Вырез 3 - Notch 3

NOTCH3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4ZLP, 5CZX, 5CZV
Идентификаторы
Псевдонимы	NOTCH3, CADASIL, CASIL, IMF2, LMNS, CADASIL1, выемка 3, рецептор выемки 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 600276 MGI: 99460 ГомолоГен: 376 Генные карты: NOTCH3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19п13.12 Начинать 15,159,038 бп[1] Конец 15,200,995 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 B1 | 17 17,37 см Начинать 32,120,820 бп[2] Конец 32,166,852 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов кальция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ферментов • связывание кадгерина • идентичное связывание с белками • сигнальная активность рецептора Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана • Мембрана Гольджи • рецепторный комплекс • клеточная мембрана • нуклеоплазма • внеклеточная область • актиновый цитоскелет • ядро клетки • цитозоль • поверхность клетки Биологический процесс • Notch сигнальный путь • дифференциация клеток • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция дифференцировки нейронов • отрицательная регуляция дифференцировки клеток • гломерулярное капиллярное образование • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • развитие многоклеточного организма • морфогенез артерии • развитие переднего мозга • обязательство судьбы нейрона • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • положительное регулирование пролиферации гладкомышечных клеток • регулирование процесса развития • положительная регуляция транскрипции мишени рецептора Notch • Процессинг рецептора Notch, лиганд-зависимый • отрицательная регуляция сигнального пути Notch Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	4854	18131
Ансамбль	ENSG00000074181	ENSMUSG00000038146
UniProt	Q9UM47	Q61982
RefSeq (мРНК)	NM_000435	NM_008716
RefSeq (белок)	NP_000426	NP_032742
Расположение (UCSC)	Chr 19: 15.16 - 15,2 Мб	Chr 17: 32.12 - 32.17 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Нейрогенный белок-гомолог notch локуса 3 это белок что у людей кодируется NOTCH3 ген.^[5][6]

Функция

Этот ген кодирует третий обнаруженный человеческий гомолог выемки мембранного белка Drosophilia melanogaster типа I. При дрозофилии взаимодействие notch с его клеточно-связанными лигандами (дельта, зубчатый) устанавливает межклеточный сигнальный путь, который играет ключевую роль в развитии нервной системы. Гомологи notch-лигандов также были идентифицированы у человека, но точные взаимодействия между этими лигандами и гомологами notch человека еще предстоит определить.

Патология

Микрофотография показывая КАДАСИЛ с Notch 3 иммуноокрашивание.

Мутации в NOTCH3 были идентифицированы как основная причина церебральной аутосомно-доминантной артериопатии с подкорковыми инфарктами и лейкоэнцефалопатией (КАДАСИЛ ).^[6] Мутации в NOTCH3 также были выявлены в турецкой семье с болезнью Альцгеймера.^[7] Взрослые мыши с нокаутом Notch3 обнаруживают неполное созревание нейронов в спинном роге спинного мозга, что приводит к необратимому увеличению ноцицептивной чувствительности.^[8]Мутации в NOTCH3 связаны с синдром бокового менингоцеле.^[9]

Фармацевтическая цель

Notch3 исследуется как мишень для противораковых препаратов, поскольку он сверхэкспрессируется при нескольких типах рака.^[10] Ранние клинические испытания Pfizer PF-06650808, антитело против Notch3, связанное с цитотоксическим препаратом, продемонстрировало эффективность против солидных опухолей.^[11]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000074181 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038146 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Сугая К., Фукагава Т., Мацумото К., Мита К., Такахаши Э., Андо А., Иноко Х., Икемура Т. (15 сентября 1994 г.). «Три гена в области MHC класса III человека рядом с соединением с классом II: ген рецептора конечных продуктов гликозилирования, ген гомеобокса PBX2 и гомолог notch, человеческий аналог гена опухоли молочной железы мыши int-3». Геномика. 23 (2): 408–19. Дои:10.1006 / geno.1994.1517. PMID  7835890.
6. «Ген Entrez: NOTCH3 Notch гомолог 3 (Drosophila)».
7. Геррейро Р.Дж., Ломанн Э., Кинселла Э., Брас Дж. М., Луу Н., Гурунлиан Н., Дурсун Б., Билджик Б., Сантана I, Ханагаси Х., Гурвит Х., Гиббс Дж. Р., Оливейра С., Эмре М., Синглтон А. (2012). «Секвенирование экзома выявляет неожиданную генетическую причину заболевания: мутацию NOTCH3 в турецкой семье с болезнью Альцгеймера». Neurobiol. Старение. 33 (5): 1008.e17–23. Дои:10.1016 / j.neurobiolaging.2011.10.009. ЧВК  3306507. PMID  22153900.
8. Русанеску Г., Мао Дж. (2014). «Notch3 необходим для дифференцировки и созревания нейронов в спинном мозге взрослого человека». J. Cell. Мол. Med. 18 (10): 2103–16. Дои:10.1111 / jcmm.12362. ЧВК  4244024. PMID  25164209.
9. Грипп К.В., Роббинс К.М., Собрейра Н.Л., Витмер П.Д., Берд Л.М., Авела К., Макити О, Алвес Д., Хоге Дж.С., Закай Е.Х., Доэни К.Ф., Стейбли Д.Л., Сол-Черч К. (2014). «Усекающие мутации в последнем экзоне NOTCH3 вызывают синдром латерального менингоцеле». Являюсь. J. Med. Genet. А. 167A (2): 271–81. Дои:10.1002 / ajmg.a.36863. ЧВК  5589071. PMID  25394726.
10. Пуров, Б. (2012). «Ингибирование Notch как многообещающий новый подход к терапии рака». Передача сигналов Notch в эмбриологии и раке. Успехи экспериментальной медицины и биологии. 727. С. 305–319. Дои:10.1007/978-1-4614-0899-4_23. ISBN  978-1-4614-0898-7. ЧВК  3361718. PMID  22399357.
11. http://adcreview.com/pfizer-adc-development-overview-2016/

дальнейшее чтение

• Льюис Дж (1996). «Нейрогенные гены и нейрогенез позвоночных». Curr. Мнение. Нейробиол. 6 (1): 3–10. Дои:10.1016 / S0959-4388 (96) 80002-X. PMID  8794055. S2CID  2921624.
• Joutel A, Tournier-Lasserve E (2002). «[Молекулярные основы и физиопатогенетические механизмы CADASIL: модель заболеваний мелких сосудов головного мозга]». J. Soc. Биол. 196 (1): 109–15. Дои:10.1051 / jbio / 2002196010109. PMID  12134625.
• Guidetti D, Casali B, Mazzei RL, Dotti MT (2006). «Церебральная аутосомно-доминантная артериопатия с подкорковыми инфарктами и лейкоэнцефалопатией». Clin. Exp. Гипертоническая болезнь. 28 (3–4): 271–7. Дои:10.1080/10641960600549223. PMID  16833034. S2CID  360190.
• Белейл О.М., Микки М.Р., Терасаки П.И. (1972). «Сравнение выживаемости мужских и женских трансплантатов почки». Трансплантация. 13 (5): 493–500. Дои:10.1097/00007890-197205000-00008. PMID  4557798. S2CID  32855236.
• Ларссон С, Ларделли М, Уайт I, Лендаль У (1994). «Гены NOTCH1, 2 и 3 человека расположены в положениях хромосом 9q34, 1p13-p11 и 19p13.2-p13.1 в областях транслокации, связанной с неоплазией». Геномика. 24 (2): 253–8. Дои:10.1006 / geno.1994.1613. PMID  7698746.
• Tournier-Lasserve E, Joutel A, Melki J, Weissenbach J, Lathrop GM, Chabriat H, Mas JL, Cabanis EA, Baudrimont M, Maciazek J (1993). «Церебральная аутосомно-доминантная артериопатия с подкорковыми инфарктами и лейкоэнцефалопатией отображается на хромосоме 19q12». Nat. Genet. 3 (3): 256–9. Дои:10.1038 / ng0393-256. PMID  8485581. S2CID  13031278.
• Joutel A, Corpechot C, Ducros A, Vahedi K, Chabriat H, Mouton P, Alamowitch S, Domenga V, Cécillion M, Marechal E, Maciazek J, Vayssiere C, Cruaud C, Cabanis EA, Ruchoux MM, Weissenbach J, Bach JF , Bousser MG, Tournier-Lasserve E (1996). «Мутации Notch3 в CADASIL, наследственном заболевании взрослых, вызывающем инсульт и деменцию». Природа. 383 (6602): 707–10. Bibcode:1996Натура.383..707J. Дои:10.1038 / 383707a0. PMID  8878478. S2CID  4351873.
• Joutel A, Vahedi K, Corpechot C, Troesch A, Chabriat H, Vayssière C, Cruaud C, Maciazek J, Weissenbach J, Bousser MG, Bach JF, Tournier-Lasserve E (1997). «Сильная кластеризация и стереотипный характер мутаций Notch3 у пациентов с CADASIL». Ланцет. 350 (9090): 1511–5. Дои:10.1016 / S0140-6736 (97) 08083-5. PMID  9388399. S2CID  38044421.
• Грей Г.Е., Манн Р.С., Мициадис Э., Энрике Д., Каркангиу М.Л., Бэнкс А, Лейман Дж., Уорд Д., Иш-Горовиц Д., Артаванис-Цаконас С. (1999). «Человеческие лиганды рецептора Notch». Являюсь. Дж. Патол. 154 (3): 785–94. Дои:10.1016 / S0002-9440 (10) 65325-4. ЧВК  1866435. PMID  10079256.
• Joutel A, Andreux F, Gaulis S, Domenga V, Cecillon M, Battail N, Piga N, Chapon F, Godfrain C, Tournier-Lasserve E (2000). «Эктодомен рецептора Notch3 накапливается в сосудистой сети головного мозга пациентов с CADASIL». J. Clin. Вкладывать деньги. 105 (5): 597–605. Дои:10.1172 / JCI8047. ЧВК  289174. PMID  10712431.
• Joutel A, Dodick DD, Parisi JE, Cecillon M, Tournier-Lasserve E, Bousser MG (2000). «Мутация de novo в гене Notch3, вызывающая CADASIL». Анна. Neurol. 47 (3): 388–91. Дои:10.1002 / 1531-8249 (200003) 47: 3 <388 :: AID-ANA19> 3.0.CO; 2-Q. PMID  10716263.
• Joutel A, Chabriat H, Vahedi K, Domenga V, Vayssière C, Ruchoux MM, Lucas C, Leys D, Bousser MG, Tournier-Lasserve E (2000). «Мутация сайта сплайсинга, вызывающая делецию Notch3 в рамке считывания семи аминокислот в CADASIL». Неврология. 54 (9): 1874–5. Дои:10.1212 / wnl.54.9.1874. PMID  10802807. S2CID  19374887.
• Симидзу К., Чиба С., Сайто Т., Кумано К., Хираи Х. (2000). «Физическое взаимодействие Delta1, Jagged1 и Jagged2 с рецепторами Notch1 и Notch3». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 276 (1): 385–9. Дои:10.1006 / bbrc.2000.3469. PMID  11006133.
• Wu L, Aster JC, Blacklow SC, Lake R, Artavanis-Tsakonas S, Griffin JD (2000). «MAML1, человеческий гомолог главного разума дрозофилы, является коактиватором транскрипции для рецепторов NOTCH». Nat. Genet. 26 (4): 484–9. Дои:10.1038/82644. PMID  11101851. S2CID  23335042.
• Беатус П., Лундквист Дж, Оберг С., Педерсен К., Лендаль У. (2001). «Происхождение области анкиринового повтора во внутриклеточных доменах Notch имеет решающее значение для регуляции активности промотора HES». Мех. Dev. 104 (1–2): 3–20. Дои:10.1016 / S0925-4773 (01) 00373-2. PMID  11404076. S2CID  9526831.
• Saxena MT, Schroeter EH, Mumm JS, Kopan R (2001). «Гомологи мышей notch (N1-4) подвергаются пресенилин-зависимому протеолизу». J. Biol. Chem. 276 (43): 40268–73. Дои:10.1074 / jbc.M107234200. PMID  11518718.
• Оливери Р.Л., Мулья М., Де Стефано Н., Маццеи Р., Лабате А., Конфорти А.Л., Патитуччи А., Габриэле А.Л., Тагарелли Г., Магариелло А., Заппиа М., Гамбарделла А., Федерико А., Кваттрон А. (2001). «Новая мутация в гене Notch3 в итальянской семье с церебральной аутосомно-доминантной артериопатией с подкорковыми инфарктами и лейкоэнцефалопатией: результаты генетической и магнитно-резонансной спектроскопии». Arch. Neurol. 58 (9): 1418–22. Дои:10.1001 / archneur.58.9.1418. PMID  11559313.
• Дичганс М, Херцог Дж, Гассер Т (2001). «Мутация NOTCH3 с участием трех остатков цистеина в семье с типичным CADASIL». Неврология. 57 (9): 1714–7. Дои:10.1212 / wnl.57.9.1714. PMID  11706120. S2CID  21180235.

внешняя ссылка

• NOTCH3 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)