MRE11A - MRE11A

MRE11
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3T1I
Идентификаторы
Псевдонимы	MRE11, ATLD, HNGS1, MRE11B, MRE11A, гомолог A MRE11, нуклеаза репарации двухцепочечного разрыва, гомолог MRE11, нуклеаза репарации двухцепочечного разрыва
Внешние идентификаторы	OMIM: 600814 MGI: 1100512 ГомолоГен: 4083 Генные карты: MRE11
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q21 Начните 94,415,578 бп[1] Конец 94,493,908 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 | 9 A2 Начните 14,784,654 бп[2] Конец 14,837,123 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • связывание ионов марганца • GO: 0004003 ДНК-геликазная активность • эндодезоксирибонуклеазная активность одноцепочечной ДНК • связывание с С-концом белка • GO: 0001948 связывание с белками • 3'-5 'экзонуклеазная активность • нуклеазная активность • эндонуклеазная активность • связывание двухцепочечной ДНК • эндодезоксирибонуклеазная активность • экзонуклеазная активность • гидролазная активность • связывание кадгерина • идентичное связывание с белками • 3'-5'-экзодезоксирибонуклеазная активность • 5'-3 'экзонуклеазная активность Сотовый компонент • место двухцепочечного разрыва • цитозоль • Тело PML • ядерная хромосома, теломерная область • ядро клетки • цитоплазма • нуклеоплазма • хромосома, теломерная область • хромосома • Комплекс МРЭ11 • вилка репликации Биологический процесс • реципрокная мейотическая рекомбинация • Рекомбинация ДНК • поддержание теломер через теломеразу • положительная регуляция киназной активности • контрольная точка повреждения ДНК внутри S • теломерное 3 'выступающее образование • отрицательная регуляция апоптотического процесса • хромосомная организация • сцепление сестринских хроматид • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • положительная регуляция поддержания теломер • Раскрутка дуплекса ДНК • синапсис • отрицательная регуляция эндоредупликации ДНК • восстановление двухниточного разрыва • GO: 0007126 мейотический клеточный цикл • репарация двухцепочечного разрыва посредством гомологичной рекомбинации • положительная регуляция аутофосфорилирования белков • клеточная пролиферация • контрольная точка митотического повреждения ДНК G2 • GO: 0022415 вирусный процесс • восстановление двухцепочечного разрыва за счет негомологичного соединения концов • положительное регулирование выработки интерферона I типа • регуляция митотической рекомбинации • Ремонт ДНК • гидролиз фосфодиэфирной связи нуклеиновой кислоты • Обработка двухцепочечных разрывов ДНК • смещение прядей • Репликация ДНК • Синтез ДНК, участвующий в репарации ДНК • регуляция передачи сигнала медиатором класса p53 • поддержание теломер • образование двухцепочечного разрыва мейотической ДНК • репарация двухцепочечных разрывов митохондрий посредством гомологичной рекомбинации • Резекция нити ДНК, участвующая в обработке репликационной вилки Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	4361	17535
Ансамбль	ENSG00000020922	ENSMUSG00000031928
UniProt	P49959	Q61216
RefSeq (мРНК)	NM_005590 NM_005591 NM_001330347	NM_018736 NM_001310728
RefSeq (белок)	NP_001317276 NP_005581 NP_005582	NP_001297657 NP_061206
Расположение (UCSC)	Chr 11: 94,42 - 94,49 Мб	Chr 9: 14,78 - 14,84 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок восстановления двухцепочечных разрывов MRE11 является фермент что у людей кодируется MRE11 ген.^[5] Ген был обозначен MRE11A отличить его от псевдогена MRE11B что в наши дни называется MRE11P1.

Функция

Этот ген кодирует ядерный белок, участвующий в гомологичная рекомбинация, теломер поддержание длины и ДНК двухниточный разрыв ремонт. Сам по себе белок имеет от 3 до 5 футов. экзонуклеаза деятельность и эндонуклеаза Мероприятия. Белок образует комплекс с RAD50 гомолог; этот комплекс необходим для негомологичное соединение концов ДНК и обладает повышенной однонитевой эндонуклеазной активностью ДНК и экзонуклеазной активностью от 3 'до 5'. В сочетании с ДНК лигаза, этот белок способствует соединению некомплементарных концов in vitro, используя короткие гомологии около концов фрагментов ДНК. Этот ген имеет псевдоген на хромосома 3. Альтернативная сварка этого гена приводит к двум вариантам транскрипта, кодирующим разные изоформы.^[6]

Ортологи

Mre11, ортолог MRE11 человека, встречается в прокариот Археон Sulfolobus acidocaldarius.^[7] В этом организме белок Mre11 взаимодействует с Rad50 белка и, по-видимому, играет активную роль в восстановлении Повреждения ДНК экспериментально введено гамма-излучением.^[7] Точно так же во время мейоза в эукариотический протист Тетрахимена Mre11 необходим для восстановления повреждений ДНК, в данном случае двухниточные разрывы,^[8] с помощью процесса, который, вероятно, включает гомологичная рекомбинация. Эти наблюдения предполагают, что человеческий MRE11 произошел от прокариотических и предковых белков Mre11, которые играли роль в ранних процессах восстановления повреждений ДНК.

Сверхэкспрессия при раке

MRE11 играет роль в соединение концов, опосредованное микрогомологией (MMEJ) ремонт двунитевых разрывов. Это один из 6 ферментов, необходимых для этого пути репарации ДНК, подверженного ошибкам.^[9] MRE11 чрезмерно экспрессируется при раке груди.^[10]

Ракам очень часто не хватает экспрессии одного или нескольких генов репарации ДНК, но сверхэкспрессия гена репарации ДНК менее обычна при раке. Например, по крайней мере 36 ферментов репарации ДНК при мутационном дефекте в клетках зародышевой линии вызывают повышенный риск рака (наследственный онкологические синдромы ).^{[нужна цитата ]} (Также см Расстройство дефицита репарации ДНК.) Аналогично, по крайней мере, 12 генов репарации ДНК часто оказывались эпигенетически репрессированными при одном или нескольких раковых заболеваниях.^{[нужна цитата ]} (Смотрите также Эпигенетически уменьшенная репарация ДНК и рак.) Обычно недостаточная экспрессия фермента репарации ДНК приводит к увеличению нереставрированных повреждений ДНК, которые из-за ошибок репликации (транслезионный синтез ), приводят к мутациям и раку. Однако MRE11 опосредовано MMEJ восстановление очень неточно, поэтому в этом случае чрезмерная экспрессия, а не недостаточная экспрессия, по-видимому, приводит к раку.

Взаимодействия

MRE11 был показан взаимодействовать с участием:

• Банкомат,^[11][12]
• BRCA1,^{[12][13][14][15]}
• Ku70,^[16]
• MDC1,^[17]
• NBN,^{[12][18][19][20][21]}
• Rad50,^{[12][13][16][18][22]} и
• TERF2.^[23]

Смотрите также

• Гомологичная рекомбинация

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000020922 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031928 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Петрини Дж. Х., Уолш М. Е., Димар С., Чен XN, Коренберг Дж. Р., Уивер Д. Т. (февраль 1996 г.). «Выделение и характеристика человеческого гомолога MRE11». Геномика. 29 (1): 80–6. Дои:10.1006 / geno.1995.1217. PMID  8530104.
6. "Ген Entrez: MRE11 MRE11 мейотическая рекомбинация 11, гомолог A (S. cerevisiae)".
7. Квайзер А, Константинеско Ф, Белый М. Ф., Фортер П, Эли С. (2008). «Белок Mre11 взаимодействует как с Rad50, так и с биполярной геликазой HerA и рекрутируется в ДНК после гамма-облучения в архее Sulfolobus acidocaldarius». BMC Mol. Биол. 9: 25. Дои:10.1186/1471-2199-9-25. ЧВК  2288612. PMID  18294364.
8. Лукашевич А., Ховард-Тилль Р.А., Новачкова М., Мочизуки К., Лоидл Дж. (Октябрь 2010 г.). «MRE11 и COM1 / SAE2 необходимы для восстановления двухцепочечных разрывов и эффективного спаривания хромосом во время мейоза протиста Tetrahymena». Хромосома. 119 (5): 505–18. Дои:10.1007 / s00412-010-0274-9. PMID  20422424. S2CID  12642689.
9. Шарма С., Джавадекар С.М., Пандей М., Шривастава М., Кумари Р., Рагхаван С.К. (2015). «Гомология и ферментативные требования к альтернативному соединению концов в зависимости от микрогомологии». Cell Death Dis. 6 (3): e1697. Дои:10.1038 / cddis.2015.58. ЧВК  4385936. PMID  25789972.
10. Юань С.С., Хоу М.Ф., Се Ю.К., Хуанг С.Й., Ли Ю.С., Чен Ю.Дж., Ло С. (2012). «Роль MRE11 в пролиферации клеток, опухолевой инвазии и репарации ДНК при раке груди». J. Natl. Институт рака. 104 (19): 1485–502. Дои:10.1093 / jnci / djs355. PMID  22914783.
11. Ким С.Т., Лим Д.С., Канман CE, Кастан МБ (1999). «Субстратные особенности и идентификация предполагаемых субстратов членов семейства киназ ATM». J. Biol. Chem. 274 (53): 37538–43. Дои:10.1074 / jbc.274.53.37538. PMID  10608806.
12. Ван И, Кортез Д., Язди П., Нефф Н., Элледж С. Дж., Цинь Дж. (2000). «BASC, суперкомплекс белков, связанных с BRCA1, участвующих в распознавании и восстановлении аберрантных структур ДНК». Genes Dev. 14 (8): 927–39. Дои:10.1101 / gad.14.8.927 (неактивно 11.10.2020). ЧВК  316544. PMID  10783165.
13. Чиба Н., Парвин Дж. Д. (2001). «Перераспределение BRCA1 среди четырех различных белковых комплексов после блокировки репликации». J. Biol. Chem. 276 (42): 38549–54. Дои:10.1074 / jbc.M105227200. PMID  11504724.
14. Паулл Т.Т., Кортез Д., Бауэрс Б., Элледж С.Дж., Геллерт М. (2001). «Прямое связывание ДНК с помощью Brca1». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (11): 6086–91. Дои:10.1073 / pnas.111125998. ЧВК  33426. PMID  11353843.
15. Чжун Кью, Чен С.Ф., Ли С., Чен И, Ван СС, Сяо Дж., Чен П.Л., Шарп З.Д., Ли У.Х. (1999). «Ассоциация BRCA1 с комплексом hRad50-hMre11-p95 и ответ на повреждение ДНК». Наука. 285 (5428): 747–50. Дои:10.1126 / science.285.5428.747. PMID  10426999.
16. Goedecke W, Eijpe M, Offenberg HH, van Aalderen M, Heyting C (1999). «Mre11 и Ku70 взаимодействуют в соматических клетках, но по-разному экспрессируются в раннем мейозе». Nat. Genet. 23 (2): 194–8. Дои:10.1038/13821. PMID  10508516. S2CID  13443404.
17. Сюй X, Стерн Д.Ф. (2003). «NFBD1 / MDC1 регулирует индуцированное ионизирующим излучением формирование фокуса посредством передачи сигналов контрольной точки ДНК и факторов восстановления». FASEB J. 17 (13): 1842–8. Дои:10.1096 / fj.03-0310com. PMID  14519663. S2CID  24870579.
18. Трухильо К.М., Юань С.С., Ли ЭЙ, Сун П. (1998). «Нуклеазная активность в комплексе факторов рекомбинации и репарации ДНК человека Rad50, Mre11 и p95». J. Biol. Chem. 273 (34): 21447–50. Дои:10.1074 / jbc.273.34.21447. PMID  9705271.
19. Cerosaletti KM, Concannon P (2003). «Связанный с нибриновой вилкой домен и С-концевой домен рака молочной железы необходимы для формирования ядерного фокуса и фосфорилирования». J. Biol. Chem. 278 (24): 21944–51. Дои:10.1074 / jbc.M211689200. PMID  12679336.
20. Мацудзаки К., Синохара А., Синохара М. (2008). «Связанный с вилкой домен дрожжевого Xrs2, гомолога человеческого Nbs1, способствует негомологичному соединению концов через взаимодействие с белком-партнером лигазы IV, Lif1». Генетика. 179 (1): 213–25. Дои:10.1534 / генетика.107.079236. ЧВК  2390601. PMID  18458108.
21. Desai-Mehta A, Cerosaletti KM, Concannon P (2001). «Определенные функциональные домены нибрина опосредуют связывание Mre11, формирование фокуса и ядерную локализацию». Мол. Cell. Биол. 21 (6): 2184–91. Дои:10.1128 / MCB.21.6.2184-2191.2001. ЧВК  86852. PMID  11238951.
22. Долганов GM, Мазер RS, Новиков A, Tosto L, Chong S, Bressan DA, Petrini JH (1996). «Человеческий Rad50 физически связан с человеческим Mre11: идентификация консервативного мультибелкового комплекса, участвующего в рекомбинационной репарации ДНК». Мол. Cell. Биол. 16 (9): 4832–41. Дои:10.1128 / MCB.16.9.4832. ЧВК  231485. PMID  8756642.
23. Чжу XD, Кюстер Б., Манн М., Петрини Дж. Х., де Ланге Т. (2000). «Регулируемая клеточным циклом ассоциация RAD50 / MRE11 / NBS1 с TRF2 и теломерами человека». Nat. Genet. 25 (3): 347–52. Дои:10.1038/77139. PMID  10888888. S2CID  6689794.

дальнейшее чтение

• Долганов Г.М., Мазер Р.С., Новиков А.В. и др. (1996). «Человеческий Rad50 физически связан с человеческим Mre11: идентификация консервативного мультибелкового комплекса, участвующего в рекомбинационной репарации ДНК». Мол. Cell. Биол. 16 (9): 4832–41. Дои:10.1128 / MCB.16.9.4832. ЧВК  231485. PMID  8756642.
• Карни Дж. П., Мазер Р. С., Оливарес Х. и др. (1998). «Белковый комплекс hMre11 / hRad50 и синдром разрыва Неймегена: связь репарации двухцепочечных разрывов с ответом на повреждение клеточной ДНК». Ячейка. 93 (3): 477–86. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81175-7. PMID  9590181. S2CID  14548642.
• Паулл Т. Т., Геллерт М (1998). «3'-5'-экзонуклеазная активность Mre 11 способствует репарации двухцепочечных разрывов ДНК». Мол. Ячейка. 1 (7): 969–79. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80097-0. PMID  9651580.
• Трухильо К.М., Юань С.С., Ли ЭЙ, Сун П. (1998). «Нуклеазная активность в комплексе факторов рекомбинации и репарации ДНК человека Rad50, Mre11 и p95». J. Biol. Chem. 273 (34): 21447–50. Дои:10.1074 / jbc.273.34.21447. PMID  9705271.
• Chamankhah M, Wei YF, Xiao W (1999). «Выделение hMRE11B: неспособность компенсировать дефекты дрожжевого mre11 из-за видоспецифических белковых взаимодействий». Ген. 225 (1–2): 107–16. Дои:10.1016 / S0378-1119 (98) 00530-7. PMID  9931460.
• Чжун К., Чен К.Ф., Ли С. и др. (1999). «Ассоциация BRCA1 с комплексом hRad50-hMre11-p95 и ответ на повреждение ДНК». Наука. 285 (5428): 747–50. Дои:10.1126 / science.285.5428.747. PMID  10426999.
• Goedecke W, Eijpe M, Offenberg HH и др. (1999). «Mre11 и Ku70 взаимодействуют в соматических клетках, но по-разному экспрессируются в раннем мейозе». Nat. Genet. 23 (2): 194–8. Дои:10.1038/13821. PMID  10508516. S2CID  13443404.
• Ким С.Т., Лим Д.С., Канман CE, Кастан МБ (2000). «Субстратные особенности и идентификация предполагаемых субстратов членов семейства киназ ATM». J. Biol. Chem. 274 (53): 37538–43. Дои:10.1074 / jbc.274.53.37538. PMID  10608806.
• Стюарт Г.С., Мазер Р.С., Станкович Т. и др. (2000). «Ген репарации двухцепочечных разрывов ДНК hMRE11 мутирован у людей с заболеванием, подобным атаксии-телеангиэктазии». Ячейка. 99 (6): 577–87. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81547-0. PMID  10612394. S2CID  14434655.
• Ван И, Кортез Д., Язди П. и др. (2000). «BASC, суперкомплекс белков, связанных с BRCA1, участвующих в распознавании и восстановлении аберрантных структур ДНК». Genes Dev. 14 (8): 927–39. Дои:10.1101 / gad.14.8.927 (неактивно 11.10.2020). ЧВК  316544. PMID  10783165.
• Гатеи М., Янг Д., Серосалетти К.М. и др. (2000). «АТМ-зависимое фосфорилирование нибрина в ответ на радиационное воздействие». Nat. Genet. 25 (1): 115–9. Дои:10.1038/75508. PMID  10802669. S2CID  23521589.
• Чжу XD, Кюстер Б., Манн М. и др. (2000). «Регулируемая клеточным циклом ассоциация RAD50 / MRE11 / NBS1 с TRF2 и теломерами человека». Nat. Genet. 25 (3): 347–52. Дои:10.1038/77139. PMID  10888888. S2CID  6689794.
• de Vries H, Rüegsegger U, Hübner W. и др. (2000). «Фактор расщепления пре-мРНК человека II (m) содержит гомологи дрожжевых белков и связывает два других фактора расщепления». EMBO J. 19 (21): 5895–904. Дои:10.1093 / emboj / 19.21.5895. ЧВК  305781. PMID  11060040.
• Фукуда Т., Сумиёси Т., Такахаши М. и др. (2001). «Изменения гена репарации двухцепочечных разрывов MRE11 при раке». Рак Res. 61 (1): 23–6. PMID  11196167.
• Desai-Mehta A, Cerosaletti KM, Concannon P (2001). «Определенные функциональные домены нибрина опосредуют связывание Mre11, формирование фокуса и ядерную локализацию». Мол. Cell. Биол. 21 (6): 2184–91. Дои:10.1128 / MCB.21.6.2184-2191.2001. ЧВК  86852. PMID  11238951.
• Пол Т.Т., Кортез Д., Бауэрс Б. и др. (2001). «Прямое связывание ДНК с помощью Brca1». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (11): 6086–91. Дои:10.1073 / pnas.111125998. ЧВК  33426. PMID  11353843.
• Хопфнер К.П., Керхер А., Крейг Л. и др. (2001). «Структурная биохимия и архитектура взаимодействия ДНК-нуклеазы репарации двухцепочечных разрывов Mre11 и Rad50-АТФазы». Ячейка. 105 (4): 473–85. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00335-X. PMID  11371344. S2CID  15913630.
• Питтс С.А., Куллар Х.С., Станкович Т. и др. (2001). «hMRE11: геномная структура и нулевая мутация, идентифицированная в транскрипте, защищенном от нонсенс-опосредованного распада мРНК». Гм. Мол. Genet. 10 (11): 1155–62. Дои:10.1093 / hmg / 10.11.1155. PMID  11371508.
• Чиба Н., Парвин Дж. Д. (2001). «Перераспределение BRCA1 среди четырех различных белковых комплексов после блокировки репликации». J. Biol. Chem. 276 (42): 38549–54. Дои:10.1074 / jbc.M105227200. PMID  11504724.