Изохоризмат-синтаза - Isochorismate synthase

Изохоризмат-синтаза
Isochorismate Synthase.png
Мультяшный вид Ishochorismate Synthase (2 подразделения)
Идентификаторы
Номер ЕС5.4.4.2
Количество CAS37318-53-9
Базы данных
IntEnzПросмотр IntEnz
БРЕНДАBRENDA запись
ExPASyПросмотр NiceZyme
КЕГГЗапись в KEGG
MetaCycметаболический путь
ПРИАМпрофиль
PDB структурыRCSB PDB PDBe PDBsum

Изохоризмат-синтаза (Номер ЕС 5.4.4.2 ) является изомераза фермент, который катализирует первый этап биосинтеза витамин К2 (менахинон) в кишечная палочка.[1]

Реакция

Изохоризматсинтаза принадлежит к семейству ферментов изомераз. Более конкретно, ее классифицируют как внутримолекулярную трансферазу, поскольку она переносит гидроксигруппу хоризмата между атомами углерода.[2]

Изохоризматсинтаза катализирует необратимое превращение хоризматировать к изохоризмат:

Изохоризмат Синтаза Rxn.png

Изохоризматсинтаза наиболее активна при 37 ° C и pH от 7,5 до 8. Она требует Mg.2+ в качестве кофактора в концентрации от 100 мкМ до 1 мМ.[1] К ингибиторам изохоризматсинтазы относятся:

  • (4р,5р) -4-гидрокси-5- (1-карбоксивинилокси) циклогекс-1-енкарбоксилат
  • (4р,5р) -4-гидрокси-5-карбоксиметокси-циклогекс-1-енкарбоксилат
  • (4р,5р) -5- (2-карбоксиаллилокси) -4-гидроксициклогекс-1-енкарбоксилат
  • (4р,5р,6S) -6-аммонио-5 - [(1-карбоксилатоэтенил) окси] -4-гидроксициклогекс-1-ен-1-карбоксилат
  • (4р,5р,7р) -5- (1-карбоксиэтокси) -4-гидроксициклогекс-1-енекарбоксилат
  • (4р,5р,7S) -5- (1-карбоксиэтокси) -4-гидроксициклогекс-1-енекарбоксилат
  • (4р,5S,6S) -4-аммонио-5 - [(1-карбоксилатоэтенил) окси] -6-гидроксициклогекс-1-ен-1-карбоксилат
  • (4р,5S,6S) -5 - [(1-карбоксилатэтенил) окси] -4,6-дигидроксициклогекс-1-ен-1-карбоксилат[3]
  • Cu2+
  • Hg2+
  • K+
  • Mg2+ при концентрациях выше 1 мМ
  • N-этилмалеимид

Номенклатура

В систематическое название этого фермента является изохоризматгидроксимутаза, а общее название - изохоризматсинтаза. Другие названия этого фермента включают:

  • Изохоризмат мутаза
  • Менахинон-специфическая изохоризматсинтаза
  • MenF

Пути

MenF - это ген, который кодирует изохоризматсинтазу, обнаруженную в пути менахинона в кишечная палочка, чтобы не быть ошибочно принятым за ген entC, который кодирует изохоризматсинтазу, обнаруженную в пути энтеробактина в кишечная палочка.[1] Этот фермент катализирует первый шаг в биосинтезе салициловая кислота в Синегнойная палочка.[4]Изохоризмат-синтаза имеет несколько других гомологов, обнаруженных у других организмов. К ним относятся:

Гены ферментов / названия ферментовОрганизмы
ICS
  • Arabidopsis thaliana
  • Цианидий кальдарий
  • Глицин макс
  • Nicotiana benthamiana
  • Populus fremontil
  • Populus angustifolia
  • Populus tremuloides
ICS1
  • Arabidopsis thaliana
Продукт гена ICS1
  • Arabidopsis thaliana
  • Цианидий кальдарий
ICS2
  • Arabidopsis thaliana
Изохоризмат-синтаза
  • Arabidopsis thaliana
  • Цианидий кальдарий
  • Глицин макс
Изохоризмат-синтаза 1
  • Arapidopsis thaliana
МБТЛ
  • Микобактерии туберкулеза
ПЧА
  • Синегнойная палочка

Рекомендации

  1. ^ а б c Дарувала Р., Бхаттачарья Д. К., Квон О, Меганатан Р. (май 1997 г.). «Биосинтез менахинона (витамина К2): сверхэкспрессия, очистка и характеристика новой изохоризматсинтазы из Escherichia coli». Журнал бактериологии. 179 (10): 3133–8. Дои:10.1128 / jb.179.10.3133-3138.1997. ЧВК  179089. PMID  9150206.
  2. ^ «EC 5.4.4.2». IUBMB. Получено 30 ноября 2014.
  3. ^ Пейн Р.Дж., Буллох Е.М., Тоскано М.М., Джонс М.А., Кербар О., Абелл С. (июнь 2009 г.). «Синтез и оценка аналогов 2,5-дигидрохоризмата как ингибиторов ферментов, утилизирующих хоризмат». Органическая и биомолекулярная химия. 7 (11): 2421–9. Дои:10.1039 / B901694E. PMID  19462053.
  4. ^ Гейл (9 мая 2003 г.). «Изохоризмат-синтаза (PchA), первый и ограничивающий скорость фермент в биосинтезе салицилатов Pseudomonas aeruginosa». Журнал биологической химии.