HLA-DP - HLA-DP
| MHC класс II, ДП | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| (гетеродимер) | ||||||||||
| Тип белка | рецептор клеточной поверхности | |||||||||
| Функция | Иммунное распознавание и презентация антигена | |||||||||
| ||||||||||
HLA-DP белок / пептид-антиген рецептор и болезнь трансплантат против хозяина антиген, состоящий из 2 субъединиц, DPα и DPβ. DPα и DPβ кодируются двумя локусами, HLA-DPA1 и HLA-DPB1, которые находятся в MHC Область класса II (или HLA-D) в Человеческий лейкоцитарный антиген комплекса на хромосоме 6 человека (ссылки см. в блоках белков справа) .О HLA-DP известно меньше, чем HLA-DQ и HLA-DR но секвенирование типов DP и определение более частых гаплотипы значительно продвинулась вперед за последние несколько лет.
Структура, функции, генетика
Структура
HLA-DP представляет собой αβ-гетеродимер рецептор клеточной поверхности. Каждая субъединица DP (α-субъединица, β-субъединица) состоит из α-спирального N-концевого домена, IgG-подобного β-слоя, домена, перекрывающего мембрану, и цитоплазматического домена. Α-спиральный домен образует боковые стороны бороздки для связывания пептида. Области β-слоя образуют основу связывающей бороздки и основной объем молекулы, а также межсубъединичную (нековалентную) связывающую область.
Функция
Название HLA-DP первоначально описывает трансплантационный антиген MHC класс II категория главный комплекс гистосовместимости человека, однако этот антиген - артефакт эпохи трансплантации органов. HLA DP действует как рецептор клеточной поверхности для чужеродных или собственных антигенов. Иммунная система изучает антигены на наличие чужеродных патогенов, когда они представлены рецепторами MHC (например, HLA-DP). Антигены MHC Class II обнаружены на антигенпрезентирующие клетки (APC) (макрофаги, дендритные клетки и B-лимфоциты). Обычно эти APC «представляют» рецептор / антигены класса II огромному количеству Т-клеток, каждая из которых имеет уникальные варианты Т-клеточного рецептора (TCR). Несколько вариантов TCR, которые распознают эти комплексы DQ / антиген, находятся на CD4-положительных Т-клетках. Эти Т-клетки, называемые Т-хелперами (Тчас) клетки, могут способствовать амплификации В-клеток, распознающих разные части одного и того же антигена. Как вариант, макрофаги и другие цитотоксические лимфоциты потребляют или разрушают клетки посредством апоптотической передачи сигналов и представляют аутоантигены. Аутоантигены в правильном контексте образуют популяцию регуляторных Т-клеток, которые защищают собственные ткани от иммунной атаки или аутоиммунитета.
Генетика
Α-цепь и β- DP кодируются локусом HLA-DPA1 и локусом HLA-DPB1 соответственно. Этот кластер расположен на проксимальном (центромерном) конце HLA суперлокус в хромосоме человека 6p21.31. Он удален от HLA-DR и HLA-DQ кодирующие локусы и поэтому гораздо более уравновешен по отношению к другим локусам HLA. в Супер B8 сложный локус DP чаще заменяется либо в результате его удаленности от других локусов, либо потому, что он не был так активно выбран в эволюции Супер B8.
Понимание гетеродимерных изоформ DP
| HLA | DPB1 | ||
|---|---|---|---|
| аллель | (м) | (п) | |
| DPA1 | (м) | αмβм (СНГ м) | αмβп (Транс) |
| (п) | αпβм (Транс) | αпβп (СНГ п) | |
| Результат: 2 СНГ, αмβм & αпβп, изоформы и 2 транс,αмβп & αпβм. | |||
Каждая комбинация продукта гена аллеля DPA1 с каждой комбинацией продукта «гена» DPB1 потенциально может рекомбинировать с образованием одной изоформы. Гены DP очень вариабельны в человеческой популяции. В типичной популяции есть много DP альфа и бета. Большинство изоформ встречаются нечасто.
Эти «цис» -изоформы будут составлять не менее 50% изоформ DP. Другие, транс-изоформы, как правило, встречаются реже, изоформы возникают в результате случайных «транс» комбинаций гаплотипов у индивидуумов в результате «транс» изоформ продукта родительского / материнского гена.
Аллели
Аллели HLA-DPA1
| HLA-DPA1 | |||
|---|---|---|---|
| *01 | *02 | *03 | *04 |
| *01:03 *01:04 *01:05 *01:06 *01:07 *01:08 *01:09 *01:10 | *02:01 *02:02 *02:03 *02:04 | *03:01 *03:02 *03:03 | *04:01 |
Аллели HLA-DPB1
| HLA-DPB1 | |
|---|---|
| *01 | *01:01 |
| *02 | *02:01 |
| *02:02 | |
| *03 | *03:01 |
| *04 | *04:01 |
| *04:02 | |
| *05 | *05:01 |
| *06 | *06:01 |
| *07 | *07:01 |
| *08 | *08:01 |
| *09 | *09:01 |
| *10 | *10:01 |
| DPB1 * 11: 01 - DPB1 * 129: 01 | |
Изменение номенклатуры аллелей HLA-DPB1
Перед обновлением номенклатуры HLA в апреле 2010 г. новые имена аллелей HLA-DPB1 были присвоены в рамках существующей системы номенклатуры. Например, аллель, обнаруженный после HLA-DPB1 * 9901, был назначен как DPB1 * 0102, последующий аллель был назван DPB1 * 0202, затем * 0302 и так далее. Такое присвоение названия было принято из-за сложных генетических характеристик аллелей DPB1 по сравнению с аллелями других локусов HLA. Большинство аллелей HLA-DPB1 нельзя просто сгруппировать по их нуклеотидным последовательностям. Такое присвоение имен было самой запутанной системой в номенклатуре HLA. В обновлении номенклатуры HLA 2010 г.[1] все аллели DPB1, кроме DPB1 * 0202 и * 0402, обнаруженные после DPB1 * 9901, были переназначены с новыми номерами. Например, DPB1 * 0102 становится DPB1 * 100: 01, а DPB1 * 0203 становится DPB1 * 101: 01.
Все переименованные аллели перечислены в таблице преобразования номенклатуры HLA-DPB1 ниже.[2]
| Предыдущие имена | Текущие имена |
|---|---|
| DPB1 * 0102 | DPB1 * 100: 01 |
| DPB1 * 0203 | DPB1 * 101: 01 |
| DPB1 * 0302 | DPB1 * 102: 01 |
| DPB1 * 0403 | DPB1 * 103: 01 |
| DPB1 * 0502 | DPB1 * 104: 01 |
| DPB1 * 0602 | DPB1 * 105: 01 |
| DPB1 * 0802 | DPB1 * 106: 01 |
| DPB1 * 0902 | DPB1 * 107: 01 |
| DPB1 * 1002 | DPB1 * 108: 01 |
| DPB1 * 1102 | DPB1 * 109: 01 |
| DPB1 * 1302 | DPB1 * 110: 01 |
| DPB1 * 1402 | DPB1 * 111: 01 |
| DPB1 * 1502 | DPB1 * 112: 01 |
| DPB1 * 1602 | DPB1 * 113: 01 |
| DPB1 * 1702 | DPB1 * 114: 01 |
| DPB1 * 1802 | DPB1 * 115: 01 |
| DPB1 * 1902 | DPB1 * 116: 01 |
| DPB1 * 2002 г. | DPB1 * 117: 01 |
| DPB1 * 2102 | DPB1 * 118: 01 |
| DPB1 * 2202 | DPB1 * 119: 01 |
| DPB1 * 2302N | DPB1 * 120: 01N |
| DPB1 * 2402 | DPB1 * 121: 01 |
| DPB1 * 2502 | DPB1 * 122: 01 |
| DPB1 * 2602 | DPB1 * 123: 01 |
| DPB1 * 2702 | DPB1 * 124: 01 |
| DPB1 * 2802 | DPB1 * 125: 01 |
Чтобы облегчить перенос данных в новую номенклатуру, Номенклатурный комитет ВОЗ по факторам системы HLA предоставил Инструмент преобразования номенклатуры IMGT / HLA. Этот инструмент позволяет вам ввести имя аллеля HLA и предоставит вам как текущую, так и новую версию имени аллеля. Новые аллели, которым никогда не было присвоено имя до апрельского обновления 2010 года:
| DPB1 * 126: 01 DPB1 * 127: 01 DPB1 * 128: 01 DPB1 * 129: 01 |
Общие гаплотипы DP
| HLA-DPA1 * 01: 03 / DPB1 * 04: 01 (DP401) |
| HLA-DPA1 * 01: 03 / DPB1 * 04: 02 (DP402) |
внешняя ссылка
- Номенклатура аллелей HLA
- База данных IMGT / HLA - словарь HLA.
- База данных частот аллелей и гаплотипов HLA
Рекомендации
- ^ Марш, С.Ж., Альберт, Э.Д., Бодмер, В.Ф., Бонтроп, Р.Э., Дюпон, Б., Эрлих, Х.А., Фернандес-Винья, М., Герати, Делавэр, Холдсворт, Р., Херли, С.К., Лау, М., Ли, К.В., Мах, Б., Майерс, М., Майр, В.Р., Мюллер, С.Р., Пархам, П., Петерсдорф, Э.В., Сасадзуки, Т., Строминджер, Д.Л., Свейгаард, А., Терасаки, П.И., Тирси , Дж. М., Троусдейл, Дж. (2010). «Номенклатура факторов системы HLA, 2010». Тканевые антигены. 75 (4): 291–455. Дои:10.1111 / j.1399-0039.2010.01466.x. ЧВК 2848993. PMID 20356336.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- ^ ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/imgt/mhc/hla/Nomenclature_2009.txt