Аденозиндезаминаза z-альфа-домен - Adenosine deaminase z-alpha domain
| Аденозиндезаминаза z-альфа-домен | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Кристаллическая структура zb-домена фермента редактирования РНК ADAR1 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | z-альфа | ||||||||
| Pfam | PF02295 | ||||||||
| Pfam клан | CL0123 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR000607 | ||||||||
| SCOP2 | 1qgp / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии белковый домен Аденозиндезаминаза z-альфа-домен относится к эволюционно сохраненным белковый домен. Эта семья состоит из N-конец и, таким образом, z-альфа-домен двухцепочечного РНК -специфический аденозиндезаминаза (ADAR), фермент, редактирующий РНК. Z-альфа-домен - это Z-ДНК связывающий домен, и связывание этой области с B-ДНК было показано, что стерические препятствия не одобряют его.[1]
Функция
Двухцепочечная РНК-специфичная аденозиндезаминаза (EC ) преобразует несколько аденозины к инозины и создает несоответствующие I / U пар оснований в двойной спиральной РНК субстраты без явной специфичности последовательности. Было обнаружено, что DRADA изменяет аденозины в регионах с высоким содержанием AU чаще, вероятно, из-за относительной легкости плавления A / U пар оснований по сравнению с G / C основание пары. В белок функции для изменения популярный Геномы РНК и могут быть ответственны за гипермутацию некоторых отрицательно -цепочечных вирусы. DRADA редактирует мРНК для глутамат рецептор подразделения путем сайт-селективного дезаминирования аденозина. ДРАДА повторение также обнаружен в вирусных белках E3, которые содержат двухцепочечную РНК-связывающую домен.
Примеры
Гены, кодирующие белки, содержащие этот домен, включают: АДАР и ZBP1.
Рекомендации
- ^ Schade M, Turner CJ, Kühne R, Schmieder P, Lowenhaupt K, Herbert A, Rich A, Oschkinat H (октябрь 1999 г.). «Структура раствора Zalpha-домена фермента редактирования РНК человека ADAR1 показывает предполагаемую связывающую поверхность для Z-ДНК». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 96 (22): 12465–70. Дои:10.1073 / пнас.96.22.12465. ЧВК 22950. PMID 10535945.