Изохоризмат-синтаза - Isochorismate synthase
Изохоризмат-синтаза | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Мультяшный вид Ishochorismate Synthase (2 подразделения) | |||||||||
Идентификаторы | |||||||||
Номер ЕС | 5.4.4.2 | ||||||||
Количество CAS | 37318-53-9 | ||||||||
Базы данных | |||||||||
IntEnz | Просмотр IntEnz | ||||||||
БРЕНДА | BRENDA запись | ||||||||
ExPASy | Просмотр NiceZyme | ||||||||
КЕГГ | Запись в KEGG | ||||||||
MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
ПРИАМ | профиль | ||||||||
PDB структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
|
Изохоризмат-синтаза (Номер ЕС 5.4.4.2 ) является изомераза фермент, который катализирует первый этап биосинтеза витамин К2 (менахинон) в кишечная палочка.[1]
Реакция
Изохоризматсинтаза принадлежит к семейству ферментов изомераз. Более конкретно, ее классифицируют как внутримолекулярную трансферазу, поскольку она переносит гидроксигруппу хоризмата между атомами углерода.[2]
Изохоризматсинтаза катализирует необратимое превращение хоризматировать к изохоризмат:
Изохоризматсинтаза наиболее активна при 37 ° C и pH от 7,5 до 8. Она требует Mg.2+ в качестве кофактора в концентрации от 100 мкМ до 1 мМ.[1] К ингибиторам изохоризматсинтазы относятся:
- (4р,5р) -4-гидрокси-5- (1-карбоксивинилокси) циклогекс-1-енкарбоксилат
- (4р,5р) -4-гидрокси-5-карбоксиметокси-циклогекс-1-енкарбоксилат
- (4р,5р) -5- (2-карбоксиаллилокси) -4-гидроксициклогекс-1-енкарбоксилат
- (4р,5р,6S) -6-аммонио-5 - [(1-карбоксилатоэтенил) окси] -4-гидроксициклогекс-1-ен-1-карбоксилат
- (4р,5р,7р) -5- (1-карбоксиэтокси) -4-гидроксициклогекс-1-енекарбоксилат
- (4р,5р,7S) -5- (1-карбоксиэтокси) -4-гидроксициклогекс-1-енекарбоксилат
- (4р,5S,6S) -4-аммонио-5 - [(1-карбоксилатоэтенил) окси] -6-гидроксициклогекс-1-ен-1-карбоксилат
- (4р,5S,6S) -5 - [(1-карбоксилатэтенил) окси] -4,6-дигидроксициклогекс-1-ен-1-карбоксилат[3]
- Cu2+
- Hg2+
- K+
- Mg2+ при концентрациях выше 1 мМ
- N-этилмалеимид
Номенклатура
В систематическое название этого фермента является изохоризматгидроксимутаза, а общее название - изохоризматсинтаза. Другие названия этого фермента включают:
- Изохоризмат мутаза
- Менахинон-специфическая изохоризматсинтаза
- MenF
Пути
MenF - это ген, который кодирует изохоризматсинтазу, обнаруженную в пути менахинона в кишечная палочка, чтобы не быть ошибочно принятым за ген entC, который кодирует изохоризматсинтазу, обнаруженную в пути энтеробактина в кишечная палочка.[1] Этот фермент катализирует первый шаг в биосинтезе салициловая кислота в Синегнойная палочка.[4]Изохоризмат-синтаза имеет несколько других гомологов, обнаруженных у других организмов. К ним относятся:
Гены ферментов / названия ферментов | Организмы |
---|---|
ICS |
|
ICS1 |
|
Продукт гена ICS1 |
|
ICS2 |
|
Изохоризмат-синтаза |
|
Изохоризмат-синтаза 1 |
|
МБТЛ |
|
ПЧА |
|
Рекомендации
- ^ а б c Дарувала Р., Бхаттачарья Д. К., Квон О, Меганатан Р. (май 1997 г.). «Биосинтез менахинона (витамина К2): сверхэкспрессия, очистка и характеристика новой изохоризматсинтазы из Escherichia coli». Журнал бактериологии. 179 (10): 3133–8. Дои:10.1128 / jb.179.10.3133-3138.1997. ЧВК 179089. PMID 9150206.
- ^ «EC 5.4.4.2». IUBMB. Получено 30 ноября 2014.
- ^ Пейн Р.Дж., Буллох Е.М., Тоскано М.М., Джонс М.А., Кербар О., Абелл С. (июнь 2009 г.). «Синтез и оценка аналогов 2,5-дигидрохоризмата как ингибиторов ферментов, утилизирующих хоризмат». Органическая и биомолекулярная химия. 7 (11): 2421–9. Дои:10.1039 / B901694E. PMID 19462053.
- ^ Гейл (9 мая 2003 г.). «Изохоризмат-синтаза (PchA), первый и ограничивающий скорость фермент в биосинтезе салицилатов Pseudomonas aeruginosa». Журнал биологической химии.