Протокатехуат 3,4-диоксигеназа - Protocatechuate 3,4-dioxygenase
| протокатехуат 3,4-диоксигеназа | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Протокатехуат-3,4-диоксигеназный гетеро24мер, Pseudomonas putida | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 1.13.11.3 | ||||||||
| Количество CAS | 9029-47-4 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| IntEnz | Просмотр IntEnz | ||||||||
| БРЕНДА | BRENDA запись | ||||||||
| ExPASy | Просмотр NiceZyme | ||||||||
| КЕГГ | Запись в KEGG | ||||||||
| MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| PDB структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Генная онтология | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
В энзимология, а протокатехуат 3,4-диоксигеназа (ЕС 1.13.11.3 ) является фермент который катализирует то химическая реакция
- 3,4-дигидроксибензоат + O2 3-карбокси-цис, цис-муконат
Таким образом, два субстраты этого фермента являются 3,4-дигидроксибензоат (протокатеховая кислота ) и О2, тогда как его товар является 3-карбокси-цис, цис-муконат.
Этот фермент принадлежит к семейству оксидоредуктазы, особенно те, которые действуют на одиночных доноров с O2 как окислитель и включение двух атомов кислорода в субстрат (оксигеназы). В систематическое название этого класса ферментов протокатехуат: кислород-3,4-оксидоредуктаза (дециклизующийся). Другие широко используемые имена включают протокатехуатоксигеназа, оксидаза протокатеховой кислоты, протокатехическая 3,4-диоксигеназа, и протокатехическая 3,4-оксигеназа. Этот фермент участвует в разложение бензоата путем гидроксилирования и Разложение 2,4-дихлорбензоата. Здесь работает один кофактор, утюг.
Было обнаружено, что этот фермент эффективен для улучшения стабильности органических флуорофоров в экспериментах с одной молекулой.[1] Коммерческие препараты фермента, выделенного из Pseudomonas sp, обычно требуют дополнительной очистки для удаления сильной загрязняющей нуклеазной активности.
Структурные исследования
На конец 2007 года 37 структуры были решены для этого класса ферментов, с PDB коды доступа 1EO2, 1EO9, 1EOA, 1EOB, 1EOC, 1YKK, 1YKL, 1YKM, 1YKN, 1YKO, 1YKP, 2BUM, 2BUQ, 2BUR, 2НО, 2BUU, 2BUV, 2BUW, 2BUX, 2КУПИТЬ, 2БУЗ, 2BV0, 2PCD, 3PCA, 3PCB, 3PCC, 3PCD, 3PCE, 3PCF, 3PCG, 3ПЧ, 3PCI, 3PCJ, 3PCK, 3PCL, 3PCM, и 3PCN.
Смотрите также
Рекомендации
- ^ Aitken CE, Marshall RA, Puglisi JD (2008). «Система поглощения кислорода для улучшения стабильности красителя в экспериментах по флуоресценции одиночных молекул». Биофиз. J. 94 (5): 1826–1835. Bibcode:2008BpJ .... 94.1826A. Дои:10.1529 / biophysj.107.117689. ЧВК 2242739. PMID 17921203.
- Фудзисава Х., Хаяиси О. (1968). «Протокатехуат 3,4-диоксигеназа. I. Кристаллизация и характеристика». J. Biol. Chem. 243 (10): 2673–81. PMID 4967959.
- ГРОСС SR, GAFFORD RD, TATUM EL (1956). «Метаболизм протокатехиновой кислоты нейроспорой». J. Biol. Chem. 219 (2): 781–96. PMID 13319299.
- Stanier RY, Ingraham JL (1954). «Оксидаза протокатеховой кислоты». J. Biol. Chem. 210 (2): 799–820. PMID 13211618.
| Этот 1.13 по К.Э. фермент -связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |