Эмаравирус мозаики инжира - Fig mosaic emaravirus


Эмаравирус мозаики инжира
Симптомы мозаики из инжира на фиговых листьях
Симптомы мозаики из инжира на фиговых листьях
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Негарнавирикота
Учебный класс:Ellioviricetes
Заказ:Буньявиралес
Семья:Fimoviridae
Род:Эмаравирус
Разновидность:
Эмаравирус мозаики инжира
Синонимы
  • Вирус мозаики инжира

Эмаравирус мозаики инжира (FMV) - сегментированный, отрицательный смысл, одноцепочечный РНК-вирус который определен как возбудитель мозаичной болезни инжира (ящура) на растениях инжира, Фикус карика.[1] Это представитель рода Эмаравирус[2] и заказать Буньявиралес и передается в основном через эриофиид клещ Ацерия фикус.[3] FMV может вызывать ряд симптомов различной степени тяжести, в том числе листовые хлороз, деформация, мозаика или изменение цвета, а также преждевременное опадание плода.[4]

История

Мозаичная болезнь инжира (ящур) была первой описанный и предположительно вирусного происхождения в 1933 г. Ира Дж. Кондит и В.Т. Хорн.[5] Было установлено, что это было вызвано вирусом в 2009 году. Дживан Джот Валиа, Нида М. Салем, и Брайс В. Фальк.[6] Заболевание и связанный с ним вирус с тех пор наблюдались в Греция, Италия, Испания, индюк, Сирия, Тунис, Алжир, Иордания, Новая Зеландия, Китай, Великобритания, Пуэрто-Рико, Австралия, а Соединенные Штаты.[6]

Классификация

FMV был помещен в род Эмаравирус,[7] который содержит другие вирусы растений с одноцепочечной сегментированной РНК отрицательного смысла. Все эмаравирусы содержат от четырех до шести геном сегменты. Они также распространены по способу передачи, который передается через различные виды эриофидные клещи неизвестным механизмом, а также механическими способами передачи.[3] Помимо FMV, род Эмаравирус включает Эмаравирус, связанный с кольцевой пятнистостью европейской рябины (EMARaV), Эмаравирус розовой розетки (RRV), Эмаравирус пятнистости листьев малины (RLBV) и другие виды.[3]

Структура генома

Геном FMV состоит из сегментированных (многораздельных) отрицательно-смысловая, одноцепочечная РНК.[8] Долгое время считалось, что геном состоит из четырех сегментов, но недавние открытия подтвердили существование шести сегментов генома РНК.[9] В каждом сегменте по одному открытая рамка чтения (ORF).[3] Первый сегмент, FMV vcRNA 1 (7093 н.), Является общим для всех вирусов рода Эмаравирус и коды вирусов 264 кДа РНК-зависимая РНК-полимераза (RdRp), который имеет эндонуклеаза активность рядом с N-конец. Второй сегмент, vcRNA2, (2252 нуклеотида) кодирует 73 кДа предполагаемый гликопротеин. FMV vcRNA3 (1490 нуклеотидов) кодирует 35 кДа нуклеокапсид (N) белок. FMV vcRNA4 (1472 н.) Кодирует 40,5 кДа белок с функцией пока неизвестно.[5] Два последних открытых сегмента, РНК5 и РНК6, в отличие от других четырех сегментов, не являются высококонсервативными в пределах рода. Возможно, это потому, что они усечены или дефектны, но функции белков, которые они кодируют, все еще не определены.[9]

Движение между клетками и внутрь (FMV-p4)

Как и все вирусы растений, FMV кодирует белок движения (MP), чтобы позволить ему перемещаться между ячейками, обычно путем увеличения пределов исключения размера (SEL) плазмодесматы чтобы позволить вирусный переход.[10] MP FMV, скорее всего, представляет собой p4, предположение, которое подтверждается его локализацией в плазматической мембране, но еще не было окончательно показано.[3]

Репликация генома через отрывание кепки

FMV vcRNA 1 кодирует РНК-зависимый белок РНК-полимеразы (RdRp), который выполняет эндонуклеазную функцию на своем N-конце и упакован в вирион. Как только вирион попадает в клетку, RdRp связывается с мРНК хозяина и использует эндонуклеазную активность для расщепления 5 ’метилированного кэпа для использования в качестве праймера для синтеза мРНК и в качестве способа захвата трансляционного аппарата хозяина.[5]

DMB и LFP

Инфекция FMV приводит к образованию отдельных тел или частиц с двойной мембраной, называемых DMB или DMP, диаметром 90-200 нм в цитозоле инфицированных клеток паренхимы.[6][8][11] Эти связанные с двойной мембраной тела окружены фибриллярным матриксом и обнаруживаются только в листьях, демонстрирующих мозаичные симптомы на макроуровне, и никогда в неинфицированной ткани, используемой в качестве контроля.[11]Некоторые сорта также показали длинные, гибкий, палочковидные вирусоподобные частицы (LFP) в тканях с признаками некроза. Они также не наблюдаются в неинфицированных контрольных тканях.[11] Ни один из типов не имеет определенной функции.

Симптомы

FMV приводит к множеству симптомов, некоторые из которых могут иметь серьезные последствия для сельского хозяйства, например снижение урожайности плодов. Симптомы включают появление мозаичного рисунка листьев, дефолиацию, снижение урожайности плодов, полосатость жилок, кольцевые пятна, деформацию и хлороз листьев, а также желтые пятна на плодах.[6][9]

Неизвестные и будущие исследования

Многие аспекты молекулярной структуры и функции этого вируса до сих пор остаются неизвестными. Белок, кодируемый четвертым сегментом вирусного генома, РНК4, до сих пор выполняет неизвестную функцию.[5] Кроме того, точные молекулярные механизмы репликации FMV и Эмаравирус репликация в целом пока не подтверждена.[4] Текущие исследования также направлены на то, чтобы узнать больше о природе DMB / DMP, поскольку их трудно изолировать от зараженных растений.[6]

Рекомендации

  1. ^ Эльбеино, Т; Дигиаро, М. Мартелли, Г.П. (сентябрь 2009 г.). «Полная нуклеотидная последовательность четырех сегментов РНК вируса мозаики инжира». Архив вирусологии. 154 (11): 1719–1727. Дои:10.1007 / s00705-009-0509-3. PMID  19777155. S2CID  898250.
  2. ^ Эльбеино, Т; Дигиаро, М. Mielke-Ehret, N; Мюльбах, HP; Martelli, GP; Ictv Report, Консорциум (ноябрь 2018 г.). "Профиль таксономии вирусов ICTV: Fimoviridae". Журнал общей вирусологии. 99 (11): 1478–1479. Дои:10.1099 / jgv.0.001143. PMID  30204080.
  3. ^ а б c d е Ishikawa, K; Maejima, K; Комацу, К. (2013). «Белок p4 вируса мозаики инжира участвует в перемещении от клетки к клетке». Журнал общей вирусологии. 94 (3): 682–686. Дои:10.1099 / vir.0.047860-0. PMID  23152372.
  4. ^ а б Ishikawa, K; Maejima, K; Нагашима, S (январь 2012 г.). «Первое сообщение о заражении вирусом мозаики инжира обыкновенного инжира (Ficus carica) в Японии». Журнал общей патологии растений. 78 (2): 136–139. Дои:10.1007 / s10327-012-0359-9. S2CID  13946882.
  5. ^ а б c d Валиа, JJ; Фальк, Б.В. (май 2012 г.). «МРНК вируса мозаики фига показывают образование путем отрывания крышки». Вирусология. 426 (2): 162–166. Дои:10.1016 / j.virol.2012.01.035. PMID  22356803.
  6. ^ а б c d е Валиа, JJ; Салем, Нью-Мексико; Фальк, Б.М. (январь 2009 г.). «Частичный анализ последовательности и обзора выявляет многочастный вирус с отрицательной РНК, связанный с мозаикой из инжира». Болезнь растений. 93 (1): 4–10. Дои:10.1094 / PDIS-93-1-0004. PMID  30764262.
  7. ^ "Отчет ICTV: Fimoviridae".
  8. ^ а б Эльбеино, Т; Дигиаро, М. Алабдулла, А (май 2009 г.). «Многочастный одноцепочечный вирус с отрицательной РНК является предполагаемым возбудителем мозаичной болезни из инжира». Журнал общей вирусологии. 90 (5): 1281–1288. Дои:10.1099 / vir.0.008649-0. PMID  19264612.
  9. ^ а б c Ishikawa, K; Maejima, K; Komatsu, K (апрель 2012 г.). «Идентификация и характеристика двух новых сегментов геномной РНК вируса мозаики инжира, РНК5 и РНК6». Журнал общей вирусологии. 93 (7): 1612–1619. Дои:10.1099 / vir.0.042663-0. PMID  22513386.
  10. ^ Lazarowitza, SG; Бичи, Р. Н. (апрель 1999 г.). «Белки вирусного движения в качестве зондов для внутриклеточного и межклеточного обмена у растений». Растительная клетка. 11 (4): 535–548. Дои:10.1105 / tpc.11.4.535. ЧВК  144200. PMID  10213776.
  11. ^ а б c Caglayan, K; Медина, В; Газель, М (октябрь 2009 г.). «Предполагаемые возбудители мозаичной болезни инжира в Турции». Турецкий журнал сельского хозяйства и лесоводства. 33: 469–476. Дои:10.3906 / tar-0807-20.

внешняя ссылка