активация гена HLA-DRA в первичных Т-лимфоцитах человека: новое использование ТАТА и элементов промоторов X и Y». Мол. Клетка. Биол. 12 (12): 5610–9. Дои:10.1128 / MCB.12.12.5610. ЧВК  360500. PMID  1448091.
• Шаифф В.Т., Хруска К.А., Маккорт Д.В. и др. (1992). «HLA-DR связывается со специфическими стрессовыми белками и сохраняется в эндоплазматическом ретикулуме в инвариантных клетках с отрицательной цепью». J. Exp. Med. 176 (3): 657–66. Дои:10.1084 / jem.176.3.657. ЧВК  2119345. PMID  1512535.
• Пьятье-Тонно Д., Гастинель Л.Н., Амблард Ф. и др. (1991). «Взаимодействие CD4 с антигенами HLA класса II и gp120 ВИЧ». Иммуногенетика. 34 (2): 121–8. Дои:10.1007 / BF00211424. PMID  1869305. S2CID  10116507.
• Нонг И, Кандил О., Тобин Э. Х. и др. (1991). «Коровой белок p24 ВИЧ ингибирует индуцированное гамма-интерфероном повышение уровней мРНК тяжелой цепи HLA-DR и цитохрома b в человеческой моноцитоподобной клеточной линии THP1». Клетка. Иммунол. 132 (1): 10–6. Дои:10.1016 / 0008-8749 (91) 90002-С. PMID  1905983.
• Rosenstein Y, Burakoff SJ, Herrmann SH (1990). «ВИЧ-gp120 может блокировать адгезию, опосредованную МНС CD4-класса II». J. Immunol. 144 (2): 526–31. PMID  1967269.
• Каллахан К.М., Форт М.М., Обах Е.А. и др. (1990). «Генетическая изменчивость gp120 ВИЧ-1 влияет на взаимодействие с молекулами HLA и рецептором Т-клеток». J. Immunol. 144 (9): 3341–6. PMID  1970352.
• Bowman MR, MacFerrin KD, Schreiber SL, Burakoff SJ (1991). «Идентификация и структурный анализ остатков в области V1 CD4, участвующих во взаимодействии с гликопротеином оболочки вируса иммунодефицита человека gp120 и молекулами главного комплекса гистосовместимости класса II». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 87 (22): 9052–6. Дои:10.1073 / pnas.87.22.9052. ЧВК  55099. PMID  1978941.
• Коппельман Б., Крессвелл П. (1990). «Быстрая нелизосомная деградация собранных гликопротеинов HLA класса II, включающих мутантную альфа-цепь DR». J. Immunol. 145 (8): 2730–6. PMID  2212658.
• Клейтон Л.К., Сие М., Благочестивый Д.А., Рейнхерц Е.Л. (1989). «Идентификация остатков CD4 человека, влияющих на MHC класса II по сравнению с связыванием gp120 ВИЧ-1». Природа. 339 (6225): 548–51. Bibcode:1989Натура. 339..548C. Дои:10.1038 / 339548a0. PMID  2543930. S2CID  4246781.
• Diamond DC, Sleckman BP, Gregory T и др. (1988). «Ингибирование функции CD4 + Т-клеток белком оболочки ВИЧ, gp120». J. Immunol. 141 (11): 3715–7. PMID  2846691.
• Тьернлунд У., Шейниус А., Йоханссон С. и др. (1989). «Т-клеточный ответ на очищенное производное белка после удаления клеток Лангерганса из суспензий эпидермальных клеток, содержащих кератиноциты, экспрессирующие трансплантационные антигены класса II». Сканд. J. Immunol. 28 (6): 667–73. Дои:10.1111 / j.1365-3083.1988.tb01500.x. PMID  3266023. S2CID  25824282.
• Андрие Дж. М., Эвен П., Венет А. (1986). «СПИД и родственные синдромы как вирусное аутоиммунное заболевание иммунной системы: нарушение анти-MHC II. Терапевтические последствия». СПИД исследования. 2 (3): 163–74. Дои:10.1089 / aid.1.1986.2.163. PMID  3489470.
• Дас Х.К., Лоуренс СК, Вайсман С.М. (1983). «Структура и нуклеотидная последовательность гена тяжелой цепи HLA-DR». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 80 (12): 3543–7. Bibcode:1983PNAS ... 80.3543D. Дои:10.1073 / pnas.80.12.3543. ЧВК  394085. PMID  6304715.
• Шамбоек А., Корман А. Дж., Камб А., Стромингер Дж. Л. (1984). «Организация транскрипционной единицы антигена гистосовместимости класса II человека: тяжелая цепь HLA-DR». Нуклеиновые кислоты Res. 11 (24): 8663–75. Дои:10.1093 / nar / 11.24.8663. ЧВК  326615. PMID  6324094.
• Дас Х.К., Биро П.А., Коэн С.Н. и др. (1983). «Использование синтетических олигонуклеотидных зондов, комплементарных генам альфа и бета HLA-DR человека, в качестве праймеров для удлинения для выделения 5'-специфических геномных клонов». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 80 (6): 1531–5. Bibcode:1983PNAS ... 80.1531D. Дои:10.1073 / pnas.80.6.1531. ЧВК  393635. PMID  6403940.