Вырез 1 - Notch 1

NOTCH1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1ПБ5, 1ТОЗ, 1YYH, 2F8X, 2F8Y, 2HE0, 2VJ3, 3ETO, 3I08, 3L95, 3NBN, 3V79, 4CUD, 4CUE, 4CUF, 4D0E, 4D0F, 5FM9, 5FMA
Идентификаторы
Псевдонимы	NOTCH1, Notch1, 9930111A19Rik, Mis6, N1, Tan1, lin-12, AOS5, AOVD1, hN1, notch 1, notch рецептор 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 190198 MGI: 97363 ГомолоГен: 32049 Генные карты: NOTCH1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9q34.3 Начинать 136,494,433 бп[1] Конец 136,546,048 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 A3 | 2 18,91 см Начинать 26,457,903 бп[2] Конец 26,516,663 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов кальция • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Крепление с выемкой • GO: 0048551 активность ингибитора фермента • связывание ионов металлов • связывание ферментов • связывание хроматина • GO: 0001948 связывание с белками • последовательное связывание ДНК • активность гетеродимеризации белков • связывание хроматина с ДНК • активность трансмембранного сигнального рецептора • сигнальная активность рецептора • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • мембрана • стык • внеклеточная область • ядро клетки • поверхность клетки • апикальная плазматическая мембрана • эндоплазматический ретикулум • неотъемлемый компонент мембраны • аппарат Гольджи • рецепторный комплекс • клеточная мембрана • нуклеоплазма • Комплекс MAML1-RBP-Jkapp-ICN1 • периферия клетки • мембрана эндоплазматического ретикулума • Мембрана Гольджи • Акросома • цитоплазматический пузырек Биологический процесс • развитие гладкомышечных клеток сердечных сосудов • развитие энтодермы • морфогенез клапана легочной артерии • положительная регуляция дифференцировки эндотелиальных клеток • регуляция сомитогенеза • дифференцировка клеток в спинном мозге • отрицательная регуляция дифференцировки нейронов • регуляция сборки внеклеточного матрикса • развитие дистальных канальцев • отрицательная регуляция пролиферации глиальных клеток • переход эпителия в мезенхиму, участвующий в формировании эндокардиальной подушки • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • морфогенез аортального клапана • дифференцировка олигодендроцитов • морфогенез эндокарда • отрицательная регуляция дифференцировки остеобластов • отрицательная регуляция дифференцировки стволовых клеток • отрицательное регулирование окостенения • зацикливание сердца • отрицательная регуляция дифференцировки фоторецепторных клеток • дифференцировка артериальных эндотелиальных клеток • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II, участвующего в дифференцировке клеток-предшественников миокарда • морфогенез атриовентрикулярного клапана • Сигнальный путь Notch, участвующий в регуляции пролиферации вторичных кардиобластов поля сердца • гуморальный иммунный ответ • морфогенез передней кишки • отрицательная регуляция дифференцировки олигодендроцитов • положительное регулирование пролиферации клеток сердечной мышцы • регулирование процесса развития • развитие мезенхимальных клеток • регенерация органов животных • ангиогенез • сперматогенез • отрицательная регуляция дифференцировки про-В-клеток • регулирование пролиферации кардиобластов • морфогенез волосяного фолликула • васкулогенез, вовлеченный в морфогенез коронарных сосудов • отрицательная регуляция канонического сигнального пути Wnt • регуляция нейрогенеза • отрицательное регулирование пролиферации клеток • развитие собирательного протока • положительное регулирование пролиферации нейробластов • морфогенез ресничек • морфогенез трабекулы сердца • развитие атриовентрикулярного узла • отрицательная регуляция дифференцировки миобластов • обязательство клеточной судьбы • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • клеточный ответ на стимул фолликулостимулирующего гормона • развитие легких • отрицательная регуляция дифференцировки слуховых рецепторных клеток • морфогенез сердечной перегородки • морфогенез межжелудочковой перегородки • отрицательная регуляция дифференцировки клеток • морфогенез коронарной артерии • ответ на мурамилдипептид • морфогенез левого желудочка сердца • внутриутробное эмбриональное развитие • отрицательная регуляция гибели клеток • дифференцировка эндокардиальных клеток • транскрипция, ДНК-шаблон • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • развитие сердца • морфогенез эпителия предстательной железы • эмбриональный морфогенез конечностей • рост, участвующий в морфогенезе сердца • развитие нервной трубки • морфогенез перикарда • развитие эпидермиса • морфогенез сердечного предсердия • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • морфогенез правого предсердия сердца • отрицательная регуляция адгезии клетки к субстрату • миграция клеток, участвующих в формировании эндокардиальной подушки • дифференциация клеток • дифференцировка венозных эндотелиальных клеток • регуляция дифференцировки слуховых рецепторных клеток • GO: 0048553 отрицательная регуляция каталитической активности • воспалительный ответ на антигенный раздражитель • положительная регуляция дифференцировки астроцитов • положительная регуляция пролиферации эпителиальных клеток • формирование правого желудочка сердца • развитие эндокардиальной подушки • спецификация клеточной судьбы • положительная регуляция дифференцировки кератиноцитов • положительная регуляция дифференцировки глиальных клеток • отрицательная регуляция нейрогенеза • развитие гломерулярных мезангиальных клеток • прорастающий ангиогенез • дифференцировка глиальных клеток • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • пролиферация клеток сердечной мышцы • дифференцировка секреторных столбчатых люминарных эпителиальных клеток, участвующих в развитии ацинуса предстательной железы • положительная регуляция перехода эпителия в мезенхиму • морфогенез миокарда трабекулы желудочков • поддержание популяции нейрональных стволовых клеток • отрицательная регуляция миграции клеток, участвующих в прорастании ангиогенеза • ответ на липополисахарид • спецификация схемы отсека • иммунная реакция • дифференциация нейронов • эпителиально-мезенхимальный переход • положительная регуляция сигнального пути BMP • дифференциация клеток скелетных мышц • регуляция экспрессии генов • положительная регуляция репликации вирусного генома • регуляция пролиферации эпителиальных клеток, участвующих в развитии предстательной железы • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • морфогенез сердечного желудочка • морфогенез ветвления эпителиальной трубки • положительная регуляция каскада JAK-STAT • отрицательное регулирование аноикиса • Передача сигналов Notch участвует в развитии сердца • морфогенез коронарных вен • апоптотический процесс, вовлеченный в морфогенез эмбрионального пальца • регулирование миграции клеток • аксоногенез • регенерация тканей • положительное регулирование миграции клеток • деление соматических стволовых клеток • морфогенез ткани сердечной мышцы • отрицательная регуляция хемотаксиса эндотелиальных клеток • дифференцировка кератиноцитов • отрицательная регуляция сигнального пути BMP • морфогенез эндокардиальной подушки • развитие эндокарда • развитие многоклеточного организма • обязательство судьбы слуховых рецепторов • ответ на кортикостероиды • формирование трубки • определение левой / правой симметрии • дифференциация астроцитов • отрицательная регуляция кальций-зависимого экзоцитоза • развитие мозга • регулирование пролиферации клеток • положительное регулирование пролиферации клеток • отрицательная регуляция дифференцировки миотрубок • положительная регуляция апоптотического процесса • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II в ответ на гипоксию • формирование митрального клапана • развитие печени • формирование сердечной камеры • развитие переднего мозга • клеточный ответ на стимул фактора роста эндотелия сосудов • обязательство судьбы нейрона • регуляция пролиферации эпителиальных клеток • регуляция сигнального пути Notch • спецификация левой / правой оси • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • сердечный эпителиальный переход в мезенхимальный • эмбриональный морфогенез задних конечностей • положительная регуляция морфогенеза аорты • морфогенез венозных кровеносных сосудов • остановка клеточного цикла • Notch сигнальный путь • отрицательная регуляция экспрессии генов • отрицательное регулирование темпов роста • положительная регуляция передачи сигнала белка Ras • положительная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • позитивная регуляция транскрипции мишени рецептора Notch • положительная регуляция сигнального пути Notch • морфогенез тракта оттока • морфогенез клапана коронарного синуса • отрицательная регуляция пролиферации клеток, участвующих в морфогенезе сердечного клапана • отрицательная регуляция секреции составляющих внеклеточного матрикса • отрицательная регуляция гипертрофии сердечной мышцы • положительная регуляция экспрессии генов • гомеостаз количества клеток в ткани • отрицательная регуляция развития биоминеральной ткани • позитивная регуляция апоптотического процесса, участвующего в морфогенезе • положительная регуляция сердечного эпителиального перехода в мезенхиму • отрицательная регуляция термогенеза, вызванного холодом Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	4851	18128
Ансамбль	ENSG00000148400	ENSMUSG00000026923
UniProt	P46531	Q01705
RefSeq (мРНК)	NM_017617	NM_008714
RefSeq (белок)	NP_060087	NP_032740
Расположение (UCSC)	Chr 9: 136,49 - 136,55 Мб	Chr 2: 26,46 - 26,52 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Notch гомолог 1, связанный с транслокацией (Дрозофила), также известный как NOTCH1, это человек ген кодирование однопроходной трансмембраны рецептор.

Функция

Этот ген кодирует член Notch семья. Члены этого типа 1 трансмембранный белок семейство разделяет структурные характеристики, включая внеклеточный домен, состоящий из нескольких фактор роста эпидермиса -подобные (EGF) повторы, и внутриклеточный домен, состоящий из множества разных типов доменов. Члены семейства Notch играют роль во множестве процессов развития, контролируя решения о судьбе клеток. Сеть сигнализации Notch - это эволюционно сохраненный межклеточный сигнальный путь который регулирует взаимодействие между физически соседними клетками. В Дрозофила, notch взаимодействие с его клеточно-связанными лигандами (дельта, пильчатый) устанавливает межклеточный сигнальный путь, который играет ключевую роль в развитии. Гомологи notch-лигандов также были идентифицированы у людей, но точные взаимодействия между этими лигандами и человеческими гомологами notch еще предстоит определить. Этот белок расщепляется в сеть транс-Гольджи, и представлен на поверхности клетки в виде гетеродимера. Этот белок функционирует как рецептор для мембраносвязанных лигандов и может играть несколько ролей во время развития.^[5]

Дефицит может быть связан с двустворчатый аортальный клапан.^[6]

Есть данные, что активировали Notch 1 и Вырез 3 способствовать дифференцировке клеток-предшественников в астроглия.^[7] Notch 1, когда активирован до рождения, вызывает радиальная глия дифференциация,^[8] но постнатально вызывает дифференциацию в астроциты.^[9] Одно исследование показывает, что каскад Notch-1 активируется Reelin неустановленным способом.^[10] Reelin и Notch1 сотрудничают в разработке зубчатые извилины, согласно другому.^[11]

Взаимодействия

NOTCH1 был показан взаимодействовать с:

• GSK3B,^[12]
• Lck,^[13]
• MAML1,^[14][15]
• Матери против декапентаплегического гомолога 3^[16]
• NFKB1,^[17][18]
• Ноя,^[19]
• RBPJ,^[20][21]
• SNW1,^[22][23]
• Убиквитин С,^[24] и
• YY1.^[25]
• USP10.^[26]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000148400 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026923 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: NOTCH1, гомолог Notch 1, связанный с транслокацией (Drosophila)».
6. Маккеллар Ш., Тестер DJ, Ягубян М., Маджумдар Р., Акерман М. Дж., Сундт TM (август 2007 г.). «Новые мутации NOTCH1 у пациентов с заболеванием двустворчатого аортального клапана и аневризмами грудной аорты». J Thorac Cardiovasc Surg. 134 (2): 290–296. Дои:10.1016 / j.jtcvs.2007.02.041. PMID  17662764.
7. Танигаки К., Ногаки Ф., Такахаши Дж., Таширо К., Куроока Х., Хондзё Т. (январь 2001 г.). «Notch1 и Notch3 инструктивно ограничивают bFGF-чувствительные мультипотентные нейральные клетки-предшественники астроглиальной судьбой». Нейрон. 29 (1): 45–55. Дои:10.1016 / S0896-6273 (01) 00179-9. HDL:2433/150564. PMID  11182080. S2CID  17047028.
8. Gaiano N, Nye JS, Fishell G (май 2000 г.). «Радиальная глиальная идентичность обеспечивается передачей сигналов Notch1 в переднем мозге мыши». Нейрон. 26 (2): 395–404. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 81172-1. PMID  10839358. S2CID  15861936.
9. Chambers CB, Peng Y, Nguyen H, Gaiano N, Fishell G, Nye JS (март 2001 г.). «Пространственно-временная селективность ответа на сигналы Notch1 в предшественниках переднего мозга млекопитающих». Разработка. 128 (5): 689–702. PMID  11171394.
10. Кейлани С., Сугая К. (июль 2008 г.). «Рилин индуцирует фенотип радиальной глии в клетках-предшественниках нейронов человека путем активации Notch-1». BMC Dev. Биол. 8 (1): 69. Дои:10.1186 / 1471-213X-8-69. ЧВК  2447831. PMID  18593473.
11. Sibbe M, Förster E, Basak O, Taylor V, Frotscher M (июль 2009 г.). «Reelin и Notch1 сотрудничают в развитии зубчатой ​​извилины». J. Neurosci. 29 (26): 8578–85. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.0958-09.2009. ЧВК  6665659. PMID  19571148.
12. Foltz DR, Santiago MC, Berechid BE, Nye JS (июнь 2002 г.). «Киназа-3бета гликоген-синтазы модулирует передачу сигналов и стабильность notch». Curr. Биол. 12 (12): 1006–11. Дои:10.1016 / s0960-9822 (02) 00888-6. PMID  12123574. S2CID  15884556.
13. Саде Х, Кришна С, Зарин А (январь 2004 г.). «Антиапоптотический эффект Notch-1 требует p56lck-зависимой, Akt / PKB-опосредованной передачи сигналов в Т-клетках». J. Biol. Chem. 279 (4): 2937–44. Дои:10.1074 / jbc.M309924200. PMID  14583609. S2CID  42454311.
14. Wu L, Aster JC, Blacklow SC, Lake R, Artavanis-Tsakonas S, Griffin JD (декабрь 2000 г.). «MAML1, человеческий гомолог главного разума дрозофилы, является коактиватором транскрипции для рецепторов NOTCH». Nat. Genet. 26 (4): 484–9. Дои:10.1038/82644. PMID  11101851. S2CID  23335042.
15. У Л., Сун Т., Кобаяши К., Гао П, Гриффин Д. Д. (ноябрь 2002 г.). «Идентификация семейства основных транскрипционных коактиваторов для рецепторов notch млекопитающих». Мол. Клетка. Биол. 22 (21): 7688–700. Дои:10.1128 / mcb.22.21.7688-7700.2002. ЧВК  135662. PMID  12370315.
16. Blokzijl A, Dahlqvist C, Reissmann E, Falk A, Moliner A, Lendahl U, Ibáñez CF (ноябрь 2003 г.). «Перекрестная связь между сигнальными путями Notch и TGF-beta, опосредованная взаимодействием внутриклеточного домена Notch с Smad3». J. Cell Biol. 163 (4): 723–8. Дои:10.1083 / jcb.200305112. ЧВК  2173673. PMID  14638857.
17. Гуан Э., Ван Дж., Лаборда Дж., Норкросс М., Бауэрле, Пенсильвания, Хоффман Т. (май 1996 г.). «Связанный с Т-клеточным лейкозом человеческий Notch / гомолог Notch, связанный с транслокацией, обладает I-каппа-B-подобной активностью и физически взаимодействует с белками ядерного фактора-каппа-B в Т-клетках». J. Exp. Med. 183 (5): 2025–32. Дои:10.1084 / jem.183.5.2025. ЧВК  2192574. PMID  8642313.
18. Ван Дж., Шелли Л., Миле Л., Бойкинс Р., Норкросс Массачусетс, Гуань Е. (июль 2001 г.). «Notch-1 человека ингибирует активность NF-каппа B в ядре посредством прямого взаимодействия с участием нового домена». J. Immunol. 167 (1): 289–95. Дои:10.4049 / jimmunol.167.1.289. PMID  11418662. S2CID  22399328.
19. Сакамото К., Ямагути С., Андо Р., Мияваки А., Кабасава И., Такаги М., Ли К. Л., Пербал Б., Кацубе К. (август 2002 г.). «Белок сверхэкспрессированного гена нефробластомы (NOV / ccn3) связывается с внеклеточным доменом Notch1 и ингибирует дифференцировку миобластов через сигнальный путь Notch». J. Biol. Chem. 277 (33): 29399–405. Дои:10.1074 / jbc.M203727200. PMID  12050162. S2CID  26465428.
20. Нам Й., Вен А. П., Астер Дж. К., Блэклоу СК (июнь 2003 г.). «Структурные требования для сборки CSL.intracellular Notch1.Mastermind-like 1 комплекса транскрипционной активации». J. Biol. Chem. 278 (23): 21232–9. Дои:10.1074 / jbc.M301567200. PMID  12644465. S2CID  13637961.
21. Астер Дж. К., Робертсон Е. С., Хассерджян Р. П., Тернер Дж. Р., Кифф Е., Склар Дж. (Апрель 1997 г.). «Онкогенные формы NOTCH1, лишенные первичного сайта связывания для RBP-Jkappa или последовательностей ядерной локализации, сохраняют способность связываться с RBP-Jkappa и активировать транскрипцию». J. Biol. Chem. 272 (17): 11336–43. Дои:10.1074 / jbc.272.17.11336. PMID  9111040. S2CID  36236215.
22. Беатус П., Лундквист Дж., Оберг С., Педерсен К., Лендаль Ю. (июнь 2001 г.). «Происхождение области анкиринового повтора во внутриклеточных доменах Notch имеет решающее значение для регуляции активности промотора HES». Мех. Dev. 104 (1–2): 3–20. Дои:10.1016 / s0925-4773 (01) 00373-2. PMID  11404076. S2CID  9526831.
23. Чжоу С., Фудзимуро М., Се Дж.Дж., Чен Л., Миямото А., Вайнмастер Г., Хейворд С.Д. (апрель 2000 г.). «SKIP, CBF1-ассоциированный белок, взаимодействует с доменом анкиринового повтора NotchIC, чтобы облегчить функцию NotchIC». Мол. Клетка. Биол. 20 (7): 2400–10. Дои:10.1128 / mcb.20.7.2400-2410.2000. ЧВК  85419. PMID  10713164.
24. Частагнер П., Израэль А., Броу С. (2008). «AIP4 / Itch регулирует деградацию рецептора Notch в отсутствие лиганда». PLOS ONE. 3 (7): e2735. Bibcode:2008PLoSO ... 3.2735C. Дои:10.1371 / journal.pone.0002735. ЧВК  2444042. PMID  18628966.
25. Yeh TS, Lin YM, Hsieh RH, Tseng MJ (октябрь 2003 г.). «Ассоциация фактора транскрипции YY1 с высокомолекулярным комплексом Notch подавляет трансактивационную активность Notch». J. Biol. Chem. 278 (43): 41963–9. Дои:10.1074 / jbc.M304353200. PMID  12913000. S2CID  23574059.
26. Lim R, Sugino T, Nolte H, Andrade J, Zimmermann B, Shi C, Doddaballapur A, Ong YT, Wilhelm K, Fasse JW, Ernst A, Kaulich M, Husnjak K, Boettger T, Guenther S, Braun T, Krüger M , Benedito R, Dikic I, Potente M (апрель 2019 г.). «Деубиквитиназа USP10 регулирует передачу сигналов Notch в эндотелии». Наука. 364 (6436): 188–193. Bibcode:2019Научный ... 364..188Л. Дои:10.1126 / science.aat0778 (неактивно 12.10.2020). PMID  30975888.

дальнейшее чтение

• Artavanis-Tsakonas S, Rand MD, Lake RJ (1999). «Передача сигналов Notch: контроль клеточной судьбы и интеграция сигналов в развитии». Наука. 284 (5415): 770–6. Bibcode:1999Научный ... 284..770А. Дои:10.1126 / science.284.5415.770. PMID  10221902.
• Мумм Дж. С., Копан Р. (2001). «Сигнализация Notch: снаружи внутрь». Dev. Биол. 228 (2): 151–65. Дои:10.1006 / dbio.2000.9960. PMID  11112321.
• Allenspach EJ, Maillard I, Aster JC, Pear WS (2003). «Передача сигналов Notch при раке». Cancer Biol. Ther. 1 (5): 466–76. Дои:10.4161 / cbt.1.5.159. PMID  12496471. S2CID  1328739.
• Астер JC (2006). «Дерегулированная передача сигналов NOTCH при остром Т-клеточном лимфобластном лейкозе / лимфоме: новые идеи, вопросы и возможности». Int. J. Hematol. 82 (4): 295–301. Дои:10.1532 / IJH97.05096. PMID  16298817. S2CID  32528011.

внешняя ссылка

• NOTCH1 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• NOTCH1