Гаплогруппа N1a (мтДНК) - Haplogroup N1a (mtDNA)

Гаплогруппа N1a
N1a Phylotree.jpg
Возможное время происхождения12,000-32,000 YBP[1]
Возможное место происхожденияБлижний Восток
ПредокN1a'e'I
ПотомкиN1a1
Определение мутаций152, 669, 2702, 5315, 8901, 16147G, 16172, 16248, 16355[2]

Гаплогруппа N1a это митохондриальная ДНК человека (мтДНК) гаплогруппа.

Источник

N1a возник на Ближнем Востоке. [3] От 12000 до 32000 лет назад.[1] В частности, Аравийский полуостров постулируется как географическое происхождение N1a. Это предположение основано на относительно высокой частоте и генетическом разнообразии N1a в современных популяциях полуострова.[4] Точное происхождение и модели миграции этой гаплогруппы до сих пор остаются предметом споров.

Дискуссия о происхождении неолитических европейцев

Существуют два основных конкурирующих сценария распространения Неолитический пакет с Ближнего Востока в Европу: демическая диффузия (в котором сельское хозяйство было привезено фермерами) или культурное распространение (в котором сельское хозяйство распространялось посредством идей).

N1a стала особенно заметной в этих дебатах, когда группа под руководством Вольфганга Хаака проанализировала скелеты из Линейная гончарная культура места. Культуре линейной керамики приписывают первые фермерские сообщества в Центральная Европа, знаменуя начало Неолитическая Европа в этом регионе около 7500 лет назад. По состоянию на 2010 год анализ митохондриальной ДНК проводился на 42 образцах из пяти мест. Было обнаружено, что семь из этих древних людей принадлежат к гаплогруппе N1a.[5][6]

Отдельное исследование проанализировало 22 скелета с европейских стоянок охотников-собирателей, датированных 13400-2300 гг. До н.э. Большинство этих окаменелостей несли мтДНК. гаплогруппа U, который не был обнаружен ни на одном из участков линейной керамической культуры. Напротив, N1a не был идентифицирован ни в одной из окаменелостей охотников-собирателей, что указывает на генетическое различие между Ранние европейские фермеры и поздние европейские охотники-собиратели.[7]

Хотя ни одно современное население не соответствует результатам LBK, авторы утверждают, что популяция линейной керамики наиболее тесно связана с современными популяциями Ближнего Востока.[6] Учитывая эту принадлежность и отличие группы от охотников-собирателей, команда Хаака заключает, что «переход к сельскому хозяйству в Центральной Европе сопровождался значительным притоком людей из-за пределов региона».[7] Однако они отмечают, что частоты гаплогрупп у современных европейцев существенно отличаются от раннего земледелия и позднего населения охотников-собирателей. Это указывает на то, что «наблюдаемое сегодня разнообразие не может быть объяснено только смешением между охотниками-собирателями и первыми земледельцами» и что «основные демографические события продолжали происходить в Европе после раннего неолита».

Критики этих исследований утверждают, что образцы LBK N1a могли происходить из местных сообществ, обосновавшихся в Европе до появления сельского хозяйства. Команда Аммермана выразила озабоченность по поводу того, что некоторые образцы LBK поступают из общин через несколько сотен лет после того, как в регионе впервые было создано сельское хозяйство;[8] было дано опровержение.[9]

В 2010 году исследователи под руководством Паланихами провели генетический и филогеографический анализ N1a. Основываясь на результатах, они приходят к выводу, что некоторые образцы LBK были коренными жителями Европы, в то время как другие могли возникнуть в результате «чехарды» колонизации.[1] Команда Дегилю согласилась с выводом Хаака о генетическом разрыве между древними и современными европейцами. Тем не менее, они рассматривают демическое распространение, культурное распространение и супружеские обмены на расстоянии - все это одинаково правдоподобные объяснения текущих генетических открытий.[10]

Древняя ДНК

Было обнаружено, что семь из 42 скелетов с участков линейной керамической культуры (Linearbandkeramik) являются членами гаплогруппы N1a (см. Неолит европейский ). N1a также был обнаружен в останках скелета в мегалитическом длинном кургане возрастом 6200 лет недалеко от Prissé-la-Charrière, Франция.[10] 2500-летняя окаменелость скифо-сибиряка в Республика Алтай, самый восточный представитель Скифы, был признан членом N1a1.[11] Исследование венгров 10 и 11 веков показало, что N1a1a1 присутствует у людей с высоким статусом, но отсутствует у простых людей.[12] Один из тринадцати скелетов, проанализированных на средневековом кладбище, датируемом 1250-1450 гг. Дания оказался членом субклада N1a1a.[13]

Субклад N1 также был обнаружен в различных других окаменелостях, которые были проанализированы на предмет древней ДНК, включая образцы, связанные с Старчево (N1a1a1, Alsónyék-Bátaszék, Mérnöki telep, 1/3 или 33%), Linearbandkeramik (N1a1a1a3, Szemely-Hegyes, 1/1 или 100%; N1a1b / N1a1a3 / N1a1a1a2/N1antags, Hal1a1a1a1a1a1a1a1a1a1a1a1a1a1a1a1a1a1a1a1a2 / N1a1a1a1a или ~ 27%), Линейная керамика Альфельда (N1a1a1, Hejőkürt-Lidl, 1/2 или 50%), Задунайский поздний неолит (N1a1a1a, Apc-Берекаля, 1/1 или 100%), Protoboleráz (N1a1a1a3, Abony, Turjányos-dűl, 1/4 или 25%), и Иберия раннего неолита культур (N1a1a1, Els Trocs, 1/4 или 25%).[14]

Распределение

Гаплогруппа N1a широко распространена в Европе, Северо-Восточной Африке, на Ближнем Востоке и в Центральной Азии. Он разделен на ветви Европы / Центральной Азии и Африки / Южной Азии на основе конкретных генетических маркеров.

Ближний Восток

Относительно высокие частоты N1a обнаруживаются в современной популяции Саудовская Аравия. Оценки варьируются от 2,4%[15] до 4%.[16] Региональный анализ показал, что гаплогруппа наиболее распространена в центре страны. Гаплотип разнообразие здесь выше, чем где-либо.[4]

Частоты N1a в Йемен относительно высоки, причем оценки варьируются в зависимости от исследования: 3,6%,[15] 5.2%,[17] и 6,9%.[16] Йемен известен высоким разнообразием гаплотипов среди населения.[4][17]

В других регионах Ближнего Востока распространенность N1a ниже. В статье 2008 года указывается, что частота населения в 1,1% Катар, 0,3% в Иран, и 0,2% в индюк.[15]

Европа

N1a - редкая гаплогруппа, которая в настоящее время встречается только у 0,2% европейского населения.[5] Существуют карманы более высоких частот, например, в Хорватия где 0,7% материковых хорватов,[18] 9,24% населения на острове Црес,[19] и 1,9% населения острова Брач являются членами N1a. в Волго-Уральский регион из Россия, N1a наиболее заметна в Коми-пермяки (9,5%), затем следует Башкиры (3.6%), Чувашский (1,8%), и Татары (0.4%).[20] В другом исследовании татар Поволжья гаплогруппа N1a была обнаружена у 1,6% (2/126) выборки татар-мишар из Буинска в Западном Татарстане (1/126 N1a1a1a1, 1/126 N1a3a3), но не наблюдалась в выборке. из 71 казанского татара из Азнакаево на востоке Татарстана, что дает общий показатель 1,0% N1a (2/197) среди татар Поволжья.[21] По России в целом частота составляет 0,7%.[22]

Исследование 542 человек в Португалия обнаружили частоту N1a 0,37%. Только 0,11% лиц, проанализированных в Шотландия были членами гаплогруппы.[23]

Азия

Анализ современного населения Сибири выявил преобладание 1,2% в Алтайцы, 0,2% в Буряты,[24] и 0,9% в Ханты.[25]

В Индии N1a был идентифицирован у 4 членов группы Havik группа, 2 участника из Андхра-Прадеш,[5] 2 участника из Западная Бенгалия и 1 участник из Тамил Наду.[1] Члены группы Хавик принадлежат к африканской / южноазиатской ветви, в то время как один член из Андхра-Прадеша и другие из Западной Бенгалии и Тамил Наду принадлежат к европейской ветви.

Гаплогруппа N1a1 наблюдалась в 2,9% (4/138) выборки Кыргызский из Кызылсу Кыргызский Автономный округ, Синьцзян, Китай.[26]

Африка

N1a сосредоточен среди Афро-азиатский - говорящее население в Северо-Восточная Африка, происходящие в Эритрея, Эфиопия, Сомали и Судан. Клада также встречается с очень низкой частотой среди нескольких соседних групп из-за исторических взаимодействий.[5][27] В Судане встречается среди Аракиен (5,9%) и Нубийцы (3.4%).[27] В Эфиопии 2,2% населения являются носителями N1a, причем гаплогруппа идентифицирована среди Семитский компьютерные колонки.[17] В Египте N1a наблюдается у 0,8% жителей.[15] В Кения, гаплогруппа принадлежит примерно 10% Кушитик -Говорящий Рендиль, а также 1% от Масаи.[28] Некоторое количество N1a также наблюдалось в Танзания.[5]

Кроме того, гаплогруппа N1a встречается среди Сокотри (6.2%).[29]

Субклады

Дерево

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогруппы N1a основано на статье Манниса ван Овена и Манфреда Кайзера. Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека[2] и последующие опубликованные исследования.[30]

  • N
    • N1'5
      • N1
        • N1a'c'd'e'I
          • N1a'd'e'I
            • N1a'e'I
              • N1a
                • N1a1
                  • N1a1a
                    • N1a1a1
                      • N1a1a1a
                    • N1a1a2
                    • N1a1a3
                  • N1a1b

Дерево N1a имеет две отдельные ветви: Африка / Южная Азия и Европа с центральноазиатским подкластером.[5][24] Однако у африканского отделения есть члены в южной Европе, а у европейского отделения есть члены в Египте и на Ближнем Востоке. Ветвь Африка / Южная Азия характеризуется мутацией 16147G, тогда как европейская ветвь характеризуется 16147A, 3336 и 16320. Центральноазиатский подкластер является ответвлением европейской ветви, которая характеризуется маркером 16189.

Субклад N1a1 связан с мутацией 16147A.[1][4] Palanichamy подсчитал, что N1a1 возник между 8900 и 22400 YBP (годы До настоящего ). Субклад N1a1a обозначен маркером 16320 и, следовательно, связан с европейской ветвью N1a. По оценкам Петраглиа, N1a1a возник между 11000 и 25000 YBP.

Смотрите также

Филогенетическое дерево гаплогруппы митохондриальной ДНК человека (мтДНК)

 Митохондриальная Ева (L )  
L0L1–6 
L1L2 L3  L4L5L6
MN 
CZDEграммQ ОАSр яWИксY
CZBFR0 pre-JT п U
HVJTK
ЧАСVJТ

Рекомендации

  1. ^ а б c d е Паланичхами, Маллия Гундер; Чжан, Цай-Линь; Митра, Бикаш; Малярчук, Борис; Деренко, Мирослава; Чаудхури, Тапас Кумар; Чжан, Я-Пин (12 октября 2010 г.). «Филогеография митохондриальной гаплогруппы N1a, имеющая значение для происхождения европейских фермеров». BMC Эволюционная биология. 10: 304. Дои:10.1186/1471-2148-10-304. ISSN  1471-2148. ЧВК  2964711. PMID  20939899.
  2. ^ а б Ван Овен, Маннис; Кайзер, Манфред (13 октября 2008 г.) [2009]. «Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека». Человеческая мутация. 30 (2): E386–94. Дои:10.1002 / humu.20921. ISSN  1098-1004. PMID  18853457. S2CID  27566749.
  3. ^ Ричардс, Мартин; Маколей, Винсент; Хики, Эйлин; Вега, Эмильс; Сайкс, Брайан; Гуида, Валентина; Ренго, Кьяра; Селлитто, Даниэле; и другие. (16 октября 2000 г.). «Отслеживание происхождения европейских основателей в ближневосточном пуле мтДНК». Американский журнал генетики человека. 67 (5): 1251–76. Дои:10.1016 / S0002-9297 (07) 62954-1. ISSN  0002-9297. ЧВК  1288566. PMID  11032788.
  4. ^ а б c d Петралья, Майкл; Роза, Джеффри (2009). Эволюция человеческих популяций в Аравии: палеосреда, предыстория и генетика. Springer. С. 82–3. ISBN  978-90-481-2719-1.
  5. ^ а б c d е ж Хаак, Вольфганг; Форстер, Питер; Браманти, Барбара; Мацумура, Шуичи; Брандт, Гвидо; Тэнзер, Марк; Виллемс, Ричард; Ренфрю, Колин; и другие. (2005). «Древняя ДНК первых европейских фермеров в неолитических памятниках возрастом 7500 лет». Наука. 310 (5750): 1016–8. Bibcode:2005Наука ... 310.1016H. Дои:10.1126 / science.1118725. ISSN  1095-9203. PMID  16284177. S2CID  11546893.
  6. ^ а б Хаак, Вольфганг; Балановский, Олег; Санчес, Хуан; Кошель, Сергей; Запорожченко, Валерий; Адлер, Кристина; Дер Саркисян, Клио; Брандт, Гвидо; и другие. (2010). Пенни, Дэвид (ред.). «Древняя ДНК европейских фермеров эпохи раннего неолита показывает их близость к Ближнему Востоку». PLOS Биология. 8 (11): e1000535. Дои:10.1371 / journal.pbio.1000536. ISSN  1544-9173. ЧВК  2976717. PMID  21085689.
  7. ^ а б Браманти, Барбара; Thomas, M .; Хаак, Вольфганг; Unterlaender, M .; Jores, P .; Тамбец, К .; Antanaitis-Jacobs, I .; Haidle, M .; и другие. (2009). «Генетический разрыв между местными охотниками-собирателями и первыми фермерами Центральной Европы». Наука. 326 (5949): 137–40. Bibcode:2009Sci ... 326..137B. Дои:10.1126 / science.1176869. PMID  19729620. S2CID  206521424.
  8. ^ Аммерман, Альберт Дж .; Пинхаси, Рон; Банфи, Эстер (2006). Комментарий к статье «Древняя ДНК первых европейских фермеров на памятниках эпохи неолита, которым 7500 лет.'". Наука. 312 (5782): 1875. Bibcode:2006Научный ... 312 ..... A. Дои:10.1126 / science.1123936. PMID  16809513.
  9. ^ Бургер, Иоахим; Гроненборн, Детлеф; Форстер, Питер; Мацумура, Шуичи; Браманти, Барбара; Хаак, Вольфганг (2006). Ответ на комментарий к статье «Древняя ДНК первых европейских фермеров в памятниках эпохи неолита, возраст которых составляет 7500 лет.'". Наука. 312 (5782): 1875. Bibcode:2006Научный ... 312 ..... B. Дои:10.1126 / science.1123984. S2CID  220083496.
  10. ^ а б Дегийу, Мари-Франс; Солер, Людовик; Пемонж, Мария-Элен; Скарр, Крис; Жуссом, Роджер; Ляпорт, Люк (2010). «Новости с запада: древняя ДНК из французской мегалитической погребальной камеры». Американский журнал физической антропологии. 144 (1): 108–18. Дои:10.1002 / ajpa.21376. PMID  20717990.
  11. ^ Ricaut, FX; Keyser-Tracqui, C; Буржуа, Дж; Crubézy, E; Лудес, Б (2004). «Генетический анализ скифо-сибирского скелета и его значение для древних среднеазиатских миграций». Человеческая биология; международный рекорд исследований. 76 (1): 109–25. Дои:10.1353 / ступица.2004.0025. PMID  15222683. S2CID  35948291.
  12. ^ Tömöry, Gyöngyvér; Csányi, Bernadett; Богачи-Сабо, Эрика; Калмар, Тибор; Сибула, Агнес; Csősz, Aranka; Прискин, Каталин; Менде, Балаж; и другие. (2007). «Сравнение материнского происхождения и биогеографические анализы древнего и современного венгерского населения» (PDF). Американский журнал физической антропологии. 134 (3): 354–68. Дои:10.1002 / ajpa.20677. PMID  17632797.
  13. ^ Мельхиор, Линия; Линнеруп, Нильс; Siegismund, Hans R .; Кивисилд, Тоомас; Диссинг, Йорген; Хофрайтер, Майкл (2010). Хофрайтер, Майкл (ред.). «Генетическое разнообразие древних северных народов». PLOS ONE. 5 (7): e11898. Bibcode:2010PLoSO ... 511898M. Дои:10.1371 / journal.pone.0011898. ЧВК  2912848. PMID  20689597.
  14. ^ Марк Липсон; и другие. (2017). «Параллельные палеогеномные трансекты раскрывают сложную генетическую историю ранних европейских фермеров». Природа. 551 (7680): 368–372. Bibcode:2017Натура.551..368L. Дои:10.1038 / природа24476. ЧВК  5973800. PMID  29144465. Получено 1 ноября 2017.
  15. ^ а б c d Абу-Амеро, Халед К.; Ларруга, Хосе М.; Кабрера, Висенте М; Гонсалес, Ана М (2008). «Структура митохондриальной ДНК на Аравийском полуострове». BMC Эволюционная биология. 8: 45. Дои:10.1186/1471-2148-8-45. ЧВК  2268671. PMID  18269758.
  16. ^ а б Абу-Амеро, Халед К.; Гонсалес, Ана М; Ларруга, Хосе М; Босли, Томас М; Кабрера, Висенте М (2007). «Влияние митохондриальной ДНК Евразии и Африки на население Саудовской Аравии». BMC Эволюционная биология. 7: 32. Дои:10.1186/1471-2148-7-32. ЧВК  1810519. PMID  17331239.
  17. ^ а б c Кивисилд, Т; Рейдла, М; Мецпалу, Э; Роза, А; Брем, А; Pennarun, E; Парик, Дж; Геберхивот, Т; и другие. (2004). «Эфиопское наследие митохондриальной ДНК: отслеживание потока генов через ворота слез и вокруг них». Американский журнал генетики человека. 75 (5): 752–70. Дои:10.1086/425161. ЧВК  1182106. PMID  15457403.
  18. ^ Перичич, Марияна; Барак, Ловорка; Лаук Ирена Мартинович; Кларич, Бранка; Яничиевич, Павао; Рудан (2005). «Обзор хорватского генетического наследия, выявленного с помощью митохондриальной ДНК и линий Y-хромосомы» (PDF). Хорватский медицинский журнал. 46 (4): 502–13. PMID  16100752.
  19. ^ Jeran, N; Havas Augustin, D; Граховац, B; Капович, М; Мецпалу, Э; Виллемс, Р. Рудан, П. (2009). «Наследие митохондриальной ДНК жителей острова Црес - пример хорватских генетических аномалий». Collegium Antropologicum. 33 (4): 1323–8. PMID  20102088.
  20. ^ Бермишева, М. А .; Тамбец, К .; Villems, R .; Хуснутдинова, Е. К. (2002). «Разнообразие гаплогрупп митохондриальной ДНК в этнических популяциях Волго-Уральского региона» (PDF). Молекулярная биология. 36 (6): 802–12. Дои:10.1023 / А: 1021677708482. S2CID  16959586. Архивировано из оригинал (PDF) 22 ноября 2009 г.
  21. ^ Ошибка цитирования: указанная ссылка Малярчук2010 был вызван, но не определен (см. страница помощи).
  22. ^ Малярчук, Борис; Деренко, Мирослава; Денисова, Галина; Кравцова, Ольга (10 мая 2010 г.). «Митогеномное разнообразие татар Волго-Уральского региона России». Молекулярная биология и эволюция. 27 (10): 2220–6. Дои:10.1093 / molbev / msq065. ISSN  0737-4038. PMID  20457583. Получено 28 февраля 2011.
  23. ^ Гонсалес, Ана М .; Брем, Антонио; Перес, Хосе А .; Мака-Мейер, Николь; Флорес, Карлос; Кабрера, Висенте М. (2003). «Сродство митохондриальной ДНК на атлантическом краю Европы». Американский журнал физической антропологии. 120 (4): 391–404. Дои:10.1002 / ajpa.10168. PMID  12627534.
  24. ^ а б Деренко, М; Малярчук Б; Гжибовски, Т; Денисова, Г; Дамбуева, I; Перкова, М; Доржу, Ц; Лузина, Ф; и другие. (2007). «Филогеографический анализ митохондриальной ДНК в популяциях Северной Азии». Американский журнал генетики человека. 81 (5): 1025–41. Дои:10.1086/522933. ЧВК  2265662. PMID  17924343.
  25. ^ Pimenoff, Ville N; Комас, Дэвид; Пало, Юкка У; Вершубский, Галина; Козлов, Андрей; Саджантила, Антти (2008). «Северо-Западные Сибирские Ханты и Манси на стыке генофондов Западной и Восточной Евразии по однопородным маркерам». Европейский журнал генетики человека. 16 (10): 1254–64. Дои:10.1038 / ejhg.2008.101. PMID  18506205. S2CID  19488203.
  26. ^ Guo, Y .; Xia, Z .; Cui, W .; Chen, C .; Джин, X .; Чжу Б. Совместные генетические анализы молекулярных маркеров митохондрий и Y-хромосомы для населения из Северо-Западного Китая. Гены 2020, 11, 564. doi: 10.3390 / genes11050564
  27. ^ а б Мохамед, Хишам Юсиф Хасан. «Генетические закономерности вариации Y-хромосомы и митохондриальной ДНК с последствиями для населения Судана» (PDF). Хартумский университет. Получено 16 апреля 2016.
  28. ^ Кастри, Лоредана; Гараньяни, Паоло; Усели, Антонелла; Петтенер, Давиде; Луизелли, Доната (2008). «Кенийский перекресток: миграция и поток генов в шести этнических группах из Восточной Африки» (PDF). Журнал антропологических наук. 86: 189–92. ISSN  1827-4765. PMID  19934476. Получено 28 февраля 2011.
  29. ^ Черный Виктор; и другие. (2009). «За пределами Аравии - поселение на острове Сокотра, выявленное генетическим разнообразием митохондрий и Y-хромосомы» (PDF). Американский журнал физической антропологии. 138 (4): 439–447. Дои:10.1002 / ajpa.20960. PMID  19012329. Архивировано из оригинал (PDF) 6 октября 2016 г.. Получено 14 июн 2016.
  30. ^ Ван Овен, Маннис; Кайзер, Манфред (2009). «Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека». Человеческая мутация. 30 (2): E386–94. Дои:10.1002 / humu.20921. PMID  18853457. S2CID  27566749.

внешняя ссылка