RICS (ген) - RICS (gene)

ARHGAP32
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3IUG
Идентификаторы
Псевдонимы	ARHGAP32, GC-GAP, GRIT, PX-RICS, RICS, p200RhoGAP, p250GAP, Rho GTPase, активирующий белок 32
Внешние идентификаторы	OMIM: 608541 MGI: 2450166 ГомолоГен: 8812 Генные карты: ARHGAP32
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q24.3 Начинать 128,965,060 бп[1] Конец 129,279,324 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 | 9 A4 Начинать 32,116,136 бп[2] Конец 32,268,446 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание фосфатидилинозита • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Активность активатора GTPase • связывание фосфатидилинозитола с фосфатом Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • эндосома • постсинаптическая мембрана • проекция клетки • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность • Мембрана Гольджи • клеточная мембрана • дендритный позвоночник • синапс • соединение клеток • эндоплазматический ретикулум • эндосомная мембрана • фибриллярный центр • нуклеоплазма • аппарат Гольджи • клеточная кора • актиновый цитоскелет Биологический процесс • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • регуляция передачи сигнала, опосредованного малой GTPase • преобразование сигнала • передача сигнала, опосредованная малой GTPase Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9743	330914
Ансамбль	ENSG00000134909	ENSMUSG00000041444
UniProt	A7KAX9	Q811P8
RefSeq (мРНК)	NM_001142685 NM_014715 NM_001378024 NM_001378025	NM_001195632 NM_177379 NM_001370957 NM_001370958
RefSeq (белок)	NP_001136157 NP_055530 NP_001364953 NP_001364954	NP_001182561 NP_796353 NP_001357886 NP_001357887
Расположение (UCSC)	Chr 11: 128.97 - 129.28 Мб	Chr 9: 32,12 - 32,27 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Rho GTPase-активирующий белок 32 это белок что у людей кодируется RICS ген.^[5] RICS имеет две известные изоформы, RICS, которые выражаются в основном в нейрит шишки роста, а на постсинаптические мембраны, и PX-RICS, который более широко выражен в эндоплазматический ретикулум, аппарат Гольджи и эндосомы.^[6] Единственная известная область RICS - это Домен RhoGAP, в то время как PX-RICS имеет дополнительный Гомология фокса и SH3 домен.

Функция

RICS (также известный как GRIT / Arhgap32) представляет собой нейрон-ассоциированный белок, активирующий ГТФазу, который может регулировать морфологию и прочность дендритных шипов путем модуляции Rho GTPase Мероприятия.^[5][6]

Изоформы

RICS

Эксперименты показали, что сбивание RICS, или просто выбивание его GAP, или C-терминал TrkA сайт связывания, приводит к аномально разрастанию нейритов и блокирует NGF регулируемый вырост.^[7]

Известно, что активность GAP RICS регулируется двумя сайтами фосфорилирования, один контролируется CaMKII, а другой - RPTPa. Когда CaMKII активируется Ca²⁺ вход через Рецепторы NMDA и деактивирует RICS через фосфорилирование, что, в свою очередь, увеличивает количество активных GTP-связанных форм Cdc42 и Rac1. Таким образом, это может вызвать, например, реконструкцию дендритные шипы. Поскольку в некоторых экспериментах было показано, что Cdc42 не влияет на морфологию позвоночника, в то время как другие показали, что Rac1 влияет (через PAK1, LIMK, CFL1 pathway), наиболее вероятный путь - через Rac1. Этот RACS также связан с β-катенин и N-кадгерины, in vivo в PSD (с которым он связывается через PSD-95, и слабое связывание с субъединицами NR2) указывает на то, что может существовать и другой путь изменения структуры позвоночника.^[6] Сайт фосфорилирования, контролируемый RPTPa, контролирует специфичность активности GAP посредством механизма, который, как полагают, включает перемещение c-концевой области RICS. В фосфорилированном состоянии RICS может влиять на Rac, Rho и Cdc42, но после дефосфорилирования RPTPa он может влиять только на Rac. Дальнейший сайт фосфорилирования, регулируемый FYN контролирует привязку RPTPa к RICS.^[8]

PX-RICS

PX-RICS - это доминирующая изоформа, экспрессирующаяся во время развития нервной системы. Известно, что GAP-активность намного ниже, чем у RICS. Хотя он более широко выражен, чем RICS, все же известно, что он ингибирует удлинение нейронов.^[9] Идея о том, что это синаптически релевантная изоформа, заключается в том, что известно, что она связывает NR2B и PSD95 in vivo.

PX-RICS, как известно, участвует в транспорте некоторых синаптических белков, у которых отсутствуют сигналы экспорта ER, из эндоплазматического ретикулума в аппарат Гольджи. Это было показано для β-catenin и N-cadherin, последний из которых лишен сигнала экспорта ER, а первый, который связывает более поздний внутри ER как необходимую, но недостаточную часть процесса его экспорта. Было обнаружено, что PX-RICS является необходимым компонентом для экспорта этого комплекса в Гольджи, а затем и далее на клеточную мембрану. Считается, что PX-RICS делает это, сначала локализуясь на мембране ER - это происходит путем связывания с ГАБАРАП который связывает ER, и через его домен гомологии Phox, который имеет высокую аффинность связывания с Pi4P, преобладающим фосфоинозитидом в эндоплазматическом ретикулуме и аппарате Гольджи. Считается, что PX-RICS связывает гетеродимер белков 14-3-3, кодируемых YWHAZ и YWHAQ гены. Сайт, в котором происходит это связывание, представляет собой сайт RSKSDP на c-конце PX-RICS, который фосфорилируется с помощью CAMKII, чтобы стимулировать связывание.^[10] Также было показано, что мембранный транспорт FGFR4, белка, связывающего N-кадгерин, зависит от нокдауна PX-RICS.^[11]

Взаимодействия

RICS (ген) показал взаимодействовать с:

• BCAR1,^[7][12]
• CDC42,^[7][12][13]
• CRK,^[12][14]
• CRKL,^[7]
• FYN,^[15]
• GAB2,^[12]
• GRIN2B,^[13]
• NCK1,^[12]
• RAC1,^[12][14]
• RHOA,^[7][13][14]
• SHC3,^[7]
• Src,^[14] и
• TrkA.^[7]

В МикроРНК Мир-132 был описан как нацеленная на мРНК этого гена для деградации; считается, что это важно для регуляции развития нейронов.^[16]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000134909 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000041444 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: белок, активирующий ГТФазу RICS Rho».
6. Окабе Т., Накамура Т., Нисимура Ю.Н., Коху К., Охвада С., Моришита Ю., Акияма Т. (март 2003 г.). «RICS, новый белок, активирующий GTPase для Cdc42 и Rac1, участвует в передаче сигналов рецепторами бета-катенин-N-кадгерина и N-метил-D-аспартата». J. Biol. Chem. 278 (11): 9920–7. Дои:10.1074 / jbc.M208872200. PMID  12531901.
7. Накамура Т., Комия М., Соне К., Хиросэ Э, Гото Н., Мори Х, Охта Й, Мори Н. (декабрь 2002 г.). «Grit, белок, активирующий GTPase для семейства Rho, регулирует расширение нейритов посредством ассоциации с рецептором TrkA и адапторными молекулами N-Shc и CrkL / Crk». Мол. Клетка. Биол. 22 (24): 8721–34. Дои:10.1128 / MCB.22.24.8721-8734.2002. ЧВК  139861. PMID  12446789.
8. Chagnon MJ, Wu CL, Nakazawa T., Yamamoto T., Noda M, Blanchetot C, Tremblay ML (ноябрь 2010 г.). «Рецепторная тирозинфосфатаза сигма (RPTPσ) регулирует p250GAP, новый субстрат, который ослабляет передачу сигналов Rac». Клетка. Сигнал. 22 (11): 1626–33. Дои:10.1016 / j.cellsig.2010.06.001. PMID  20550964.
9. Хаяси Т., Окабе Т., Насу-Нишимура Ю., Сакауэ Ф., Охвада С., Мацуура К., Акияма Т., Накамура Т. (август 2007 г.). «PX-RICS, новый вариант сплайсинга RICS, является основной изоформой, экспрессируемой во время нейрального развития». Гены Клетки. 12 (8): 929–39. Дои:10.1111 / j.1365-2443.2007.01101.x. PMID  17663722. S2CID  22118853.
10. Накамура Т., Хаяси Т., Мимори-Киёсуэ Й, Сакауэ Ф., Мацуура К., Иемура С., Нацумэ Т., Акияма Т. (май 2010 г.). «Комплекс PX-RICS-14-3-3zeta / тета соединяет N-кадгерин-бета-катенин с динеин-динактином, чтобы опосредовать его экспорт из эндоплазматического ретикулума». J. Biol. Chem. 285 (21): 16145–54. Дои:10.1074 / jbc.M109.081315. ЧВК  2871483. PMID  20308060.
11. Накамура Т., Хаяси Т., Насу-Нисимура Ю., Сакауэ Ф., Моришита Ю., Окабе Т., Охвада С., Мацуура К., Акияма Т. (май 2008 г.). «PX-RICS опосредует транспорт ER-to-Golgi комплекса N-кадгерин / бета-катенин». Genes Dev. 22 (9): 1244–56. Дои:10.1101 / gad.1632308. ЧВК  2335319. PMID  18451111.
12. Чжао К., Ма Х., Босси-Ветцель Э., Липтон С.А., Чжан З., Фэн Г.С. (сентябрь 2003 г.). «GC-GAP, белок, активирующий ГТФазу семейства Rho, который взаимодействует с сигнальными адаптерами Gab1 и Gab2». J. Biol. Chem. 278 (36): 34641–53. Дои:10.1074 / jbc.M304594200. PMID  12819203.
13. Накадзава Т., Ватабе А.М., Тедзука Т., Ёсида Ю., Ёкояма К., Умемори Х., Иноуэ А., Окабе С., Манабе Т., Ямамото Т. (июль 2003 г.). «p250GAP, новый мозг, обогащенный GTPase-активирующий белок для GTPases семейства Rho, участвует в передаче сигналов рецептора N-метил-d-аспартата». Мол. Биол. Клетка. 14 (7): 2921–34. Дои:10.1091 / mbc.E02-09-0623. ЧВК  165687. PMID  12857875.
14. Moon SY, Zang H, Zheng Y (февраль 2003 г.). «Характеристика специфического для мозга белка, активирующего ГТФазу Rho, p200RhoGAP». J. Biol. Chem. 278 (6): 4151–9. Дои:10.1074 / jbc.M207789200. PMID  12454018.
15. Танигучи С., Лю Х., Накадзава Т., Ёкояма К., Тэдзука Т., Ямамото Т. (июнь 2003 г.). «p250GAP, нейральный белок RhoGAP, связан с Fyn и фосфорилируется им». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 306 (1): 151–5. Дои:10.1016 / S0006-291X (03) 00923-9. PMID  12788081.
16. Во Н., Клейн М.Е., Варламова О., Келлер Д.М., Ямамото Т., Гудман Р.Х., Импей С. (ноябрь 2005 г.). «МикроРНК, индуцированная связывающим белком цАМФ-элементом, регулирует морфогенез нейронов». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 102 (45): 16426–31. Дои:10.1073 / pnas.0508448102. ЧВК  1283476. PMID  16260724.

дальнейшее чтение

• Хаяси Т., Окабе Т., Насу-Нисимура Ю., Сакауэ Ф., Охвада С., Мацуура К., Акияма Т., Накамура Т. (2007). «PX-RICS, новый вариант сплайсинга RICS, является основной изоформой, экспрессируемой во время нейрального развития». Гены Клетки. 12 (8): 929–39. Дои:10.1111 / j.1365-2443.2007.01101.x. PMID  17663722. S2CID  22118853.
• Лим Дж., Хао Т., Шоу С., Патель А.Дж., Сабо Дж., Руал Дж.Ф., Фиск С.Дж., Ли Н., Смоляр А., Хилл Д.Е., Барабаши А.Л., Видал М., Зогби Х.Ю. (2006). «Сеть межбелкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Клетка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID  16713569. S2CID  13709685.
• Benzinger A, Muster N, Koch HB, Yates JR, Hermeking H (2005). «Целевой протеомный анализ 14-3-3 сигма, эффектора р53, который обычно подавляется при раке». Мол. Клетка. Протеомика. 4 (6): 785–95. Дои:10.1074 / mcp.M500021-MCP200. PMID  15778465.
• Накадзава Т., Ватабе А.М., Тэдзука Т., Ёсида Ю., Ёкояма К., Умемори Н., Иноуэ А., Окабе С., Манабе Т., Ямамото Т. (2004). «p250GAP, новый мозг, обогащенный GTPase-активирующим белком для GTPases семейства Rho, участвует в передаче сигналов рецептора N-метил-d-аспартата». Мол. Биол. Клетка. 14 (7): 2921–34. Дои:10.1091 / mbc.E02-09-0623. ЧВК  165687. PMID  12857875.
• Чжао Ч., Ма Х., Босси-Ветцель Э., Липтон С.А., Чжан З., Фэн Г.С. (2003). «GC-GAP, белок, активирующий ГТФазу семейства Rho, который взаимодействует с сигнальными адаптерами Gab1 и Gab2». J. Biol. Chem. 278 (36): 34641–53. Дои:10.1074 / jbc.M304594200. PMID  12819203.
• Танигучи С., Лю Х., Накадзава Т., Йокояма К., Тэдзука Т., Ямамото Т. (2003). «p250GAP, нейральный белок RhoGAP, связан с Fyn и фосфорилируется им». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 306 (1): 151–5. Дои:10.1016 / S0006-291X (03) 00923-9. PMID  12788081.
• Окабе Т., Накамура Т., Нисимура Ю.Н., Коху К., Охвада С., Моришита Ю., Акияма Т. (2003). «RICS, новый белок, активирующий ГТФазу для Cdc42 и Rac1, участвует в передаче сигналов рецепторами бета-катенин-N-кадгерина и N-метил-D-аспартата». J. Biol. Chem. 278 (11): 9920–7. Дои:10.1074 / jbc.M208872200. PMID  12531901.
• Гардинер Э.М., Пестонджамасп К.Н., Бол Б.П., Чемберлен С., Хан К.М., Бокоч Г.М. (2003). «Пространственный и временной анализ активации Rac при хемотаксисе живых нейтрофилов». Curr. Биол. 12 (23): 2029–34. Дои:10.1016 / S0960-9822 (02) 01334-9. PMID  12477392. S2CID  13589833.
• Moon SY, Zang H, Zheng Y (2003). «Характеристика специфического для мозга белка, активирующего ГТФазу Rho, p200RhoGAP». J. Biol. Chem. 278 (6): 4151–9. Дои:10.1074 / jbc.M207789200. PMID  12454018.
• Накамура Т., Комия М., Соне К., Хиросэ Э, Гото Н., Мори Х, Охта Й, Мори Н. (2003). «Grit, белок, активирующий GTPase для семейства Rho, регулирует расширение нейритов посредством ассоциации с рецептором TrkA и адапторными молекулами N-Shc и CrkL / Crk». Мол. Клетка. Биол. 22 (24): 8721–34. Дои:10.1128 / MCB.22.24.8721-8734.2002. ЧВК  139861. PMID  12446789.
• Накаяма М., Кикуно Р., Охара О. (2003). «Белковые взаимодействия между большими белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК». Genome Res. 12 (11): 1773–84. Дои:10.1101 / гр. 406902. ЧВК  187542. PMID  12421765.
• Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О. (1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XI. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (5): 277–86. Дои:10.1093 / днарес / 5.5.277. PMID  9872452.